单链构象多态性的应用介绍
单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序,并与数据库中已知序列比对。......阅读全文
构象异构体的分子链构象
晶体中的高分子链构象晶体中的分子链构象有螺旋形构象、平面锯齿形构象等。1、两个原子或基团之间距离小于范德华半径之和时,将产生排斥作用。2、分子链在晶体中的构象,取决于分子链上所带基团的相互排斥或吸引作用的情况。3、有规立构高分子链在形成晶体时,在条件许可下总是尽量形成时能最低的构象形式。4、基本结构
双链构象多态分析法介绍
双链构象多态分析(double -strand conformation analysis,DSCA) 是利用荧光标记引物,通过PCR 扩增出相关的研究片段作为荧光标记参照(fluorescence labeled reference,FLR)DNA分子。然后,用标记参照物FLR 分子与待测PC
关于蛋白质结构的侧链构象介绍
蛋白质结构:残基侧链上的原子根据希腊字母表的顺序(α、β、γ、δ、ε等)来命名,如Cα指的是对应残基上最接近羰基的碳原子,而Cβ则是次接近的。Cα通常被认为是主链骨架的组成原子。这些原子之间的键对应的二面角则相应以χ1、χ2、χ3等来命名,如赖氨酸侧链上第一、二个碳原子(即Cα和Cβ)之间共价键
PCRSSCP(聚合酶链反应单链构象多态)实验步骤
一. 样品的制备1. 设计引物。用Oliga6.0对目的基因进行分析,设定引物,引物长度18-21个碱基,扩增片段以200-300bp最为合适。2. PCR扩增并检测。根据不同的引物挑选适合的退火温度进行PCR扩增。扩增产物用2-2.5%的琼脂糖胶跑水平电泳检测,上样量3-5ul。PCR产物为 10
毛细管电泳色谱仪在基因突变分析中的应用
毛细管电泳色谱仪简称毛细管电泳仪(CE),是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。
单链RNA的基本信息介绍
一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒(如脊髓灰质炎病毒)的ssRNA可直接起mRNA作用,转译早期蛋白质,包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下,以ssRNA(正链)为模板
毛细管电泳色谱仪分析基因突变的方法
基因突变分析是遗传性疾病基因诊断和致病基因分离鉴定的基础,突变是一个或多个脱氧核糖核苷酸的构成、复制或表形功能的异常变化,即遗传物质结构改变引起遗传信息改变。随着对疾病病因和发病机制研究的不断深入,人类对疾病的认识逐渐深入到基因诊断的水平,传统技术多用琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离野生型DN
构象异构体的应用
在不同的构象异构体之间,由于非键合原子之间作用力的不同,使构象异构体在物化性质方面均表现一定的差异。构象分析正是以化合物适当的基态、过渡态和激发态的构象,对化合物的物化性质进行分析和解释。这方面的内容因很广泛,在此只能做一般的介绍。对于构象异构体的稳定性,前面已经以乙烷、丁烷、十氢化奈和取代环己烷为
简述微流控芯片检测基因突变
基因突变主要是指高等动物、低等动物受到各种因素的作用下,基因出现改变,包括单个碱基、多个碱基的改变,使用微流控芯片可以检测基因突变,例如秀丽隐杆线虫cwn-1突变、循环系统肿瘤细胞基因突变。一般而言,所有疾病相关基因逐渐被克隆基因突变包括单链构象多态性、限制性片段长度多态性所取代,其中,单链构象多态
高效毛细管电泳仪在核酸分析中的应用
高效毛细管电泳仪(CE)是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转
高效毛细管电泳仪在核酸分析中的应用
高效毛细管电泳仪(CE)是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机
毛细管电泳仪在核酸分析中的应用
毛细管电泳仪(CE)是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。一、在DNA测序中的应
单链互补DNA的定义
中文名称单链互补DNA英文名称single-strand cDNA;sscDNA定 义在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
单链DNA的结构特点
单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。
单链-cDNA-的合成实验
本方案利用的是总RNA,因为如果使用18SrRNA作内对照,在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA,以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10X
单链-cDNA-的合成实验
一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液MMLV 逆转录酶(100~200U/ul)SUPERaseIN
单链-cDNA-的合成实验
实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液(去除 RNA 酶的双蒸水,100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液
单链RNA的结构特点
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
抗单链DNA(ssDNA)抗体检测的介绍
抗单链DNA(ssDNA)是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。
β转角的特定构象介绍
β-转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中,由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H),在β-转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍,因此是立体化学上最合适的氨基酸;而脯氨酸具有环状结构和固定的角,因此在一定程度上迫使β-转角形成,促使多肽自身回折且这些回折有助于
关于蛋白质主链构象的结构单元的简介
1)α-螺旋Pauling等人对α-角蛋白(α-keratin)进行了X线衍射分析,从衍射图中看到有0.5~0.55nm的重复单位,故推测蛋白质分子中有重复性结构,并认为这种重复性结构为α-螺旋(α-helix). α-螺旋的结构特点如下: ①多个肽键平面通过α-碳原子旋转,相互之间紧密盘曲
SNP的检测方法(直接测序法与PCRSSCP)
人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的
抗单链DNA抗体的概述
抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。
单链RNA的基本信息
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
单链突出端的定义
中文名称单链突出端英文名称overhang定 义双链核酸末端带有一个或多个未配对核苷酸的单链部分。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
基因诊断的方法有哪几种
基因诊断(gene diagnosis)是以探测基因的存在,分析基因的类型和缺陷及其表达功能是否正常,从而达到诊断疾病的一种方法。它是继形态学、生物化学和免疫学诊断之后的第四代诊断技术,它的诞生与发展得益于分子生物学理论和技术的迅速发展。 常用基因诊断技术: 一、Southern印迹法(Sout
SNP的检测知识
SNP的检测知识:人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人
基因多态性的检测方法
1.限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP):由DNA 的多态性,致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变,用限制酶切割基因组时,所产生的片段数目和每个片段的长度就不同,即所谓的限制性片段长度多态性,导致限制片段长度发生改
核酸突变检测技术
基因突变是指由于DNA碱基对的置换、增添或缺失而引起的基因结构的变化,亦称点突变。它的分类方式包括1)根据基因结构的改变方式,基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两种类型;2)根据遗传信息的改变方式,基因突变又可以分为同义突变、错义突变和无义突变三种类型。基因突变的检测方法:从基因突变的性质来看,检
细胞化学词汇单链DNA
中文名称:单链DNA外文名称:single-stranded DNA术语含义:单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。