如何用双酶切鉴定外源DNA在重组质粒中的插入方向
在基因插入的邻近末端部位选择一个单酶切点( B ),在载体上选一个单酶切点( A),用这两个内切酶分别酶切两份重组质粒,正、反两个方向的插入将产生不同大小的 DNA 片段,通过凝胶电泳即可鉴定插入片段方向是否正确.......阅读全文
重组质粒双酶切鉴定
既然你的质粒已经提出来了,那么感受态、转化等因素就不必再考虑了。 你看看双酶切后载体的位置有几条带,如果是两条,那说明酶切不完全,如果是一条,那说明酶切效率没问题。 pET28a分子量为5.6k,你的插入片段为500bp,如果你的质粒完全切开,载体和插入片段的摩尔比为1:1,质量比就是5.6
双酶切反应
双酶切buffer的选择: 1、U :Supplied with its own unique reaction buffer that is different from the four standard NEBuffers. Its compatibility with the fou
【共享】双酶切
1、 在双酶切载体时如果2个酶切位点靠得很近,必须注意酶切顺序。因为有的限制性内切酶要求其识别序列的两端至少保留有若干个碱基才能保证酶的有效切割。有的酶要求识别序列两端有多个碱基的,则必须先切,否则就可能造成酶切失败。2、 回收PCR产物:回收的PCR产物片段=1:10 ,一般取前者0.03pmol
DNA酶切及鉴定
实验概要限制酶主要存在原核细胞中。多数来源于细菌,有的来源于蓝藻和链霉菌,极少数来源于支原体等微生物中,存在原核细胞的限制酶能在特异的识别位点切断外源DNA,如感染的噬菌体。而宿主细胞内的DNA则因它的一些特异识别位点常常由于其中一个碱基的甲基化被保护起来,从而使此位点不再成为限制酶的底物。限制性内
双酶切反应酶活性分析及双酶切建议缓冲液
同步双酶切是一种省时省力的常用方法。选择能让两种酶同时作用的最佳缓冲液是非常重要的一步。NEB每一种酶都随酶提供相应的最佳 NEBuffer,以保证100%的酶活性。NEBuffer的组成及内切酶在不同缓冲液中的活性见《内切酶在不同缓冲液里的活性表》及每支酶的说明书。能在最大程度上保证两种酶活性
重组克隆筛选(酶切鉴定)
【实验目的】1.掌握质粒提取的基本方法的原理;2.学习和掌握限制性内切酶的使用方法。【实验原理】重组克隆的筛选和鉴定是基因工程中的重要环节之一。不同的克隆载体和相应的宿主系统,其重组克隆的筛选和鉴定方法不尽相同。从理论上说,重组克隆的筛选是排除自身环化的载体、未酶解完全的载体以及非目的DNA片断插入
双酶切小技巧
A.任何时候2 种酶的总量不能超过反应体系的1/10体积。B.双酶切时如果两种酶反应温度一致而buffer不同时,可查阅内切酶供应商在目录后的附录中提供的各种酶在不同buffer中的活力表(也可以向ebiotrade.com客户服务部索取),如果有一种buffer能同时使2 种酶的活力都超过70
双酶切反应酶活性分析
同步双酶切是一种省时省力的常用方法。选择能让两种酶同时作用的最佳缓冲液是非常重要的一步。NEB每一种酶都随酶提供相应的最佳NEBuffer,以保证100%的酶活性。NEBuffer的组成及内切酶在不同缓冲液中的活性见《内切酶在不同缓冲液里的活性表》及每支酶的说明书。能在最大程度上保证两种酶活性的缓冲
质粒DNA的双酶切
实验概要掌握质粒DNA双酶切的原理和操作方法。实验原理分子生物学实验中,基因的重组与分离涉及到一系列的酶促反应。许多种酶在基因克隆实验中有着广泛的用途。限制性内切酶是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DNA水解酶。多种细菌能合成限制性核酸酶,这是它们保护自己,降解外来DNA分子的重要手段。每一
转化克隆的筛选和鉴定——酶切鉴定法
利用转化后宿主菌所获得的抗菌素抗性性状筛选出获得质粒的菌落克隆。再从这些菌落中鉴定出质粒上带有外源基因插入片断的克隆菌落。实验材料重组大肠杆菌试剂、试剂盒LB培养基氨苄青霉素乙醇质粒提取试剂盒限制性内切酶缓冲液甘油硫酸镁Tris盐酸琼脂糖仪器、耗材试管记号笔酒精灯冰箱牙签旋涡混合器镊子微量移液取样器
质粒DNA的提取、酶切与鉴定
1. DNA 琼脂糖凝胶电泳 ① 琼脂糖凝胶的制备:称取0.6g 琼脂糖,置于三角瓶中,加入50 mL TBE 缓冲液,经沸水浴加热全部融化后,取出摇匀,此为1.2%的琼脂糖凝胶。 ② 胶板的制备:取橡皮膏(宽约1cm)将有机玻璃板的边缘封好,水平放置,将样品槽板垂直立在玻璃板表面。将冷却至65℃左
如何用双酶切鉴定外源DNA在重组质粒中的插入方向
在基因插入的邻近末端部位选择一个单酶切点( B ),在载体上选一个单酶切点( A),用这两个内切酶分别酶切两份重组质粒,正、反两个方向的插入将产生不同大小的 DNA 片段,通过凝胶电泳即可鉴定插入片段方向是否正确.
双酶切,两个酶温度不同怎么办
如果能够找到让两种酶同时作用的最佳缓冲液NEBuffer,那就可以同时双酶切。如果找不到就只能采用分步酶切。分步酶切应从反应要求盐浓度低的酶开始,酶切完毕后再调整盐浓度直至满足第二种酶的要求,然后加入第二种酶完成双酶切反应。
双酶切连接反应之全攻略
前一阵子一直在做双酶切质粒重组,失败了 很多次,不过很快改善了 实验方法,用2周重组了 14个质粒。现就自己的体会,结合丁香园战友的宝贵经验,谈一下质粒重组的一些个人经验。1、回收PCR产物:在进行PCR扩增时候,给引物两端设计好酶切位点,一般说来,限制酶的 选择非常重要,尽量选择粘端酶切和 那些酶
双酶切连接反应之全攻略
在进行PCR扩增时候,给引物两端设计好酶切位点,一般说来,限制酶的 选择非常重要,尽量选择粘端酶切和 那些酶切效率高的限制酶,如BamHI、HindIII,提前看好各公司的双切酶所用公用的BUFFER,以及各酶在公用BUFFER里的效率。选好酶切位点后,在各个酶的两边加上保护碱基,其原则可
挑克隆鉴定时PCR有目的条带但是酶切没有
可能原因:1.PCR扩增的是假克隆,因为PCR验证的可靠性不稳定。2.质粒中酶切位点变异你可以做如下实验:1.看重组质粒的大小是不是比原始质粒大2.用提出的质粒做pcr,这样比较可靠,用细菌做pcr的假阳性极高3.用别的酶再试一下,是否能切出目的片段。
DNA酶切
一、 DNA酶切反应 1、 将清洁干燥并经灭菌的eppendorf管(最好0.5ml)编号,用微量移液枪分别加入DNA 1μg和相应的限制性内切酶反应10×缓冲液2μl,再加入重蒸水使总体积为19μl,将管内溶液混匀后加入1μl酶液,用手指轻弹管壁使溶液混匀,也可用微量离心机甩一下,使溶
DNA酶切
一、 DNA酶切反应 1、 将清洁干燥并经灭菌的eppendorf管(最好0.5ml)编号,用微量移液枪分别加入DNA 1μg和相应的限制性内切酶反应10×缓冲液2μl,再加入重蒸水使总体积为19μl,将管内溶液混匀后加入1μl酶液,用手指轻弹管壁使溶液混匀,也可用微量离心机甩一下,使溶液集中在
DNA的酶切与连接——质粒DNA酶切
DNA的连接和酶切可用于:(1)利用限制性核酸内切酶切割DNA和利用DNA连接酶连接DNA是DNA重组过程中的关键步骤之一;(2)成功的酶切和有效的连接为后续的外源基因进入宿主细胞进行表达提供了有效的实验材料。实验方法原理限制性内切酶能够特异性地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附
质粒DNA的酶切和琼脂糖凝胶电泳鉴定
[实验原理]限制性内切酶识别短的DNA序列并在识别序列内或旁侧特异性切割双链DNA。对环状DNA有多少切口,就能产生多少个酶解片段,因此鉴定酶切后的片段在电泳凝胶中的区带数,就可以推断酶切口的数目,从片段的迁移率可以大致判断酶切片段大小的差别。DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。D
快速细胞破碎法实验步骤和转化子DNA的酶切鉴定
快速细胞破碎法实验步骤1、 挑取转化平板上的单菌接种于含相应抗生素的2ml LB中,37℃振荡培养至A590值为0.6~0.8。2、 取1ml菌液至1.5ml Eppendorf管中,9000rpm离心9min,去尽上清。3、 加入70μl Cracking Gel缓冲液[1mol/L Tris –
切刻内切酶(NEAR)恒温扩增
切刻内切酶(NEAR)恒温扩增是目前相关研究最少的一种恒温核酸扩增技术。它是在2008年由Ionian科技公司的研究人员开发并申请ZL的(Brain等2009)。除了链置换酶(Bst)外,NEAR反应中还需添加一个切刻内切酶。NEAR反应的引物设计需要将所使用的切刻内切酶的DNA作为序列加在引物
内切酶列表:
Single letter code:R = G or A; Y = C or T; W = A or T; M = A or C; K = G or T; S = C or G;H = A, C or T;V = A, C or G;B = C, G or T;D = A, G or T;N =
酶切反应心得
一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则,即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常,一个50μl的反应体系中,1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶,则可相应缩短反应时间;如果减少酶的用
DNA酶切反应
一、 DNA 酶切反应1、将清洁干燥并经灭菌的eppendorf管(最好0.5ml)编号,用微量移液枪分别加入DNA 1μg和相应的限制性内切酶反应10×缓冲液2μl,再加入重蒸水使总体积为19μl,将管内溶液混匀后加入1μl酶液,用手指轻弹管壁使溶液混匀,也可用微量离心机甩一下,使溶液集中在管
酶切反应建议
一、 建立一个标准的酶切反应目前大多数研究者遵循一条规则,即10个单位的内切酶可以切割1μg不同来源和纯度的DNA。通常,一个50μl的反应体系中,1μl的酶在1X NEBuffer终浓度及相应温度条件下反应1小时即可降解1μg已纯化好的DNA。如果加入更多的酶,则可相应缩短反应时间;如果减少酶
DNA的限制性内切酶酶切反应
[实验目的] 通过本实验学习DNA的限制性内切酶酶切反应的基本原理与实验技术。 [实验原理] 1.限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA 序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作
限制性内切酶酶切反应实验原理
限制性内切酶已有百余种,每种酶有其特定的核苷酸序列识别特异性,酶的活性需Mg2+来激活。不同的酶也有许多差别:有些酶除需Mg2+外,还需ATP等其他辅助因子的激活;切割位点和识别序列间的距离不同;某些内切酶同时具有甲基化作用。根据这些差别,可将限制性内切酶分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型。Ⅱ型限制性内切酶只需要
酶切的基础知识(酶切原理和实验过程)
酶切的原理:DNA酶切一般分为质粒直接酶切和PCR产物酶切。限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类、Ⅱ类、Ⅲ类。Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。Ⅰ类酶结合于识别位点
DNA的限制性内切酶酶切反应技术
限制性核酸内切酶(restriction endonuclease)是指识别并切割特异的双链DNA序列的一种内切核酸酶。本实验是掌握DNA的限制性内切酶的酶切技术。DNA的限制性内切酶酶切反应技术[实验原理]1. 限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA 序列之内或其附近的特异位