岳峰课题组揭示“增强子劫持／共扩增”在脂肪肉瘤中
脂肪肉瘤（Liposarcoma）是成年人中一种常见的软组织肿瘤， 常常出现在四肢、腹腔和胸腔等部位。这种癌症目前缺乏有效的治疗方法，因此寻找其病因和治疗靶点非常重要。近年来，研究发现脂肪肉瘤中存在巨大染色体以及大量拷贝数变异[1]。然而，这些基因组上的变异与失控的癌基因转录调控有何关联尚不清楚。另一方面，3D基因组在脂肪肉瘤中的角色尚未被调查研究。 近日，美国西北大学Feinberg医学院岳峰教授团队在Cancer Research在线发表了题为Enhancer co-amplification and hijacking promote oncogene expression in liposarcoma 的研究论文。该研究通过整合19对来自同一脂肪肉瘤患者的癌症与癌旁组织的转录组数据（RNA-Seq），4对来自同一患者的癌症与癌旁的增强子分布（H3K27Ac ChIP-seq），染色质构象（Hi-C），基因组结构变异......阅读全文
岳峰课题组揭示“增强子劫持/共扩增”在脂肪肉瘤中
脂肪肉瘤（Liposarcoma）是成年人中一种常见的软组织肿瘤， 常常出现在四肢、腹腔和胸腔等部位。这种癌症目前缺乏有效的治疗方法，因此寻找其病因和治疗靶点非常重要。近年来，研究发现脂肪肉瘤中存在巨大染色体以及大量拷贝数变异[1]。然而，这些基因组上的变异与失控的癌基因转录调控有何关联尚不清楚
一种全新肿瘤发生机制：增强子劫持
肿瘤细胞中有着大量的基因组结构变异（Structural Variation/SV），比如基因组的缺失、重复、倒位、异位等。一些很重要的结构变异已被证明和肿瘤的发生息息相关，并被用于肿瘤的分型与预后诊断，成为设计靶向治疗药物的重要依据。然而过去的研究大多数集中在SV介导的融合基因，比如由白血病中
Nature：癌症中增强的劫持现象
髓母细胞瘤是最常见的一种儿童脑瘤。近日德国的研究人员在针对髓母细胞瘤的研究中取得了突破性发现。两篇论文发表在《自然》（Nature）杂志上。 PedBrain肿瘤网络协调员、德国癌症研究中心的Peter Lichter教授说：“根据疾病的侵袭性，髓母细胞瘤可以分为差异极大的4种不同亚型。其中
Nature子刊：劫持肿瘤的迁移机制
恶性细胞会沿着神经纤维和血管侵入到新的位点由此扩散至大脑，是胶质母细胞瘤极其难以治疗的因素之一。现在，研究人员学会了劫持这一迁移机制，利用比人类头发还要细的纳米纤维膜来引诱肿瘤细胞离开可转而对抗这种癌症。相关技术细节报道在2月16日的《Nature Materials》杂志上。 不再侵
增强子的增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 有的增强子可以对外部信号产生反应。增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定，而能有很大的变动;[2]它能在两个方向产生相互作用。一个增强
科学家发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增
近日，美国克利夫兰凯斯综合癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Functional Enhancers Shape Extrachromosomal Oncogene Amplifications”的文章，发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增 跨越致癌基因边界的非编码区扩增一
增强子的定义
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
增强子的分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类:①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇激素、锌、镉
增强子元件的定义
中文名称增强子元件英文名称enhancer element定 义存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游,在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同,单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。
增强子元件的定义
中文名称增强子元件英文名称enhancer element定 义存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游，在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同，单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。
增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 某些增强子可以应答外部信号。
简述增强子的发现
1981年Benerji在SV40DNA中发现一个140bp的序列,它能大大提高SV40DNA/兔β—血红蛋白融合基因的表达水平,这是发现的第一个增强子。它位于SV40早期基因的上游,由两个正向重复序列组成,每个长72 bp。发现的增强子多半是重复序列,一般长50bp,通常有一个8—12bp组成
增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 某些增强子可以应答外部信号。
增强子的基本结构
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合之后，基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游，也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因，这是因为染色质的缠绕结构，使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
外显子捕获与扩增
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类： ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇
增强子的基本分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类：①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性，只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下，才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如，金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录，又可受类固醇激素、锌、镉
增强子捕获的方法特点
中文名称增强子捕获英文名称enhancer trapping定 义用于确定DNA序列中是否包含增强子功能的一项技术。用做检测的载体含有启动子和报道基因可作表达的标记，但缺乏增强子，将拟检测的DNA序列克隆入这种载体的适当位置，导入细胞或个体，从报道基因表达的程度可分析出增强子的存在与否及其强弱。应
概述增强子的特点作用
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动；[2]它能在两个
外显子捕获与扩增（二）
材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。无二价阳离子的磷酸缓冲液（PBS）酶及缓冲液胰酶-EDTA 溶液核酸与寡核苷酸DNA用于转染的质粒 DNA 制备见本方案阶段 1, 步骤 10~12。用作对照的质粒载体（步骤 3)培养基含 10% 热灭活胎牛血清的 Dulbecco's modified
外显子捕获与扩增2
阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚：氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液（PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X
外显子捕获与扩增（三）
凝胶琼脂糖凝胶（1.5%m/V), 用 TBE 配制核酸与寡核苷酸寡核苷酸引物 [20 mmol/L,TE(pH8.0) 配制]分别提取自转染有对照载体和重组载体的 COS-7 细胞的 RNA(阶段 3)。培养基含 50ug/ml 氨苄青霉素的 LB 琼脂平板专用设备自动微量加样器所用的加样器尖头微
外显子捕获与扩增（一）
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3COS-7 细胞载体 pBluescriptⅡ大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 pSPL3 多克隆位点图谱限制性内切核酸酶PvuⅡT4DNA 连接酶LB 琼脂平板黏粒载体TESOC 培养基琼脂糖凝胶LB 肉汤培养基PBS胰酶-EDTA 溶液D
外显子捕获与扩增1
本方案以哺乳动物穿梭载体 pSPL3 为例，描述了外显子扩增的方法，内容分为以下五个阶段。阶段 1: 文库的构建; 阶段 2: 电穿孔法将文库转染 COS-7 细胞; 阶段 3:mRNA 的提取; 阶段 4: 反转录 PCR; 阶段 5: 克隆分析。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）上册，作者：
Nature子刊：增强RNA干涉的效力
人们可以通过纳米颗粒将短链RNA运输到目标细胞，关闭功能发生异常的基因，从而治疗癌症和其他疾病。不过迄今为止，科学家们还不完全了解，纳米颗粒进入细胞后发生的情况。 现在，麻省理工MIT的一项新研究展现了这些纳米颗粒的命运，这一发现能帮助人们大大提高siRNA的运输效率。文章于六月二十三日发
分子遗传学词汇增强子
中文名称：增强子外文名称：enhancer定义：增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合之后，基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游，也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因，这是因为染色质的缠绕结构，使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
细菌劫持免疫细胞
沙门氏菌可劫持免疫细胞，并利用它们在体内传播。针对小鼠细胞进行的实验表明，这种细菌通过扰乱肠道内的电信号达到这一目的。相关成果日前发表于美国《科学公共图书馆·综合》。 人类肠道拥有小电场。这是由钾离子和氯离子等带电离子进出肠道细胞造成的。诸如食物中毒等沙门氏菌感染会扰乱电场，因为它们会破坏警
关于增强子的基本信息介绍
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
分子遗传学词汇增强子元件
中文名称：增强子元件英文名称：enhancer element定 义：存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游，在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同，单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥
分子遗传学词汇转录增强子
中文名称：转录增强子英文名称：transcriptional enhancer定 义：能提高基因转录效率的顺式调节序列。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）