这两家公司在单细胞测序开展合作
Oxford Nanopore Technologies 周四表示，它已与 10x Genomics 合作开发单细胞和空间全长转录组测序的工作流程。 在合作下，Oxford Nanopore 的 PromethIon 测序仪、流动槽和试剂盒已被添加到 10x Genomics Compatible Partner Program 中。此外，Oxford Nanopore 还发布了仅使用纳米孔的单细胞测序方案。 Oxford Nanopore 表示：“双方都相信这将简化客户体验，并突出基于纳米孔的测序与 10 倍基因组学工作流程相结合的引人注目的效用。” “我们很高兴欢迎 Oxford Nanopore 加入 10x 兼容合作伙伴计划，并验证我们领先的 Chromium 单细胞和 Visium 空间产品组合可用于 PromethIon 设备，”10x Genomics 营销副总裁 Edwin Hauw 在一份声明中说。 “......阅读全文
Ultima－Genomics联合英伟达挑战基因测序巨头
测序技术新人 Ultima Genomics 近日表示，它已与英伟达合作以加速基因组分析。 总部位于加利福尼亚州纽瓦克的 Ultima 一周前从隐身模式中脱颖而出，获得了 6 亿美元的资金支持，并表示计划在明年初推出一个高通量 DNA 测序平台。该公司还发布了一份 BioRxiv 预印本，详细
我国学者采用混合组装策略和软件技术大幅降低测序深度
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平院士和马占山研究员领导的团队发布了以“10x Genomics测序”辅助“三代测序”的混合组装策略和软件技术。研究人员采用美国加州大学Jain等人2018年发表在 Nature Biotechnology（doi: 10.1038/nbt.4060.）的人类基
Microbial－Genomics：口腔细菌或会导致肠炎的发生
悉尼新南威尔士大学领导的一项研究发现，严重的溃疡性结肠炎（一种炎症性肠病（IBD））与一种新发现的口腔细菌菌株有关。 科学家在患有严重溃疡性结肠炎的人的细菌细胞样本中发现了一种名为“ pSma1”的分子。该分子在通常存在于口腔中的弯曲杆菌弯曲杆菌（C. condisus）的某些菌株中。 这项
Pathway－Genomics付款4百万美元用于回扣指控
分析测试百科网讯 政府机构近日宣布，Pathway Genomics已同意支付约4百万美元用于解决美国司法部的指控，指控其向医生和医生组织非法支付回扣以交换转诊病人。 美国律师Laura Duffy在声明中说道：“给医疗服务提供者回扣用于换取病人的转诊削弱医师的医疗判断，并且利用了患者的信任。
－Google－Genomics：25元/年的基因云存储生意
相较于Google研究的高大上的月球探测器项目，Google Genomics可能对人类有更重大的意义。从现在的配对数千组基因组，随着技术的发展未来能做到配对数百万对，Google Genomics计划无疑能推动下一个十年内医学的发展。但是我们的问题又来了，亚马逊、Google、IBM、微软，巨
Nature：借助第三代测序韩国发表最连续人类基因组
国立首尔大学医学院的研究人员和美国被誉为“测序黑马”的公司——10x Genomics联合运用去年新发售的GemCodeTM测序平台以及第三代测序PacBio单分子实时测序平台在本期的Nature上发表了一项新的研究，对一名韩国人的基因组（AK1）进行从头组装和单倍体型定相信息分析。这是迄今为止
四天内，QIAGEN、Illumina、Agilent都与这家公司达成了合作
编者按：近日，10X Genomics公司在短短四天内接连宣布与业内大型公司QIAGEN，Illumina和Agilent达成合作伙伴关系。这几家公司不约而同地看中了该公司的GemCode平台技术。 在去年的摩根健康大会上以黑马之姿出现在公众视野的10X Genomics公司（以下简称10X
开源代码－Cell－Ranger－可以处理哪些类型的单细胞测序数据？
Cell Ranger 主要用于处理由 10x Genomics 平台生成的单细胞测序数据，包括以下几种常见类型：单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据单细胞免疫组库（scVDJ-seq）测序数据单细胞 ATAC 测序（scATAC-seq）数据（在较新的版本中支持）它为这些数据提供了从原始
Paragon－Genomics推出与华大智造测序平台兼容产品
2019年6月13日，Paragon Genomics宣布首批与华大智造测序平台兼容的CleanPlex®产品正式推出，并将于6月15-6月18日举办的欧洲人类遗传学大会(ESHG 2019)上正式发布。在本次大会上，华大智造将主办卫星会，届时也将专门介绍华大智造测序平台兼容的CleanPlex
Paragon－Genomics－推出与华大智造测序平台兼容产品
2019年6月13日，Paragon Genomics宣布首批与华大智造测序平台兼容的CleanPlex®产品正式推出，并将于6月15-6月18日举办的欧洲人类遗传学大会(ESHG 2019)上正式发布。在本次大会上，华大智造将主办卫星会，届时也将专门介绍华大智造测序平台兼容的CleanPlex
DNA测序大厂融资4亿美元，将收购Loop－Genomics
DNA测序公司Element Biosciences周二表示，它已收购Loop Genomics，收购金额未公开。 Loop 总部位于加利福尼亚州圣何塞，销售样本制备试剂盒和测序服务，利用短读长测序提供合成长读长。 总部位于圣地亚哥的 Element 表示，通过将 Loop 的长读长样品制备
卢煜明开启NIPT新时代，实现无创单基因遗传病检测
无创单基因遗传病检测可以通过对胎儿cfDNA进行目标区域捕获测序，结合父母双方单体型信息，判断胎儿相关疾病的携带情况。近日，Genome Web网站报道了NIPT在单基因遗传病检测上的新突破。 香港中文大学卢煜明教授开发了一种新方法，对父母双方基因组单倍型分型，并对单基因病突变位点附近有效SN
提供一些单细胞测序基准数据集的资源链接
以下是一些可以获取单细胞测序基准数据集的资源链接：The Human Cell Atlas (HCA)：https://www.humancellatlas.org/10x Genomics：https://www.10xgenomics.com/resources/datasets/ ，这里提供了
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
利用Plant－Genomics微孔板分析THC/CBD制备大麻植物样品
Porvair Sciences报告了一种高效流程，利用Plant Genomics微孔板，以在分析四氢大麻酚（THC）和大麻二酚（CBD）时制备大麻样品。 随着大麻合法化的呼声越来越高，高产能、高精确地测量其活性成分的需求也在显著增长。大麻植物包含人类大脑受体的多种大麻酚。其中两种最重要的是精神活
Premaitha－Health和Coastal－Genomics合作开发临床测序测试技术
分析测试百科网讯 近日，Premaitha公司表示，Premaitha Health和Coastal Genomics签署了开发临床DNA测序测试技术的协议。图片来源于网络 根据协议，位于温哥华的Coastal Genomics和位于英国曼彻斯特的Premaitha计划开发用于生殖健康和其他应
2019JP摩根会议－第一天会议要点精炼
第37届J.P摩根大会于周一如期而至，几家生命科学和分子诊断公司和数千名投资者参加了这场盛会。图片来源于网络 以下是要点精炼： 10x Genomics 1，10x Genomics在2018年的总收入为1.46亿美元，高于2017年的7100万美元，增加了一倍以上。 2，2018年已经
技术前沿空间转录组测序技术的展望
对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究，更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起，使得在保留样本空间位置信息的同时，检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews G
常用的基准单细胞测序数据集有哪些？
以下是一些较为常用的基准单细胞测序数据集：PBMC（外周血单核细胞）数据集：由 10x Genomics 等平台产生，常用于评估免疫细胞的分析方法。小鼠大脑数据集：例如艾伦脑科学研究所发布的相关数据集，有助于研究神经细胞的类型和功能。肿瘤相关数据集：如某些特定癌症类型的单细胞测序数据，可用于评估肿瘤
推荐一些单细胞测序数据处理的开源代码
以下是一些用于单细胞测序数据处理的开源代码和工具：Seurat：这是一个在 R 语言中广泛使用的单细胞分析包。代码可在 GitHub 上获取：https://github.com/satijalab/seuratScanpy：一个用于 Python 的单细胞分析库。GitHub 地址：https:/
测序仪性能知多少
2015年二代测序走得更远。因为测序价格下降，技术的提高，测序读长增大，研究人员开始利用二代测序和配套设备来更好的评估长范围的基因组信息。 DeciBio最近的市场报告显示， NGS对应的市场已经达到$ 24亿。并预计2019年将增长至 $ 45亿。临床应用将成为推动这一增长的主要原因，包括单
测序仪性能知多少
2015年二代测序走得更远。因为测序价格下降，技术的提高，测序读长增大，研究人员开始利用二代测序和配套设备来更好的评估长范围的基因组信息。 DeciBio最近的市场报告显示， NGS对应的市场已经达到$ 24亿。并预计2019年将增长至 $ 45亿。临床应用将成为推动这一增长的主要原因，包括单
Clinical－Genomics融资1500万助肿瘤基因检测新方法开发
精准医疗的兴起，让科学家们对基因诊断在肿瘤治疗中的应用又有了新的认识。如何能够通过基因诊断预测癌症风险以及个性化设计治疗方案已经成为肿瘤治疗领域的重点。因此，基因诊断已经成为生物医药产业中发展最为迅速的领域之一。最近，基因诊断公司Clinical Genomics就宣布融资1500万美元涉足液体
Bionano－Genomics－以高达－6400－万美元的价格收购－Purigen－Biosystems
光学基因组图谱 (OGM) 公司 Bionano Genomics 在近日收盘后表示，它已签署最终协议，收购 Purigen Biosystems，该公司使用专有的等速电泳 (ITP) 技术开发和商业化自动化核酸提取和纯化解决方案。 Bionano 表示，拟议收购的交易对价将高达 6400 万
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－5
图5: 长读长实时测序原理。长reads的合成与真正测序的平台不同的是，合成长读长技术依赖于一个barcode系统来结合不同的片段，通过已有的短读长测序仪来获得长读长reads61。该方法将大的DNA分子分割成若干个小片段到微孔中或者乳液中。每个微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。
博奥晶典两大引进平台入围2015十大生命科学领域创新产品
日前，致力于生命学科技研究的美国著名杂志The scientist推出2015年度生物十大创新产品排行榜。这十大创新产品，包含了7个基因组学、1个蛋白组学和2个代谢组学。该榜单旨在表彰对科学和医学领域产生巨大影响的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术。 博奥晶典长期致力于技术创新，引进转化
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
有哪些常用的基准单细胞测序数据集？
以下是一些常用的基准单细胞测序数据集：Human Cell Atlas（HCA）：这是一个大规模的项目，旨在绘制人体所有细胞类型的图谱，包含了来自多个组织和器官的单细胞测序数据。10x Genomics 提供的一些公开数据集，例如 PBMC（外周血单核细胞）数据集。Mouse Cell Atlas：
盘点：2015年那些横空出世的“非典型”测序仪
提及测序仪，那就不得不说Illumina和Thermo两只“大鳄”。这两家公司提供的测序仪占据了绝大部分市场份额。出于应对特殊政策的需要，国内的几家企业也纷纷推出了“自己”的测序仪。放眼国际市场，有一些企业另辟蹊径，研发出别具特色的测序仪，力图从垄断者手中分得一杯羹。小编今天就带大家认识一下这些