JACS|大连化物所:基于nMS表征影响蛋白质结构的分子机制
近日,连化物所生物分子结构表征新方法研究组(1822组)王方军研究员、刘哲益副研究员团队与西南交通大学封顺教授团队合作,利用我所自主搭建的高能紫外激光解离—串联质谱仪器,揭示了质子化氨基酸侧链的正电荷在电喷雾离子化过程中影响蛋白质结构的分子机制,为质谱精确表征蛋白质高级结构提供了参考。 非变性质谱(nMS)是研究蛋白质及其复合物组成和高级结构的前沿质谱技术。在nMS分析中采用生物兼容溶液和非变性电喷雾离子化将蛋白质从液相转移至气相并保持高级结构和相互作用。然而带正电荷的质子化氨基酸侧链在失去水分子的溶剂化稳定作用后,会与空间接近的蛋白骨架羰基形成氢键,通过分子内溶剂化稳定侧链正电荷。虽然有报道通过离子迁移—质谱检测到了分子内溶剂化引起的蛋白质碰撞截面积变化,但是对其发生的具体位点和引起结构变化的区域仍然缺乏有效分析手段进行精确表征。 在本工作中,研究团队利用我所自主搭建的高能紫外激光解离—串联质谱仪器和蛋白质光解离质谱数......阅读全文
为什么讲生物质谱是蛋白质组学研究的主要工具
蛋白质组学(Proteomics)研究生物质谱技术对分离的蛋白质 进行鉴定是蛋白质组研究的重要内容,蛋白质微量测序、氨基酸组成分析等传统的蛋白质鉴定技术不能满足高通量和高效率的要求,生物质谱技术是蛋白质组学(Proteomics)的另一支撑技术。生物质谱技术在离子化方法上主要有两种软电离技术,即基质
为什么讲生物质谱是蛋白质组学研究的主要工具
蛋白质组学(Proteomics)研究生物质谱技术对分离的蛋白质 进行鉴定是蛋白质组研究的重要内容,蛋白质微量测序、氨基酸组成分析等传统的蛋白质鉴定技术不能满足高通量和高效率的要求,生物质谱技术是蛋白质组学(Proteomics)的另一支撑技术。生物质谱技术在离子化方法上主要有两种软电离技术,即基质
质谱检测法与蛋白质分析
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。 在生命科学研究工作中有一个重要问
质谱检测法与蛋白质分析
在生命科学研究工作中有一个重要问题,就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息,我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来,从原则上来说,也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗,透过这个窗口,我们就能够对复杂的细胞调控网
羧肽酶的种类及其作用
羧肽酶A能水解蛋白质和多肽底物C端芳香族或中性脂肪族氨基酸残基,释放除脯氨酸、羟脯氨酸、精氨酸和赖氨酸之外的所有C末端氨基酸,更易于水解具有芳香族侧链和大脂肪侧链的羧基端氨基酸。比如酪氨酸,苯丙氨酸,丙氨酸等。 羧肽酶A(carboxypeptidase A),CPA, 因其底物的首位字“A”而得名
简述羧肽酶的基本作用
羧肽酶A能水解蛋白质和多肽底物C端芳香族或中性脂肪族氨基酸残基,释放除脯氨酸、羟脯氨酸、精氨酸和赖氨酸之外的所有C末端氨基酸,更易于水解具有芳香族侧链和大脂肪侧链的羧基端氨基酸。比如酪氨酸,苯丙氨酸,丙氨酸等。 羧肽酶A(carboxypeptidase A),CPA, 因其底物的首位字“A”而
羧肽酶的作用
羧肽酶A能水解蛋白质和多肽底物C端芳香族或中性脂肪族氨基酸残基,释放除脯氨酸、羟脯氨酸、精氨酸和赖氨酸之外的所有C末端氨基酸,更易于水解具有芳香族侧链和大脂肪侧链的羧基端氨基酸。比如酪氨酸,苯丙氨酸,丙氨酸等。 羧肽酶A(carboxypeptidase A),CPA, 因其底物的首位字“A”而得名
高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中...(二)
3.2 分类与多元统计结果实验挑选 6 种最为常见的食用植物油进行深度的多元统计分析。图 5 为对 SIEVE 软件获得的脂质轮廓谱数据矩阵进行聚类分析的结果,可见, 6 种食用植物油样品按照各自的植物基源,分类明确。随后,为进一步明晰不同脂质分子在脂质整体轮廓分类中的贡献,实验又对这 6 种植物油
高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中...(一)
1. 前言食品组学(Foodomics)是食品科学中的一门新兴学科,它通过运用或整合各种先进组学技术(-Omics)来研究食品与营养学中的相关科学问题,从而改善消费者的福祉与健康 [1]。按照研究目的与对象体系的不同,食品组学能从基因组学、蛋白组学与代谢组学等不同组学角度实施,可广泛应用于食品产地溯
肽的理化性质
小肽的理化性质与氨基酸类似。许多小肽已经结晶。晶体的熔点很高,说明是离子晶体,在水溶液中以偶极离子存在。肽键的亚氨基不解离,所以肽的酸碱性取决于肽的末端氨基、羧基和侧链上的基团。在长肽或蛋白质中,可解离的基团主要是侧链上的。肽中末端羧基的pK’比自由氨基酸的稍大,而末端氨基的pK’则稍小。侧链基团变
组成蛋白质的氨基酸均为α氨基酸
氨基酸(amino acid):含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。生物功能大分子蛋白质的基本组成单位,是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物。氨基连在α-碳上的为α-氨基酸。组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸。 基酸中包含的羧基(COOH),氨基(NH
MIT最新研究:从氨基酸链片段直接预测蛋白质功能
就在几个月前,DeepMind推出了AlphaFold系统,这个被称为生物界“AlphaGo”的系统能够预测并生成蛋白质3D结构。而近日,来自MIT的研究人员开发了一个新的研究模型,能够直接预测氨基酸链片段是如何决定蛋白质功能的。这一发现可以帮助研究人员设计和测试新的蛋白质,从而用于药物研发和生
CESI-8000QExactive电泳质谱联用快速表征生物制品
在生物制药行业,由于单克隆抗体药物(mAbs)的杂质和异质性可以影响安全性或疗效,对其进行全面和可重复性的表征至关重要。单克隆抗体是一类高分子量的糖蛋白(约150 kDa),同时包含一些其他的翻译后修饰(PTMs)。单克隆抗体肽谱(第三水平表征)可以提供关于纯度和异质性的定性和定量的信息。毛细管
质谱技术原理与方法简介
质谱方法(Mass Spectroscope,MS)是通过正确测定蛋白质分子的质量而进行蛋白质分子鉴定、蛋白质分子的修饰和蛋白质分子相互作用的研究。质谱仪通过测定离子化生物分子的质荷比便可得到相关分子的质量。但长期以来,质谱方法仅限于小分子和中等分子的研究,因为要将质谱应用于生物大分子需要
质谱分析技术原理与方法
质谱方法(Mass Spectroscope,MS)是通过正确测定蛋白质分子的质量而进行蛋白质分子鉴定、蛋白质分子的修饰和蛋白质分子相互作用的研究。质谱仪通过测定离子化生物分子的质荷比便可得到相关分子的质量。但长期以来,质谱方法仅限于小分子和中等分子的研究,因为要将质谱应用于生物大分子需要将之制
蛋白鉴定方法之质谱相关技术
质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术,开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分,1)样品入机的离子源,2)测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子,并在飞
质谱检测法与蛋白质分析(二)
离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪 随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化,我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪,我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不仅提高了数
质谱检测法与蛋白质分析(三)
Protein(s):待测蛋白质样品;Enz. Digestion:酶解;Pep. Mixture:裂解产物混合物; MS Analysis:质谱检测分析;DB Search:数据库比对搜索;Identities:鉴定; Prot.DB :蛋白质数据库;Proteom
质谱检测法与蛋白质分析(一)
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质
质谱研究蛋白质相互作用(一)
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽,从而帮助研究人员识别并测序多肽分子,分析它们的特征,了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的,一些关键的生物学过程,如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为,这些蛋白复合
质谱检测法与蛋白质分析(二)
传统的和最新的蛋白质组学研究策略虽然到目前为止,还没有一种蛋白质组学研究策略能够对某个蛋白质组进行常规的、完整的分析,但是现在的技术已经非常强大,我们相信,很快就能进行全蛋白质组学研究了。而且,对某个亚蛋白质组(比如某个细胞器或亚细胞结构的蛋白质组)进行研究早就已经不是什么难题了,这已经成为了一种常
质谱和蛋白质组学:击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者:Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)
质谱检测法与蛋白质分析(一)
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋
2018中国质谱大会生命科学与医学集锦
分析测试百科网讯 2018年11月24日-26日,2018年中国质谱学术大会在广州东方宾馆盛大召开。本次大会包括一个报告主论坛,21个主题分论坛,共300余场演讲报告。在“生命科学与医学”分论坛上,数十位业内专家学者带来精彩的演讲报告,吸引参会人员驻足聆听。分析测试百科网作为本次活动的合作媒体,
蛋白质谱测定蛋白质的基础原理
蛋白质是一条或者多条肽链以特殊方式组合而成的生物大分子,大多数蛋白质会自然折叠为一个特定的三维结构。蛋白质的结构层次可以分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构: 一级结构:组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。 二级结构:依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构,主要为α
质谱发展的机遇与挑战
分析测试百科网讯 2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会(质谱大会)在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕。南京大学 陈洪渊 来自南京大学的陈洪渊院士带来了题为《质谱发展的机遇与挑战》的报告。 陈洪渊介绍到1870年科学家发现了阴极射线管,在此基础上质谱在1912年诞生,随着技术的
一文了解离子迁移谱
IMS,是离子迁移谱(Ion mobility spectroscopy)的简称,离子迁移谱(ion mobility spectrometry,IMS)技术是从20世纪60年代末发展起来的一门检测技术,它以离子迁移时间的差别来进行离子的分离定性,借助类似于色谱保留时间的概念,起初被称为等离子体
实验分析仪器液质联用缺陷及解决办法
一、测定对象的局限性 虽然 LC-MS 技术在体内药物分析中的适用范围极广, 但是仍有一些类型的化合物不适合直接采用LC-MS 进行测定, 或者在特定的条件下直接采用LC-MS 分析不能达到灵敏度等要求。通常这样的情况还需要采用衍生化法或者其他更进一步的处理而使得检测复杂化。 1、小分子非极性
综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展
糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾
Bruker在ASMS-2016上展出创新rapifleX--MALDITOF/TOF系统
全新rapiflex™增强了MALDI技术在蛋白表征、生物发展和质量控制,以及质谱成像(MSI)的领导地位 分析测试百科网讯 2016年6月6日,在ASMS2016会议期间,布鲁克展出了rapifleX™,一款超高性能的MALDI-TOF/TOF MS,这款产品曾在第14届人类蛋白质组