多序列比对的实际应用1
Andreas D.BaxevanisGenome Technology BranchNational Human Genome Research InstitudeNational Institutes of HealthBethesda.Maryland 在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中，人们习惯于把新的序列同已知功能的蛋白序列作比对。由于这些比对通常都希望能够推测新蛋白的功能，不管它们是双重比对还是多序列比对，都可以回答大量的其它的生物学问题。举例来说，面对一堆搜集的比对序列，人们会研究隐含于蛋白之中的系统发生的关系，以便于更好地理解蛋白的进化。人们并不只是着眼于某一个蛋白，而是研究一个家族中的相关蛋白，看看进化压力和生物秩序如何结合起来创造出新的具有虽然不同但是功能相关的蛋白。研究完多序列比对中的高度保守区域，我们可以对蛋白质的整个结构进行预测，并且猜测这些保守区域对于维持三维结构的重要性。显然，分析一群相......阅读全文
多序列比对的实际应用1
Andreas D.BaxevanisGenome Technology BranchNational Human Genome Research InstitudeNational Institutes of HealthBethesda.Maryland 在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中，人
多序列比对的实际应用2
模体和样式前面叙述的方法对于多序列比对极为有用，但是用户必须实现搜集好独立的输入序列，要么通过一系列的BLAST或其它的数据库搜索，要么在实验室里直接作出决定。但是，有太多的方法可以获取一个单独的序列，并且基于此序列中的任何模体或样式，返回所有的蛋白质家族，完成某个特异方法所定义的最佳比对。很多时候
多序列比对的目标是什么？
多序列比对的目标是使得参与比对的序列中有尽可能多的列具有相同的字符，即使得相同残基的位点位于同一列，这样以便于发现不同的序列之间的相似部分，从而推断它们在结构和功能上的相似关系，主要用于分子进化关系，预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数，基因组序列分析等。
构建多序列比对模型的方法介绍
手工比对方法手工比对方法在文献中经常看到。因为难免加入一些主观因素，手工比对通常被认为有很大的随意性。其实，即使用计算机程序进行自动比对，所得结果中的片面性也不能予以忽视。在运行经过测试并具有比较高的可信度的计算机程序基础上，结合实验结果或文献资料，对多序列比对结果进行手工修饰，应该说是非常必要的。
多序列比对法的一般步骤
多序列比对一般通过3个步骤完成：（1）两两进行双重比对。（2）生成一系统树图（dendrogram），将序列按相似性大致地分组。（3）使用系统树图作为引导，产生出最终的多序列比对结果。
如何获取漂亮的ClustalX序列比对图片
发表论文当然需要一些质量高的图片，那么如何将ClustalX序列比对的结果转化成比较漂亮的图片呢？小编在此搜集了一个还不错的教程，分享给大家。多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR 引物，以及在分子进化
如何获取漂亮的ClustalX序列比对图片
发表论文当然需要一些质量高的图片，那么如何将ClustalX序列比对的结果转化成比较漂亮的图片呢？小编在此搜集了一个还不错的教程，分享给大家。多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR 引物，以及在分子进化
如何获取漂亮的ClustalX序列比对图片
发表论文当然需要一些质量高的图片，那么如何将ClustalX序列比对的结果转化成比较漂亮的图片呢？小编在此搜集了一个还不错的教程，分享给大家。多序列比对在分子生物学中是一个基本方法，用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR 引物，以及在分子进化
双序列比对的背景及临床意义
是序列分析的基础·然而，对于构成基因家族的成组的序列来说，我们要建立多个序列之间的关系，这样才能揭示整个基因家族的特征·多序列比对在阐明一组相关序列的重要生物学模式方面起着相当重要的作用。多序列比对有时用来区分一组序列之间的差异,但其主要用于描述一组序列之间的相似性关系,以便对一个基因家族的特征有一
多重序列比对及系统发生树的构建
【实验目的】1、熟悉构建分子系统发生树的基本过程，获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识；2、掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法；3、掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。【实验原理】在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的
多重序列比对及系统发生树的构建实验
实验方法原理 在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。 实验步骤
多重序列比对及系统发生树的构建实验
实验方法原理在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤：1. 以FASTA格式准
序列比对之Clustalx与Clustalw使用指南
这几天实验需要做多序列比对，很久不做了，一时之间不知道如何使用clustal这个工具了。在网上搜集了一些资料，做个整理，总结了Clustalx和Clustalw的使用，省得以后久不使用又生疏了，又要去整理了，在此分享给大家，希望有所帮助。1.先提供下载地址：Clustalx、Clustalw的各种最
多序列比的概念
把两个以上字符序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列的字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征的方法称为多序列比对。多序列比对问题是双序列比对问题的推广。
多重序列比对及系统发生树的构建实验（一）
实验方法原理在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤：1. 以FASTA格式准
多重序列比对及系统发生树的构建实验（二）
2. 文件outfile改为infile。点击DNADIST程序。选项M是输入刚才设置的republicate的数目，输入D选择data sets，输入200。设置好条件后，输入Y确认参数。程序开始运行，并在EXE文件夹中产生outfile，部分内容如下：将outfile文件名改为infile，为
基因序列排序与整理、数据库比对与意义
由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后，再利用DNA扩增的方式原理，在扩增的同时借由侦测萤光的方式（将不同碱基原料接上萤光讯号，只要这有接讯号的碱基被合成了，即会发出不同强度的萤光讯号）即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基
DNA序列分析技术1
物种的遗传多样性在本质上是DNA 一级序列的多样性。近年来，随着DNA 测序技术的迅速发展和日益普及，DNA 测序在遗传多样性的研究中正在起着越来越大的作用。本章将介绍目前在遗传多样性研究中常用的一种手动和一种全自动双链DNA 测序方法。1.DNA 模板的制备在遗传多样性的研究中，由于样本量一般都较
色差仪的实际应用
调色方面的测量当用户拿到一个样品的时候，需要再现出和这个样品相同的颜色，这个时候需要反复打样，以前是靠人眼比较所打出的小样和标准样品之间的差别，当在允许范围内时，把工艺交给车间去生产.由于人眼的主观因素，这个差值很难确定，这时候，可用色差计测量小样和标准样品的差值，根据差值来确定样品的色差是否符合范
表达序列标签的应用
EST作为表达基因所在区域的分子标签因编码DNA序列高度保守而具有自身的特殊性质，与来自非表达序列的标记（如AFLP、RAPD、SSR 等）相比更可能穿越家系与种的限制，因此EST标记在亲缘关系较远的物种间比较基因组连锁图和比较质量性状信息是特别有用。同样，对于一个DNA序列缺乏的目标物种，来源于其
PH电极的的实际应用
最初人们对酸碱的意识是入口食物的味道，譬如醋是酸的，柠檬也是酸的，尝起来涩涩的碱面是碱性的，这是pH值或酸碱度最初的由来，简单直观。 以摩尔值表示水相溶液中的氢离子浓度，浓度从100（1）到10-14，再以10为底的负对数换算，pH范围即为0-14。pH是拉丁文pondushydrogenii
记录仪的实际应用
医药行业：药品车间、仓库、药店等环境温度的观测记录。 记录仪 食品行业：食品车间、仓库等环境温度的观测记录。 电子行业：电子车间、洁净环境、机房等环境温度的观测记录。 农业研究：对植物生长环境的温度记录。 其他对环境温度有观测记录要求的场合 温湿度测量是现代测量新发展出来的一个领域
振动筛的实际应用
1．筛分：筛分就是把颗粒、粉末分成大小不同的粒子段。单台振动筛分机可配至4层筛网，能连续分选出2-5个粒级，并控制较窄的粒度范围； 2．筛出杂质：高性能筛机在高流量处理过程中，能迅速清除百分含量低的大颗粒或小颗粒浆渣分离。振动筛分机能把各类浆液中的非溶性固体物质迅速清除，并连续排渣。 了解一
面粉拉伸试验的实际应用
面团拉伸的检测其实是用于检测面粉的流变学特性,其测量数据与面粉的品质有非常显著的相关性。如果能将面条拉伸试验与粉质仪、拉伸仪中的试验数据及烘焙(蒸煮)试验相结合,找出自己所产面粉的正常试验值范围,该方法将是一种简单可行、能对面粉的质量进行监控的一种有效手段。面粉拉伸阻力通过测定几个参数来反映
离心机的实际应用
药品生产行业在积极贯彻 GMP 的同时，为医药工业生产服务的制药装备行业相应提出了《制药装备符合药品生产质量管理规范的通则》等指导性标准，以配合规范的实施。这里制药装备所提出的“符合”与制药行业的“贯彻”表达出制造方和使用方两者有着不“符合”就不能很好的“贯彻”，要“贯彻”就必须“符合”的不可分
离心机的实际应用
药品生产行业在积极贯彻 GMP 的同时，为医药工业生产服务的制药装备行业相应提出了《制药装备符合药品生产质量管理规范的通则》等指导性标准，以配合规范的实施。这里制药装备所提出的“符合”与制药行业的“贯彻”表达出制造方和使用方两者有着不“符合”就不能很好的“贯彻”，要“贯彻”就必须“符合”的不可分
膜过滤技术的实际应用
膜过滤技术正开始在各种设备中频繁使用，尤其是在气液过滤网这样的设备中。而膜过滤技术在实际的运用中有哪些分类?超滤所谓的超滤就是指在一定的压力下，含有小分子的溶液经过被支撑的膜表面时，其中的溶剂和小分子溶质会透过膜，而大分子的则被拦截，作为浓缩液被回收。海德能超滤膜过滤粒径在5--10nm之间，操作压
简述醋酸铜的实际应用
有机合成 乙酸铜更多的是在有机合成中作为催化剂或氧化剂使用。例如，Cu2(OAc)4可以催化两个末端炔烃的偶联，产物是1,3-二炔： Cu2(OAc)4 + 2 RC≡CH → 2 CuOAc + RC≡C-C≡CR + 2 HOAc 反应的中间体包括乙炔亚铜等，再经乙酸铜氧化，得到炔基自
摩尔吸光系数的实际应用
当吸光物质的浓度为1mol/L，吸收池厚为1cm，以一定波长的光通过时，所引起的吸光度值A。ε值取决于入射光的波长和吸光物质的吸光特性，亦受溶剂和温度的影响。在实际应用中，ε可作为定性鉴定的参数，也可用以估量定量方法的灵敏度。ε值越大，表示该有色物质对该波长光的吸收能力越强，显色反应越灵敏，反映了用
热电阻的实际应用
目前应用最广泛的热电阻材料是铂和铜：铂电阻精度高，适用于中性和氧化性介质，稳定性好，具有一定的非线性，温度越高电阻变化率越小；铜电阻在测温范围内电阻值和温度呈线性关系，温度线数大，适用于无腐蚀介质，超过150易被氧化。中国最常用的有R0=10Ω、R0=100Ω和R0=1000Ω等几种，它们的分度