什么是表达序列标签?

表达序列标签从互补DNA(cDNA)分子所测得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库,代表在一定的发育时期或特定的环境条件下,特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达,推导全长cDNA序列,或作为标签标志基因组中的特殊位点以确定基因的位置等。......阅读全文

什么是基因的渗漏表达

在诱导之前就会有插入基因的表达的现象叫基因的渗漏表达。产生的原因很有可能是因为培养基中存在部分乳糖导。如果重组蛋白没有毒性,那么问题不大。但是如果目的蛋白有毒,就会造成你的菌提前死亡。解决方法可以在培养基中加入一定量的葡萄糖,细菌在有葡萄糖存在的时候不会启动乳糖诱导机制。但是葡萄糖的量需要根据菌量以

BIORAD-采用-Profinity-eXactTM融合标签表达系统纯化无标签...

BIORAD 采用 Profinity eXactTM融合标签表达系统纯化无标签的重组蛋白亲和标签已成为后基因组学时代纯化重组蛋白常用手段。此方法无需了解蛋白质的生化特性或生理活性,就可通过带标签的重组融合蛋白选择性地与层析基质上的配体结合,从而得以纯化任何蛋白质。此方法与常规的层析方法不同之处在于

什么是简单序列长度多态性?

简单序列长度多态性是据串联重复排列微卫星基序两侧的单一序列设计引物,对微卫星序列(microsatellite DNA或simple sequence repeats,SSR)进行扩增,由微卫星基序重复数目的变异而产生多态性。

什么是基因表达的系列分析?

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

用于蛋白质表达的标签实验

实验步骤一、设计具有标签的蛋白质时需要考虑的因素亲和力和可溶性的选择在大肠埃布氏菌中生产外源蛋白时面临两个挑战: 一? 是所用蛋白质表达系统的表达水平很低; 二是所表达的蛋白质被错误折叠进不溶性的聚集体—包涵体中。弱启动子、低转录起始或稀有密码子的存在引起的表达问题都可以通过在装配过表达质粒时将矫正

用于蛋白质表达的标签实验

实验步骤 一、设计具有标签的蛋白质时需要考虑的因素 亲和力和可溶性的选择 在大肠埃布氏菌中生产外源蛋白时面临两个挑战: 一? 是所用蛋白质表达系统的表达水平很低; 二是所表达的蛋白质被错误折叠进不溶性的聚集体—包涵体中。弱启

什么是组织特异性表达载体

在较高等的真核生物中,有一类特殊的调控序列(启动子等)可以调控基因只能在一定的组织中才进行有效的表达。选用这样的调控序列可以构建一系列组织特异性表达载体,为研究动植物发育和人类基因治疗等提供了有效的手段。目前已构建的组织特异性表达载体有乳腺组织特异性表达载体、肿瘤细胞特异性表达载体、神经组织特异性表

分子遗传学词汇上游表达序列

中文名称:上游表达序列英文名称:upstream expressing sequence;UES定  义:酵母基因转录的调控元件之一,位于结构基因5'端上游。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

关于外显子的表达序列介绍

  在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外

表达基因的克隆策略与分离表达基因序列的技术方法

人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基因组中绝大部

用于蛋白质表达的标签实验(二)

二、可溶性标签在重组蛋白表达中,特别是当在细菌中表达真核蛋白时,主要的瓶颈在于蛋白质的正确折叠与可溶性。一些可溶性蛋白已被作为标签用来改善目标蛋白质的折叠。这些标签应该与其他方法共同使用来促进蛋白质的折叠,如诱导后降低培养温度或者共表达伴侣蛋白(BaneyxandMujacic,2004;deMar

用于蛋白质表达的标签实验(一)

一、设计具有标签的蛋白质时需要考虑的因素亲和力和可溶性的选择在大肠埃布氏菌中生产外源蛋白时面临两个挑战: 一? 是所用蛋白质表达系统的表达水平很低; 二是所表达的蛋白质被错误折叠进不溶性的聚集体—包涵体中。弱启动子、低转录起始或稀有密码子的存在引起的表达问题都可以通过在装配过表达质粒时将矫正

重组蛋白表达的几种常用标签介绍

 重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。本文将简要介绍几个常用载体标签及其功能和优点。一. GST标签GST(谷胱甘肽巯基转移酶) 标签蛋白本身是一个在解毒过程中起到重要作用的转移酶,它的天然大小为26KD。将它应用在原

用于蛋白质表达的标签实验2

三、标签的去除由于蛋白标签可能会干扰目标蛋白质的正常功能,所以在完成其促进溶解或亲和纯化的作用后,标签的去除对于生物学和功能研究很有帮助,对 GST 或 MBP 这样的大标签尤其如此,尽管有一些例子显示融合了标签的蛋白质更易结晶 (Smythetal.,2003)。大多数用来向目标蛋白质添加标签的商

什么是氨基酸序列的覆盖率

你是质谱结果么?意思就是质谱鉴定出来的能够跟数据库中的序列对的上的那一部分氨基酸占总的氨基酸序列的比值。例如,二级质谱能够找到的若干个肽段含有的总氨基酸个数是40个,而你的目标蛋白的氨基酸总过有100个,那么氨基酸序列覆盖率即为40%.

关于原核表达载体原件SD序列的介绍

  1974年Shine和Dalgarno首先发现,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由3~9 bp组成的序列。这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3¢;末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。以后将此序

使用酶标仪的细胞成像系统检测标签蛋白的表达

优势:   带细胞成像系统的功能模块扩展了微孔读板机的检测应用2.   方便检测每个细胞或每孔的标签蛋白的表达水平3.   按照一般微孔读板机的简单流程4.   细胞可视化数据输出,增加了数据可信性某些细胞蛋白存在或不存在,可代表着细胞对某些刺激的反应、某种分化的状态或特定细胞类型的独特特征或者基因

冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性

单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1,其余点上皆为0;单位阶跃序列只有在n>=0时,才取非零值1,当n

DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列

  Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列,以不同器官中的mRNA为探针,检测其基因表达水平,结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列,用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红,绿荧光标记进行杂交检测,结果表明9

BIORAD-采用-Profinity-eXactTM融合标签表达系统纯化-重组蛋白

  BIORAD 采用 Profinity eXactTM融合标签表达系统纯化无标签的重组蛋白   亲和标签已成为后基因组学时代纯化重组蛋白常用手段。此方法无需了解蛋白质的生化特性或生理活性,就可通过带标签的重组融合蛋白选择性地与层析基质上的配体结合,从而得以纯化任何蛋白质。此方法与常规的层析方

重组表达载体pET32aHisAPC10的序列测定

通过上述实验所构建的表达质粒pET-32a-His-APC10经限制性内切酶分析正确后,必须进行DNA序列测定,以获得序列完全正确的克隆。1. 基本原理目前应用的DNA序列测定方法有双脱氧法(Sanger法)和化学测序法(Maxam-Gilbert法),在变性聚丙稀酰胺凝胶(测序胶)上进行高分离度的

蛋白不表达或者表达量低是怎么回事

蛋白不表达就说明他的转录和翻译,这个过程出现了问题。表达量低说明他这个合成蛋白质的效率是很低的,可能在盘旋折叠最后一个部分出现了问题。

转录组是干什么用的,和表达谱有什么区别

转录组测序可以得到特定条件下所有mrna转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(geneexpressionprofile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cdna文库,大规模cdna测序,收集cdna序列片段、定性、定量分析其mrna群体组成,从而描绘该特定细

什么是白细胞介素17E的表达谱?

  人IL-17E是通过同源性分析、序列拼接获得的,到目前为止,尚未用Northern Blot方法在任何组织中检测到其mRNA的存在。IL-17E确切的生理性细胞来源亦尚属未知。用GeneAtalas分析IL-17E的表达谱,发现在舌、支气管上皮细胞和骨髓中,IL-17E表达水平很高;在肾上腺、脑

pdl1表达检测有什么用cps值是5

这是对肿瘤的基因进行检测,然后根据结果可以评估肿瘤的风险性,一定要到正规的医院去进行检查,CPS值是5表示低表达率,低风险。

安捷伦最新推出百万特征序列格式的基因表达微阵列芯片

  2010 年 5 月 19 日,加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所:A) 今日发布了安捷伦 SurePrint G3 基因表达微阵列芯片,该产品在 1 英寸×3 英寸的单位标准芯片上提供的特征序列可多达一百万种,大幅提高了通量,有效节约了成本,并且具有独一无二

Science:新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达

  几十年来,科学家们已经知道,“垃圾 DNA(junk DNA)”实际上起着至关重要的作用:尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图,但是基因组中的一些非编码部分,包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域,似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水

给星巴克带来“致癌”标签的是何物

  美国加利福尼亚州洛杉矶县高等法院日前裁定,在加州销售的咖啡产品须标注致癌警示信息,原因是咖啡豆在烘焙过程中产生可能致癌的丙烯酰胺。此事引发全球媒体广泛关注和争论。那么,丙烯酰胺是什么?真的会致癌吗?我们又该怎么做?  问:丙烯酰胺是什么?  答:丙烯酰胺是食物在煎、炸、烘烤等高温加热过程中产生的

“儿童专用”标签实际上是消费误导

  一些产品被贴上“儿童专用”标签后,通过市场炒作,抬高价格,以迎合人们的消费心理。这实际上是一种消费误导,根本目的是牟取超额利润  近日,朋友换了新居。装修时,一款儿童油漆引起了他注意:商家称,这种油漆低毒、环保,特别是铅含量极低,特别适合有孩子的家庭。可是,算算高出普通油漆一倍以上的价格,朋友很

多序列比对的目标是什么?

多序列比对的目标是使得参与比对的序列中有尽可能多的列具有相同的字符,即使得相同残基的位点位于同一列,这样以便于发现不同的序列之间的相似部分,从而推断它们在结构和功能上的相似关系,主要用于分子进化关系,预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数,基因组序列分析等。