Northern杂交技术的方法和步骤
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝酸纤维素滤膜上,然后与探针杂交。1、材料:待检测的RNA及制备好的探针。2、设备:电泳仪,电泳槽,塑料盆,真空烤箱,放射自显影盒,X-光片,杂交袋,硝酸纤维素膜或尼龙膜。3、试剂:(1)20×SSPE:175.3g NaCl, 88.2g柠檬酸钠,溶于800ml水中,用10mol/LNaOH调pH至7.4,定溶到1L。(2)其他试剂:与Southern杂交试剂类似,只是所有的试剂均应用DEPC处理。4、操作步骤:(1)RNA经变性电泳完毕后,可立即将乙醛酰RNA转移至硝酸纤维素滤膜上。转移方法与转移DNA的方法相似。(2)转移完毕后 ,以......阅读全文
southern杂交与northern杂交的区别
研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上。
Northern-Blotting反应方法步骤
Northern杂合反应的步骤主要包括:(1) 加入核酸探针,使与固定于尼龙膜上的特定RNA 进行杂合反应;(2) 待杂合反应结束后以含盐缓冲液与SDS 洗掉非专一性结合于尼龙膜上的核酸探针。 进行反应时应注意下列几个问题:a. 实验操作过程仍应尽可能避免RNase 的污染;b. 反应前应先进行杂合
组织印迹的Northern杂交
组织印迹的Northern杂交1)硝酸纤维素膜或尼龙膜上的组织印迹1.在塑料板上放置两层Whatman 1号滤纸,在滤纸上方放上一张普通纸,然后铺上一层尼龙膜。2.用双面刀片从植物组织如大豆的茎上切取一块切片(厚度约为1mm)。如果组织表面是湿的,则在Kimwipes纸上轻轻吸干或先用蒸馏水洗涤几秒
Northern印迹和总RNA杂交实验——杂交和放射自显影
实验材料mRNA试剂、试剂盒甲酰胺SSPEDenhardt 试剂SDS仪器、耗材滤膜实验步骤1. 滤膜进行 1~2 小时预杂交。在 42℃:50% 甲酰胺5x SSPE2 x Denhardt 试剂0.1% SDS或者在 68℃:6x SSC2x Denhardt 试剂0.1% SDS2. 把已变性
Northern-Blot实验方法步骤
实验概要本文介绍了Northern Blot实验仪器试剂和方法步骤。实验原理在变性条件下将待检的RNA样品进行琼脂糖凝胶电泳,继而按照同Southern Blot相同的原理进行转膜和用探针进行杂交检测。用途:检测样品中是否含有基因的转录产物(mRNA)及其含量。主要试剂1. NorthernMax
Northern-Blot实验仪器试剂和方法步骤(2)
7.探针的制备1.在1.5ml离心管中配制以下反应液:模板DNA(25 ng) 1ulRandom Primer 2ul灭菌水 11ul总体积:14ul2.95°C加热3分钟后,迅速放置于冰冷却5min。3.在离心管中按下列顺序加入以下溶液:10×Buffer 2.5uldNTP Mixtu
Northern-Blot实验仪器试剂和方法步骤(1)
[仪器、试剂、材料](一)仪器恒温水浴箱,电泳仪,凝胶成像系统,真空转移仪,真空泵,UV 交联仪,杂交炉,恒温摇床,脱色摇床,漩涡振荡器,分光光度计,微量移液器,电炉(或微波炉),离心管,烧杯,量筒,三角瓶,等。(二)材料总RNA样品或mRNA样品,探针模板DNA(25 ng),尼龙膜(三)试剂No
Northern杂交试验指导手册
Northern杂交试验指导手册DIG标记的Northern杂交试验指导一、 RNA提取方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入25
分子杂交——Northern基因检测
实验概要Northern杂交采用琼脂糖凝胶电泳,将分子量大小不同的RNA分离开来,随后将其原位转移至固相支持物(如尼龙膜、硝酸纤维膜等)上,再用放射性(或非放射性)标记的DNA或RNA探针,依据其同源性进行杂交,最后进行放射自显影(或化学显影),以目标RNA所在位置表示其分子量的大小,而其显影强度则
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
分子杂交技术Southern杂交的操作步骤
(1) 约50μl体积中酶切10pg-10μg的DNA, 然后在琼脂糖凝胶中电泳12-24小时(包括DNA分子量标准物)。 (2) 500ml水中加入25μl 10mg/ml溴化乙锭,将凝胶放置其中染色30分钟, 然后照相。 (3) 依次用下列溶液处理凝胶,并轻微摇动: 500ml 0.2m
Northern杂交试验指导手册(3)
A. 载体选择为了获得能够在体外转录RNA探针的DNA模板,其克隆载体必须带有可供选择的特异转录启动子,同时,为了获得理想的Northern杂交试验结果,载体选择带有两种不同类型而方向相反启动子的载体,以便在RNA探针制备时同时得到两条链的转录探针。常用的这类载体有:pGEM-3/pGEM-4 (
Northern杂交试验指导手册(3)
试验程序1.在纯净工作台上将5ml含AP的LB液体培养基加入到一10~15ml通气良好的试管中,然后将前述经鉴定含有目的 DNA片断的转化细菌接种其中,37℃下振荡培养过夜。2.取1.5ml培养物置于一微量离心管中,在4℃下12000rpm离心2min.,弃去上清液,使细菌沉淀尽可能干燥。3.将细菌
Northern杂交试验指导手册(1)
一、RNA提取方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备
Northern杂交试验指导手册(5)
E.杂交建议杂交条件:探针浓度50~100ng/ml,温度68℃过夜。1.将印迹膜置于装有预杂交液的杂交袋中(每100cm2膜20ml预杂交液),封好杂交袋,在设定的杂交温度下预杂交至少1小时。2.将探针在沸水浴中变性10min.(探针一经变性,立即使用),用预杂交液稀释成设定浓度。3.将杂交袋中
Northern杂交试验指导手册(2)
RNA样品质量分析:完整的总RNA样品应呈现出三条条带,分别为28S rRNA、18S rRNA、5S rRNA。其中28S rRNA条带的亮度应约为18S rRNA条带亮度的2倍,这表明RNA样品比较完整,基本无降解。如果两条带的亮度反过来,则说明RNA样品已发生降解。如果在点样槽内或槽附近有
Northern杂交试验指导手册(4)
8.将样品测试条和对照测试条按下列顺序在上述准备的溶液中浸渍处理,两步骤直接让多余的溶液滴在吸水纸上。①. 封闭, 2min.→②. 抗体结合, 3min.→①. 封闭, 1min.→③. 洗膜, 1min. →④. 平衡, 1min. →⑤. 显色反应(黑暗),5-30min.9.显色反应30mi
分子杂交技术斑点杂交的操作步骤
(1) 10μl样品与20μl 100%甲酰胺、 7μl 37%甲醛、2μl 20×SSC混合。混合置于68℃,15分钟后置冰浴中。 (2) 用0.1mol/L NaOH清洗点样器,再用无菌水充分冲洗。将一张经20×SSC浸润的滤纸铺在点样器上,上面再铺上一张经20×SSC浸润1小时的硝酸纤维
Northern-blotting操作步骤
1. 取RNA2. 将电泳槽和板,梳齿浸泡在3%H2O2中20-30分钟,并吹干3. 跑 1%琼脂糖凝胶,检测样本RNA含量4. 变性胶在桌面上利用保险膜铺出一块干净的区域,将1.95g 琼脂糖加入 110ml 的 DEPC-H2O (加热前可在三角瓶上做一个记号,在加热后把蒸发的水分补足)加热
原位杂交技术和操作步骤详细介绍
原位杂交技术应用于染色体、细胞和组织切片等样品中进行核酸特异性检测,与免疫组化技术的结合应用,能将DNA、mRNA和蛋白水平上的基因活性与样品的显微拓扑信息结合起来。1969年Pardue和Gall将放射性标记的探针直接应用于纯化核酸的杂交,此后得益于分子克隆技术的发展,及不同探针标记系统和检测系统
原位杂交技术和操作步骤详细介绍
原位杂交技术应用于染色体、细胞和组织切片等样品中进行核酸特异性检测,与免疫组化技术的结合应用,能将DNA、mRNA和蛋白水平上的基因活性与样品的显微拓扑信息结合起来。1969年Pardue和Gall将放射性标记的探针直接应用于纯化核酸的杂交,此后得益于分子克隆技术的发展,及不同探针标记系统和检测系统
核酸杂交的技术操作步骤
(1)制备样品:首先需要从待检测组织样品提取DNA或RNA。DNA应先用限制性内切酶消化以产生特定长度的片段,然后通过凝胶电泳将消化产物按分子大小进行分离。一般来说DNA分子有其独特的限制性内切酶图谱,所以经酶切消化和电泳分离后可在凝胶上形成特定的区带。再将含有DNA片段的凝胶进行变性处理后,直接转
Northern杂交试验指导手册(7)-杂交结果检测
方法一、化学发光检测试剂及其配制:洗膜缓冲液:100mmol Maleic acid150mmol NaCl0.3%(v/v) Tween20pH 7.5Maleic acid缓冲液:100mmol Maleic acid150mmol NaClpH 7.5封闭液:5% (w/v) SDS17mmo
Northern杂交法对mRNA的检测、分析及定量的方法
方法:Northern杂交目标RNA的类型:mRNA同时定量的目标RNA的数量:通常为一个,最多几个。用途:主要用于估测不同组织、细胞中目标mRNA的分子质量,可用于mRNA的粗略定量。缺点:需要大量RNA;只可同时检测一个或最多几个mRNA;与PCR方法相比,灵敏度差、耗时。
总RNA提取与Northern杂交(1)
一、 总RNA的提取1、 取组织10-50毫克,剪切成大小在0.5厘米以内的碎片,加入×5的RNA later(约2毫升)。样品在37度可保存1天。室温下1周,4度下1个月。2、 匀浆:用Rnase Erase spray(ICN)清理匀浆器头部(7mm),用DEPC水和乙醇清洗,将上述样品用镊
总RNA提取与Northern杂交(3)
第二天:将上述物品揭开,将胶正面朝下,膜正面朝上,用铅笔作好标记。将胶浸泡在EB中1-2分钟,用DEPC H2O清洗,将膜放在滤纸上面,夹好,4度下保存,或者直接进行预杂交。UV杂交(有助于RNA结合到膜上面)。五、预杂交和杂交预杂交和杂交 buffer: 100ul20×SSC 25ml (5×S
总RNA提取与Northern杂交(2)
4、Loading buffer(10ul每个样) 总体积 100ul 200 ul 500ul 10×MOPS