科学家“复活”石器时代分子,展现古代微生物多样性

古代基因组重建和生物技术的突破正在揭示旧石器时代微生物丰富的分子秘密。在最新一期《科学》杂志上发表的研究中,德国莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研究所、马克斯·普朗克进化人类学研究所以及美国哈佛大学领导的跨学科研究团队重建了更新世以前未知细菌的基因组,并由此建立了一个平台以恢复古代细菌的天然产物。当一个生物体死亡时,它的DNA会迅速降解并分裂成许多微小的碎片。科学家可通过将这些DNA片段与数据库进行匹配来识别其中的一些片段,但大多数古代DNA无法与当今已知的任何东西相匹配。这个问题长期以来一直困扰着科学家。近年来计算技术的进步使得将DNA片段重新组合在一起成为可能,就像拼图一样,或可重建未知的基因和基因组。经过3年的测试和优化,科学家取得了突破,实现了长度超过100000个碱基对的DNA片段,并恢复了广泛的古代基因和基因组。他们现在可从数十亿个未知的古代DNA片段开始,系统地将它们整理成冰河时代失传已久的细菌基因组。团队专注于重......阅读全文

调整基因编码蛋白的检测

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微生物所发现植物保护内源编码基因避免RNA沉默的新机制

  在真核生物中,RNA沉默是一个具有核苷酸序列特异性的,能够导致RNA降解、DNA甲基化,异染色质形成,以及蛋白翻译抑制的调控机制。在植物中,诱发高效的RNA沉默还包括siRNA和甲基化在靶序列上的漂移、沉默信号在细胞间和整株植物的扩散并产生由信号诱导的RNA沉默(非自主性沉默)。植

CAST基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质是一种内源性钙蛋白酶(钙依赖半胱氨酸蛋白酶)抑制剂它由一个N-末端结构域L和四个重复的钙蛋白酶抑制结构域(结构域1-4)组成,参与淀粉样前体蛋白的蛋白水解。calpain/calpastatin系统参与许多膜融合事件,如神经囊泡胞吐、血小板和红细胞聚集编码的蛋白质也被认为会影响编码

GAPDH基因编码功能及结构描述

这个基因编码甘油醛-3-磷酸脱氢酶蛋白家族的一个成员。编码的蛋白质已被鉴定为一个月光蛋白的基础上,它能执行机械上不同的功能该基因产物在糖代谢过程中起着重要的产能作用,在无机磷和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的存在下,可逆的氧化磷酸化作用。编码的蛋白质在细胞核中还具有尿嘧啶DNA糖苷酶活性此外,这种蛋

CASR基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是一种质膜G蛋白偶联受体,能感觉到循环钙浓度的微小变化。编码的蛋白质将这些信息与细胞内的信号传导途径结合起来,这些信号传导途径可以调节甲状旁腺激素的分泌或肾离子的处理,因此这种蛋白质在维持矿物离子的稳态中起着至关重要的作用该基因突变是家族性低钙血症、新生儿重度甲状旁腺功能亢进和常

POLE正相关基因编码功能描述

该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The

NFKBIA基因编码功能及结构描述

该基因编码NF-Kappa-B抑制剂家族的一个成员,该家族包含多个Ankrin重复结构域。编码蛋白与rel二聚体相互作用,抑制参与炎症反应的nf-kappa-b/rel复合物。编码蛋白通过核定位信号和crm1介导的核输出在细胞质和细胞核之间移动。在外胚层发育不良伴T细胞免疫缺陷常染色体显性遗传病的无

CROT基因编码功能及结构描述

这个基因编码肉碱/胆碱乙酰转移酶家族的一个成员。编码的蛋白质将4,8-二甲基壬酰基-CoA转化为相应的肉碱酯这种酯交换反应发生在过氧化物酶体中,是将长链酰基-CoA分子从过氧化物酶体转运到细胞质和线粒体所必需的。因此,蛋白质在脂质代谢和脂肪酸β氧化中起作用。已经描述了选择性剪接的转录变体。[由ref

FANCI基因编码功能及结构描述

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

ENG基因编码功能及结构描述

该基因编码一种同二聚体跨膜蛋白,是血管内皮的主要糖蛋白。该蛋白是转化生长因子β受体复合物的一个组成部分,它与beta1和beta3肽具有高亲和力。该基因突变导致遗传性出血性毛细血管扩张症,也称为Osler-Rendu-Weber综合征1,常染色体显性遗传性多系统血管发育不良这个基因也可能与子痫前期和

CREBBP基因编码功能及结构描述

该基因广泛表达,参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白(creb)的核蛋白被分离出来,该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合,在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性,也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相

常见癌基因编码蛋白的检测

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ITGAL基因编码功能及结构描述

ITGAL编码整合素αL链整合素是由α链和β链组成的异二聚体膜蛋白含有α整合素的I-结构域与β2链(ITGB2)结合形成整合素淋巴细胞功能相关抗原-1(LFA-1),在所有白细胞上表达LFA-1通过与其配体ICAMs 1-3(细胞间粘附分子1-3)的相互作用,在白细胞间粘附中发挥中心作用,并在淋巴细

FASLG基因编码功能及结构描述

这个基因是肿瘤坏死因子超家族的成员编码的跨膜蛋白的主要功能是通过与fas结合诱导细胞凋亡。Fas/FasLG信号通路是免疫系统调节的关键,包括T细胞的活化诱导的细胞死亡(AICD)和细胞毒性T淋巴细胞诱导的细胞死亡。它也与一些癌症的进展有关。该基因缺陷可能与系统性红斑狼疮(sle)有关。另外,已经描

常见癌基因编码蛋白的检测

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FANCL基因编码功能及结构描述

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增

FUS基因编码功能及结构描述

该基因编码异质核核糖核蛋白(hnrnp)复合物的多功能蛋白成分。hnRNP复合物参与mRNA的前剪接和全加工mRNA向细胞质的输出该蛋白属于FET家族的RNA结合蛋白,参与了包括基因表达调控、基因组完整性维护和mRNA/microRNA处理在内的细胞过程选择性剪接导致多个转录变体该基因缺陷导致肌萎缩

DBT基因编码功能及结构描述

支链α-酮酸脱氢酶复合物(BCKD)是一种线粒体内酶复合物,参与支链氨基酸异亮氨酸、亮氨酸和缬氨酸的分解bckd复合物被认为是由24个转酰酶(e2)亚基和相关的脱羧酶(e1)、脱氢酶(e3)和调节亚基组成。这个基因编码转酰酶(E2)亚单位该基因突变导致枫糖尿病,2型。已经描述了选择性剪接的转录变体,

ATM基因编码的概念和特点

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

KDR基因编码功能及结构描述

KDR所编码的蛋白也命名为血管内皮生长因子受体-2(Vascular endothelial growth factor receptor-2,VEGFR-2),是血管生长因子重要信号转导的重要受体,迄今已发现的VEGF信号转导的主要受体包括fms样酪氨酸激酶VEGFR-1,即Flt- 1,胎儿肝激

GNRHR基因编码功能及结构描述

该基因编码1型促性腺激素释放激素受体该受体是七个跨膜g蛋白偶联受体(gpcr)家族的成员。它在垂体促性腺激素细胞以及淋巴细胞、乳腺、卵巢和前列腺的表面表达。在促性腺激素释放激素结合后,受体与激活磷脂酰肌醇钙第二信使系统的G蛋白结合。受体的激活最终导致促性腺激素黄体生成素(LH)和卵泡刺激素(FSH)

CYBA基因编码功能及结构描述

细胞色素b由轻链(α)和重链(β)组成该基因编码光,α亚基,已经提出作为吞噬细胞的杀微生物氧化酶系统的主要成分。该基因的突变与常染色体隐性遗传性慢性肉芽肿性疾病(CGD)有关,其特征在于活化的吞噬细胞的失败产生超氧化物,这对于这些细胞的杀微生物活性是重要的。[由RefSeq提供,2008年7月]Cy

AREG基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是表皮生长因子家族的一员。它是一种自分泌生长因子,也是星形细胞、雪旺细胞和成纤维细胞的有丝分裂原。与表皮生长因子(egf)和转化生长因子α(tgfα)有关。该蛋白与EGF/TGFα受体相互作用,促进正常上皮细胞的生长,抑制某些侵袭性癌细胞系的生长。在乳腺、卵母细胞和骨组织发育中也

MYOF基因编码功能及结构描述

与质膜相关的蛋白DyfFLIN的突变可导致影响近端和远端肌肉的肌肉无力。由该基因编码的蛋白质是一种II型膜蛋白,其结构类似于dysferlin。它是ferlin家族的一员,与质膜和核膜都有联系。该蛋白含有C2结构域,在钙介导的膜融合事件中发挥作用,提示其可能参与膜再生和修复已经发现了两个编码不同亚型

DSCAM基因编码功能及结构描述

该基因是细胞粘附分子免疫球蛋白超家族(ig-cams)的成员,参与人类中枢和外周神经系统的发育。该基因是唐氏综合征和先天性心脏病(dschd)的候选基因。编码类似Ig-CAM蛋白的基因位于11号染色体上另外,已经观察到该基因编码多个亚型的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2012年10月]This

FNTA基因编码功能及结构描述

Prenyl转移酶可通过C-末端Caax盒将硫醚连接的法尼酰基或香叶基与蛋白质的半胱氨酸残基结合。caax-geranylgeranyltransferase和caax-farnesyltransfer是具有相同α亚基但具有不同β亚基的异二聚体。这个基因编码这些转移酶的α亚单位。选择性剪接导致多个转

ELOC基因编码功能及结构描述

这个基因编码蛋白质elongin C,它是转录因子B(SIII)复合物的一个亚单位SIII复合物由elongins A/A2、B和C组成,它通过抑制RNA聚合酶II在转录单位内的许多位点上的短暂停顿来激活伸长elongin a作为siii复合物的转录活性成分发挥作用,而elongin b和c是调节亚

GNAS基因编码功能及结构描述

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。