高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译,具体作用机制可分为两种:一种是降解目标mRNA从而达到阻止其翻译的目的,另一种则是直接抑制mRNA的翻译过程。为了了解细胞中基因的真正生物学意义,研究人员往往会使用很多microRNA分子来沉默细胞中大量的mRNA表达,有时候这些被沉默基因的数目甚至比所使用的microRNA数目还要多。而现在使用的计算机预测靶基因技术还不够成熟,非常容易出错。鉴于此,去年人们开始使用一种新型的大规模验证方法,即在硅片上进行microRNA靶基因验证的“湿试验(真正的试验而不是用计算机模拟的“干”试验)”。由于采用了这种方法,研究人员在2008年取得......阅读全文
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然,确定miRNA与mRNA之间的互作,我们还有更直接的方法,那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗体进行免疫共沉淀(co-IP)。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物,然后开展深度测序以鉴定发现的RNA,
m5C-RNA修饰靶基因验证
技术简介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq将RIP技
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...(二)
图5. 荧光定量证实miRNA不管在人源还是鼠源都在糖尿病组中低表达;与靶基因的表达成反比;miRNA低表达促进糖尿病患者血管内膜增生5.构建VSMC损伤修复模型作者首次提出VSMC损伤修复机制模型,机制的参与成员主要包括VSMC、内皮组织和血小板,如下图所示。在未受伤个体中,内皮组织完整,VSMC
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...(一)
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复文章导读血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增
-高通量miRNA药物精准筛选的新方法
高通量的药物筛选是具有挑战性的。信息化处理的基因网络过程能够对应这个挑战。它能将多个药物候选的潜在目标整合,处理成信息化的可读数据,同时报告特异性和非特异性的效果。在2月16日的Nature Communication中报告了基于细胞检验miRNA药物靶点的这样的基因网络。 该研究采取细胞内遗
lncRNA芯片脂肪肝中分子特异性非酒精性脂肪肝发生机制
伯豪客户利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝 对于很多小伙伴们,特别是医院的工作人员,除了每天繁忙的门诊工作之外,还需要挤出时间来做科研,发文章。这真是一件又苦又累又烧脑筋的工作。有没有办法即简单,又快速地发表还可以的影响因子(3分以上)的文章呢?小编告诉您,是可以的。那么,需要满足哪几
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测
植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制
植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中,miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合,最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割,或者在内质网中抑制靶
BMC-Plant-Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通
首次揭示Y染色体上LncRNA-TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖...
首次揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移文章导读前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,
RIP-技术——研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具-二
但是miRNA具有成百上千个靶标,所以要完全理解一个miRNA和靶标的特异性反应与肿瘤发生之间的联系,是一项非常具有挑战性的工作,尤其是在癌症研究中鉴别出miRNA的准确靶点仍然是一大难题。现已知道miRNA的调节功能是通过结合不同的蛋白质或RNA来实现的,因此研究miRNA与蛋白的结合情况对于揭示
喂食mRNA-mimics和inhibitors研究昆虫mRNA调控发育的机制
棉铃虫(Helicoverpa armigera),夜蛾科昆虫的一种,是棉花蕾铃期的重要钻蛀性害虫,主要蛀食蕾、花、铃,也取食嫩叶。MicroRNA是一类非编码小分子 RNAs(18-25 nt),其在各种生物进程中发挥着重要的作用,包括发育和基因调控。澳大利亚昆士兰大学研究人员通过人工
喂食microRNA-mimics和inhibitors研究昆虫miRNA调控发育的机制
棉铃虫(Helicoverpa armigera),夜蛾科昆虫的一种,是棉花蕾铃期的重要钻蛀性害虫,主要蛀食蕾、花、铃,也取食嫩叶。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其在各种生物进程中发挥着重要的作用,包括发育和基因调控。澳大利亚昆士兰大学研究人员通过人工合成miR
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
文章导读:在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作
喂食microRNA-mimics和inhibitors研究昆虫miRNA调控发育的机制
棉铃虫(Helicoverpa armigera),夜蛾科昆虫的一种,是棉花蕾铃期的重要钻蛀性害虫,主要蛀食蕾、花、铃,也取食嫩叶。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其在各种生物进程中发挥着重要的作用,包括发育和基因调控。澳大利亚昆士兰大学研究人员通过人工合成miR
环状RNA研究深度剖析(一)
1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀青年基金,两
lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究...
lncRNA芯片应用于通过脂肪肝模型中分子特异性表达研究非酒精性脂肪肝发生机制利用lncRNA芯片研究非酒精性脂肪肝对于很多小伙伴们,特别是医院的工作人员,除了每天繁忙的门诊工作之外,还需要挤出时间来做科研,发文章。这真是一件又苦又累又烧脑筋的工作。有没有办法即简单,又快速地发表还可以的影响因子(3
世界首篇非洲爪蟾环状RNA研究成果发表!
作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世
RIP技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具
microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合到核糖核
非洲爪蟾环状RNA研究成果
作为最新的明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界首个小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界第
快速灵敏-让-miRNA-无处可逃
miRNA 是一种既可爱又可恨的小东西,它们深居简出,它们飘忽不定,它们似乎总是在和我们捉迷藏,当我们费尽力气以为即将要将它们掌控的时候,它却又顽皮的从我们的指缝中溜走,而我们却又毫无办法。同学莫怕,TIANGEN 即将上市的最新产品 miRcute 增强型 miRNA cDNA 第一链合成试
RIP-技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具
microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。 miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA
RIP-技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具
microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。 miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA
四川农大:揭示miRNA调控玉米穗发育机制
microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA,在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用,包括代谢,激素反应,转座子的表观遗传控制,胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中,胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而,关于miRNA参
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章,影响因子高达7.8分! 文章导读: 在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m