转录物组学的定义
中文名称转录物组学英文名称transcriptomics定 义研究基因组转录产生的全部转录物的种类、结构和功能的学科。应用学科遗传学(一级学科),总论(二级学科)......阅读全文
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
分子遗传学词汇转录阻遏物
中文名称:转录阻遏物英文名称:transcription repressor定 义:阻止基因转录或使基因转录活性下降的各种因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
利用转录组学方法揭示南荻群体遗传
南荻是中国特有的亩产生物量最大的芒属能源植物。南荻原产于河滨地带,但其遗传变异丰富,生态适应强,移栽到黄土高原等半干旱地区后,生长良好;由于其根系较浅,种植后不会过度利用深层土壤水分,可以有效减少地表径流,有助于水土保持,发挥重要的生态修复功能。 近日,中国科学院武汉植物园闫娟博士在李建强和桑
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子
转录的定义和过程
转录(Transcription)是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以A、U、C、G四种核糖核苷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,进行转录时,一个基因会被读取并被复制为mRNA,即特
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。
转录物的概念
中文名称转录物英文名称transcript定 义在DNA模板上由RNA聚合酶催化转录生成的mRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
于军研究组:首次利用RNAseq解析小鼠乳腺转录组学
乳腺是哺乳动物特有的器官, 90%的发育过程集中在出生之后。近期来自中科院北京基因组研究所,中国科学院大学等处的研究人员首次利用RNA-seq技术对小鼠乳腺发育进行转录组学研究, 包括怀孕期、哺乳期和退化期小鼠乳腺的基因表达情况,并解析了怀孕哺乳周期乳腺的关键调控基因。 作为哺乳动
转录组测序原理
而转录组测序即是利用高通量测序技术,将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq,也就是转录组测序,可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括:正常组织与肿瘤组织;药物治疗前后的表达差异;发育过程中,不同发育阶段,不同组织的表达
基础转录装置的定义
基础转录装置(basical transcriptional apparatus):在TFⅡA~F等参与下,RNA聚合酶Ⅱ与TFⅡD、TFⅡB等聚合,形成一个功能性的前起始复合物PIC,可以开始转录但其速率低,因此称为基础转录装置。
逆转录PCR的定义
逆转录PCR(reverse transcription PCR)或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
转录激活因子的定义
定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)
转录起始因子的定义
中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定 义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
不对称转录的定义
不对称转录有两重含义:一是指双链DNA只有一股单链用作模板,二是指同一单链上可以交错出现模板链和编码链。不对称转录RNA转录时,一个转录子内是只转录一条链的DNA上的信息,表现为不对称转录。而DNA上遗传信息以基因为单位(真核),可以在不同的单链上。RNA在转录后,加工编辑的过程中,有些情况下会把不
转录激活因子的定义
定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)
学者开发PASSAGE加速大规模空间转录组学特征识别
中国科学院广州生物医药与健康研究院与北京大学生物医学前沿创新中心/昌平实验室合作,在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助下,开发面向大规模异质性空间转录组学切片的表征与空间特征解析方法PASSAGE。2月5日,相关成果发表于《微尺度:方法》(Small Methods)。PASSAGE
高立志小组油茶转录组学研究获新进展
近日,中科院昆明植物研究所高立志课题组对普通油茶转录组学及其油脂代谢途径进行研究,为油茶享有“东方橄榄油”美誉提供了比较转录组学证据,为进一步开展普通油茶的比较功能基因组学研究与分子育种奠定了重要基础。该研究成果发表在《公共科学图书馆·综合》。 科研人员采用新一代高通量测序技术,率先对普通油茶
我国学者在空间转录组学测序方面取得进展
图 空间转录组测序技术Decoder-Seq的示意图 在国家自然科学基金项目(批准号:21927806)等资助下,厦门大学杨朝勇教授团队在空间转录组测序技术与应用上取得进展,相关研究成果以“解码测序提高空间转录组测序的转录本捕获效率(Decoder-seq enhances mRNA captur
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
应用转录组学-为更多的患者量身定制精确的肿瘤药物。
WINTHER试验(WINTHER trial),编号NCT01856296,是由Vall d'Hebron肿瘤学研究所(西班牙)、Chaim Sheba医学中心(以色列)、Gustave Roussy(法国)、Léon Bérard中心(法国)、麦吉尔大学Segal癌症中心(加拿大)、
空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例
单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl
转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pl
转录组学方介导的多效调控蛋白-SprA-作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a
动物所建立高通量大视野空间转录组学新技术
在生物医学研究领域,空间转录组学技术已成为揭示细胞组成、空间异质性以及细胞间复杂相互作用的关键工具,对探讨胚胎发育、神经科学及疾病发生机制等至关重要。然而,该技术在实际应用中受限于成本高昂、视野范围有限和数据处理通量不足等技术瓶颈。这些限制在构建三维及多时空全转录组图谱时尤为突出。9月10日,中国科
绘测疟原虫在整个生命周期中的转录物组
研究人员报告称,他们利用单细胞RNA测序创建了第一个全面且具高分辨率的致疟寄生虫在其整个复杂生命周期中的转录图谱:疟疾细胞图谱。该研究的结果揭示了该寄生虫基因功能和调控的新线索,它同时也为研究涉及多种疟原虫物种的致疟寄生虫以及新药研发和抗感染策略提供了一个宝贵的可开放性获取的新型参考数据集。疟