JACS|大连化物所：基于nMS表征影响蛋白质结构的分子机制

JACS|大连化物所：基于nMS表征影响蛋白质结构的分子机制

　　近日，连化物所生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员、刘哲益副研究员团队与西南交通大学封顺教授团队合作，利用我所自主搭建的高能紫外激光解离—串联质谱仪器，揭示了质子化氨基酸侧链的正电荷在电喷雾离子化过程中影响蛋白质结构的分子机制，为质谱精确表征蛋白质高级结构提供了参考。　　非变性

用高能紫外激光解离质谱实现蛋白质识别机制解析

原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/482501.shtm 近日，中科院大连化学物理研究所研究员王方军团队与南方科技大学教授田瑞军、副教授李鹏飞等人合作，利用193nm紫外激光解离—质谱装置，实现了免疫共受体CD28磷酸化胞质端与激酶PK

王方军：高能紫外激光解离质谱实现蛋白质识别机制解析

　　近日，大连化物所生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队与南方科技大学田瑞军教授、李鹏飞副教授等人合作，利用193nm紫外激光解离—质谱装置，实现了免疫共受体CD28磷酸化胞质端与激酶PKCθ的C2结构域识别结合机制解析。　　与常规毫秒级碰撞诱导质谱解离（CID）相比，5ns单

紫外激光解离生成金纳米团簇及原位质谱表征

近日，大连化物所所生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员、基元反应动力学研究组（1111组）肖春雷研究员、催化反应化学研究组（501组）李杲研究员等合作，采用193nm脉冲紫外激光解离—质谱装置，实现了有机配体保护金团簇前体高效气相解离生成400余种不同尺寸、组成和电荷价态金纳米团簇

氨基酸按侧链基团分类

非极性氨基酸（疏水氨基酸）共9种：丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、蛋氨酸、甘氨酸；极性氨基酸（亲水氨基酸）共13种：极性不带电荷（中性氨基酸）：丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、硒半胱氨酸、吡咯赖氨酸；极性带正电荷的氨基酸（碱性氨基酸）：赖氨酸、精氨酸

我所发现小分子抑制剂诱导的CDK12/13Cyclin－K变构激活解离新机制

原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202305/t20230521_6760199.html　　近日，我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队与上海药物研究所药物发现与设计中心罗成研究员团队合作，通过整合赖氨酸反应性分析质

百家争鸣，质谱之花绽放杭州

　　2018年5月7日，中国化学会第31届学术年会质谱分析分会进展到第三天，分为报告部分和墙报展部分，当天共有十位专家携自己精彩的报告与众多专家学者交流学习。清华大学教授 欧阳证　　清华大学教授欧阳证带来了题为“分子结构分析在临床质谱分析仪器的实现与应用”的报告。欧阳证介绍了清谱科技生产的Miniβ

氨基酸根据侧链基团极性分类

非极性氨基酸（疏水氨基酸）共8种：丙氨酸（Ala）；缬氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；异亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）极性氨基酸（亲水氨基酸）共14种：极性不带电荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；丝氨酸（Ser）；苏氨酸（Thr）；半胱氨

根据侧链基团极性分类氨基酸

非极性氨基酸（疏水氨基酸）共8种：丙氨酸（Ala）；缬氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；异亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）极性氨基酸（亲水氨基酸）共14种：极性不带电荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；丝氨酸（Ser）；苏氨酸（Thr）；半胱氨

氨基酸根据侧链基团极性分类

　　非极性氨基酸（疏水氨基酸）共8种：　　丙氨酸（Ala）；缬氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；异亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）　　极性氨基酸（亲水氨基酸）共14种：　　极性不带电荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；丝氨酸（Ser）；苏氨酸（

氨基酸根据侧链基团极性分类

  非极性氨基酸（疏水氨基酸）共8种：丙氨酸（Ala）；缬氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；异亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）极性氨基酸（亲水氨基酸）共14种：极性不带电荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；丝氨酸（Ser）；苏氨酸（Thr）；半

2025－中国质谱学术大会圆满落幕：凝心聚力探前沿，共绘领域新未来

　　——致敬前辈・赋能青年　　2025年9月22日，2025 年中国质谱学术大会在郑州落下帷幕。围绕“中国质谱——凝心聚力，共创未来”的主题，来自全国 138 所高校/科研院所/企业以及日本两所高校的 2000 余位专家学者汇聚一堂，共同探讨质谱技术的最新进展、应用挑战与未来趋势。过去三天时间内，大

我所发展蛋白质疏水功能热点原位三氟甲基化标记和质谱探测新方法

原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202402/t20240227_7003113.html近日，我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队与南方科技大学董哲副教授团队合作，发展了一种蛋白质疏水功能热点原位三氟甲基化标记和质

我所发展可实现靶蛋白结构稳定性分析的时间分辨紫外激光解离质谱法

我所发展可实现靶蛋白结构稳定性分析的时间分辨紫外激光解离质谱法发布时间：2024-04-08  |  供稿部门：1822组  |  【放大】 【缩小】  |  【打印】 【关闭】近日，我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队发展了整合紫外激光解离的时间分辨质谱法，

科学家改进整合紫外激光解离的时间分辨质谱法

近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军团队发展了整合紫外激光解离的时间分辨质谱法，实现了对氨基酸位点突变引起的靶蛋白稳定性和动态精细结构的表征，为研究靶蛋白氨基酸突变的病理机制提供了新技术。相关成果发表在《美国化学会志》上。氨基酸位点突变如何影响靶蛋白稳定性和动态结构，对于理解疾病的分子机制

科学家革新紫外激光质谱法，精准解析蛋白质突变影响

近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军团队发展了整合紫外激光解离的时间分辨质谱法，实现了对氨基酸位点突变引起的靶蛋白稳定性和动态精细结构的表征，为研究靶蛋白氨基酸突变的病理机制提供了新技术。相关成果发表在《美国化学会志》上。氨基酸位点突变如何影响靶蛋白稳定性和动态结构，对于理解疾病的分子机制

关于蛋白质结构的侧链构象介绍

　　蛋白质结构：残基侧链上的原子根据希腊字母表的顺序（α、β、γ、δ、ε等）来命名，如Cα指的是对应残基上最接近羰基的碳原子，而Cβ则是次接近的。Cα通常被认为是主链骨架的组成原子。这些原子之间的键对应的二面角则相应以χ1、χ2、χ3等来命名，如赖氨酸侧链上第一、二个碳原子（即Cα和Cβ）之间共价键

ESI－质谱和－MALDI－质谱对聚乙烯亚胺进行结构表征

氨基酸解离常数表

氨基酸解离常数缩写中文译名支链分子量等电点羧基解离常数氨基解离常数Pkr(R)R基GlyG甘氨酸亲水性75.075.972.359.78-HAlaA丙氨酸疏水性89.096.022.359.87-CH₃ValV缬氨酸疏水性117.156.482.399.74-CH-(CH₃)₂LeuL亮氨酸疏水性1

高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究

肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外，还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中，正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏，原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下，逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种

探索界面相互作用：大连化物所发布结构质谱实验手册

　　近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组研究员王方军团队发布了表征蛋白质-纳米材料界面相互作用精细结构的赖氨酸反应性分析-质谱（LRP-MS）实验手册。　　微/纳米材料在生命科学、医药健康、生物催化等领域广泛应用，探讨蛋白质与材料之间的界面相互作用分子机制对生

大连化物所解析出光系统II复合物的动态光损伤分子机制

　　近日，中国科学院大连化学物理研究所生物分子结构表征新方法创新特区研究组研究员王方军团队在超大分子量膜蛋白质复合物组成和结构动态分析方面取得进展，通过整合化学交联质谱法和整体蛋白质组学分析，解析出光系统II复合物的动态光损伤分子机制。　　光系统II（PSII）是光合作用过程中光依赖性反应中的第一膜

我所发表功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略综述

　　近日，我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队与南方科技大学田瑞军教授团队合作，发表了功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略的综述文章。　　功能蛋白复合物的发现和结构—功能表征研究在理解和干预生物学过程中发挥着至关重要的作用。亲和纯化质谱（AP-MS）是发现功

蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目，不一定要用到质谱技术简单说，蛋白质测序的方法有很多，一般是在构建完成后，通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后，用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。

直播预告丨多肽药物第五期多肽药物的结构表征与分析

多肽类药物由多种氨基酸组成，通常分子量较大，紫外光谱、红外光谱、核磁共振波谱等常用的小分子化学药物确证方法不能满足全方面结构解析的要求。指导原则提出“多肽原料药一级结构应明确氨基酸连接顺序，对于具有氨基酸侧链修饰的多肽和存在两个以上分子内环（如二硫键、酰胺键等）的环肽，应明确具体修饰位点、修饰物结构

氨基酸结构和分类（二）

二、氨基酸的性质 （一）物理性质 α-氨基酸都是白色晶体，每种氨基酸都有特殊的结晶形状，可以用来鉴别各种氨基酸。除胱氨酸和酪氨酸外，都能溶于水中。脯氨酸和羟脯氨酸还能溶于乙醇或乙MI中。 除甘氨酸外，α-氨基酸都有旋光性，α-碳原子具有手性。苏氨酸和异亮氨酸有两个手性碳原子。从蛋白质水解得到的氨基酸

国人发AC：结合质谱将蛋白配体互作结构表征提至亚残基

　　近日，中国药科大学郝海平、叶慧团队在Analytical Chemistry杂志上发表题为“Sub-residue Resolution Footprinting of Ligand-Protein Interactions by Carbene Chemistry and Ion Mobili

利用质谱技术测蛋白质的氨基酸序列成本多少

基于质谱的蛋白分析成本主要取决于两个方面：第一、质谱仪及其联用设备的类型，高分辨率高灵敏度质谱通常都大几百万甚至上千万人民币的；第二，数据处理方法，如果你用商业的数据分析软件比如mascot等；第三，样品处理方式，是简单鉴定还是相对定量或者绝对定量。ps：质谱技术很少能做氨基酸测序的（少部分如mal

侧链理论的定义

中文名称侧链理论英文名称side chain theory定　　义1900年由德国科学家埃尔利希(P.Ehrlich)提出的抗体形成理论，认为同一个淋巴细胞表面有很多侧链，抗原与相应侧链特异性结合，可诱导该侧链大量合成和分泌，即为特异性抗体。应用学科免疫学（一级学科），概论（二级学科），免疫学相关名

中检院合作文章——高分辨质谱对AAV2衣壳蛋白表征分析

腺相关病毒 (Adeno-associated virus，AAV) 因其低免疫原性、低基因毒性、在多种不同组织类型具有持久基因表达、作用时间长以及易于生产等特性，成为了临床基因治疗领域广泛应用的基因治疗载体[1]。AAV病毒属于细小病毒家族，无包膜，由衣壳蛋白和单链DNA（全长4.7kb）组成。不