DNA测序的方法自动测序法的操作步骤

一、准备工作1. BigDye测序反应试剂盒 主要试剂是BigDye Mix,内含PEZL四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP,AmpliTaq DNA polymerase FS,反应缓冲液等。2. pGEM-3Zf (+) 双链DNA对照模板 0.2 g/L,试剂盒配套试剂。3. M13(-21)引物 TGTAAAACGACGGCCAGT,3.2 μmol/L,即3.2 pmol/μl,试剂盒配套试剂。4. DNA测序模板 可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1 μl为宜。本实验测定的质粒DNA,浓度为0.2 g/L,即200 ng/μl。5. 引物需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物,配制成3.2 μmol/L,即3.2 pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如M13(-21)引物,T7引物等。6. 灭菌去离子水或三蒸水。7. 0.2 ml或和0.5 m......阅读全文

DNA测序EDF胶片显影法的介绍

  使用EDF胶片可增强测序条带的对比度,如果测序胶上条带很淡,我们建议把数据转移至EDF胶片,银染胶在其影像转移至EDF胶片之后可增强条带可读性。  1. 在暗室内,将染色过的粘于玻璃板的凝胶(胶面向上)置于荧光灯箱上。如有合适的漫射板,亦可用白灯箱,为确保曝光时间,用一小条EDF胶片曝光不同时间

蛋白上游研究之Sanger测序技术的发展史

DNA测序技术是分子生物学研究中最常用的技术,它的出现极大地推动了生物学的发展。成熟的DNA测序技术始于20世纪70年代中期。1977年Maxam和Gilbert报道了通过化学降解测定DNA序列的方法。同一时期,Sanger发明了双脱氧链终止法。20世纪90年代初出现的荧光自动测序技术将DNA测序带

双脱氧法DNA测序实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器、耗材 离心机离心管微量滴定板实验步骤 1.  对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中(1)0.5 pmol 单链DNA模板(2)0.5 pmol 引物(3)1 μl 10×测序酶缓冲液(4

双脱氧法DNA测序实验

测序酶进行标记测序反应 α-标记核苷酸进行热循环测序反应             实验材料 DNA

DNA序列和大规模DNA测序策略的探讨(图)

人类基因组计划的核心内容之一是基因组测序。随着人类基因组图谱趋于完成,人类基因的 定位克隆、鉴定分析直至全基因组测序取得了突破性进展,测序策略的成熟、测序方法的改进、自动测序仪的广泛应用、计算机数据分析系统的扩展以及测序分析能力的提高, 大大推进了大规模DNA测序的进程。第一节 DNA测序的基本方法

切口平移法的操作步骤

1、用DNase I处理双链DNA,使之随机产生单链断裂。2、DNA聚合酶I的5‘-3’外切酶活性从断裂处5‘除去一个核苷酸,同时5‘-3'聚合酶活性将一个放射性核素标记的单核苷酸引入到断裂的3'端。3、反应重复进行,结果标记的核苷酸代替了原来的核苷酸残基,形成了放射性的DNA分子。

切口平移法的操作步骤

1、用DNase I处理双链DNA,使之随机产生单链断裂。2、DNA聚合酶I的5‘-3’外切酶活性从断裂处5‘除去一个核苷酸,同时5‘-3'聚合酶活性将一个放射性核素标记的单核苷酸引入到断裂的3'端。3、反应重复进行,结果标记的核苷酸代替了原来的核苷酸残基,形成了放射性的DNA分子。

MTT法操作步骤

(1)单细胞悬液接种于96孔培养板;103-104细胞/孔,每孔培养基总量200微升(96孔培养板每孔容积370微升),37℃、5%CO2培养箱中培养一段时间(根据实验目的决定培养时间)(2)加入2毫克/毫升的MTT液(50微升/孔);继续培养3小时。(3)吸出孔内培养液后,加入DMSO液(150微

DNA测序的方法非同位素银染色法的操作方法

一、试剂准备1. SILVER SEQUENCETM DNA测序试剂盒。2. 丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺储备液(38%丙烯酰胺 W/V,2%甲叉双丙烯酰胺 W/V):95 g丙烯酰胺,5 g甲叉双丙烯酰胺溶于140 ml 双蒸水中,定容至250 ml,0.45 mm过滤器过滤后,贮于棕色瓶中,置于4℃

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

DNA测序的测序原理

DNA测序的测序原理是:利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸

蛋白质自动测序仪的基本结构

  蛋白质自动测序仪结构非常复杂,基本组成构件包括反应器、转换器、进样器、氨基酸分析系统和信息软件处理系统[1]。  反应器反应器中进行 Edman化学降解反应中偶联反应和环化裂解反应。在偶联反应之前有一个样品固定过程,即将蛋白质样品固定在纤维板上或将转印有蛋白质斑点的聚偏二氟乙烯膜(FVDF)放置

蛋白质自动测序仪的日常维护

  流动相的选择采用与检测器相匹配且黏度小的“HPLC”级溶剂,经过蒸馏和0.45μm的过滤去除纤维毛和未溶解的机械颗粒等,经过0.2μm的过滤可除去有紫外吸收的杂质对试样有适宜的溶解度。避免使用会引起柱效损失或保留特性变化的溶剂[1]。  水的等级需用纯化水,因为不纯物的存在会增加去离子的吸光率,

蛋白质自动测序仪的工作原理

  蛋白质测序仪主要检测的是蛋白质一级结构(氨基酸序列),其基本原理沿用艾德蒙(Edman)化学降解法,这也是经典的蛋白质测序方法。利用 Edman化学降解法测定蛋白质或多肽N末端序列,在测定过程中,氨基酸残基依次与异硫氰酸苯酯(PITC)作用,从蛋白质N末端依次切割下来,形成稳定的PTH氨基酸后进

蛋白质自动测序仪的发展历史

  1953年,瑞典化学家Edman采用异硫氰酸苯酯法测定蛋白质的N端序列,为氨基酸自动测序奠定了基础。  1967年,Edman和Begg根据异硫氰酸苯酯法测定原理设计了第一台蛋白质自动测序仪(旋转杯蛋白质测序仪),为蛋白质自动测序以及蛋白质自动测序仪的商品化生产提供了理论支持和样机。  1971

双脱氧法DNA测序实验——测序酶进行标记测序反应

在基本的双晩氧测序反应中,寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板,在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时,引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种,当它掺入到DNA的生长链时,可终止链的延伸。实验材料DNA试剂、试剂盒寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器

ABI-310型DNA测序仪的测序原理和操作规程

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种

ABI-310型DNA测序仪的测序原理和操作规程

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最

ABI-310型DNA测序仪的测序原理和操作规程

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用zui多的

ABI-310型DNA测序仪的测序原理和操作规程

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用zui多的

细胞周期检测方法即PI法的操作步骤

1. 细胞培养:取对数生长期的细胞,按1×106cells/ mL以1mL接种24孔板或2mL接种于6孔板内,进行所需的处理(比如加入药物),特定时间后终止培养,进行下一步的实验。2. 细胞固定: 800rpm离心5min,收集细胞沉淀,弃上清,用预冷PBS洗涤两次,加入预冷75%乙醇,于4℃固定4

DNA测序原理和方法

DNA测序原理和方法DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实

蒸馏法的实验操作步骤介绍

  加料  将待蒸馏液通过玻璃漏斗小心倒入蒸馏瓶中,要注意不使液体从支管流出。加入几粒助沸物,安好温度计。再一次检查仪器的各部分连接是否紧密和妥善。  加热  用水冷凝管时,先由冷凝管下口缓缓通入冷水,自上口流出引至水槽中,然后开始加热。加热时可以看见蒸馏瓶中的液体逐渐沸腾,蒸气逐渐上升。温度计的读

薄层色谱法的操作步骤

薄层板制备薄层板除另有规定外,将1份固定相和3份水在研钵中向一方向研磨混合,去除表面的气泡后,倒入涂布器中,在玻板上平稳地移动涂布器进行涂布(厚度为0.2~0.3mm),取下涂好薄层的玻板,置水平台上于室温下晾干,后在110℃烘30分钟,即置有干燥剂的干燥箱中备用。使用前检查其均匀度(可通过透射光和

功能基因cDNA序列的分析

(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'

薄层色谱法的的操作步骤

  操作步骤  ①薄层板制备:除另有规定外,将1份固定相和3份水在研钵中向一方向研磨混合,去除表面的气泡后,倒入涂布器中,在玻板上平稳地移动涂布器进行涂布(厚度为  0.2~O.3mm),取下涂好薄层的玻板,置水平台上于室温下晾干,后在110℃烘30min,即置有干燥剂的干燥箱中备用。使用前检查其均

SDS法提取斑马鱼DNA详细操作步骤及各步原理

原理:SDS:使细胞裂解,使与DNA双链紧密相连的组蛋白分开和变性。EDTA:可以与镁离子螯合,从而有助于阻止核酸分子间的聚集,及核酸与蛋白质分子的聚集,与SDS一样,还可抑制核酸酶的活性。蛋白酶K:水解蛋白质,在SDS存在下活性增强,不受EDTA的抑制,在较高温度下仍有活性。苯酚/氯仿:去除变性的

DNA测序技术的测序规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

DNA测序的测序原理介绍

  化学修饰法测序原理  化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。  Sanger法测序的原理  就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定

DNA测序的测序目的

确定重组DNA的方向与结构,对突变进行定位、鉴定和比较研究。