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DNA柔性在抗体基因超突变中的生理功能新进展

4月24日,《细胞》(Cell)以Research Article的形式,在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心孟飞龙研究组等撰写的题为Mesoscale DNA Feature in Antibody-Coding Sequence Facilitates Somatic Hypermutation的最新成果。该研究基于经典生化方法与高通量测序技术,建立了体外检测抗体基因超突变的一系列新方法,从而揭示了抗体基因互补决定区(CDR)通过高度柔性特征引发超高突变的分子机理。胞苷脱氨酶AID在B淋巴细胞中启动了抗体基因超突变,其蛋白表面具有大片正电荷片区;而抗体基因CDR编码区域DNA序列则在进化中获得了高度柔性的特征。酶与底物的协同进化共同促进了CDR区的超突变偏好。该工作为下一代抗体基因人源化动物模型的设计提供了底层理论。 抗体作为适应性免疫系统中的关键效应分子,时刻守卫着机体的健康。面对复杂多变的外界环境,机体的免疫系......阅读全文

高通量单细胞测序助力寻找新冠肺炎全人源抗体

  日前,在北京市科委协调推进下,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)发挥所长,联合首都医科大学附属北京佑安医院、北京义翘神州科技有限公司等单位,用高通量单细胞测序找到了新冠肺炎多种全人源抗体,有望为大规模疫情防控提供解决方案。  新冠肺炎(COVID-19)亟需特效治疗药物。日前利用康复期

高通量基因点样仪

  高通量基因点样仪是一种用于基础医学领域的医学科研仪器,于2016年11月17日启用。  技术指标  1.X 轴移动速度:50-250mm/s;Y 轴移动速度:100mm/s;Z 轴移动速度:100mm/s;X,Y,Z轴移动精度:± 0.2mm;划线头定位精度:± 0.2mm。2.划头最小间距:

高通量细胞迁移筛选

细胞迁移是一个活的生物生长和维持生命过程中不可缺少的的关键过程。为了完成相应的功能,体内的细胞经常会以特定的方向迁移到特定的位置。迁移是一个循环的过程,细胞向前端伸出突触,缩回其尾端。动物组织中的细胞发生迁移主要是为了响应特定的外部信号。细胞迁移对于胚胎发育、伤口愈合、分化以及免疫应答等都是非常重要

高通量细胞分析设备简介

  仪器主要用途:可用于细胞的定性和定量分析(包括检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞因子、细胞内DNA、RNA含量等,定量分析细胞内pH值,蛋白总含量、DNA及RNA含量、免疫表现、细胞周期动力学、细胞特殊配体、细胞生物活性鉴定、细胞凋亡研究、细胞功能分析、钙流等),并将具有将特定形状或功能的细胞从混合

高通量快速验证miRNA靶基因

尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译

关于抗原抗体反应基因工程抗体在真核细胞中的表达

  噬菌体表达的抗体片段常常是在原核细胞()中完成。原核系统表达抗体片段产量高,成本低,快速易于操作。但抗体片段在原核表达系统中不能进行CH2糖基化,从而影响抗体的活性。因此重组抗体基因片段可转移至适合的骨髓瘤细胞系或哺乳动物细胞系(如CHO),甚至于植物细胞中表达,可以得到与淋巴细胞表达相同的抗体

抗体基因重排

  抗体的L链是由C、V、J三个基因簇编码的,H链由C、V、D、J四个基因簇编码的。V是编码可变区,有300个种类;D编码高变区,有15 ~ 20个种类;J编码连接V、C的结合区,有4~5个种类;C编码恒定区,仅有一种。这些外显子通过多种多样的重排,所合成出的肽链,还要再进一步进行L和H链组合,这样

高通量细胞分析产品推荐

  生化药物筛选虽然十多年前就已经规范化了,但药物疗效并不是总能实现预期效果的。在试管中看起来效果不错的靶标,在动物或者人类试验中却结果不佳,这一部分是由于毒性的问题,另外一部分则是由于药物在体内被处理的过程,与在单纯化学相互作用环境中的不同。科学家们希望能通过以细胞为基础的分析方法,来进行药物研发

澳发现维系抗体生成细胞存活的关键基因

  据物理学家组织网近日报道,澳大利亚科学家已经确认了一种基因Mcl-1,它对于维系抗体生成细胞的存活十分关键。这一发现或能对骨髓瘤和慢性免疫性失调等疾病中不受控制的细胞进行管控,开创更好的治疗方式。相关研究报告发表在2月3日出版的《自然·免疫学》杂志上。   抗体生成细胞也被称为浆细胞,其存在于

高通量基因分析仪相关介绍

  高通量基因分析仪是一种用于预防医学与公共卫生学领域的仪器,于2013年01月04日启用。  技术指标  1、通量:有三种通量的测序芯片灵活可选,分别是50M、500M、1.5-2G,可供不同通量需求的项目灵活选择.  2、半导体测序芯片,125万个反应微孔。  3、运行速度:每轮反应2小时内可以

基因组高通量测序的原理

测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。测序反应采用Big Dye Terminator chemistry version 3.1(AppliedBiosystems)和标准M

感染病原高通量基因检测意义

高通量基因测序检查技术优点,能对临床上未知病原体筛查,避免临床上对许多疾病的未知因素检查效果,以及未知...

华大基因获批开展高通量基因测序临床应用

  日前,国家卫生计生委医政医管局委托中华医学会、国家卫生计生委临床检验中心和产前诊断技术专家组评估确定了第一批高通量基因测序技术临床应用试点单位,开展遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断3个专业的试点工作。华大基因成为获批单位之一。   据悉,华大基因下属的深圳华大临床检验中心获批开展

北京基因组所开发新型高通量单细胞多组学新技术

  单细胞测序已成为生物医学领域的关键共性技术。然而,由于缺乏高效的手段降低“假单细胞率”,主流微流控平台的单通道细胞通量通常在1万细胞以下,空载率达到90%以上,且成本高昂,限制了对数百万个细胞或上千例样本的人群队列进行大规模研究。  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)蒋岚研究组

抗原抗体反应抗体基因文库

  抗体基因文库(antibody recombination library)是将不同的重链和轻链基因随机组合,克隆到合适的表达载体中,在原核细胞表达不同的抗体,形成一个抗体库,从这个抗体库中,用抗原可以筛选到相应的抗体基因。抗体基因来源于杂交瘤细胞或动物B细胞(免疫或未免疫)的DNA和mRNA。

高通量筛选平台(HTS)在抗体药物开发中的应用

细胞株开发和培养基优化是生物药物的开发的第一步,工业界一直致力于寻找一个高效快速的解决方案,我们将分两期给大家介绍一下默克提供的解决方案。这一期将分享HTS技术。HTS全称为高通量筛选(High Throughput Screen ),这里要划一下重点:1)高通量,是指通过大量不同的培养基筛选,

高通量单细胞技术获得新突破

  人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne

如何实现高通量的单细胞分选?

 单细胞分选通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、采集、释放和分选,通量达~60个细胞/分钟。    为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现高通量分选。  首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,影响激光聚焦,降低空间

抗原抗体反应抗体基因的改造简介

  将鼠源抗体的V区基因与人源抗体C区基因重组,获得的嵌合抗体(chimericalantibody),可保留鼠抗体对抗原的高亲和性,又减弱鼠源抗体对人的免疫原性,提高治疗性抗体的效果。  重组的嵌合抗体基因转化骨髓瘤细胞或中国地鼠卵细胞(CH0),可在其中表达。为了进一步地消除鼠抗体V区框架区(F

REAfinity重组基因工程抗体-REA抗体

REAfinity流式抗体,即Recombinant Engineered Antibody(重组基因工程改造抗体),经基因工程改造,对Fc段序列进行点突变,使其不会对FcR受体产生非特异性的结合。序列优化和突变后,使得REA抗体与传统大鼠、小鼠单克隆抗体相比优势明显。 1 |        

高通量基因分型检测平台及其应用案例

Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA,通量达到800个样本/3小时。同时,适用于多

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

依托高通量测序技术 400多个水稻基因转基因克隆工作完成

  我国的水稻研究已进入了一个全新的领域,目前华大基因农能平台已经完成400多个水稻基因的转基因克隆工作,依托华大基因强大的高通量测序技术,今后将进一步加快水稻转基因育种研究工作。这是记者在6月29日结束的“水稻基因组学与农业应用研讨会”上获悉的消息。  作为世界上最早种植水稻的国家,水稻

抗原抗体的基因重排

  抗体的L链是由C、V、J三个基因簇编码的,H链由C、V、D、J四个基因簇编码的。V是编码可变区,有300个种类;D编码高变区,有15 ~ 20个种类;J编码连接V、C的结合区,有4~5个种类;C编码恒定区,仅有一种。这些外显子通过多种多样的重排,所合成出的肽链,还要再进一步进行L和H链组合,这样

应用原代细胞进行高通量复杂炎症分析(二)

抗炎化合物抑制黏附分子潜在抗炎化合物比较多通路炎症实验高通量实验评估抗炎化合物效力总结- 我们通过检测标记抗体与粘附分子的结合,可以有效的评估抗炎化合物的效能。- 我们已经测试了多种炎症因子和抗炎药物组合对HUVEC细胞的不同处理条件下,细胞炎症标记,如VCAM,E-selectin,HLA-DR,

PNAS:高通量测序揭示B细胞的生死抉择

  作为机体免疫应答的中坚力量,B细胞时刻准备着识别和摧毁入侵机体的抗原(包括感染和癌细胞)。为了做好这项工作,每一个新生B细胞都配备了高度特异性的武器——与抗原特定部分选择性结合的抗体蛋白。B细胞的成熟要经过仔细的筛选,要么被选中得以成熟,要么被淘汰而死去。这一过程的关键在于,决定B细胞特异性的抗

应用原代细胞进行高通量复杂炎症分析(一)

前言炎症反应的一个重要步骤是细胞表面抗原与血管中免疫细胞的特异性结合。因此,对这些分子变化的及时监控,如VCAM,E-selectin,以及内皮细胞上的HLADR等等,可以为细胞水平的炎症模型提供有效的生理指标上的支持。我们用多通道荧光读取人原代细胞表面的炎症标记,并在此基础上评估不同介质对炎症反应

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

高通量单细胞转录组测序发展与展望

单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该