可以DNA结合的酶拓扑异构酶和解旋酶

拓扑异构酶和解旋酶: 拓扑异构酶是具有活性核酸酶和连接酶的酶。这些酶能够改变DNA的拓扑特性。它们中的一些通过切割DNA螺旋并允许其旋转,降低其超螺旋程度,然后通过连接酶将两端连接。另一方面,其它拓扑异构酶能够在连接断裂的DNA链之前,切断螺旋,并允许第二个螺旋通过断裂部位。拓扑异构酶是许多涉及DNA的过程所必需的,例如DNA复制和转录 。解旋酶是能够利用核苷三磷酸中存在的化学能的蛋白质,尤其是ATP,以破坏核碱基之间形成的氢键,从而允许DNA的双螺旋打开成单链。......阅读全文

脱氧核糖核酸与蛋白质作用

所有DNA功能都取决于其与特定蛋白质的相互作用。这些相互作用可以是非特异性的,也可以是极其特异性的。还有许多可以结合DNA的酶,其中,在DNA转录和复制中复制DNA序列的聚合酶特别重要。DNA与组织蛋白(图1中白色部分)的交互作用,这种蛋白质中的碱性氨基酸(左下蓝色),可与DNA上的酸性磷酸基团结合

脱氧核糖核酸与蛋白质作用

所有DNA功能都取决于其与特定蛋白质的相互作用。这些相互作用可以是非特异性的,也可以是极其特异性的。还有许多可以结合DNA的酶,其中,在DNA转录和复制中复制DNA序列的聚合酶特别重要。DNA与组织蛋白(图1中白色部分)的交互作用,这种蛋白质中的碱性氨基酸(左下蓝色),可与DNA上的酸性磷酸基团结合

细胞化学基础脱氧核糖核酸与蛋白质作用

所有DNA功能都取决于其与特定蛋白质的相互作用。这些相互作用可以是非特异性的,也可以是极其特异性的。还有许多可以结合DNA的酶,其中,在DNA转录和复制中复制DNA序列的聚合酶特别重要。DNA与组织蛋白(图1中白色部分)的交互作用,这种蛋白质中的碱性氨基酸(左下蓝色),可与DNA上的酸性磷酸基团结合

结合脱氧核糖核酸DNA的酶的介绍

  核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞

解析DNA拓扑异构酶核心结构揭示DNA穿链新机制

生物物理所解析DNA拓扑异构酶核心结构揭示DNA穿链新机制成果入选Faculty of 1000 BiologyGyrase B’三维结构(左)及结构域运动(右)  近日,中科院生物物理研究所王大成课题组与毕利军课题组合作在Nucleic Acids Research杂志上发表的题为

DNA螺旋与拓扑异构酶相互作用的新发现

  一个荷兰人领导的国际性研究组在分子水平上破解了自然释放DNA中积累起来的扭曲张力的机制。来自Delft理工大学、Ecole Normale Superieure和Sloan-Kettering研究所的研究人员将他们的发现公布在3月31日的《自然》杂志上,并成为这一期杂志的封面。  IB型拓扑异构

与解链有关的酶和蛋白质有哪些?

与解链有关的酶和蛋白质包括:1.单链结合蛋白2.解旋酶 3.拓扑异构酶Ⅰ 4.拓扑异构酶Ⅱ。在细菌中类似的解旋酶很多,都具有ATP酶的活性,大部分的移动方向是5'→3',但也有3'→5'移到的情况,如n'蛋白在φχ174以正链为模板合成复制形的过程中,就是按3

拓扑异构酶的临床应用

  这些药物包括阿霉素(adriamycin)、放线霉素D(actinomycinD)、道诺梅素(daunomycin)、VP-16、VM-26(替尼泊苷teniposide或者表鬼臼毒素(epipodophyllotoxin)。相对来说,无论是临床,还是处在试验阶段的,作为哺乳动物异构酶II型毒素

拓扑异构酶的用途介绍

  DNA的结构转换和解析  Ⅱ型拓扑异构酶巧妙地执行了打开DNA双螺旋的过程。它将DNA的一个双螺旋结构切开,并让另一个螺旋从缺口处穿过,在此之后一个双螺旋便被打开。由两个蛋白构建的:这个编号为1bgw的蛋白具有拓扑异构酶的下半部分结构,另外一个编号为1eil的蛋白来自于一个旋转酶的结构域,它与拓

简述拓扑异构酶的作用

  是使超级螺旋松弛。所谓超级螺旋是DNA中张力积聚的形式。拓扑异构酶抑制成分是重要抗肿瘤药物,被认为通过稳定拓扑异构酶与DNA之间所形成的一种共价复合物来发挥作用,后者又为DNA复制机制设置了一障碍。科学家对以拓扑异构酶为作用目标的药物的药效起源仍不是很了解。由于该药物的作用而造成的正向DNA超级

概述拓扑异构酶的分类

  可分为两类一类叫拓扑异构酶I,一类叫拓扑异构酶II。拓扑异构酶I催化DNA链的断裂和重新连接,每次只作用于一条链,即催化瞬时的单链的断裂和连接,它们不需要能量辅因子如ATP或NAD。E.coliDNA拓扑异构酶I又称ω蛋白,大白鼠肝DNA拓扑异构酶I又称切刻-封闭酶(nicking-closin

DNA-复制过程中需要哪些酶的参与?

DNA 复制过程中需要多种酶的参与,主要包括以下几种:解旋酶(Helicase):解开 DNA 双螺旋结构,使两条链分开,形成复制叉。单链结合蛋白(Single-strand Binding Protein,SSB):与解开的单链 DNA 结合,防止单链重新形成双螺旋,保持其伸展状态以便复制。引物酶

解旋酶打开DNA双链过程破解

  美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。  温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提

解旋酶打开DNA双链过程破解

  美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。  温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提

酶和抗体活性、结合物中酶含量及结合率的测定

  ⑴ 酶与抗体的活性 常用琼脂扩散或免疫电泳法,使抗原与抗体形成沉淀线,经PBS漂洗1天,再以蒸馏水浸泡1小时,将琼脂凝胶片浸于酶底物溶液中着色,如果出现应有的颜色反应,再用生理盐水浸泡,颜色仍然不褪,表示结合物既有酶的活性,也有抗体活性。良好的结合物在显色后,琼扩滴度应在1:16以上。另一个测定

解旋酶的作用和存在形式

解旋酶是一类解开氢键的酶,是由水解ATP供给能量来解开DNA的酶。它们常常依赖于单链的存在,并能识别复制叉的单链结构。一般在DNA或RNA复制过程中起到催化双链DNA或RNA解旋的作用。

非洲猪瘟病毒DNA拓扑异构酶催化机制研究获新进展

中国科学院生物物理研究所饶子和院士研究组首次阐明非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶的基本机制,为减轻非洲猪瘟病毒的影响提供了潜在的干预策略。相关论文于5月30日发表在《自然-通讯》。非洲猪瘟是一种威胁全球养猪业的急性、烈性传染病,至今仍缺少安全有效的上市疫苗与药物。非洲猪瘟病毒是唯一一种编

非洲猪瘟病毒DNA拓扑异构酶催化机制研究获新进展

中国科学院生物物理研究所饶子和院士研究组首次阐明非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶的基本机制,为减轻非洲猪瘟病毒的影响提供了潜在的干预策略。相关论文于5月30日发表在《自然-通讯》。非洲猪瘟是一种威胁全球养猪业的急性、烈性传染病,至今仍缺少安全有效的上市疫苗与药物。非洲猪瘟病毒是唯一一种编

拓扑异构酶的基本信息介绍

  DNA拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶,他们能够催化DNA链的断裂和结合,从而控制DNA的拓扑状态,拓扑异构酶参与了超螺旋结构模板的调节。哺乳动物中主要存在两种拓扑异构酶。DNA拓扑异构酶I通过形成短暂的单链裂解-结合循环,催化DNA复制的拓扑异构状态的变化;相反,拓扑异构酶II通过引起瞬间双

双链DNA结合域的结构和作用

双链DNA结合域,DNA结合蛋白中与双链DNA结合的结构域。 双杂交系统的基础是在一些转录因子上发现的模域(modular domains):一个DNA结合域,它可以结合一段特异的DNA序列,和一个转录激活域,这个转录激活域与基础转录机制相作用。

最杰出的等温扩增方法之一——解旋酶依赖性扩增HDA

解旋酶依赖性扩增技术(helicase-dependent amplification,HDA)于2004年发明,是模拟动物体内DNA的复制机制的一种体外恒温基因扩增技术。随着技术的发展,在反应速度、特异性和灵敏度上也不断被提升,至少有三代HAD技术,整个系统比较简单,高效。 系统核心组成:解旋酶,

菌落的裂解和DNA与滤膜的结合实验

            实验方法原理 本方案介绍如何从携带重组质粒的克隆中释放出 DNA 并将其固定于硝酸纤维滤膜或尼龙膜的方法,这一方法最初由 Grunstein 和 Hogness 使用。 实验材料

菌落的裂解和DNA与滤膜的结合实验

本方案介绍如何从携带重组质粒的克隆中释放出 DNA 并将其固定于硝酸纤维滤膜或尼龙膜的方法,这一方法最初由 Grunstein 和 Hogness 使用。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理本方案介绍如何从携带重组质粒的克隆中释放出 DNA 并将其固定于硝酸纤维滤膜或尼龙膜的

菌落的裂解和DNA与滤膜的结合实验

实验方法原理 本方案介绍如何从携带重组质粒的克隆中释放出 DNA 并将其固定于硝酸纤维滤膜或尼龙膜的方法,这一方法最初由 Grunstein 和 Hogness 使用。实验材料 带有 E.coli 转化子克隆的滤膜试剂、试剂盒 变性液中和液SDS (10% m V)2X SSPE仪器、耗材 玻璃或塑

基因克隆常见方法

、T4连接酶介导的DNA克隆传统的分子克隆,通常需要使用相同的限制性内切酶酶切载体和目的片段,使得载体和片段产生相同的粘性或平末端,使用T4 DNA连接酶对其进行连接,转化,挑取阳性克隆,得到重组质粒为了更方便的对DNA进行克隆,后续又将克隆的载体进行了简化,出现了T载体,这样就可以不用酶切,直接将

DNA结合蛋白的形成

它是解链酶(unwinding enzyme)类中的一种类型,发现于原核生物的大肠杆菌细胞内,由相同亚基组成的四聚体,分子量8×104,与单链DNA亲和力极大,与双链DNA结合力较差。因此,当DNA发生暂时性熔化时,它与DNA单链区结合而促使反应偏向单链的形成,使DNA在大大低于Tm(解链温度)的温

DNA聚合酶及DNA连接酶的功能和区别

DNA聚合酶,以已有的核酸序列作为模板,将4种脱氧核苷酸(A、T、G、C)按照模板的碱基排列顺序,以“碱基互补原则”依次连接,聚合成为一条新的DNA链。 DNA连接酶,是将DNA片段上的缺刻连接起来的酶。    一、DNA聚合酶    (一)DNA聚合酶I     DNA聚合酶I(DNA pol

大肠杆菌的拓扑异构酶的相关介绍

  大肠杆菌的拓扑异构酶II(gyrase)除了引入负超螺旋以外.还具有形成或拆开双链DNA环连体和成结分子的能力。II类拓扑异构酶没有碱基序列特异性,它们可以和任何相交的两对双链DNA结合。DNA旋转酶有两个α亚基和两个β亚基。α亚基约105KDa,为gyrA基因所编码,具有磷酸二脂酶活性,可为萘

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验             实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

本方案介绍在放射性标记的 DNA 片段上确定蛋白质结合位点的作图方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羟自由基断裂 DNA。如果希望得到优化足迹法反应的建议,请参见本方案最后部分的疑难解析以及优化 DNA 酶 I 足迹法反应的栏目。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)