新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析
近日,中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台,实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者,硕士研究生黄沛霖为第二作者,南开大学计算机学院刘健教授为共同通讯作者。脊椎动物进化中的基因复制事件普遍存在,它们在获得新基因和新性状方面发挥着重要作用。而全基因组复制(WGD)可以通过增加基因组的灵活性和复杂性为自然选择提供重要原料,是基因复制的重要来源之一。此外,WGD也是脊椎动物进化的驱动力,对物种,特别是具有复杂WGD模式的脊椎动物多样性有很大贡献。近年来,测序和组装技术的进步使得脊椎动物的全基因组数据呈现出快速增长的趋势。近5年来,NCBI数据库中的脊椎动物的基因组装配(Assembly)数量已从260个增长到1000个,增幅近300%。在数据大爆发的背景下,现有的分析工具和平台......阅读全文
新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析
近日,中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台,实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者,硕士研究生黄沛霖为第二作者,南开大学计算机学院刘健教授
中山大学完成3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列测定和分析
日前,中山大学海洋学院教授何建国及其项目组完成了3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列的测定和分析。在此基础上,他们提出了虹彩病毒的一个新属,并找到该病毒里3个与鱼类免疫信号传导系统相互作用的基因。在鳜鱼(俗称桂花鱼)、石斑鱼、大黄鱼等多种养殖鱼类中频繁流行,对鳜鱼的致死率接近100%,对石斑鱼、美国
从航天可视化到可视化航天
自9月28日进入北京航天飞行控制中心,在历时12天的紧张工作中,石家庄铁道大学校信息科学与技术学院院长赵正旭教授及刘展威、佟宽章、王威4人圆满地完成了嫦娥二号三维可视化前期任务。向全球展现了嫦娥二号发射任务的实时精彩仿真。 “以前是航天可视化,现在是可视化航天。”北京航天飞行控制中心
无脊椎动物和有脊椎动物的红细胞的相关介绍
无脊椎动物 在无脊椎动物中具有红细胞,只限于海生动物,如螠虫、光裸星虫、绿纽虫、海豆芽、扫帚虫、魁蛤、海棒槌等。涉及到各门约有100种,但也有的和白血球并没有明显区别,不过和脊椎动物的红细胞则有明显的差异。 有脊椎动物 脊椎动物中哺乳类的红细胞,是中心部凹陷的圆饼状,在造血组织中(的成红血
羊膜脊椎动物的概念
中文名称羊膜脊椎动物英文名称amnion vertebrate定 义胚胎发育过程中胎儿体外包有羊膜的脊椎动物。爬行类、鸟类、哺乳类均属羊膜动物。由外胚层和中胚层发育而成的羊膜,提供了一个水性环境,从而保证胚胎细胞的正常生长和发育。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
果蝇发育调控可视化
生命科学最大魅力是纷繁复杂的生物形式,而其中极具挑战的科题之一是多细胞生物的发育调控。在多细胞个体遗传调控研究中,科学家经常使用一种看似不起眼但又被广泛使用的模式动物——果蝇 (Drosophila ontogenesis) [1]。遗传级联遗传调控指导受精卵单细胞发育成复杂多细胞生物体。虽然每个细
研究揭示脊椎动物“手”的起源
根据英国《自然》杂志23日发表的研究,科学家发现一块鱼类化石其胸鳍拥有手指样附体,为理解脊椎动物的手的起源带来了全新线索。这是迄今最完整的希望螈样本,其代表了鱼类向陆地脊椎动物过渡的演化阶段,同时其也是第一次在已知动物化石身上发现了手指与鳍“锁”在一起的现象,揭示了人类的手部是如何由远古鱼类的鱼
基因“时钟”或能预测脊椎动物寿命
近日,一个澳大利亚研究团队报告了一种采用基因标记准确估算不同脊椎动物物种寿命的模型。这个“寿命时钟”筛选了CpG(核苷酸对)位点的42个特定基因,以预测某脊椎动物物种成员可能拥有多长的寿命。CpG位点是DNA上的短片段,其密度与寿命相关。相关论文刊登于《科学报告》。 一个物种的最大寿命难以定义
PNAS:miRNA揭示脊椎动物进化起源
美英科学家的一项最新研究表明,脊椎动物这种复杂生命形式的出现源于miRNA。调控基因表达的miRNA的不断进化是早期脊椎动物出现的背后原因。相关论文近日在线发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 论文高级作者、美国达特茅斯学院的Kevin Peterson表示,“新的研究不仅为认识人类自身的进
心脏可视化助力中风预测
中风每4分钟便会导致1人死亡。为确定患者的中风风险,医生会测量心脏的某些特征,比如它的大小和泵血力量。 不过,研究人员一直没有工具研究疾病诱导的心脏结构变化可能如何影响心脏功能和血液流动。 如今,一个跨学科科学家团队表示找到了分析血液流经心脏上部血液收集腔体——左心房的新方法,从而可能带来评
可视化测漏仪定义
可视化测漏仪是所有检测泄漏方法中最便捷的一种,其快速/便捷/精准度高等特点已深入人心.超声检漏仪的发展可分为三代,第一代是单纯靠超声信号来判断泄露的仪器;第二代是数字超声波检漏仪,这一代的检漏仪可以听到泄漏声音也可以看到数字;第三代可视化超声波检测技术已经成熟,第三代超声检漏相机具有可视化/功能
可视化基因载体的介绍
据介绍,微环DNA被认为是最具潜力的基因治疗载体,而如何实现微环DNA的高效递送以及载体非侵入性生物学信息的获取是当前亟待解决的问题。聚乙烯亚胺(PEI)作为阳离子基因传递载体,已广泛应用于生物医学研究。但由于高分子量PEI在提高基因转染效率的同时也增加了细胞毒性,其在体内的应用受到制约。如何实
质谱成像的可视化
质谱成像技术根据分子质量与电荷比关系可视化显示出分子发布情况。近日,科学家在科研及工作中发现:该项技术在涉及公共利益专业应用中同样具有良好应用前景。 凡是需要对组织及特定分析过程进行特殊分析时,质谱成像技术(Imaging MS)均显示出其强大之处:它允许从空间同—形态层面对组织样本分子组成
可视化虫情测报灯介绍
夏季是农林害虫多发的季节,这段时期也是虫情测报人员最忙碌的季节,为了及时收集和分析害虫的发生发展信息,测报人员需要频繁的出入田间地头,提取虫情信息,而为了实现高效率的病虫害防治,当前不少地区引进了一种新一代的虫情测报“智能卫士”-可视化虫情测报灯。该测报灯不仅减轻了测报人员劳动强度,提高测报的准确率
三维表面模型可视化软件Vayu-1.0发布
Vayu 主界面与部分案例展示。(中科院古脊椎动物与古人类所供图) 包括古生物学在内,众多科研领域已经在前所未有的精度和广度上大规模应用X射线计算机断层扫描以及三维重建技术,随之对生成的三维表面模型的可视化效果方面也提出了更高的需求。 目前大部分三维重建处理软件在在处理三维表面
-姥鲨基因揭示早期脊椎动物进化
在过去的4.2亿年里,姥鲨(Callorhinchus milii)几乎没有什么变化,这就使其DNA序列在与其他脊椎动物物种进行比较时更有价值。 这种有着大吻状突起、外形古怪的鱼类是最原始的颌类脊椎动物,研究人员已经对其基因组进行了测序。姥鲨的DNA序列有助于解释为什么鲨鱼具有一副软骨
最古老的脊椎动物,原来长这样!
中国古生物学者运用先进的实验技术证实,5.18亿年前的云南虫是地球上最古老的脊椎动物。这是中国化石宝库澄江动物群中诞生的又一位“超级明星”。该发现对了解我们自身所在的脊椎动物谱系起源具有重要意义,相关成果8日刊发在国际权威期刊《科学》上。 云南虫生态复原图。(中科院南京地质古生物研究所研究员赵方臣
海口虫:揭开脊椎动物远祖的面纱
陈均远等人对海口虫的研究成果表明,脊椎动物的演化在5.2亿年前就已拉开序幕。这些保存惊人完好的化石,展现了一幅包括人类在内的脊椎动物远祖的生动“肖像”。这一发现被一些国外科学家誉为“人类重塑地球生命史的一项惊人成就”。 云南昆明滇池之畔,海口镇耳材村村后,有一个长2000米、宽1000米的斜
可视化测漏仪的简介
在测漏方面,可视化超声波测漏仪提供快且正确的方法来定位微小及粗大的泄漏。因为超音波是短波,所以在泄漏端可以清楚、大声地接收到泄漏的超音波成份。在噪杂的工厂,超音波的特性使其更为明显有用。大部份工厂的声音会盖掉泄漏的低频成份,使得无法使用可听音检查。因超音波探测仪对于低频声无反应,只听泄漏的超音波
BioTechniques:大数据的可视化工具
如今,面对海量的生物数据集,人们往往感到束手无策。然而,这些TB级的数据有望带来新的假说、新的药物靶点,以及对生物系统的更彻底了解。数据可视化在其中扮演着至关重要的作用。在这一期的《BioTechniques》杂志上,Sarah Webb博士探讨了数据可视化的挑战和能力。 大数据是一个美好的概
可视化测漏仪的应用
●压缩气体、氧气、氮气和蒸汽系统的泄漏检测(任何气体泄漏都可检测) ●真空系统泄漏/阀类检测/热交换机/锅炉/冷凝器泄漏检测 ●电气设备检测接触不良/局部放电/电晕产生的高电压绝缘子缺陷造成的泄漏检测 ●气密性/密封性,压力容器及需要密封的环境(例如:城际列车/飞机/航空设备/潜艇/汽车等
可视化测漏仪的特点
可视化 可视化的检测界面系统,不仅能实现自动显示泄漏位置,并会根据泄漏的严重程度显示不同颜色和不同的数值,系统可自动拍照泄漏点储存到PC并进行分析 多功能 压力、真空泄漏检测,热交换机、锅炉、冷凝器检测,阀门、管道内漏检测,电气设备局部放电检测,密封性检测仪,轴承监测,预知性维护系统解决方
可视化技术,赋予医生“透视眼”
神经外科手术因其精细程度和复杂性,被称为在“万丈深渊上走钢丝”。病灶的精准定位是实现手术精确、灵活、快速、微创的关键,也是当前神经外科手术的重点和难点。 在传统手术操作中,医生会根据手术前拍摄的核磁共振、CT等影像判断病灶部位,然后通过徒手穿刺或神经导航进行穿刺。然而,这种操作方式存在着明显的
中山大学创业学院揭牌仪式在中山大学深圳校区文学园举行
9月2日,中山大学创业学院揭牌仪式在中山大学深圳校区文学园举行。这意味着该校创办于2009年的创业学院正式调整挂靠至深圳校区办学,将进一步强化对深圳市创新创业管理经营人才的支撑力度。 据介绍,创业学院此前依托中山大学管理学院开展人才培养、科学研究等工作。今年6月,中山大学将创业学院调整至挂靠深
海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验
培养胚胎用玻璃器具和塑料器具的处理 试剂、试剂盒 硝酸 EDTA
海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验
培养胚胎用玻璃器具和塑料器具的处理 试剂、试剂盒 硝酸 EDTA
海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验
试剂、试剂盒 硝酸EDTA蒸馏水 仪器、耗材 玻璃器具 实验步骤 一、胚胎学玻璃器具的酸洗 1. 将需洗涤的玻璃器具放在到防烟尘盖的大容器中。 2. 小心加入硝酸,完全覆盖玻璃器具。 3. 浸泡过夜。 4. 第二天早上,用镊子小心取出玻璃器具并放入新容器内
全部脊椎动物基因组测序再上路
为了获得更多的关注和支持,研究人员迫切希望对所有脊椎动物的基因组进行测序。近日,科学家正式启动了脊椎动物基因组计划(VGP),发布了14个物种的15个高质量基因组。但该计划仍远未筹集到所需资金,以记录地球上约6.6万种脊椎动物的基因组。 这个项目已经进行了3年,其前身是2009年启动的基因组1
CpG密度可准确预测脊椎动物的寿命?
“少小离家老大回,乡音无改鬓毛衰。”衰老是几乎所有动物都存在的现象。它涉及到多种生物功能的下降,并限制了物种的最大寿命。之前的研究表明,衰老与表观遗传变化相关,包括DNA甲基化。最近,澳大利亚的一组研究人员就试图通过表观遗传模式来预测物种的寿命。 研究人员研究了250多种寿命已知的脊椎动物的启
5亿年化石可能改写脊椎动物起源
在7月6日发表于《自然-通讯》的一篇论文中,美国哈佛大学古生物学家Karma Nanglu与合著者报告说,一块保存完好的5亿年前的化石与今天一些被囊动物非常相似,即用两根虹吸管过滤水中的有机颗粒,复杂的肌肉组织则用来控制虹吸管。这一发现为早期被囊动物的出现时间和发育提供了线索,甚至可能推迟被囊动