研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端结构域识别其固有无序靶标的结构机制。相关研究成果以“Combined prediction and design reveal the target recognition mechanism of an intrinsically disordered protein interaction domain”为题,发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上。 固有无序蛋白(Intrinsically Disordered Protein,IDP)之间的相互作用具有高度动态性。如何阐明其底层的三维结构机制对目前的研究方法是一种挑战。4.1G蛋白作为细胞膜骨架适配器,其保守但被认为是固有无序的C端结构域可以靶向识别其他蛋白中的特定无序......阅读全文

Science:蛋白无序?但有功能

  Rohit Pappu和他的两位同事在9月20日《科学》(Science)杂志上的一篇perspective文章中,揭示了一大类没有遵循结构-功能范例的蛋白质。这些所谓的内在无序蛋白质无论整体或部分均不能折叠,但它们是具有功能的。   近期我们坐下类与圣路易斯华盛顿大学生物系统工程学中心的

Nature解析多功能的无序蛋白

  精密折叠的结构,给蛋白赋予了多重功能。不过,细胞中也存在不少未折叠的松散蛋白,这些无序蛋白IDP(intrinsically disordered protein)也能执行多种功能。本周的Nature杂志上,Scripps研究所(TSRI)的科学家们,阐述了一个重要IDP实现多重功能的策略,

通过拉曼光谱逐个探究无序蛋白分子

  天然无序蛋白具有独特的结构特点,参与许多重要的生理与病理过程,还与一些神经退行性疾病的发生和发展有着密切联系。其中,α-突触核蛋白(α-Syn)的单体在自然状态中不形成稳定的蛋白质二级结构,而是自发地从某一种二级结构转变为另一种二级结构。有些情况下,α-突触核蛋白从一些不太稳定的低聚体转化成不可

多臂老虎机助力无序蛋白药物虚拟筛选

  最近,北京大学化学与分子工程学院的刘志荣教授课题组将多臂老虎机算法应用于天然无序蛋白质的药物设计问题,大大加速了基于构象系综的配体虚拟筛选过程,相关研究成果发表在Phys. Chem. Chem. Phys. (2021, 23, 6800-6806)上。  一个人在成长过程中会遇到各种各样的选

Cell:科学家阐释天然无序蛋白质的研究进展

  截至目前为止研究人员并不清楚细胞中的蛋白“交通”如何运转地这么迅速,而且可以足够精确地抑制不必要分子的通过,近日,一项刊登在国际杂志Cell上的研究报道中,来自德国、法国和英国的研究人员解开了这个谜题。  在细胞中蛋白质可以识别其它的蛋白质,每一种蛋白质都会在一类特殊的蛋白质中从事特殊的工作,就

癌症“魅影”:寻找无序中的有序

  无序蛋白指得是一部分没有稳定三维结构的蛋白质。因为没有绝对稳定的状态,经常参与调控细胞各成分的相互作用,如DNA的转录等。然而,它们的错误表达也可能造成细胞的变化,引起癌症等严重的疾病。  日前,美国麻省理工学院化学系博士后林星程等人在《生物分子》期刊上发表了一篇论文,研究人员运用分子动力学模型

ACS-Nano:基于本征无序蛋白域的相分离合成细胞器

  代谢工程和合成生物学工具有潜力驯化微生物细胞工厂,这些工厂能够有效生产大量化学品和材料,包括大宗和特种化学品、生物燃料、聚合物和药物。所需产物的微生物生产可以通过在微生物底盘细胞中异源表达特定酶或整个合成途径来实现。过表达靶途径酶并减少甚至消除内源性竞争途径中酶的表达的策略已被广泛使用。  20

“无序科研”与“有序科研”,哪个模式好?

  “无序科研”在此指没有组织的科研,研究方向和目标不固定,科研人员自由发展,各自为战。  “有序科研”在此指有组织的科研,有长期坚持的研究方向,有明确的要攻克的目标,并有固定的研究团队。一个人沿着一个方向长期坚持研究下去,直至攻克目标,也算有序科研。  我国高校和科研院所的科研多为“无序科研”。科

中药资源无序开发威胁生态环境

 在盛产虫草的青藏高原及周边地区,过度的挖采不但导致虫草资源枯竭,也破坏了本来就稀疏的植被,极易引起水土流失、草场退化甚至沙化。   巨大的市场需求导致中药资源无序开发,不但使得中药资源生物多样性受到严重破坏,对生态环境也带来了威胁   近日来,归真堂欲上市、其"

环保部:土壤污染治理不能粗放无序

   人民网北京3月9日电 (人民网前方报道组 记者章斐然 初梓瑞)今日下午,十二届全国人大五次会议新闻中心在梅地亚中心多功能厅举行记者会,邀请环保部部长陈吉宁就“加强生态环境保护”的相关问题回答中外记者的提问。   陈吉宁在会上表示,环境问题是人类现代化进程中面临的一项重大挑战,优美环境是人类

国办提五条意见遏制煤炭产能无序增长

  中国煤炭工业协会网站27日公布“国务院办公厅关于促进煤炭行业平稳运行的意见”。意见提出,坚决遏制煤炭产量无序增长,切实减轻煤炭企业税费负担,加强煤炭进出口环节管理,减少低质煤进口。   2012年以来,煤炭行业出现结构性产能过剩、价格下跌、企业亏损等问题,运行困难加大。为促进煤炭行业平稳

两部委印发《意见》-严控地方“无序调水”

  针对一些地方“无序调水”“跑马圈水”现象,国家发展改革委会同水利部日前印发《关于切实做好引调水工程前期工作的指导意见》,提出了开展引调水工程前期工作的指导思想和基本原则,并从强化规划约束、加强科学论证、严格建设程序、落实责任主体等方面作出了具体要求,旨在进一步推动科学做好引调水工程前期工作。

十三陵水库因无序旅游-环境遭破坏

树林里经营烧烤、炒菜水库边到处是游人交费后游人就可以随便钓鱼水库路边停放的车辆排长队  “每到节假日,十三陵水库边游人特别多,钓鱼、游泳、烧烤的大有人在。水库路边停车都排起了长队,库区树林里到处是垃圾。”近日,读者向本报反映,越来越多的市民到十三陵水库周边娱乐休闲

江西赣州稀土无序开采致生态严重破坏

布满山体的白色管道将稀释的稀土原液输往山下已经成型的稀土原料稀土在这样的露天池中过滤  流入过滤池中的稀土原液江西赣州,如果不是因为稀土,恐怕不会有太多人记得这个城市。然而,因其拥有全国30%以上的离子型重稀土(一种品质较好的稀土矿),被誉为中国的“稀土王国”。  一方面,得天独厚的资源优势为地方经

超均匀无序波导和近红外硅光子学器件

  近日,来自美国和英国的一个联合研究小组的研究人员们推出了超均匀无序平台实现近红外(NIR)光子设备来创建、探测和操纵光。 他们在一个绝缘体上的硅(SOI)平台上建造了这个装置,以演示在一个不受晶体对称性约束的灵活的硅集成电路结构的功能。   科学家们报告了被动器件元件的结果,包括波导和谐振器与传

有机无序体系的量子电子液体描述研究中获进展

  由于多种无序因素的影响,有机固体中电子传输的物理图像一直存在争议。近年来,“导电高聚物是否可被描述为一维拉廷格液体,其在低温下的非线性输运是否由拉廷格液体机制所主导”的话题受到学界关注,其由诺贝尔化学奖得主、导电高聚物之父阿兰·黑格提出(Nat. Mater. 8, 572(2009)),至今仍

物理所实现磁场对氢键无序有序相变的调控

  氢键是一种以氢原子为媒介的化学键,广泛存在于气态、液态和固态物质中。在一些含有氢键的晶体中,随着温度的降低,热涨落被抑制,氢键集体发生动态无序到静态有序的相变,同时伴随着晶体结构和对称性的变化,并可能产生铁电或反铁电有序。通常,氢键无序-有序的相变过程对外加磁场不敏感,因此,人们难以利用磁场来有

无序、粗放开发导致中国海岛消失问题逐年加剧

  记者21日从国家海洋局获悉,中国908专项海岛海岸带调查已全面完成,调查研究发现在中国海岛开发利用过程中存在着无序、粗放式开发,以及由人类开发活动(围填海、挖沙、炸岛)导致海岛消失等问题,并有逐年加剧的趋势。  据悉,908专项海岛海岸带调查工作于2005年全面展开,采

各种无序因素影响逐步积累-未来气候变化难以确切预测

  近年来气温变化迅速,导致全球气候剧烈变化,给许多国家带来灾难性影响。但究竟是什么造成了气候变化?未来的气候变化可以预知吗?  美国物理学家组织网近日报道,丹麦哥本哈根大学尼尔斯·玻尔研究院的最新研究表明,由于各种各样无序因素的影响逐步积累,其结果是很难预测的。这项研究发表在《地球

武汉催乳师市场缺乏规范无序竞争-从业者无资质

  接连不断的奶粉事件,催生了一个新行业催乳师。  与很多行业刚兴起时一样,催乳师服务没有标准,也拿不到资质。在各显神通的市场混战中,新妈妈们被催乳时不乏担心,催乳师们直喊“累”,医院也面临管理难题。这个行业的相关方面都发出呼吁:到了该规范的时候了!  市场

洞庭湖江豚接连死亡或因无序采砂、水体污染导致

人们对已死亡的雌性江豚进行测量。  数量少于大熊猫的珍稀动物长江江豚,近日再次引起人们的关注。据报道,从3月3日开始,洞庭湖水域在44天内,陆续出现10多头江豚死亡。同时,鄱阳湖在几天之前也接连发现江豚死亡。江豚为什么连续死亡?记者采访了相关部门和人士。 

二维无序颗粒体系中玻色峰本质研究获进展

  上海交通大学物理与天文学院、自然科学研究院张洁课题组在二维无序颗粒体系中玻色峰本质的研究中获新进展,相关研究成果日前发表于《自然—通讯》。  玻色峰,是指在无序体系中低频区域相对于德拜模型有过剩的态,具体可以表现为在态密度曲线的某个特征频率以及比热容曲线的特定温度上有个峰,或者在热传导曲线对应温

中国稀土资源遭无序开采和贱卖-储量最多维持20年

漫画:中东有石油,中国有稀土  最近一段时间,一种工业原料――稀土在国际上引起轩然大波,特别是一些西方发达国家尤为神经过敏,有的指责,有的谩骂,有的威胁,有的还要诉诸世界贸易组织,个中奥秘何在?  无法替代的“工业维生素”  自上世纪90年代以来,有“工业维生素”美称的稀土全球年消费量从3

国家能源局连发两道通知批评酒泉风电建设无序

  国家能源局两道令牌整肃风电   严厉批评酒泉风电建设无序  5月9日,国家能源局下发《关于酒泉风电基地建设有关要求的通知》(国能新能【2011】145号),对酒泉市能源局在酒泉风电基地二期工程建设中给企业定任务指标、设备招标要求选本地产品等行为提出严厉批评,同时强调“未经国家核准的项目不得开工建

科学家揭示高分子无序增强室温磷光新机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/509606.shtm

在单原子水平上解密化学有序/无序态同材料性质的关系

  完美的晶体在自然界是不存在的。现实中的材料往往存在缺陷,和化学有序/无序态,例如晶界,位错,界面,表面重构以及点缺陷。这些缺陷严重影响着材料的性质和功能。尽管材料的定量表征方法被快速建立,但精确处理有序/无序排列的三维(3D)原子和晶体缺陷对材料性质的影响仍是一大挑战。与此同时,量子力学计算方法

我国学者发现无序玻璃态固体玻璃玻色峰的方向序

  有序晶体的原子振动可描述为一系列格波,而声子则是这些格波的能量量子化。在太赫兹(THz)低频段,格波可近似为连续介质弹性波,其振动能级态密度正比于频率的平方,服从经典的德拜模型。但是,对于所有的无序玻璃态固体,它们的低频振动总是偏离德拜模型预测而出现态密度过剩,形成反常的“玻色峰(Boson p

3D无序阳离子骨架实现锂离子电池稳定氧变价反应

  中国科学院物理研究所、松山湖材料实验室依托中国散裂中子源在锂离子电池材料结构研究方面取得新进展。  锂离子电池因其各方面的优势,已经被作为储能领域的首选技术。不断提升其能量密度一直是各国科学家和技术人员努力的方向。锂离子电池的能量密度正相关于单位质量正极材料脱嵌锂的数量。众多研究表明,富锂氧化物

能源“金三角”同质化无序竞争严重-需以环境承载力定产

  宁东、鄂尔多斯、榆林曾被李克强总理称为能源“金三角”。这里的能源资源量约占全国的1/4,但由于分属宁夏、内蒙古、陕西三省区,开发粗放,资源浪费严重,同质化竞争激烈,再加上水资源总体匮乏,用水资源不合理,“金三角”发展存在严重问题。8月29日,中国工程院与宁夏回族自治区政府在银川联合举行《能源“金

证实无序岩盐氧化物正极材料中锂离子的传导和存储机制

在全球变暖和能源危机的大背景下,随着新能源技术的快速发展,人们对高性能、低成本储能技术的需求不断扩张。锂离子电池由于具有高能量密度、长循环寿命等优异综合性能,广泛应用于消费电子产品、电动汽车及储能等领域。为应对不断提高的产能需求和日益紧缺的原材料资源,高比容量、高稳定性、低成本电极材料开发是目前锂离