蛋白质芯片对于筛选及研究的应用
常规筛选蛋白质主要是在基因水平上进行,基因水平的筛选虽已被运用到任意的cDNA文库,但这种文库多以噬菌体为载体,:通过噬菌斑转印技术(plaque life procedure)在一张膜上表达蛋白质。但由于许多蛋白质不是全长基因编码,而且真核基因在细菌中往往不能产生正确折叠的蛋白质,况且噬菌斑转移不能缩小到毫米范围进行,所以这种方法的局限性,靠蛋白质芯片弥补。酶作为一种特殊的蛋白质,可以用蛋白质芯片来研究酶的底物、激活剂、抑制剂等。蛋白质芯片为蛋白质功能研究提供了新的方法,合成的多肽及来源于细胞的蛋白质都可以用作制备蛋白质芯片的材料。Uetz将蛋白质芯片引入酵母双杂交研究中,大大提高了筛选率。建立了含6O0O个酵母蛋白的转化子,每个都具有开放性可阅读框架(Open Reading Frame,0FR)的融合蛋白作为酵母双杂交反应中的激活区,此蛋白质芯片检测到192个酵母蛋白与此发生阳性反应。......阅读全文
微流控芯片在蛋白质分析中的应用
1、酶学分析 在硅片、玻璃芯片、石英芯片或者高分子聚合物芯片上构筑简单的十字通道或者反映舱,加上电化学检测器、光学检测器或者其他的检测系统就可以完成简单的酶的测定。如,Hadd-AG在芯片上制作了具有5个溶液出入通道的酶检测系统,首先将荧光基团底物RBG与Tris缓冲液混合,在与B半乳糖苷酶溶
蛋白质芯片技术应用于生化反应的检测
对酶活性的测定一直是临床生化检验中不可缺少的部分。Cohen用常规的光蚀刻技术制备芯片、酶及底物加到芯片上的小室,在电渗作用中使酸及底物经通道接触,发生酶促反应。通过电泳分离,可得到荧光标记的多肽底物及产物的变化,以此来定量酶促反应结果。动力学常数的测定表明该方法是可行的,而且,荧光物质稳定。Are
临床出血倾向评估及筛选试验的应用
一、门诊患者出血倾向的评估 对怀疑血小板减少,或者血管壁脆性增加的患者,可以进行毛细血管脆性试验、血小板计数和出血时间(BT)的检测。BT的检测过去我们常用Duke法检测出血时间,但由于扎针深度较难统一,现在已基本不用。目前推荐使用出血时间测定器法。测定器中含有统一规格的小刀,按下按纽后可以保证每
临床出血倾向评估及筛选试验的应用
一、门诊患者出血倾向的评估 对怀疑血小板减少,或者血管壁脆性增加的患者,可以进行毛细血管脆性试验、血小板计数和出血时间(BT)的检测。BT的检测过去我们常用Duke法检测出血时间,但由于扎针深度较难统一,现在已基本不用。目前推荐使用出血时间测定器法。测定器中含有统一规格的小刀,按下按纽后可以保证每
蛋白质芯片技术应用于疾病诊断
蛋白质芯片技术在医学领域中有着潜在的广阔应用前景。蛋白质芯片能够同时检测生物样品中与某种疾病或者环境因素损伤可能相关的全部蛋白质的含量情况,即表型指纹(phenomic fingerprint)。表型指纹对监测疾病的过程或预测,判断治疗的效果也具有重要意义。Ciphelxen Biosystems公
临床出血倾向评估及筛选试验应用
一、门诊患者出血倾向的评估 对怀疑血小板减少,或者血管壁脆性增加的患者,可以进行毛细血管脆性试验、血小板计数和出血时间(BT)的检测。BT的检测过去我们常用Duke法检测出血时间,但由于扎针深度较难统一,现在已基本不用。目前推荐使用出血时间测定器法。测定器中含有统一规格的小刀,按下按纽后可以保证每
蛋白质芯片的制备
固体芯片的构建常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。探针的制备低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物
蛋白质芯片的特点
⒈ 直接用粗生物样品(血清、尿、体液)进行分析⒉ 同时快速发现多个生物标记物⒊ 小量样品⒋ 高通量的验证能力⒌ 发现低丰度蛋白质⒍ 测定疏水蛋白质: 与“双相电泳加飞行质谱”相比,除了有相似功能外,并可增加测定疏水蛋白质⒎ 在同一系统中集发现和检测为一体 特异性高 利用单克隆抗体芯片,可鉴定未知抗原
蛋白质芯片的种类
蛋白芯片主要有三类:蛋白质微阵列、微孔板蛋白质芯片、三维凝胶块芯片等。
蛋白质芯片的原理
蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生
蛋白质芯片技术固体芯片的构建方法
常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。
生物芯片入门(一):生物芯片及应用简介
生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或
生物芯片在药物研究中的应用
生物芯片技术是大规模获取旧关生物信息的一种重要手段。从经济效益方面来讲,最大的应用领域可能是开发新药。就创新药物而言,生物芯片吸疾病叉药物两个角度对生物体的多个参量同时进行研究以谛选药物靶标。有关药物筛选方面的工作尚处于起步萨段,目前正在形成一潜为巨大的市场。因此能以更高的灵敏度对疾病进行早期诊断
类器官芯片在肿瘤研究中的应用
在过去几十年中,干细胞生物学的进展导致在体外创造了一类新的3D细胞样细胞,称为类器官,因为它们的空间形态与原始器官相似。利用该技术从体外培养的肿瘤组织中形成的肿瘤类有机物在很大程度上保留了肿瘤细胞在体内的生物学特性,具有成本低、操作简单等优点,弥补了传统肿瘤实验模型的缺陷。1、肿瘤发生发展机制肿瘤是
基因芯片技术在研究领域的应用
包括基因表达检测、寻找新基因、杂交测序、基因突变和多态性分析以及基因文库作图以及等方面。1、基因表达检测。人类基因组编码大约10万个不同的基因,仅掌握基因序列信息资料,要理解其基因功能是远远不够的,因此,具有监测大量mRNA(信使RNA,可简单理解为基因表达的中介物)的实验工具很重要。有关对芯片技术
抗肿瘤药物研究及新药筛选(一)
提 纲一、化疗药物的发展二、肿瘤的药物治疗三、抗肿瘤药物筛选及评价四、体外抗肿瘤活性试验五、体内抗肿瘤活性试验一、化疗药物的发展• 近代肿瘤化疗学始于20世纪40年代。• 50年代通过动物筛选化疗药物发现了5FU、MTX、CTX等,化疗学有了发展。• 60年代认识到肿瘤细胞动力学及化疗药药代动
抗肿瘤药物研究及新药筛选(三)
b、Decoy核酸Decoy核酸是与靶转录因子具有高亲和性的双链寡聚核酸 ,通过竞争性抑制转录因子与调控区域的结合 ,调控转录来改变下游基因的异常表达 ,从而抑制肿瘤恶性增殖 .体外筛选结合转录因子AP2的decoy核酸药物 ,结果OG03对多种肿瘤细胞生长有显著的抑制作用 ,在异植人肿瘤细胞N
抗肿瘤药物研究及新药筛选(四)
三、抗肿瘤药物筛选及评价 以国立肿瘤研究所(Nationai Cancel Institute NCI)为代表的美国抗肿瘤药物筛选模式经历了三个发展阶段。• 1955-1985年,以动物移植性肿瘤为基本模型,以动物生命延长率和瘤重抑制率为药物活性的基本评价指标,此阶段是以化合物为本位的体内筛选方
抗肿瘤药物研究及新药筛选(五)
4、磺酰罗丹明染色法 试验原理:SRB是一种蛋白质结合染料,粉红色,可溶于水。 SRB可与生物大分子中的碱性氨基酸结合。其在515 nm波长的OD读数与细胞数呈良好的线性关系。故可用作细胞数的定量。MTT法的一个缺点是OD值可随放置时间而变,而SRB法无此现象。因此更适用于进行大规模的试验。
抗肿瘤药物研究及新药筛选(二)
原理:原发肿瘤的生长和转移是依赖于新生血管生成的,开发和研究能够破坏或抑制血管生成、有效地抑制肿瘤生长和转移的药物(称为TA 抑制剂),是新型抗肿瘤药物研究的活跃领域之一。代表药物:angiostatin和endostatinAvastin Endostatin可直接与血管内皮细胞受体结合抑制内
Arraystar-CircRNA芯片应用于肝癌研究
第二军医大学免疫所所长、中国医学科学院院长曹雪涛院士课题组主要从事天然免疫与免疫调节基础研究、免疫治疗应用研究。近期其实验室用Arraystar CircRNA芯片研究发现circMTO1可以作为microRNA的吸附海绵结合癌基因miR-9从而上调p21的表达从而抑制肝细胞癌(hepatocell
临床出血倾向评估及筛选试验的应用(2)
二、住院患者出血倾向的评估 住院患者出现大面积、多器官的出血多见于弥散性血管内出血。严重的肾功能障碍,如尿毒症以及可引起急性肾小管坏死的各种病因都可导致肾脏及全身血管内皮损伤,从而激活内源性凝血系统、激肽系统、纤溶和补体系统。同时坏死的肾皮质又可释放组织因子入血激活外源性凝血系统。内毒素、抗原抗体
临床出血倾向评估及筛选试验的应用(3)
三、新生儿出血倾向的评估 新生儿的止凝血系统尚未发育完善,储备能力有限,与成人相比有许多不同之处。新生儿的血小板数量与成人无异,但vWF量高于成人。孕妇随着妊龄的增加,各种凝血因子的量也增加,处于高凝状态。胎儿第10~11周开始合成凝血因子,随着胎龄的增加,凝血因子的浓度增加,但是直至出生,其凝血因
临床出血倾向评估及筛选试验的应用(4)
四、出血筛选试验的应用 1.血管壁与血小板的筛选试验 (1) 毛细血管脆性试验:毛细血管壁的完整性有赖于毛细血管的结构、功能和血小板质和量的正常,也与某些体液因素有关。当这些因子有缺陷时,毛细血管的完整性就受到破坏。毛细血管脆性试验或称束臂试验是在上臂增加血管负荷,观察前臂一定范围内皮肤出血点的
在肿瘤和抗癌药物筛选研究中的应用
普通显微镜及电子显微镜,仅能对肿瘤相关抗原进行定性分析,而 CLSM 则可对单标记或者多标记细胞、组织标本及活细胞进行重复性极佳的荧光定量分析,从而对肿瘤细胞的抗原表达、细胞结构特征,抗肿瘤药物的作用及机制等方面定量化。
蛋白质芯片技术应用于抗原抗体检测
在CavinM.等人的实验中,蛋白质芯片上的抗原抗体反应体现出很好的特异性,在一块蛋白质芯片上10800个点中,根据抗原抗体的特异性结合检测到唯一的1个阳性位点。Cavin M.指出,这种特异性的抗原抗体反应一旦确立,就可以利用这项技术来度量整个细胞或组织中的蛋白质的丰富程度和修饰程度。其次利用蛋白
蛋白质芯片的技术原理
蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生
蛋白质芯片的功能特点
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。
蛋白质芯片的种类介绍
蛋白质微阵列哈佛大学的Macbeath和SchreiberL等报道了:通过点样机械装置制作蛋白质芯片的研究,将针尖浸入装有纯化的蛋白质溶液的微孔中,然后移至载玻片上,在载玻片表面点上1nl的溶液,然后机械手重复操作,点不同的蛋白质。利用此装置大约固定了10,000种蛋白质,并用其研究蛋白质与蛋白质间
对于胶上蛋白质的鉴定要提供多少蛋白质
一般情况下,考染能看得见的点都有机会鉴定出来。分子量在 2 - 5 万之间的蛋白质,鉴定成功率一般比较大。分子量小的蛋白酶切位点少,合适的肽段( 1000 ~ 3000 Da )就少,所以鉴定的成功率相对较低。而分子量太大的蛋白质,在同等质量的情况下,蛋白的摩尔数 (pmol) 较少;而