基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破

深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据,首次对苔类目级系统框架进行了重建,得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员,通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员,深圳华大生命科学研究院联合培养研究生余进博士,美国康涅狄克大学Bernard Goffinet教授共同完成该项工作。苔类(liverworts)是植物界的一个门,属于苔藓植物三个主要分支(苔、藓、角苔)之一,其起源历史可追溯至4亿年前。作为一个古老的植物类群,苔类植物多样性却非常丰富,目前全世界有苔类7300余种,隶属15目,87科,300余属,其深层次系统演化关系尚有很大争议。近年来,随着高通量测序技术的发展,植物系统发育基因组学获得了快速的发展,转录组(transcriptome)数据被广泛应用于植物系统发育基因组学中。转录组是某一特定状态下基因组的所有转录本,数......阅读全文

昆明植物所等发表“中国和越南苦苣苔科分类”专辑

近日,由中国科学院昆明植物研究所组织,海南大学、广西植物研究所、中科院华南植物园、安徽大学、深圳仙湖植物园、生态环境部南京生态环境研究所、越南植物保护中心(CPC)等多家科研单位共同完成的“中国和越南苦苣苔科分类”专辑在PhytoKeys发表。  该专辑共收录19篇文章,相关研究利用分子手段恢复了1

中国研究人员发表“中国和越南苦苣苔科分类”专辑

  近日,由中国科学院昆明植物研究所组织,海南大学、广西植物研究所、中科院华南植物园、安徽大学、深圳仙湖植物园、生态环境部南京生态环境研究所、越南植物保护中心(CPC)等多家科研单位共同完成的“中国和越南苦苣苔科分类”专辑在PhytoKeys发表。  该专辑共收录19篇文章,相关研究利用分子手段恢复

关于转录因子的转录抑制区的介绍

  也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。  转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核

科学家揭示心血管疾病家兔模型的基因组和转录组特征

  6月1日,由中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组、美国密歇根大学医学中心和日本山梨大学分子病理系等单位研究人员合作完成的论文“Hyperlipidemia-associated gene variations and expression patterns revealed

核转录分析

            实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

核转录分析

实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase

辅助转录因子

中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定  义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

转录的特点

转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo

体外转录

·         In Vitro RNA Transcription (Promega)For in vitro preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f

RNA-反转录

 实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p

版纳园等自主开发出叶绿体全基因组分析比较基因组程序包

  高通量测序(High-throughput sequencing),又称“下一代”测序(Next-generation sequencing),是近年来在测序技术发展史中具有革命性改变的新突破,能一次并行对几十万到几百万条DNA分子同时测序,因此能对物种的转录组和基因组进行比以往较细致全貌的

投资11亿元,佛山仙湖实验室开展氢能核心技术攻关

  日前,总投资近11亿元的佛山仙湖实验室二期基础设施建设工程项目(以下简称“仙湖二期项目”)首根试验桩开打,标志着项目正式开工。作为氢能和氨氢融合装备制造产业集群标杆项目,仙湖二期项目建成载体将交付佛山仙湖实验室开展氢能核心技术攻关相关工作,助力佛山锤炼“氢”功,发展新质生产力,巩固自身氢能下游应

华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组

香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质

华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组

香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质

深圳市执行首批节能环保专项扶持

  深圳节能环保企业有望享受今年首批专项资金扶持。2月11日,深圳市发展改革委、科技创新委、人居环境委联合发布《关于组织实施深圳市2015年第一批节能环保产业发展专项资金扶持计划的通知》。   记者了解到,本次扶持计划重点面向四大领域。在高效节能产业,主要面向电机及拖动装置、节能监测、余热余压利用、

深圳市2025年政府投资项目计划

 近日,深圳市发展和改革委员会印发《深圳市2025年重大项目计划》。 计划共安排重大项目798个,总投资约3.15万亿元,其中建设项目679个,年度计划投资3076.4亿元。 根据市委市政府和市人大有关工作安排,按照深圳市2025年国民经济和社会发展计划目标,制定本计划。  一、2025年政府投资项

RNA的转录与逆转录相关介绍

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

转录组测序和全转录组测序的区别

全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有

研究揭示揭示花性别分化的调控机理

  植物花性别分化是一个复杂的过程,由遗传和环境因素共同决定,并且花性别分化的调控机制在不同物种之间是不同的。木本油料能源植物小桐子(Jatropha curcas)的大部分种质资源是典型的雌雄同株异花,但在其起源中心也有雌雄异株和两性花等类型的野生种质材料。由于植物染色质结构是调节不同细胞类型和发

科研人员发现蕨类植物新“科”

  9月17日,记者从深圳市中科院仙湖植物园获悉,该园刘红梅博士及其合作者经过6年研究论证,终于研究发现蕨类植物—新“科”——“爬树蕨科”。这一科研成果8月24日已在国际最权威的植物分类学杂志《分类学》(Taxon)上发表,标志着深圳的蕨类植物研究正式跻身国际前列。   据了解,从1929年我国的

武汉植物园在植物NAC蛋白进化研究中取得新进展

     NAC蛋白是植物中最大的转录因子家族之一,广泛存在于陆生植物中。NAC蛋白参与植物生长发育和器官模式建成的许多特异方面。越来越多的研究表明,NAC蛋白在植物应答生物及非生物胁迫过程中发挥重要的作用。   中科院武汉植物园植物应用基因组学学科组博士研究生朱婷婷在彭俊华研究员

版纳植物园等揭示植物叶片“设计”规律的古老性

  叶片功能特征的发育需要遵循一定的规律,比如寿命较长的叶片因为在结构和韧性上的投入较多,在光合作用上的投入就会相对较少,从而导致其较弱的光合作用能力。但是这些规律是否在不同的地质历史时期都相同,是否适用于所有的植物类群之前还不确定。中国科学院西双版纳热带植物园植物生理生态学研究组已毕业博士研究生章

版纳植物园“植物园与生物分类项目”通过验收

  中科院西双版纳热带植物园承担的 “南美油藤(Plukenetia volubilis Linneo)的保育和开发利用研究” 、“喜马拉雅特有植物象牙参属(Roscoea)的系统发育及谱系生物地理学研究”、“三种蒟蒻薯属植物的分子谱系地理学研究”等三个“植物园与生物分类学研究项目”于

上海植物园考察团到武汉植物园交流考察

   上海植物园考察团到武汉植物园交流考察   7月14日,上海植物园考察团在党委书记施俊、副园长陈必胜率领下一行17人赴中科院武汉植物园考察交流。武汉植物园主任助理、园艺中心主任刘宏涛等接待了来宾。   座谈会上,刘宏涛向客人详细介绍了武汉植物园的发展概况以及在引种驯化、园地管理、科

全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制

   中国南方喀斯特起源古老、分布广泛,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。  喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进

植物转录起始调控机制研究获进展

在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录