我国科学家成功获得长春花叶片单细胞转录组图谱
长春花为夹竹桃科长春花属植物，在中草药用途上，全草入药有止痛、消炎等功效。单萜类吲哚生物碱（MIAs）是植物中最多样的特殊代谢产物，具有重要的药用价值。长春花能够合成130多种MIAs，是研究单萜吲哚生物碱合成的模式药用植物，其所含生物碱，如长春花碱、长春新碱等被用来临床治疗白血病、霍奇金淋巴瘤等，在药用植物研究领域备受关注。 中国医学科学院药用植物研究所、成都中医药大学和法国图尔大学多家团队联合开展研究，利用单细胞转录组学探讨长春花叶片中MIAs代谢的空间分布规律，并首次定位20个MIAs基因的转录，成功解析长春花中MIAs合成路径30多个酶促反应步骤，并通过RNA原位杂交技术对部分基因表达定位进行验证，更新了MIAs生物合成模型。相关研究成果发表在NaturePlants期刊。 该研究不仅为阐明单细胞分辨率下生物过程的时空分布提供了通用路线图，而且为研究植物药和中药有效成分的生物合成、转运和储存机制开辟了新途径。......阅读全文
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉，该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构，构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱，系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用，有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
PNAS：单细胞测序绘制大脑的细胞图谱
斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表文章，介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。 研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法，他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型，并确定神经元的亚型。他们还观察了
2016值得关注的技术：综合单细胞图谱
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞转录组制备仪的技术指标
将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序，可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库，在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括： 高通量 -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备， 引入条形码序列标记（Barcode），可将测序
单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多个发育轨迹和
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
高通量单细胞转录组测序发展与展望
单细胞转录组测序技术这几年的发展之快，运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术，也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中，上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳，在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章，希望能进一步提升科研工作者对该
玉米单细胞转录组测序，11种细胞类型
近日，广东省科学院南繁种业研究所生物育种研究室在玉米单细胞转录组测序研究方面取得新进展。相关研究在线发表于《作物学报》（The Crop Journal）。广东省科学院南繁种业研究所李旭辉博士为该论文第一作者，齐永文研究员为通讯作者。玉米是全球重要的粮食和能源作物，而其产量形成的基础依赖其特殊的根系
科学家破解大豆发育“基因密码”助力精准分子育种
大豆是人类与家畜植物性蛋白质和油的重要来源。目前，利用分子设计育种策略加速大豆育种颇为重要，而揭示关键基因和大豆器官发育的调控网络则对分子设计育种至关重要。中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜研究团队与合作者，开创性地构建了宏观-单细胞-空间三级转录解析体系。研究基于314份全器官样本的Bulk
人脑血管通路首张单细胞图谱问世
研究示意图由加拿大多伦多大学健康网络和瑞士苏黎世大学领导的一个国际研究团队，成功创建了首张单细胞分辨率的人脑血管系统图谱。该图谱涵盖了大脑从早期发育到成年阶段，以及脑肿瘤和脑血管畸形等疾病状态。这一最新图谱有望为未来治疗相关疾病开辟新途径。研究成果发表于10日出版的《自然》杂志。在最新研究中，科学家
全球首个奶牛多组织单细胞表达图谱诞生
中国农业大学动物科学技术学院教授孙东晓团队构建了覆盖奶牛59种组织、179万个细胞的多组织单细胞表达图谱，为解析牛重要性状遗传调控机制、推进精准育种及探索人类疾病的牛模型研究提供了重要资源。9月5日，相关研究成果发表于《自然-遗传》。作为人类最早驯化的家畜之一，奶牛在全球粮食安全与农业生态系统中占据
单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就
今天，《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果，研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法，完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱，揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况，鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系，为肺
人脑血管通路首张单细胞图谱问世
科技日报北京7月11日电（记者刘霞）由加拿大多伦多大学健康网络和瑞士苏黎世大学领导的一个国际研究团队，成功创建了首张单细胞分辨率的人脑血管系统图谱。该图谱涵盖了大脑从早期发育到成年阶段，以及脑肿瘤和脑血管畸形等疾病状态。这一最新图谱有望为未来治疗相关疾病开辟新途径。研究成果发表于10日出版的《自然》
泛癌症T细胞单细胞图谱－相关成果发表
北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院，在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
迄今最完整胚胎发育单细胞图谱发布
科技日报北京8月4日电 （实习记者张佳欣）科学家以果蝇为模型生物，构建了迄今为止最完整、最详细的动物胚胎发育单细胞图谱。这一发表在最新一期《科学》杂志上的成果，利用了来自100多万个各个发育阶段的胚胎细胞数据，代表了多个层面的重大进步，有助于科学家探索突变如何导致不同的发育缺陷，以及了解人类基
人类胸腺单细胞图谱助力肿瘤免疫治疗
胸腺是T细胞的分化、发育和成熟的场所，是组成免疫系统的重要器官。到目前为止，还不清楚在整个生命过程中，人体胸腺中的早期免疫前体细胞如何发育为T细胞。尽管已通过各种动物模型对胸腺进行了广泛的研究，但是还未有详细的人类胸腺细胞图谱得以报道。 由来自VIB炎症研究中心（VIB Center for
单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就
今天，《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果，研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法，完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱，揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况，鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系，为肺
单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就
今天，《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果，研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法，完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱，揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况，鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系，为肺
人脑血管通路首张单细胞图谱问世
由加拿大多伦多大学健康网络和瑞士苏黎世大学领导的一个国际研究团队，成功创建了首张单细胞分辨率的人脑血管系统图谱。该图谱涵盖了大脑从早期发育到成年阶段，以及脑肿瘤和脑血管畸形等疾病状态。这一最新图谱有望为未来治疗相关疾病开辟新途径。研究成果发表于10日出版的《自然》杂志。 在最新研究中，科学家从
首个海洋生物空间单细胞图谱获揭示
记者从深圳华大基因科技有限公司（简称“华大”）获悉，3月29日，中国海洋大学联合青岛华大基因研究院，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，结合单细胞转录组测序，以柄海鞘的内柱器官为研究对象，绘制了高质量的空间分辨率单细胞图谱，全面解析了海洋动物咽部器官的细胞类型和潜在功能特征，为揭示脊
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
科学家通过单细胞和时空转录组研究，首次解析迄今为止跨时间点最广（GW6-GW23）、面积最大（最大4cm x 3cm）的人脑多区域时空发育转录组图谱，为解码人脑发育及区域特化研究提供了新见解。日前，相关研究成果发表在《细胞》上。 脑是人类最复杂和神秘的器官。解剖学上，脑可以被划分为不同的区域，
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
Science：构建出真涡虫细胞类型转录组图谱
真涡虫是一类相对简单的动物，具有不同寻常的生物学特征：成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞（progenitor cell）。真涡虫获得人们的大量研究，部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whiteh
单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊
从Top50期刊2000余篇文献统计： 在刚刚发布的“十四五”规划中，“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域，近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析，帮助读者了
猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱发布
由860亿个神经元组成的人类大脑，就像一座结构精巧的迷宫。为了绘制出这座迷宫的地图，脑科学家们将目光聚焦在猕猴——这种与人类最接近的灵长类模式动物上，它的大脑包含超过60亿个神经元。 7月12日23时，由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）联合华大生命科学研究院、临港实验室