带来更有效药物和疫苗:从棋盘游戏到蛋白质设计
科学家已成功将强化学习应用于分子生物学的挑战:美国华盛顿大学研究人员开发出一款功能强大的新型蛋白质设计软件,该软件改编自一种被证明擅长棋盘游戏(如国际象棋和围棋)的策略。实验发现,用新方法制造的蛋白质能更有效地在小鼠体内产生有用抗体。发表在最新一期《科学》杂志上的研究结果,可能会很快带来更有效的疫苗。 强化学习是一种机器学习,其中计算机程序通过尝试不同的动作和接收反馈来学习作出决策。例如,这样的算法可通过导致胜败的数百万种不同动作来学习下国际象棋。 为了开发用于蛋白质设计的强化学习程序,研究人员为计算机提供了数百万个简单的起始分子。然后,该软件进行了一万次尝试,随机改进每一个以达到预定义的目标。计算机将蛋白质加长或以特定方式弯曲它们,直到学会如何将它们扭曲成所需的形状。 作为这项研究的一部分,研究人员在实验室制造了数百种人工智能设计的蛋白质。使用电子显微镜和其他仪器,他们证实计算机创建的许多蛋白质形状确实在实验室中实现......阅读全文
RNA引物设计怎么设计
一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的,就是引物在两个exon的交界处,这样pcr的时候就不会有DNA污染现在NCBI可以直接有引物设计,还可以选择上述的设计方式或者可以通过找到cDNA序列然后自己在primer3上设计也可以
采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验
计算方法一直在蛋白质设计中发挥重要作用。本工作主要集中在搜索蛋白质序列空间,以找到一条或数条与已知结构和功能相容的蛋白质序列。在期望的功能和结构限制下,概率性计算方法为所容许的氨基酸变化范围提供信息。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验步骤蛋白质设计中的概
几周内或能完成半年任务?AI无需人干预设计新蛋白质
《自然·化学工程》创刊号1月12日发表一项研究,报道了一个能对蛋白质进行工程改造的、由人工智能(AI)驱动的全自动机器人。研究结果是对无需人类干预的蛋白质设计和构建的一次概念验证。 蛋白质在所有生命形式中都起着重要作用。其各种功能广泛应用于生物技术、化学和医学。改造新的蛋白质通常是个重复且费力
采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验
实验步骤 蛋白质设计中的概率性方法是提供在一个特定的蛋白质结构中对某氨基酸(出现)在一指定位点的概率估计。这里,我们讨论几种估计这些概率的方法并将重点放在直接解出这些概率的基于熵的自洽公式。2.1 关联序列的比对蛋白质结构的序列可变性可用序列和结构数据库来探讨。已知折叠为非常相似结构的序列可以从蛋白
采用计算方法的组合式蛋白质设计策略实验
采用计算方法的组合式蛋白质设计策略 实验步骤 蛋白质设计中的概率性方法是提供在一个特定的蛋白质结构中对某氨基酸
AI设计能提高蛋白质稳定性、精确度及效率
人工智能(AI)蛋白质设计正在走向“更快、更好、更强”。美国麻省总医院布莱根分院和贝斯以色列女执事医疗中心团队开发了一款名为EVOLVEpro的AI工具,被认为是蛋白质工程领域的一项重大突破。团队在最新一期《科学》杂志上展示了通过该工具设计的6种具有不同用途的蛋白质,证明了EVOLVEpro能够提高
mRNA疫苗可能会产生意想不到的蛋白质
即使在新冠疫情期间接种了数十亿剂疫苗后,信使核糖核酸(mRNA)疫苗仍令人惊讶。近日,《自然》发表的一项研究表明,mRNA疫苗可能会促使细胞产生少量意想不到的蛋白质。研究人员提出一种解决方案,有助于使未来基于mRNA的疫苗或药物更安全、更有效。 mRNA引导细胞的核糖体产生新的蛋白质。 英国
科学家首次证明昆虫也爱玩游戏
游戏是人类的天性,这一本能在哺乳动物和鸟类中均有发现。英国科学家发现,大黄蜂在实验中会自发滚动小球,该研究首次证明昆虫也存在游戏行为。相关论文10月19日发表于《动物行为》。 2017年,一项研究发现大黄蜂在蜜糖奖励下,经训练能学会滚动小球。这是科学家首次发现昆虫可以通过学习掌握非生存必须的技能
“游戏成瘾”正式被世卫组织列为精神疾病
6月18日,世界卫生组织(WHO)官网宣布发布最新一版《国际疾病分类》,新版《国际疾病分类》首次将游戏障碍添加到关于成瘾性疾患的章节中。 游戏障碍在《国际疾病分类》第十一次修订本中作了定义,即一种游戏行为(“数码游戏”或“视频游戏”)模式,特点是对游戏失去控制力,日益沉溺于游戏,以致其它兴
参与色谱飞机大战,玩游戏、学知识、赢大奖!
活动时间:2014年2月20日~2014年3月31日 参加方式: 1. 直接点击或者访问 现在就参与活动>> 2. 本次活动参与方式为开放式互动游戏,没有时间限制。超过50分,即可填写抽奖表格,成绩越高越好!记得把成绩截
南非研发新型采矿技术,将改变矿业“游戏规则”
南非盎格鲁黄金公司新任首席执行官Venkat近日宣称,该公司最近研发的一项新的采矿技术将改变矿业的“游戏规则”。这项技术的关键在于解决了钻井和回填的问题,并且不使用矿井爆破技术。使用该技术可以进行无人采矿,因而实现了矿井全年全天候生产。 为了开采出传统方法无法采掘出的1亿盎司黄金,南非盎格
世卫组织首次将游戏障碍纳入疾病分类手册
据美国《福布斯》杂志12月24日报道,世界卫生组织(WHO)计划于明年发表的诊断手册《国际疾病分类》(ICD)中,将首次纳入“游戏障碍”(GamingDisorder)一词。 “游戏障碍”并非某个游戏的名称,也不是指游戏机控制器上的“开始”键出故障,游戏中你的虚拟人物把工具满屏幕乱丢,也不是指
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活动时间:2014年2月20日~2014年3月31日 参加方式: 1. 直接点击或者访问 现在就参与活动>> 2. 本次活动参与方式为开放式互动游戏,没有时间限制。超过50分,即可填写抽奖表格,成绩越高越好!记得把成绩截图回复本主题贴,参与优胜奖角逐哦!赶快开始游戏吧! 游戏规则
广东科学中心推出《五心探索之旅》科普游戏
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514913.shtm12月25日,记者从广东科学中心获悉,该中心基于“叻科”“科豆”两个IP动漫角色开发的一款全新的科普互动游戏——《五心探索之旅》于近日正式上线。该科普游戏融合线上线下场景,以有趣的互
盘点:医疗行业中15个成功的游戏化案例
如今,很多人都开始关注自己每天行走的步数,用锻炼获得的积分来种植虚拟植物,被游戏化的魅力深深折服。游戏化的应用、设备与治疗方法将来会出现在医疗领域的每一处,一切都会更加简单,也更加妙趣横生。本文梳理了医疗行业中游戏化的难点与优势,并对15个成功的游戏化案例作了详细整理。 行为改变为什么这么难?
量子物理实验召十万游戏玩家一起“玩”
人类的随机性会促进量子力学研究吗?答案是肯定的。据英国《自然》杂志9日发表的报告称,欧洲一项大型物理实验发动了全球十万名游戏玩家竞相生成随机数序列,从而帮助检验是否可能违背量子力学所预测的定域性和实在性。 一直以来,关于量子物理能否提供关于实体现实的完整描述,讨论的焦点在于所谓的定域性和实在性
沉浸式学习!香港生产力学院推“TecHunt”游戏
日前,香港生产力学院宣布推出全新创科体验游戏“TecHunt”。游戏利用虚拟现实(VR)技术,让高小和初中学生探索香港生产力促进局(生产力局)的前沿科技主题展馆、认识先 进制造技术及新质生产力形成的过程。通过创新和互动的方式学习 STEAM 知识,培育未来科创生力军。“TecHunt”利用虚拟现实(
杨晓勇博士Cell解析大脑中的“饥饿游戏”
耶鲁大学医学院的研究人员发现,大脑中一个影响进食的分子过程,控制着白色脂肪向棕色脂肪转化。我们能消耗多少能量,减掉多少重量都取决于这个过程。相关论文发表在十月九日的Cell杂志上,文章的通讯作者是耶鲁大学的杨晓勇(Xiaoyong Yang)副教授和Tamas Horvath教授。 杨晓勇博士
引物设计的引物设计原则
1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
引物设计的引物设计原则
1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3
青岛能源所计算机辅助蛋白质设计取得新进展
蛋白质作为药物、生物制剂和催化剂被广泛应用,其稳定性对于生物技术应用具有重要影响。通常,蛋白质的稳定性可以通过定向进化、序列同源比对和理性设计来完成。上述方法都有各自优势和缺点,在实际应用中方法的适用性和成功率通常依赖于蛋白质体系本身。 近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所仿真模拟团队
Science:新型呼吸道合胞病毒疫苗可引起强烈的免疫反应
呼吸道合胞病毒(RSV)是导致婴儿感染疾病死亡的主要原因之一,一种针对这种病毒的实验性疫苗在人类临床试验的第一阶段就显示出了早期的希望。包括德克萨斯大学奥斯汀分校的Jason McLellan在内的一组研究人员近日在《Science》杂志上发表报告说,他们的一种候选疫苗引起了持续数月的RSV中和
揭秘白酒厂商“数字游戏”“年份酒”乱象几时休?
一瓶白酒标注上“年份”二字,含金量会提升几何?近期,关于“年份酒”的讨论再度热传,有报道称, 同一品牌白酒挂上“年份”二字,价差便可达数百元乃至数万元。年份酒“数字游戏”背后,是这类酒乱标年份、企业自说自话、标准缺失的行业乱象。不过,困扰白酒行业多年的“症结”或将迎来破解。日前,中国酒业协会副
毒理学家与下毒者的猫鼠游戏
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500607.shtm011922年7月31日,美国纽约百老汇街附近的谢尔本快餐店发生了多人食用快餐后中毒死亡的大案。在谢尔本快餐店吃过午餐的60人被紧急送往医院,其中6人当天死亡。经过毒理分析,谢尔本快餐
网易发布《致暴雪游戏玩家的一封信》
11 月 17 日消息,网易官方今日晚间发布《致暴雪游戏玩家的一封信》。网易表示,针对大家关心的退费、游戏数据、虚拟财产、游戏权利等相关问题,将尽最大可能和动视暴雪公司协商,以最大程度保障中国玩家利益。当地时间 11 月 16 日,暴雪娱乐发布声明,由于同网易的现有授权协议将在 2023 年 1 月
年轻的免疫系统让抗击COVID如游戏般简单
虱子预防针(Cootie Shot)的游戏在美国已经流传了好几代,通常还伴随着顺口溜“Circle circle, dot dot, now you've got a cootie shot!”,以此来抵御同学们携带的(想象中的)细菌(1)。尽管做游戏的孩子们可能并没有意识到,但他们的免疫系
我国科学家发现网络游戏成瘾的脑机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503649.shtm27日,记者从中国科学技术大学获悉,该校张效初教授团队创新性地探索网络游戏成瘾在价值决策中损失厌恶的变化,及其背后相关的大脑网络的变化,以及是否能够有助于该疾病的诊断与分类。该项研究成
《先进科学》:人工智能或改变药物研发游戏规则
人工智能算法可用于专门设计与天然物质具有相同效果、但结构更简单的活性成分。在快速设计、制造、测试、分析循环中,将自动化、基于规则的分子构建与机器学习和实验验证很好地结合在一起。 近日,瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH)的科学家在《先进科学》杂志上发表文章,介绍了如何借助人工智能(AI)开发基于