复杂生物样本中大规模未知代谢物鉴定获得实现
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员课题组在Nature Communications杂志在线发表了题为“Metabolite Annotation from Knowns to Unknowns through Knowledge-guided Multi-layer Metabolic Networking”的研究论文 (Nature Communications, 2022, 13: 6656) 。该工作发展了一种知识驱动的多层代谢网络技术(Knowledge-guided multi-layer networking, KGMN)，在复杂生物样本中实现了未知代谢物的大规模鉴定。朱正江课题组毕业生周智伟博士，博士研究生罗名都同学是论文的共同第一作者，中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心为第一单位。 生命体代谢组不仅包含内源性产生的已知代谢物，还包含微生物菌群、植物、食物和其......阅读全文
复杂生物样本中大规模未知代谢物鉴定获得实现
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员课题组在Nature Communications杂志在线发表了题为“Metabolite Annotation from Knowns to Unknowns through Knowledge-guided Multi-laye
朱正江：软件平台自主创新－破冰代谢组学研究难点
近期，中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员、刘南研究员课题组合作的最新学术成果发表在《自然·通讯》期刊（Nature Communications），应用基于稳定同位素标记的非靶向代谢流组学技术MetTracer，在系统层面上揭示了果蝇衰老过程中发生的代谢稳态变化，其中
朱正江：基于离子淌度质谱的非靶向代谢组学研究
分析测试百科网讯 2020年9月14日，由中国质谱学会（中国物理学会质谱分会）主办，分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020 CMSS）正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年，按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素
代谢物结构鉴定新算法MetDNA，克服标准MS/MS谱图库依赖性
近日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）杂志发表了由中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组的最新研究成果“Metabolic Reaction Network-based Recursive Metabolite Annotat
上海有机所发表基于离子淌度质谱的多维代谢物鉴定技术
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组发展了基于离子淌度质谱的碰撞截面积数据库（AllCCS），并开发出基于离子淌度质谱的多维代谢物分析技术，用于生命体内已知和未知代谢物的化学结构鉴定。 离子淌度质谱（Ion Mobility-Mass Spectrometry）
精准分析－量化释能——6位专家齐聚2019－SCIEX技术交流会
分析测试百科网讯 2019年4月18日，在第一届中国生物物理学会代谢组学分会年会暨2019代谢组学国际研讨会召开前夕，2019 SCIEX技术交流会如期召开，此次交流会的主题为“精准分析、量化释能”，旨在推动精准医学的发展。中国科学院大连化学物理研究所许国旺研究员、北京大学郑乐民教授、中国科学院
布鲁克最新发布－|－4D代谢组学和4D脂质组学新突破
新型VIP-HESI离子源将4D-代谢组学、4D-脂质组学和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上； 数据库全新发布包含CCS值的代谢物数据库METLIN-4D； 数据处理软件集成了代谢物CCS值预测功能CCS-Predict Pro； 新款代谢组学软件MetaboScape 20
朱大海教授发表新成果：加速再生的代谢物
乙酰乙酸（AA）是一种酮体，为多种组织的细胞活动提供能量。日前，中国医学科学院的朱大海教授领导研究团队揭示了AA的新功能。他们在Journal of Biological Chemistry杂志上发表文章指出，AA能够促进肌细胞的增殖。 研究人员在小鼠体内对AA进行了深入研究。他们发现，AA能
Analytical－Chemistry|朱正江课题组基于神经网络构建的离子淌度质谱CCS值数据库
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员团队在Analytical Chemistry杂志在线发表了题为“AllCCS2: Curation of Ion Mobility Collision Cross-Section Atlas for Small Molecules
聚焦科研市场－Agilent－6546－QTOF助力代谢组学新发展
分析测试百科网讯 2019年4月18日，安捷伦科技有限公司在上海开元名都酒店隆重举行了质谱新产品6546 Q-TOF及新一代代谢组学/脂质组学解决方案发布会（Agilent新液质6546 Q-TOF实现宽动态范围下高分辨数据采集）。分析测试百科网采访了安捷伦科技学术与政府机构市场总监Steve
生物样本库类型
生物样本库(Biobank)有多种类型，常见的组织、器官库(Tissue bank)，如血液库、眼角膜库、骨髓库，到拥有正常细胞、遗传突变细胞、肿瘤细胞和杂交瘤细胞株(系)的细胞株(系)库，近年来出现了脐血干细胞库、胚胎干细胞库等各种干细胞库以及各种人种和疾病的基因组库(Genome bank)
科学家发现未知真核生物
真核生物通常分为植物、动物、真菌和被称为原生生物的微小多细胞生物4个界，涵盖了地球上找到的几乎所有真核生物。但加拿大新斯科舍省达尔豪斯大学的研究人员近日在英国《自然》网站上发文称，他们发现了生命之树上的新分支——一种以前未知的新型真核生物，或许应该使其所在的“门”升级为新的“界”。 该论文描述
一种新的具有高检测覆盖面的靶向代谢组学方法
文章题目为SWATHtoMRM: Development of High-Coverage Targeted Metabolomics Method Using SWATH Technology for Biomarker Discovery，是由中科院生物与化学交叉研究中心的朱正江研究员课题组
生物样本库的推广势在必行如何安全存储和管理生物样本
1. 标准化样本处理 生物样本种类繁多（主要分为5大类：组织样本、血液样本、核酸和蛋白质样本、冻存的细胞样本、组织切片和组织芯片），对样本进行标准化处理是构建样本库最重要也是最核心的一样工作。 1) 样本处理是对样本进行必要的分割、分装和处理，以使样本满足储存和将来使用的质量要求。样本的处理
云起紫荆－时代共鉴－学术大咖共享代谢组学最新进展
分析测试百科网讯 2021年7月20日，由清华大学药学院主办，安捷伦科技（中国）有限公司协办的紫荆代谢组学国际会议在北京举办。来自代谢组学领域百余位科技工作者参加了本次会议。会议现场参会代表合影留念 清华大学药学院胡泽平研究员和中国科学院大连化学物理研究所许国旺研究员共同担任本次会议主席。本次
瑞金医院朱正纲：晚期癌症开刀没用，还会起反作用
“我不知道我能拦下多少刀。”坐在办公室，朱正纲教授神色凝重。 他是上海瑞金医院胃肠外科的带头人，也是我国胃癌诊治与研究专家，就是他领衔的“一滴血筛查早期胃癌”正从实验室向市场转化。但近一年半，他的重心摆在胃癌晚期患者身上。 按现在的普遍认识，手术切除是这类患者的最后希望。可朱正纲不这样想，这
上海生科院发现脂质过氧化是冠心病的重要特征
4月26日，国际学术期刊《氧化还原生物学》（Redox Biology）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）尹慧勇研究组的最新研究成果Comprehensive Metabolomics Identified Lipid Peroxidation as A Prominent
生物样本库主要形式
1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库（Biobank）； 2、医院或研究机构建立的生物样本库（Biobank），进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用； 3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库（Bioba
生物样本DNA的提取
DNA的提取DNA主要存在于细胞核中,绝大数以脱氧核糖核蛋白形式存在。以1mol/L氯化钠溶液提取,将得到的脱氧核苷酸核蛋白黏液与含少量辛醇和戊醇的氯仿一起摇荡,除去蛋白质。
生物样本库的现状
早在1994年中国科学院就建立了中华民族永生细胞库，而后，山东省脐带血造血干细胞库、北京脐带血造血干细胞库、泰州(复旦)健康科学研究院、SBC芯超生物银行等专项生物标本资源库也相继建立，所以我国生物样本资源库与欧美相比，起步时间并不算晚。 2003年我国启动了国家自然科技资源共享平台建设项目，
生物样本库的价值
在和大量客户接触和交流的过程中，发现越来越多的临床科研工作者意识到样本资源对于科研工作的重要性，开始重视临床生物样本的大量收集和规范化管理工作,一个优秀的生物样本库信息化管理体系的建立，将带来以下价值： 整体科研 即从短期、中期和长期三个阶段来规划本单位的科研目标，明确各个阶段可以采用的科研
生物样本库主要形式
1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库(Biobank)； 2、医院或研究机构建立的生物样本库(Biobank)，进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用； 3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库(Bioba
什么是生物样本库？
生物样本库又称生物银行(Biobank)，主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本(包括人体器官组织、全血、血浆、血清、生物体液或经处理过的生物样本(DNA、RNA、蛋白等)以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制
生物样本的概念介绍
生物样品通常是指动物(包括人)的体液(如尿血、唾液、胆汁、胃液、淋巴液及生物体的其他分泌液等)、毛发、肌肉和一些组织器官(如胸腺、胰腺、肝、肺、脑、胃、肾等)以及各种微生物。生物样品常有动物体内的药物及代谢产物、糖类及有关化合物、脂类及长链脂肪酸化合物、维生素及辅酶类化合物、核苷、核苷酸及其衍生物、
生物样本细胞的提取
1.细胞的破碎当待测组分(主要是各种多肽激素、各种酶以及各种基因工程的产物如胰岛素、生长激素等)存在于生物体细胞内及多细胞生物组织中时,需在分析测定之前将细胞和组织破碎,使这些待测组分充分释放到溶液中去,不同的生物体或同一生物体的不同组织,其细胞破碎的难易程度不一样,使用的方法也不完全相同。如动物胰
生物样本库的定义
生物样本库 根据经济合作与发展组织（OECD）的定义，”生物样本库（Biobank）是一种集中保存各种人类生物材料（Human biological material），用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统”。 类型 生物样本库（Biobank）有多种类型，常见的组织、器官库（T
第四届质谱论坛－MS助力生命与健康研究应用
分析测试百科网讯 2019年10月22日，第四届质谱论坛在北京师范大学英东学术讲堂成功举办，由北京师范大学质谱中心与中国质谱学会主办，安捷伦科技（中国）有限公司、安特百科（北京）技术发展有限公司及首都科技条件平台-北京师范大学研发实验服务基地协办，本届论坛是庆祝中国质谱学会成立四十周年系列学术交
海光杜江：凝聚正能量－探索国企改革发展之路
------“企业发展正能量分享”系列报告 2014年8月7日，2014丹东科学仪器论坛暨中国仪器仪表学会分析仪器分会（以下简称：分析仪器分会）成立35周年纪念活动在丹东盛大开幕。下午的大会上增设了“企业发展正能量分享”环节，遴选了行业中积极发展的优秀企
2020CMSS揭开帷幕，10大领域看质谱发展潮流
分析测试百科网讯 2020年9月14日，由中国质谱学会（中国物理学会质谱分会）主办，分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020 CMSS）正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年，按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素
生物芯片生物样本的制备方法
分离纯化、圹增、获取其中的蛋白质或DNA、RNA并用荧光标记， 才能与芯片进行反应。用DNA芯片做表达谱研究时，通常是将样品先抽提MRNA，然后反转录成CDNA。同时掺入带荧光标记的dCTP或dUTP。