基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究生余进博士，美国康涅狄克大学Bernard Goffinet教授共同完成该项工作。苔类（liverworts）是植物界的一个门，属于苔藓植物三个主要分支（苔、藓、角苔）之一，其起源历史可追溯至4亿年前。作为一个古老的植物类群，苔类植物多样性却非常丰富，目前全世界有苔类7300余种，隶属15目，87科，300余属，其深层次系统演化关系尚有很大争议。近年来，随着高通量测序技术的发展，植物系统发育基因组学获得了快速的发展，转录组（transcriptome）数据被广泛应用于植物系统发育基因组学中。转录组是某一特定状态下基因组的所有转录本，数......阅读全文
珍稀丹霞梧桐落户华南国家植物园
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503414.shtm 中新网韶关6月24日电 (王坚 王子杰)记者24日从韶关市丹霞山管委会获悉，被紧急运送至华南国家植物园(下称“华南植物园”)的7株韶关丹霞梧桐近日已萌发新芽新叶，标志着丹霞梧桐崖
武汉植物园完成掌叶木和伞花木的叶绿体基因组解
掌叶木和伞花木是我国特有的无患子科植物，分别所属的掌叶木属和伞花木属是无患子科的单种属。近期，中国科学院武汉植物园研究人员通过浅层基因组测序技术组装了这两种植物的叶绿体基因组，为开展针对性种群遗传学研究和保护工作等提供重要的理论数据。在2021年公布的《国家重点保护野生植物名录》中，掌叶木和伞花木均
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物，属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊，形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
基因组与植物进化研讨会在上海辰山植物园召开
10月13日，The Symposium of Genomics and Plant Evolution （基因组与植物进化研讨会）在上海辰山植物园（中国科学院上海辰山植物科学研究中心）报告厅举行。会议旨在促进植物领域基因组学和系统进化研究的交流与合作，从而推动其进一步发展。来自全球25个科研机
招标公告：佛山仙湖实验室系统气相色谱仪
项目概况系统气相色谱仪 招标项目的潜在投标人应在佛山市禅城区汾江中路121号东建大厦27楼获取招标文件，并于2022年03月10日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号：XH202206-01-001项目名称：系统气相色谱仪预算金额：60.0000000 万元（人民币）最
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增
北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能
4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队，在《分子细胞》（Molecular Cell）上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库
随着高通量测序技术的发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息，服务生物医学基础研究领域需求，构
北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组，在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展，该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
珍稀丹霞梧桐首次实现整群异地迁种落户华南国家植物园
迁地种植现场 丹霞山管委会 供图 中新网韶关6月24日电 (王坚 王子杰)记者24日从韶关市丹霞山管委会获悉，被紧急运送至华南国家植物园(下称“华南植物园”)的7株韶关丹霞梧桐近日已萌发新芽新叶，标志着丹霞梧桐崖壁原生种群首次以整株整群的方式迁地种植获得成功。 据韶关市丹霞山管委会介绍，这是丹霞
武汉植物园在菱属泛基因组和结构变异研究中获进展
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物，但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患，因此对“孤儿作物”（orphan crop）的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而，随着城乡现代化进程的持续推进和现代集约化农业的快速发展，“孤儿作物”野生种和地方品种资源正日趋减少，与主粮作物相比，其种质资源
武汉植物园在猕猴桃叶绿体基因组研究中获得新进展
猕猴桃（Actinidia chinensis）是一种富含Vc的经济水果，目前在全世界越来越受到消费者欢迎。尽管我国学者对中华猕猴桃的全基因组进行了测序，然而对猕猴桃叶绿体基因组并未进行组装和注释。 中国科学院武汉植物园猕猴桃资源与育种学科组副研究员姚小洪在研究员黄宏文的指导下，完成了不同倍性
华南植物园猕猴桃多重高效基因组编辑系统研究取得进展
猕猴桃因其丰富的营养价值和独特的风味而成为重要的全球性新兴水果。随着我国及世界猕猴桃产业的发展，如何快速高效地创制优异特色新种质并培育新品种，成为制约产业发展的关键。目前，基于成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列关联蛋白（clustered regularly interspa
裸子植物物种多样化和表型进化研究新进展
确定生命之树中物种多样性和表型差异产生的主要的内部与外部驱动力是进化生物学研究的挑战之一。对于绿色植物，全基因组复制（WGD，或多倍化）是重要的进化驱动力，但WGD是否能与响应气候变化和新生态机遇的适应性辐射演化等进化过程一起塑造宏观进化模式尚不清楚。现存的裸子植物支系明显经历了古辐射演化、大量
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达；也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达，还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目：表征人类基因组，选择的模式生物的D
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。转录因子的结合位点
榕树气生根发育、性别决定和榕蜂协同多样化的分子机制
榕属植物是热带雨林的关键类群，具有极高的物种多样性、生活型多样性。榕属植物和与传粉榕小蜂有的高度专性共生关系，在探讨物种形成、动植物协同进化等方面均具有重要的研究价值，然而榕树和榕小蜂高质量参考基因组信息的缺乏，严重制约了以上榕树相关问题的深入研究。 10月8日，中国科学院西双版纳热带植物园陈
人血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
在临床和研究环境中，血液都是对人类进行分子分析的主要来源，并且是许多治疗策略的目标，这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划（www.proteinatlas.org）是一个开放式数据库，旨在通过整合各种组学技术（包括基于抗体的成像）来绘制所有人类蛋白的图谱。在
武汉植物园在昆栏树目叶绿体基因组研究方面取得新进展
真双子叶植物基部类群昆栏树目(Trochodendrales)仅包含两个单种属，水青树属(Tetracentron)和昆栏树属(Trochodendron)，是研究被子植物系统与进化的重要和关键类群之一。 与大多数被子植物相比，昆栏树目植物叶绿体DNA的反向重复区(IRs)包含了更多的基因
武汉植物园等在金豆的叶绿体全基因组解析研究中获进展
金豆【Fortunella venosa（Champ. ex Benth.） C.C.Huang】是芸香科中一种多年生常绿灌木。此物种为我国特有，分布区域与金柑【《中国植物志》 Fortunella hindsii （Champ. ex Hook.） Swingle】略有重叠，且范围狭窄，主要分
科学家绘制出燕麦野生种基因密码图谱
近日，中国科学院华南植物园副研究员刘青团队与英国莱斯特大学教授John Seymour Heslop Harrison合作，采用基因组学技术，组装燕麦野生种基因组序列，开展比较基因组学研究，绘制出燕麦野生种基因密码图谱。相关研究成果发表于《科学数据》（Scientific Data）和《BMC植物生
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区（transcription activation domain）和转录抑制区（transcription repression domain）二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足： 1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列； 2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
吐鲁番沙漠植物园：治沙治出的植物园
上个世纪，新疆吐鲁番市风沙危害严重，中国科学院新疆生态与地理研究所的科研人员来到这里治理风沙，建设了中国科学院吐鲁番沙漠植物园。 通过野外引种、繁育培植，植物园里的物种逐渐丰富。目前，植物园里生长着500多种耐盐、耐旱的荒漠植物，为防风治沙工作提供了支持。 暖阳下，新疆各地的梨花、杏花、桃花
昆明植物所等发表“中国和越南苦苣苔科分类”专辑
近日，由中国科学院昆明植物研究所组织，海南大学、广西植物研究所、中科院华南植物园、安徽大学、深圳仙湖植物园、生态环境部南京生态环境研究所、越南植物保护中心（CPC）等多家科研单位共同完成的“中国和越南苦苣苔科分类”专辑在PhytoKeys发表。 该专辑共收录19篇文章，相关研究利用分子手段恢复了1
中国研究人员发表“中国和越南苦苣苔科分类”专辑
近日，由中国科学院昆明植物研究所组织，海南大学、广西植物研究所、中科院华南植物园、安徽大学、深圳仙湖植物园、生态环境部南京生态环境研究所、越南植物保护中心（CPC）等多家科研单位共同完成的“中国和越南苦苣苔科分类”专辑在PhytoKeys发表。 该专辑共收录19篇文章，相关研究利用分子手段恢复
中国最大深水型淡水湖保护升级－保抚仙湖I类水质
中新社玉溪7月9日电 “从今天开始，抚仙湖保护由恢复性保护转向巩固性保护，由重点保护转向全面保护，由探索性保护转向依法保护。”9日，云南省玉溪市委书记孔祥庚在此间宣布，被誉为“中国保护的最好的淡水湖”――云南抚仙湖的保护工作当日起将全面升级，“一退、二调、三保”战略即日起开始正式实施。 据孔祥