代谢物结构鉴定新算法MetDNA，克服标准MS／MS谱图库依赖性
近日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）杂志发表了由中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组的最新研究成果“Metabolic Reaction Network-based Recursive Metabolite Annotation for Untargeted Metabolomics”。基于液相色谱-质谱联用（LC-MS）技术的非靶向代谢组学研究严重受限于代谢物结构鉴定的低效率和低准确度。该工作首次发展了一种基于代谢反应网络的代谢物结构鉴定算法MetDNA，创新性地克服了代谢物结构鉴定对于代谢物标准MS/MS谱图库的依赖，能够在多种生物样本中鉴定出超过2000种代谢物的结构，相比传统方法提高了近10倍，极大地提高了代谢物结构鉴定的效率和准确度。 代谢组学技术主要分析生命体内小分子代谢物的含量和动态变化规律，帮助更直接、更准确地研究疾病发生的机理，实现......阅读全文
代谢物结构鉴定新算法MetDNA，克服标准MS/MS谱图库依赖性
近日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）杂志发表了由中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组的最新研究成果“Metabolic Reaction Network-based Recursive Metabolite Annotat
复杂生物样本中大规模未知代谢物鉴定获得实现
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员课题组在Nature Communications杂志在线发表了题为“Metabolite Annotation from Knowns to Unknowns through Knowledge-guided Multi-laye
朱正江：软件平台自主创新－破冰代谢组学研究难点
近期，中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员、刘南研究员课题组合作的最新学术成果发表在《自然·通讯》期刊（Nature Communications），应用基于稳定同位素标记的非靶向代谢流组学技术MetTracer，在系统层面上揭示了果蝇衰老过程中发生的代谢稳态变化，其中
研究构建油脂代谢物结构鉴定新方法
近日，中国农业科学院油料作物研究所油料品质化学与加工利用创新团队研究构建了一种简约、通用和高效的油脂代谢物精细结构鉴定新方法，为挖掘新型功能性脂质提供了技术支撑，也为食品分析、药物分析和环境分析等领域未知代谢物结构鉴定研究提供了新思路。相关研究成果发表在《分析化学（Analytical Chem
研究构建油脂代谢物结构鉴定新方法
近日，中国农业科学院油料作物研究所油料品质化学与加工利用创新团队研究构建了一种简约、通用和高效的油脂代谢物精细结构鉴定新方法，为挖掘新型功能性脂质提供了技术支撑，也为食品分析、药物分析和环境分析等领域未知代谢物结构鉴定研究提供了新思路。相关研究成果发表在《分析化学（Analytical Chem
AB－Sciex视频讲座“QTRAP系统进行代谢物鉴定方法”
3月24日，AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“在药物发现和开发阶段代谢物鉴定的高级解决方案”的网络视频讲座。AB Sciex 的资深应用专家张克荣老师简单介绍了代谢物鉴定的应用和仪器概述，随后重点讲解用QTRAP®系统进行代谢物鉴定的方法。 代谢物鉴定的应用和仪器概述
暨大研发另类质谱鉴定算法，大幅提高蛋白质组鉴定能力
暨南大学的研究人员利用翻译组测序(RNC-seq)数据作为稳态细胞内蛋白质的“标准答案”，并另辟蹊径，提出了蛋白水平上的一种简单有效的多算法结果整合策略，不用做额外的实验，零成本轻松提高蛋白质组鉴定数量，同时有效降低假阳性率。 鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是
用于植物油快速质控的自动计算法以及品质鉴定
Peter J. Lee、Yoji Ichikawa、Roger R. Menard和Alice J. Di Gioia 沃特世公司，美国马萨诸塞州米尔福德市 引言 植物油是食品、化妆品和个人护理品的重要成分，主要来自于世界各地的22种油料作物。生产加工、贮存、
大连化物所岛津组学研究创新合作实验室成果交流会暨代谢组学前沿学术论坛圆满落幕
2024年8月23日，岛津企业管理(中国)有限公司（下文简称“岛津”）在岛津上海分公司举办“组学研究创新合作实验室成果交流会暨代谢组学前沿学术论坛”，与参会专家围绕代谢组学前沿分析新技术与新方法进行深入交流，共有来自华东区域教育科研、政府实验室约50余名代表参加本次交流会。 会议现场 大会伊始，岛津
暨大另类质谱鉴定算法策略大幅提高蛋白质组鉴定能力
鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是蛋白质组研究的标准研究方法。从质谱谱图中鉴定蛋白质需要依赖搜库算法,现有许多算法被开发出来，常见的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P
同时鉴定和定量水果和蔬菜中300种农药及其代谢物
目前，世界上使用的农药已超过800种，其中很多化合物在饮用水和食品中法定允许量即最大残留 限要求得到控制。对于这种目标物分析，迫切需要能够进行同时多残留组分的分析方法，这样可以大大 降低工作量。但是，很多农药用GC-MS分析很困难或几乎不能分析，但是却可以用LC-MS/MS多残留组分 分
同时鉴定和定量水果和蔬菜中300种农药及其代谢物
目前，世界上使用的农药已超过800种，其中很多化合物在饮用水和食品中法定允许量即最大残留 限要求得到控制。对于这种目标物分析，迫切需要能够进行同时多残留组分的分析方法，这样可以大大 降低工作量。但是，很多农药用GC-MS分析很困难或几乎不能分析，但是却可以用LC-MS/MS多残留组分 分析方法进
应用EADHRMS新技术开展环肽和PROTAC的代谢物鉴定
报告时间2023年6月10日下午报告地点中国药学会医药生物分析技术年会分会场5（深圳厅）项目背景液相色谱串联高分辨质谱仪（LC-HRMS）是目前开展药物代谢产物鉴定（MetID）最常用的分析仪器，LC-HRMS开展MetID的流程中一个关键的步骤是根据代谢物的离子谱图进行结构解析。常用的质谱解离方式
SCIEX与IROA－合作推出新系统－将加速代谢物鉴定分析
分析测试百科网讯 近日，SCIEX宣布已经与IROA Technologies合作，提供用于生物样品中代谢物鉴定和定量的系统。 根据协议条款，两家公司表示将共同推广一个结合同位素比值异常分析的IROA工作流程，该系统包括用质谱法标记生物化学代谢物的相对定量分析，然后进行算法分析——利用SCI
蛋白质二级结构拟合算法
早期的蛋白质或多肽的二级结构拟合计算方法中,主要采用多聚氨基酸为参考多肽。Greenfield 等采用多聚L2赖氨酸作参考多肽,建立α2螺旋、β2折叠及无规卷曲等二级结构参考CD 光谱曲线,采用单一波长法(208nm) 计算出α2螺旋含量后,然后假设不同的β2折叠含量( Xβ) 值,并假设CD 值是
用于植物油快速质控的自动计算法以及品质鉴定（四）
结果和讨论不使用卤代溶剂做流动相的普通高效液相色谱法很难分离植物油的主要组分——甘油三酸酯。图12为普通高效液相色谱法(2根5μm粒径颗粒填充的150mm长的C18柱，蒸发光散射检测器ELSD)得到的大豆油的典型色谱图，使用乙腈和二氯甲烷作为流动相，实现该分离需要60多分钟。由于二氯甲烷在240nm
用于植物油快速质控的自动计算法以及品质鉴定（五）
现在，Empower 2软件能够使用自定义字段计算、命名组、定时组和报告模板(如图6、7、9、10和11所示)，根据特级天然橄榄油A的质控标准，自动计算并报告样品合格与否的结果。图18为特级天然橄榄油A的典型Empower质控报告。该报告表明所有指示峰均符合质控标准。Empower软件的这些高级功
用于植物油快速质控的自动计算法以及品质鉴定（一）
引言植物油是食品、化妆品和个人护理品的重要成分，主要来自于世界各地的22种油料作物。生产加工、贮存、运输和销售各环节都对植物油的质量起着至关重要的作用。偶发事件和故意事件均会导致植物油的交叉污染。现已颁布了包括315/93/EEC、2568/91/EEC、EC 333/2007和EC 640/2
用于植物油快速质控的自动计算法以及品质鉴定（三）
对于杂质指示峰，在第4步中，在“输入公式”窗口中输入以下公式：GT(Impurity[Ratio_IS],0.42)*EQ(Name,”Impurity”)+NEQ(Name,“Impurity”)*-1*50000. 在第7步中，在字段名中输入“Oly_Impurity”，创建字段“Oly_
用于植物油快速质控的自动计算法以及品质鉴定（二）
用于鉴定特纯天然橄榄油A质量的质控标准： 为了便于演示，我们从纯天然橄榄油A的典型色谱图中选取六个峰。选择其中的一个峰作为标记峰，其余的峰为指示峰。“峰面积比(指示峰面积除以标记峰面积)±3xSTDEV”用作指示峰的质控标准。 1. 指示峰3O(峰面积OOL/标记峰面积)>0.84或1.18或0.3
Science：新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子
肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子，它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点；少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性，并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是，在大多数情况下，这些分子的产生尚未与特定的细菌菌株或代谢
对1μM维拉帕米进行快速灵敏的体外代谢物鉴定
目的 ：使用ACQUITY UPLC®/Xevo™ G2 QTof质谱系统及MetaboLynx™ XS应用管理软件，鉴定通过人肝微粒体体外孵育而获取的1 μM维拉帕米的代谢物。 背景 近年来，随着越来越多的一线药品因存在安全性顾虑而退出市场，人们对药品研发过程中的药物代谢和毒性研究给
高置信的代谢物鉴定：在多组学分析中获得有意义的结果
利用质谱法进行非靶向代谢组学分析，对于新的小分子代谢物的发现来说，是一种强有力的手段。测定碰撞截面（Collision Cross Section, CCS）已被证明能够多角度提升对小分子的注释和鉴定准确性。然而，现有的公开CCS数据库尚未完全覆盖小分子化学结构。 在与《Technology
上海有机所发表基于离子淌度质谱的多维代谢物鉴定技术
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组发展了基于离子淌度质谱的碰撞截面积数据库（AllCCS），并开发出基于离子淌度质谱的多维代谢物分析技术，用于生命体内已知和未知代谢物的化学结构鉴定。 离子淌度质谱（Ion Mobility-Mass Spectrometry）
注水算法
迭代注水算法是由Wei Yu提出的，它是一种多用户功率分配算法。这是一种自私算法，当接收端和发送端没有共享信道信息时，它的实现非常简单，复杂度低。但是，当信道上有共享信 息，需要共享信道，这是网络拓扑就会出现远近效应，这就产生了非平衡状态，引起用户间信号干扰，信息传输效率下降。 迭代注水
晶体结构鉴定手段或方法
X射线衍射分析、红外光谱分析X-射线粉末衍射法是利用单色X-射线照射到粉末晶体或多晶样品上，所得的衍射图称为粉末图。用粉末图谱解决有关晶体结构等问题的方法称为X-射线粉末衍射法;通常用Debye-Scherrer照相法。其优点是所需样品少，甚至0.1mg也可以测定，收集的衍生数据完全，仪器设备和试验
双向扫描算法和电梯调度算法区别
双向扫描算法和电梯调度算法区别：1、双向扫描(SCAN)算法不仅考虑到欲访问的磁道与当前磁道间的距离，更优先考虑的是磁头，当前的移动方向。例如，当磁头正在自里向外移动时，SCAN算法所考虑的下一个访问对象应足其欲访问的磁道既在当前磁道之外，又是距离最近的。这样自里向外地访问直至再无更外的磁道需要访问
研究鉴定促进绵羊卵母细胞成熟和早期胚胎发育关键代谢物
近日，四川农业大学动物科技学院教授周光斌和中国科学院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组共同在Journal of Advanced Research发表文章。该研究成功鉴定了促进绵羊卵母细胞成熟和早期胚胎发育的关键代谢物，为提高卵母细胞成熟和胚胎培养提供了新的视角。 通过利用超灵敏微量代谢组