新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析

近日,中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台,实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者,硕士研究生黄沛霖为第二作者,南开大学计算机学院刘健教授为共同通讯作者。脊椎动物进化中的基因复制事件普遍存在,它们在获得新基因和新性状方面发挥着重要作用。而全基因组复制(WGD)可以通过增加基因组的灵活性和复杂性为自然选择提供重要原料,是基因复制的重要来源之一。此外,WGD也是脊椎动物进化的驱动力,对物种,特别是具有复杂WGD模式的脊椎动物多样性有很大贡献。近年来,测序和组装技术的进步使得脊椎动物的全基因组数据呈现出快速增长的趋势。近5年来,NCBI数据库中的脊椎动物的基因组装配(Assembly)数量已从260个增长到1000个,增幅近300%。在数据大爆发的背景下,现有的分析工具和平台......阅读全文

海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验

培养胚胎用玻璃器具和塑料器具的处理试剂、试剂盒硝酸                                                                  EDTA                                                      

海洋无脊椎动物胚胎的培养设备实验

试剂、试剂盒硝酸EDTA蒸馏水仪器、耗材玻璃器具实验步骤一、胚胎学玻璃器具的酸洗1. 将需洗涤的玻璃器具放在到防烟尘盖的大容器中。2. 小心加入硝酸,完全覆盖玻璃器具。3. 浸泡过夜。4. 第二天早上,用镊子小心取出玻璃器具并放入新容器内。硝酸可保存起来并能反复使用几次。5. 用去离子水彻底冲洗,以

最新发现:云南虫不是脊椎动物

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505671.shtm

CpG密度可准确预测脊椎动物的寿命?

  “少小离家老大回,乡音无改鬓毛衰。”衰老是几乎所有动物都存在的现象。它涉及到多种生物功能的下降,并限制了物种的最大寿命。之前的研究表明,衰老与表观遗传变化相关,包括DNA甲基化。最近,澳大利亚的一组研究人员就试图通过表观遗传模式来预测物种的寿命。  研究人员研究了250多种寿命已知的脊椎动物的启

5亿年化石可能改写脊椎动物起源

  在7月6日发表于《自然-通讯》的一篇论文中,美国哈佛大学古生物学家Karma Nanglu与合著者报告说,一块保存完好的5亿年前的化石与今天一些被囊动物非常相似,即用两根虹吸管过滤水中的有机颗粒,复杂的肌肉组织则用来控制虹吸管。这一发现为早期被囊动物的出现时间和发育提供了线索,甚至可能推迟被囊动

中山大学创业学院揭牌仪式在中山大学深圳校区文学园举行

  9月2日,中山大学创业学院揭牌仪式在中山大学深圳校区文学园举行。这意味着该校创办于2009年的创业学院正式调整挂靠至深圳校区办学,将进一步强化对深圳市创新创业管理经营人才的支撑力度。  据介绍,创业学院此前依托中山大学管理学院开展人才培养、科学研究等工作。今年6月,中山大学将创业学院调整至挂靠深

光子的量子纠缠实现快速可视化

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507000.shtm

新“访问”方式让人脑活动可视化

科技日报讯 (记者张梦然)据5月29日最新一期《科学·转化医学》报道,美国加州理工学院研究人员在人类头骨上设计了一种“定制窗口”,可用于将大脑活动数据可视化。这种颅窗使研究人员能在非手术室环境通过超声成像观察人类的大脑活动。该技术为临床医生和神经科学家提供一种侵入性较小方法,以高分辨率研究大脑。为了

新“访问”方式让人脑活动可视化

  据5月29日最新一期《科学·转化医学》报道,美国加州理工学院研究人员在人类头骨上设计了一种“定制窗口”,可用于将大脑活动数据可视化。这种颅窗使研究人员能在非手术室环境通过超声成像观察人类的大脑活动。该技术为临床医生和神经科学家提供一种侵入性较小方法,以高分辨率研究大脑。  为了研究、诊断和治疗脑

人类中心粒组装实现可视化

沿着纵轴切割并从上方观察的人类中心粒模型。瑞士日内瓦大学科学家将高分辨率显微镜和运动学重建技术相结合,成功实现人类中心粒组装过程可视化。发表在《细胞》杂志上的这项研究,阐明了中心粒组装的复杂性,为研究其他细胞器开辟了新途径。中心粒是细胞内的一种桶状结构,由多个蛋白质组成。这些蛋白质的突变可引起一系列

使用凝胶电泳如何可视化DNA

    凝胶电泳是一种允许在其组成分子水平上分析DNA的技术。在这种DNA可视化方法中,将样品放置在琼脂糖凝胶介质上,并在凝胶上施加电场。这会导致DNApian段根据其电化学特性以不同的速率通过凝胶迁移。溴化乙锭对于这种可视化技术,在电泳前将溴化乙锭与琼脂糖粉,EDTA缓冲液和水混合以形成凝胶基质。

可视化检测农药残留方面获进展

  近期,中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所研究员蒋长龙团队在氨基甲酸酯农药和有机磷农药残留分析检测方面取得新进展。研究设计制备了两种高效的比率荧光纳米探针,并结合智能手机的颜色识别器,实现对食品和环境水体中农药的可视化定量检测。相关研究成果发表在《化学工程杂志》(Chemical Engi

肉馅“可视化”不如食品“可溯化”

   想包点儿饺子,很多消费者都习惯到超市买现成肉馅儿。不过,也有大爷大妈们不放心,担心买到问题肉。针对这种担心,日前国家食品药品监督管理总局公布了《超市生鲜食品包装和标签标注管理规范(征求意见稿)》,规定超市不得将购进的生鲜肉类预先加工成肉馅等产品形态进行包装销售或直接散装销售。(12月1日《新文

中科院团队研发出化石三维建模可视化专用软件

如何让古生物学领域对古老化石的研究更具活力?如何让化石与现代生物的形态和解剖学可视化效果更形象逼真?三维表面模型可视化软件的开发应用不可或缺且至为关键。 记者21日从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(中科院古脊椎所)获悉,为提升化石和现代生物成像数据的可视化效果,该所卢静研究员团队最近自主研发

脊椎动物数量锐减-工业化惹的祸

  据新华社华盛顿11月22日电 (记者林小春)包括哺乳类、鸟类、爬虫类、两栖类及鱼类在内的很多脊椎动物群体数量正在大幅下降,那这种快速衰退从什么时候开始的呢?中美一项新研究认为是120多年前,当时正是工业化快速发展时期。   这项研究由美国得克萨斯大学符云新教授、中国科学院李海鹏研究员和张亚平院士

3.19亿年化石保存最古老脊椎动物大脑

近日,科学家通过扫描3.19亿年前的鱼化石,发现了最古老的脊椎动物完整大脑。该大脑及其脑神经约1英寸长,属于一种已经灭绝的蓝鳃鱼。美国密歇根大学的这项最新发现,为摸清当今主要鱼类“鳍鱼”的神经解剖和早期进化打开了一扇窗。相关研究2月1日发表于《自然》。这一意外发现也为脊椎动物化石中软组织的保存提供了

遗传研究揭示脊椎动物延缓衰老的新线索

  在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学、斯托瓦斯医学研究所和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员发现了关于非洲青鳉鱼(African turquoise killifish)在滞育(diapause)期间如何能够暂停衰老过程的线索。相关研究结果发表在2020年2月21日的Science期刊上,论文标题

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(一)

Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo

从普通无脊椎动物系统获取配子实验

实验材料 海胆和沙币试剂、试剂盒 KCl 溶液3-氨基-124-三唑仪器、耗材 巴斯德吸管Nytex 滤器实验步骤 一、海胆和沙币体腔内注射 0.5 mol/L 的 KCl1. 制备 0.5 mol/L 的 KCl 溶液。2. 用海水冲洗一下动物以去掉颗粒物质。3. 用一个 23~26 号的针头向动

体型最大和最小的脊椎动物灭绝风险最高

  一个国际科研小组最新发现,脊椎动物的灭绝风险与体型相关,体型最大和最小的脊椎动物灭绝风险最高,但二者原因不同。  这个由澳大利亚、美国、瑞士研究人员组成的科研小组9月18日在美国《国家科学院学报》上报告说,他们针对全球超过2.7万种脊椎动物建立起身体质量数据库,并分析它们的灭绝风险。  结果发现

从普通无脊椎动物系统获取配子实验

海胆和沙币海星海鞘软体动物实验材料海胆和沙币                                                          试剂、试剂盒KCl 溶液                                                          

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(二)

  3.颅面畸形三维重建与评估:每条斑马鱼幼体,记录高达320帧的图像,通过三维重构技术,形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是:retinoic acid(视黄酸)、cyclopamine(环巴胺)和flu

研究揭示有颌脊椎动物早期演化新框架

  1月28日凌晨0时,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所朱幼安、卢静、朱敏带领由中国、澳大利亚、英国和瑞典学者组成的研究团队,在《当代生物学》(Current Biology)上发表了关于4亿年前的澳大利亚盾皮鱼类脑腔、内耳和内淋巴系统精细解剖结构的最新研究成果及其对有颌脊椎动物早期演化框架的冲击

从普通无脊椎动物系统获取配子实验

海胆和沙币 海星 海鞘 软体动物             实验材料 海胆和沙币

科学家首次观察脊椎动物胚胎形成过程

德国科学家借助新型高性能显微镜首次观察到脊椎动物胚胎形成过程,在最初数小时内,从一个单细胞变成一个心脏跳动的胚胎,这将有助于深入了解人体器官是如何形成和一些遗传性疾病的研究 斑马鱼胚胎诞生过程 网易探索讯 据英国每日邮报报道,德国科学家借助新型高性能显微镜首次观察到脊椎动物胚胎形成过

全球两成无脊椎动物濒临灭绝

    像蛞蝓这样的无脊椎动物正面临着灭绝的危险。   根据英国伦敦动物学会(ZSL)的一份最新报告,全世界1/5的无脊椎动物物种正面临着绝灭的危险。   从棋子蝶到巨型乌贼,无脊椎动物被认为代表了地球上99%的生物多样性。然而,迄今为止,科学家们从未试图全面审视它们的保存状

中山大学6件作品获奖

3月28日,记者从中山大学获悉,由广东省教育厅举办的2021年广东教育好新闻评选活动近日揭晓,中山大学报送的作品共有6件获奖,其中一等奖两篇,二等奖两篇,三等奖两篇,是获奖最多的高校。广东教育好新闻奖旨在引导教育战线新闻宣传工作者、各媒体教育线记者积极采访报道新时代广东教育好新闻,传播新时代广东教育

岛津校园讲座走入中山大学

    接近年底,新一轮的大学毕业生找工热潮来临了。此时的高校校园正轮番举办着各式各样的宣讲会,但有一个讲座,吸引了中山大学分析化学专业学生的注意:“快速发展的分析行业,多元的就业机会,你准备好了吗?”这是岛津公司分析仪器市场部策划的校园系列活动之一,旨在为在校学生带来更多

中山大学领导班子调整

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516561.shtm近日,中山大学官网“现任领导”一栏更新,4位校领导出现调整,其中杨清华任常务副校长,张琪任党委副书记,匡铭、林天歆任校长助理。   ?杨清华,男,1965年10月生,研究员。本

癌症诊断新思路:“可听化”代替“可视化”

  最近一项研究展示了“数据可听化”是如何改进目前干细胞光谱学分析中的所用到的标准技术。  “数据可听化”  “数据可听化”近年来在众多领域得到广泛应用,例如医学、天体物理和人机交互等。它的原理是依赖听觉感知,运用非语音信号包括声音的频率、音色、音调等来传达信息,大大降低了视觉负荷。  那么如果将其