多序列比对法的一般步骤
多序列比对一般通过3个步骤完成:(1)两两进行双重比对。(2)生成一系统树图(dendrogram),将序列按相似性大致地分组。(3)使用系统树图作为引导,产生出最终的多序列比对结果。......阅读全文
多序列比对法的一般步骤
多序列比对一般通过3个步骤完成:(1)两两进行双重比对。(2)生成一系统树图(dendrogram),将序列按相似性大致地分组。(3)使用系统树图作为引导,产生出最终的多序列比对结果。
多序列比的概念
把两个以上字符序列对齐,逐列比较其字符的异同,使得每一列的字符尽可能一致,以发现其共同的结构特征的方法称为多序列比对。多序列比对问题是双序列比对问题的推广。
核酸序列的一般分析流程
核酸序列的一般分析流程1.1 核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.nc
核酸序列的一般分析流程
1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
核酸序列分析的一般流程
1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b
多序列比对的实际应用2
模体和样式前面叙述的方法对于多序列比对极为有用,但是用户必须实现搜集好独立的输入序列,要么通过一系列的BLAST或其它的数据库搜索,要么在实验室里直接作出决定。但是,有太多的方法可以获取一个单独的序列,并且基于此序列中的任何模体或样式,返回所有的蛋白质家族,完成某个特异方法所定义的最佳比对。很多时候
多序列比对的目标是什么?
多序列比对的目标是使得参与比对的序列中有尽可能多的列具有相同的字符,即使得相同残基的位点位于同一列,这样以便于发现不同的序列之间的相似部分,从而推断它们在结构和功能上的相似关系,主要用于分子进化关系,预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数,基因组序列分析等。
多序列比对的实际应用1
Andreas D.BaxevanisGenome Technology BranchNational Human Genome Research InstitudeNational Institutes of HealthBethesda.Maryland 在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中,人
PCR一般步骤
(一)总RNA提取取液氮冻存脑组织置于玻璃匀浆器中,按100g:3ml的比例加入Trizol试剂,严格按照TrizolRNA提取试剂盒说明书的流程进行。(1)加Trizol(按3ml/100mg组织,宁多勿少)置于玻璃匀浆器中匀浆后,冰浴10-15min。(2)移入1.5mlEP管中,4ºC 130
构建多序列比对模型的方法介绍
手工比对方法手工比对方法在文献中经常看到。因为难免加入一些主观因素,手工比对通常被认为有很大的随意性。其实,即使用计算机程序进行自动比对,所得结果中的片面性也不能予以忽视。在运行经过测试并具有比较高的可信度的计算机程序基础上,结合实验结果或文献资料,对多序列比对结果进行手工修饰,应该说是非常必要的。
滴定分析的一般步骤
一般步骤(通用): 1.明确实验目的,熟知实验内容及实验原理。 2.准备所需仪器及药品。 3.动手操作实验,得出数据(注意安全!)。 4.记录实验报告。 5.清洗仪器,处理实验废液(注意环保)。 具体步骤就依你的实验内容和性质而定,而且使用的仪器药品也不一样。最重要的是你的实验内容、原理
基因工程的一般步骤
取得符合要求的DNA片段;构建基因的表达载体;将目的基因导入受体细胞;目的基因的检测与鉴定。
类器官培养的一般步骤
类器官培养的一般步骤如下:样本准备:获取需要培养的类器官样本,并进行处理,如清洗、剪碎等。消化:将样本放入适量的消化液中,进行消化处理,使其分散成单个细胞或细胞团。铺板:将消化后的细胞或细胞团均匀地铺在培养板上,加入适量的基质胶,以提供支撑和营养。培养:将培养板放入培养箱中,提供适宜的培养条件,如温
研究有机物的一般步骤
研究有机物一般经过以下几个基本步骤:分离、提纯→确定实验式→确定分子式→确定结构式鉴别方法在药品的生产、研究及检验等过程中,常常会遇到有机化合物的分离、提纯和鉴别等问题。有机化合物的鉴别、分离和提纯是三个既有关联而又不相同的概念。分离和提纯的目的都是由混合物得到纯净物,但要求不同,处理方法也不同。分
研究有机物的一般步骤
第一,直接法。测其密度,从中算出摩尔质量,推出一摩尔气体中各元素的原子个数,从而计算分子式。第二,最简式法。即用碳氢个数比,得知其最简式,来推测其分子式。第三,余数法。用相对分子质量除以碳氢二的相对质量。
色谱分析的一般步骤
如果你问的是色谱仪的操作,那么大致需要以下几步:1.安装色谱柱.如果是新柱子要先老化.2.检漏.3.设置升温程序、载气流速等参数.4.进空白样.谱图除溶剂峰外为一直线就可以做样了.5.进样分析.
红外光谱一般解析步骤
1、根据分子式,计算不饱和度:f = 1 + n4 + 1/2 ( n3 – n1) 通过计算不饱和度估计分子结构式中是否有双键、三键或芳香环等,并可验证光谱解析是否合理 2、根据未知物的红外光谱图找出主要的强吸收峰。按照由简单到复杂的顺序,习惯上将红外区分为五个区域来分析: (1)4000
绿化种植土一般多厚
不同的植物种植土深度不一。草本系植物浅根,10-20cm,比如一年或两年生植物;灌木类,则25-40cm,这个深度满足大部分植物所需。如果是乔木或是根系发达的植物,最好露地栽植。绿化种植土厚度的注意事项:(一)城市公共绿地,特别是城市中心地区新建公共绿地,总体上要以乔木为骨干多层次进行配置,尽可能在
食品微生物检验的一般步骤
检验前准备(1)准备好所需的各种仪器,如冰箱、恒温水浴箱、显微镜等。(2)各种玻璃仪器,如吸管、平皿、广口瓶、试管等均需刷洗干净(121℃20min)或干法(160℃一170℃,2h)灭菌,冷却后送无菌室备用。(3)准备好实验所需的各种试剂、药品,做好普通琼脂培养基或其他选择性培养基,根据需要分装试
红外光谱图解析的一般步骤
1、根据分子式,计算不饱和度:f = 1 + n4 + 1/2 ( n3 – n1) 通过计算不饱和度估计分子结构式中是否有双键、三键或芳香环等,并可验证光谱解析是否合理 2、根据未知物的红外光谱图找出主要的强吸收峰。按照由简单到复杂的顺序,习惯上将红外区分为五个区域来分析: (1)
离心机一般故障的检查步骤
离心机分离技术是根据颗粒在一个实用离心场合中的状态而发展起来的新技术。离心分离技术也经历了数代更换,由医用离心机,低速冷冻离心机,高速离心机到高速冷冻离心机,超大容量冷冻离心机,超速离心机,超速冷冻离心机,智能高速冷冻离心机。不同密度、大小或外形的颗粒在不同速度的离心场合中沉降,所以一个大体是球形非
概述脑AVM栓塞术的一般-步骤
1.会阴及两侧腹股沟常规消毒,铺无菌巾。 2.用1%或2%利多卡因在右(或左)侧腹股沟韧带下2~3cm,股动脉搏动明显处逐层进行浸润麻醉,并给病人神经安定麻醉。 3.用16G或18G穿刺针穿刺右(或左)侧股动脉,采用Seldinger法循序插入6F导管鞘,导管鞘侧臂带三通连接管与动脉加压输液
菌落总数检测一般步骤有哪些
菌落总数检测一般步骤为:采样 — 样品制备与稀释 — 倒平板 — 涂布平板 — 倒置培养 — 菌落计数 — 计算菌落总数样品制备,需要对样品进行均质,根据客户需要检测的样品不同。WIGGENS提供不同的均质设备,如均质机,拍打式均质器等;样品的稀释,国标中采用1:10的十倍稀释方法,SOCOREX提
透射电镜一般操作步骤
抽真空 接通总电源,打开冷却水,接通抽真空开关,真空系统就自动的抽真空。一般经 15~2 0 m i n 后,真空度即可达到 10-4~ 10-5 T o r r,持高真空指示灯亮后即可上机工作。 加电子枪高压 接通镜筒内的电源,给电子枪和透镜供电,由低至高速级给电子枪加高压,直至所需值。
研磨试验——检查项目的一般步骤
首先病人俯卧,健侧膝关节屈曲90°。检查者使其患肢内收稍背伸,并将膝部放于病人大腿后侧,两手持握足部,向上提拉,并向外、向内侧旋转,如发生疼痛,则为阳性。然后在前述的基础上,检查者双手握住患肢足部,使患膝屈曲90°,小腿呈足心向上直立位,再向下挤压膝关节,并向外及向内旋转,同时将膝关节屈曲到最大
检测实验室检验的一般步骤(二)
⑤化学分离法主要有以下几种方法: a、磺化法和皂化法:常用来处理油脂或含脂肪的样品。例如,农药残留分析和脂溶性维生素测定中,油脂被浓H2SO4磺化或被碱皂化,由憎水性变成亲水性,使油脂中需检测的非极性物质能够较容易地被非极性或弱极性的溶剂提取出来。 b、沉淀分离法:是利用沉淀反应进行分离的方
简述红外光谱图解析的一般步骤
一、红外光谱的原理 1. 原理 样品受到频率连续变化的红外光照射时,分子吸收其中一些频率的辐射,分子振动或转动引起偶极矩的净变化,是振-转能级从基态跃迁到激发态,相应于这些区域的透射光强减弱,透过率T%对波数或波长的曲线,即为红外光谱。 辐射→分子振动能级跃迁→红外光谱→官能团→分子结构
简述红外光谱图解析的一般步骤
(1)根据分子式计算不饱和度公式:不饱和度 Ω=n4+1+(n3-n1)/2 其中:n4:化合价为4价的原子个数(主要是C原子), n3:化合价为3价的原子个数(主要是N原子), n1:化合价为1价的原子个数(主要是H,X原子) (2)分析3300~2800cm-1区域C-H伸缩振动吸收;以3
检测实验室检验的一般步骤(一)
食品检验的基本步骤为:样品的采集;样品的处理;样品的分析检测;分析结果的记录与处理四个阶段。 ⑴样品的采集 样品的采集又称采样、样品的制备,是指抽取有一定代表性的样品,供分析化验用。样品的采集一般包括三个内容:即抽样、取样和制样。采样时必须注意样品的生产日期、批号、代表性和均匀性。采样数量应
简述红外光谱图解析的一般步骤
利用红外吸收光谱进行有机化合物定性分析可分为两个方面:一是官能团定性分析,主要依据红外吸收光谱的特征频率来鉴别含有哪些官能团,以确定未知化合物的类别;二是结构分析,即利用红外吸收光谱提供的信息,结合未知物的各种性质和其它结构分析手段(如紫外吸收光谱、核磁共振波谱、质谱)提供的信息,来确定未知物的