梯度凝胶电泳的定义
中文名称梯度凝胶电泳英文名称gradient gel electrophoresis定 义使所制备的电泳凝胶形成从大到小的孔隙梯度,以期样品中各组分在电泳过程中穿过孔径逐渐减小的凝胶,以期得到更好的分离。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)......阅读全文
变性梯度凝胶电泳的研究历史与应用
变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)最初是Lerman 等人于20 世纪80 年代初期发明的,起初主要用来检测DNA 片段中的点突变。Muyzer 等人在1993 年首次将其应用于微生物群落结构研究 。后来又发展出其衍生技术,温度
变性梯度凝胶电泳技术的技术原理
双链DNA 分子在一般的聚丙烯酰胺凝胶电泳时,其迁移行为决定于其分子大小和电荷。不同长度的DNA 片段能够被区分开,但同样长度的DNA 片段在胶中的迁移行为一样,因此不能被区分。DGGE/TGGE 技术在一般的聚丙烯酰胺凝胶基础上,加入了变性剂(尿素和甲酰胺)梯度,从而能够把同样长度但序列不同的DN
电化学梯度发的定义
电化学梯度指的是浓度梯度和电位梯度。在生物细胞上,这两种梯度往往是同时存在的。
链分离凝胶电泳的定义
中文名称链分离凝胶电泳英文名称strand separating gel electrophoresis定 义一种存在变性剂(脲和甲酰胺等)梯度的凝胶电泳,可以分离长度相同而序列不同的解链核酸。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
脉冲电场凝胶电泳的定义
脉冲电场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis),在脉冲电场中,DNA分子的迁移方向随着电场方向的周期性变化而不断改变。
脉冲电场凝胶电泳的定义
PFGE:脉冲电场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis),在脉冲电场中,DNA分子的迁移方向随着电场方向的周期性变化而不断改变。在标准的PFGE中,第一个脉冲的电场方向在另一侧成45°夹角。由于琼脂糖凝胶的电场方向、电流大小及作用时间都在交替变化,使得DNA分子
反转电场凝胶电泳的定义
中文名称反转电场凝胶电泳英文名称field-inversion gel electrophoresis;FIGE定 义一种脉冲电场凝胶电泳,使用单对电极和一个可转动的潜入式琼脂糖凝胶板托,电泳时电场有规律地颠倒180。,驱动DNA先向后退,再向前进,使向前的脉冲时间或场强大于向后,样品获得向前的净
水平板凝胶电泳的定义
中文名称水平板凝胶电泳英文名称horizontal slab gel electrophoresis定 义在水平方向放置的凝胶平板中进行的电泳。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
变性梯度凝胶电泳不同的双链DNA-片段
不同的双链DNA 片段因为其序列组成不一样,所以其解链区域及各解链区域的解链浓度也是不一样的。当它们进行DGGE时,一开始变性剂浓度比较小,不能使双链DNA 片段最低的解链区域解链,此时DNA 片段的迁移行为和在一般的聚丙烯酰胺凝胶中一样。然而,一旦变性剂浓度达到DNA 片段最高的解链区域温度时
变性梯度凝胶电泳的技术优势和缺陷
优点1、几乎可以检出所有突变2、可将突变分子完好无损地同野生型分子分开用于进一步的分析3、无须标记4、电泳前只需一步操作5、可用于未经扩增的基因组 DNA6、可检测出象甲基化这样的 DNA 修饰缺点1、需要专门设备需要用计算机对序列进行分析2、需要进行预实验需要昂贵的“ GC 夹板”3、无法确定突变
变性梯度凝胶电泳技术的优缺点对比
DGGE 法的优缺点优点1、几乎可以检出所有突变2、可将突变分子完好无损地同野生型分子分开用于进一步的分析3、无须标记4、电泳前只需一步操作5、可用于未经扩增的基因组 DNA6、可检测出象甲基化这样的 DNA 修饰缺点1、需要专门设备需要用计算机对序列进行分析2、需要进行预实验需要昂贵的“ GC 夹
变性梯度凝胶电泳技术的原理和应用
变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)最初是Lerman 等人于20 世纪80 年代初期发明的,起初主要用来检测DNA 片段中的点突变。Muyzer 等人在1993 年首次将其应用于微生物群落结构研究 。后来又发展出其衍生技术,温度
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验
实验方法原理 肝与其他动物组织一样,可制备用作双向电泳的材料。离心之后,溶于合适的溶液中即可。不需要浓缩蛋白质或去除干扰物质等额外步骤。所用抽提溶液包括脲、硫脲和酰胺烷基硫代甜采碱去垢剂ASB-14,它们配合使用可最大量地溶解蛋白质。实验材料 鼠肝试剂、试剂盒 二硫苏糖醇(DTT)抽提溶液苯甲基硫酰
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验
方案1 双向凝胶电泳鼠肝蛋白质提取物的制备实验 方案2 双向凝胶电泳真核生物细胞裂解物的制备实验 方案3 双向凝胶电泳大肠杆菌裂解液的制备实验 方案4 双向凝胶电泳脑脊液蛋白样品的制备实验 方案5 第一向:蛋白质的等电聚焦电泳实验
分子生态学词汇变性梯度凝胶电泳
变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)最初是Lerman 等人于20 世纪80 年代初期发明的,起初主要用来检测DNA 片段中的点突变。Muyzer 等人在1993 年首次将其应用于微生物群落结构研究 。后来又发展出其衍生技术,温度
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验
方案4 双向凝胶电泳脑脊液蛋白样品的制备实验实验方法原理可用乙醇沉淀人类脑脊液以浓缩其中的蛋白质和除去盐分,否则这些物质会干扰第一向 IEF。实验材料人类脑脊液试剂、试剂盒乙醇NaOH增溶溶液β-巯基乙醇仪器、耗材离心管冷冻离心机超声波仪实验步骤1.在室温下解冻脑脊液样品。当样品解冻后,旋紧试管盖,
温度梯度凝胶电泳的相关内容介绍
温度梯度凝胶电泳(temperature gradient gel electrophoresis, TGGE)是电泳技术的一种,通过物质在不同温度下性质的区别进行分离。 TGGE是一种有效的分离DNA、RNA或者蛋白的手段。它利用了不同分子在温度改变下构象的差别进行分离。另外一种类似的技术是
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验7
方案7 垂直SDS 平板凝胶制备:同时灌制多梯度凝胶实验实验方法原理对于分离宽分子量范围的蛋白质,梯度 SDS-PAGE 凝胶可提供最佳分析方法,产生更清晰的蛋白质点。通过减少凝胶中孔的尺寸,可使扩散减少。但是,梯度凝胶重复性较差,所以通常用多凝胶灌制装置来同时灌制,制作一套凝胶来进行同一系列的实验
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验19
方案19 用胶体金染色膜上的蛋白质实验材料转膜蛋白试剂、试剂盒胶体金染液PBS (PH 7. 2)吐温-20溶液实验步骤1.将膜浸入吐温-20 溶液中,37°C,轻摇 45 min。2.室温下,用吐温-20 溶液洗膜,轻摇 5 min。3.弃去洗液,多次重复步骤①和②。4.室温下在胶体金染液中染膜
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验11
方案11 与质谱兼容的银染法实验实验方法原理在方案 11 中介绍的银氨方法是用于检测在 SDS-PAGE 凝胶上蛋白质的最灵敏的方法之一。但是,这种方法和其他标准银染方法都不适合于质谱分析,而质谱已成为鉴定双向凝胶上蛋白质的最好方法。因为在凝胶中被质谱分析的蛋白质不能被修饰,许多通常用的敏化试剂(例
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验18
方案18 用印度墨水染色膜上的蛋白质实验材料转膜蛋白试剂、试剂盒印度墨水PBS吐温-20溶液实验步骤1.将膜浸人吐温-20 溶液中,轻摇 10 min。2.弃去吐温-20 溶液。3.重复步骤1与2三次。4.将膜转人印度墨水中,轻摇染色 2~18 h。5.弃去染液,用吐温-20 溶液洗膜,轻摇 5 m
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验10
方案11 银氨染色实验方法原理银染聚丙烯酰胺凝胶首先由 Switzer 等引进(1979),已迅速成为一种最普遍使用的高灵敏度蛋白质染色方法。因存在背景高、重复性不好及银镜等问题,多年来对此方法的改进较多。目前,Rabilloud 等(1994b)在文献中发现 100 多种不同的方案,但所有这些方案
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验1
方案1 双向凝胶电泳鼠肝蛋白质提取物的制备实验实验方法原理肝与其他动物组织一样,可制备用作双向电泳的材料。离心之后,溶于合适的溶液中即可。不需要浓缩蛋白质或去除干扰物质等额外步骤。所用抽提溶液包括脲、硫脲和酰胺烷基硫代甜采碱去垢剂ASB-14,它们配合使用可最大量地溶解蛋白质。实验材料鼠肝试剂、试剂
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验17
方案17 用考马斯亮蓝 R250 染色膜上的蛋白质实验材料转膜的蛋白质试剂、试剂盒考马斯亮蓝 R250甲醇乙酸实验步骤1.将转移后的膜浸在考马斯亮蓝染液中,轻摇 5min 。2.弃去染液,在摇床上用含乙酸的甲醇进行脱色。不要重复使用染液,因为这样会使结果的重复性变差。3. 用水洗膜,轻摇 5min。
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验8
方案8 第二向:蛋白质的 SDS-PAGE 实验实验方法原理在第一向 IEF 和 IPG 胶条平衡之后,需进行第二向 SDS-PAGE。SDS-PAGE 是基于蛋白质分子量的不同而将其分离的。这种分离系统可从多家供应商处获得,在许多蛋白质化学实验室中也普遍使用。这里介绍放置 IPG 胶条的方法以及第
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验6
方案6 垂直 SDS 平板凝胶的制备:均一凝胶的灌制实验实验方法原理蛋白质通过 IEF 进行分离之后,可进行第二向电泳,即 SDS-PAGE。本方案详细介绍了灌制均一 SDS-PAGE 凝胶的方法。均一凝胶(具完全相同的%T和%c) 对特殊分子量范围的蛋白质有较好的分离效果,因其灌制方法简单而被普遍
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验2
方案2 双向凝胶电泳真核生物细胞裂解物的制备实验实验方法原理在生物医学研究中,培养的哺乳动物细胞是被广泛使用的材料。本方案中介绍的方法已经成功用于许多人类克隆的癌细胞系和纤维原细胞系(Ji,etal,1994,1997)。虽然多数细胞蛋白质能用此方法提取,但是一些 DNA 结合蛋白可能会丢失。如果研
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验12
方案12 用 SYPRO Ruby 进行荧光染色实验材料含蛋白质样品的凝胶试剂、试剂盒固定液SYPRO Ruby 染料仪器、耗材聚丙烯塑料平皿往复式或定轨式摇床UV或蓝光透射仪实验步骤1.将胶放入聚丙烯塑料平皿中,其中应有足够的固定溶液,使凝胶在平皿中能自由漂浮。在摇床上摇动 30 min。如果是多
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验14
方案14 双向凝胶的槽式转移实验实验材料包含蛋白质样品的凝胶试剂、试剂盒转移缓冲液仪器、耗材印迹纸硝化纤维素薄膜或 PVDF 膜电源电泳转移设备实验步骤1.测量 SDS-PAGE 凝胶的尺寸,将转移膜剪成与凝胶相适应的尺寸。槽式转移系统的膜根据需要可以剪成比凝胶大或者小。2.用水将薄膜润湿或用甲醇将
固相化-pH-梯度双向凝胶电泳实验3
方案3 双向凝胶电泳大肠杆菌裂解液的制备实验实验方法原理细菌裂解液含大量核酸,在进行双向凝胶电泳之前,需先对核酸进行处理。可通过超声波处理包含脲和 CHAPS 的细菌提取液。当脲存在时,核酸酶(Benzonase) 是有活性的,但是其活性依赖于 Mg2+。核酸酶处理后加入 EDTA 以抑制金属蛋白酶