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技术前沿空间转录组测序技术的展望

对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究,更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起,使得在保留样本空间位置信息的同时,检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews Genetics》的一篇Research Highlights中,“Spatial transcriptomics coming of age”的标题体现了空间转录组技术在接下来的生命科学研究中的重要性。 空间转录组测序技术的关键词是两个:“空间”和“测序”。这两个问题解决了,所有的问题就迎刃而解。其中,“测序”相对来说比较简单,现有高通量二代测序技术已非常成熟,测序成本也已经非常非常低,对于微量核酸转录的定量也通过添加UMI方式得到很好的解决。而解决“空间”这个问题,这些年的研究进展主要集中在两个方向: 一类是精确定位的技术,......阅读全文

技术前沿-空间转录组测序技术的展望

对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究,更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起,使得在保留样本空间位置信息的同时,检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews G

【技术前沿】空间转录组测序技术的展望

对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究,更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起,使得在保留样本空间位置信息的同时,检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews Genetic

技术前沿-空间转录组测序技术的展望

  对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究,更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起,使得在保留样本空间位置信息的同时,检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews Genetic

空间转录组技术用于免疫治疗的研究与展望

肿瘤免疫治疗现状近年来,免疫疗法,这种通过激活患者的免疫系统来杀死癌细胞的策略,已成为对抗癌症的新希望。目前的免疫疗法主要基于癌症疫苗,细胞因子(例如白介素2),继细胞转移(ACT)和免疫检查点抑制。基于他们的特点,特别针对程序性细胞死亡-1 /程序性细胞死亡配体1(PD-1 / PD-L1)途

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

  空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。   空间转录组测序运用方向(Trends Bi

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。空间转录组测序运用方向(Trends Biotechn

中科院学者Nature Protocols:空间转录组测序新技术

  在真核细胞中,转录组的空间组织已经成为调节RNA转录后命运的一种有力手段,但是一般研究采用的是原位杂交或者原位的荧光染色,这项技术操作困难且通量低。近期来自中科院生物化学与细胞生物学研究所细胞生物学国家重点实验室等处的研究人员作建立了一种可以获得具有空间位置信息的少量细胞转录组图谱的技术方法:G

2018年新技术:空间转录组学技术

  ——也许不久的将来,定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。  对于基因表达研究来说,空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展,这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。  空间基因表达对于理解组织中细胞的

空间转录组测序样本准备指南

  一、外泌体研究热度持续攀升   外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,

空间转录组测序样本准备指南

  现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究,所以在样本冻存前至少10分钟,将异戊烷和液氮浴准备好(之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻,是因为液氮沸点比较低,直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴,导致不同区域降温不同步而改变内部形态,甚至组织碎裂)。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到