Illumina芯片助力大型癌症项目
近日,来自欧洲、亚洲、澳大利亚、北美等地的国际研究组 C 癌症基因-环境联合研究协会( Collaborative Oncological Gene-environment Study,COGS)公布了关于癌症的重大突破性成果。这些成果以十三篇论文的形式,分别发表于Nature Communications、Nature Genetics等期刊上。 在这一大型研究中,研究人员使用了Illumina公司的iCOGS定制芯片,来鉴定乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌中的遗传变异。据介绍,这款芯片是由 Illumina公司联合四个大型协作组共同开发的,它们分别是乳腺癌协会协作组(BCAC)、卵巢癌协会协作组(OCAC)、前列腺癌协会研究基因组中癌症相关改变小组(PRACTICAL)和BRCA1/2改变研究人员协作组(CIMBA)。 具体来说,iCOGS芯片鉴定出与癌症相关的DNA特定区域内的单核苷酸多态性(......阅读全文
乳腺癌基因组揭秘
10月23日分别发表于《自然》和《自然—遗传学》的两篇论文介绍了与乳腺癌风险上升相关的遗传变异。人们希望全基因组关联研究(收集大量个体数据进行研究)能够改进该疾病的筛选、早期检测和治疗。 乳腺癌风险受遗传影响,虽然之前已知105个遗传区域与乳腺癌相关,但是它们对于患病风险的影响在很大程度上仍未
乳腺癌基因组揭秘
10月23日分别发表于《自然》和《自然—遗传学》的两篇论文介绍了与乳腺癌风险上升相关的遗传变异。人们希望全基因组关联研究(收集大量个体数据进行研究)能够改进该疾病的筛选、早期检测和治疗。 乳腺癌风险受遗传影响,虽然之前已知105个遗传区域与乳腺癌相关,但是它们对于患病风险的影响在很大程度上仍未
基因组检测让部分乳腺癌无需化疗
美欧多国研究人员日前在新一期《新英格兰医学杂志》上报告说,基因组测试可以识别出部分早期乳腺癌患者复发风险低,术后无需化疗。这一方法可用来预测癌症患者的生存情况,为医生和患者选择治疗方案提供依据。 欧洲9国近6700名乳腺癌早期患者在接受手术治疗后,研究人员采用一种名为MammaPrint的方法
Illumina芯片助力大型癌症项目
近日,来自欧洲、亚洲、澳大利亚、北美等地的国际研究组 C 癌症基因-环境联合研究协会( Collaborative Oncological Gene-environment Study,COGS)公布了关于癌症的重大突破性成果。这些成果以十三篇论文的形式,分别发表于Nature
治疗乳腺癌的药物可以用在患前列腺癌的男性身上
药物阻断了一种被称为聚(腺苷二磷酸核糖)的聚合酶(PARP),该酶能够帮助细胞修复某些类型的DNA损伤。肿瘤学者大多检测出生时带有两个癌症相关基因BRCA1或BRCA2基因突变的卵巢癌和乳腺癌患者的PARP抑制剂。由于他们禁用修复DNA损伤的蛋白会导致癌症刺激突变,因此这些基因突变增加了妇女患
Nature-抗癌新概念:利用合成必要性寻找抗癌靶标
日前,研究人员已经找了一种发现缺乏关键抑癌基因肿瘤治疗靶标的新方法。来自德州大学安德森癌症中心的研究人员解释道,这种方法为大多数种类的前列腺癌找到了治疗靶标位置,也将适用于针对其他肿瘤如乳腺癌、脑癌和结直肠癌的精准医疗的开发。相关研究结果近日发表在国际顶级权威期刊《Nature》上。 通过一种
新方法可以有效预测肺癌,前列腺癌,乳腺癌及白血病...
新方法可以有效预测肺癌,前列腺癌,乳腺癌及白血病的风险【DNA的端粒长度可以有效预测癌症风险】国匹兹堡大学癌症研究所(UPCI)的科学家在美国华盛顿特区的AACR年会上报道,保护染色体末端的DNA端粒长度可以预测癌症的风险并成为未来治疗的潜在靶标。 皮特和新加坡科学家率先研究的研究表明,超过预期的端
华人博士第一作者最新《Nature》文章-提出癌症新概念
科学家们发现了一种可以用于识别缺乏特异性关键抑癌基因这类癌症的靶标的新方法,他们利用这种方法针对最常见的一种前列腺癌进行了分析,找到了一个遗传位点。这种方法也可以确定其它类型的癌症,如乳腺癌,脑癌和结肠癌的精确治疗靶点。赵笛(Di Zhao,音译)博士 这一研究成果在线公布在2月6日的Natu
GenomeDx-Bioscience-开发前列腺癌基因组检测试剂盒
随着医疗水平的提高,人们已经认识到检测方法的更新对疾病治疗的重要意义。因此,许多专注于新型检测手段开发的生物医药公司也越来越受到产业的追捧。最近,GenomeDx Biosciences就宣布公司将募集超过2500万美元的经费用于推广期最新前列腺癌基因组检测方法Decipher Biopsy的推
-“垃圾DNA”中发现潜在癌症病源
人类基因组中仅有1%~2%是负责蛋白质编码的基因,其余非编码区域早先被认为是毫无用处的“垃圾DNA”。但是,美、英等国研究人员最近在这个“垃圾”区域中找到近百个乳腺癌与前列腺癌的潜在“导火索”,提示研究“垃圾DNA”对了解癌症的重要性。 美国耶鲁大学、英国韦尔科姆基金会桑格研究所等机构的研
EBioMedicine:全基因组测序高效识别癌症相关基因突变
UT西南医学中心癌症研究人员已经证明,全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险,其可以潜在地改善癌症的预防,诊断和治疗。 这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组,诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具,能够确定
证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变
最近,UT西南医学中心的癌症研究人员表明,全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险,这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。 这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组,以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。 UT西南
深度测序!这些基因的变体还大量存在于血浆中?
公布于今年ASCO年会上的一项新研究显示,深度测序技术在乳腺癌,肺癌和前列腺癌患者的早期诊断与干预中显示出了巨大的前景,深度测序能够在早期癌症患者的血液中检测到与肿瘤组织高度一致的DNA。 最新的深度测序技术能够对具体的基因组区域扫描60万次以上,产生的数据比其他技术高出100倍,能够有效地帮
Nature等十三篇论文解析常见癌症
由来自欧洲,亚洲,澳大利亚,北美等多处组成的国际研究组:癌症基因-环境联合研究协会( Collaborative Oncological Gene-environment Study,COGS)公布了关于癌症的重大突破性成果,这些成果以十三篇论文的形式,分别发表于Nature Commu
北京基因组所等首次实现前列腺癌的无创性体液检测
前列腺癌是男性中最常见的恶性肿瘤之一,目前前列腺癌的传统诊断方法是检测血清中特异性抗原(PSA)浓度,对PSA偏高的患者进行穿刺活检最终确诊。然而,该方法的主要缺陷是PSA的特异性较差(PSA 4-10ng/ml时,特异性只有25%-40%),其它如前列腺炎、前列腺增生等前列腺疾病也能引起PSA
研究概述迄今规模最大的晚期前列腺癌基因组分析的结果
最近发表在美国临床肿瘤学会(ASCO)期刊《Journal of Clinical Oncology Precision Oncology》上的一项研究概述了迄今规模最大的晚期前列腺癌基因组分析的结果。利用综合基因组图谱(CGP)分析了数千例晚期前列腺癌患者的肿瘤样本,研究人员发现,评估的样本中
年轻患者BMI对乳腺癌基因组复发特征的影响
根据韩国团队的一项新研究,体重指数 (BMI) 似乎会影响具有雌激素受体 (ER) 阳性、HER2/ERBB2 阴性乳腺癌病史的年轻女性基于基因表达的乳腺癌复发评分. “这项研究的结果表明,增加 BMI 可能与年轻的 ER 阳性、ERBB2 阴性乳腺癌患者的基因组风险更高有关,”江南 Seve
基因组测试可识别乳腺癌患者复发风险-术后无需化疗
美欧多国研究人员日前在新一期《新英格兰医学杂志》上报告说,基因组测试可以识别出部分早期乳腺癌患者复发风险低,术后无需化疗。这一方法可用来预测癌症患者的生存情况,为医生和患者选择治疗方案提供依据。 欧洲9国近6700名乳腺癌早期患者在接受手术治疗后,研究人员采用一种名为MammaPrint的方法
Cancer-Res:艾滋病药物对抗前列腺癌
尽管前列腺癌在很多男性中都可以被成功治愈,但是当癌症转移到患者骨头中就对患者是致命性的影响,近日,发表在国际杂志Cancer Research上的一篇研究论文中,来自托马斯杰斐逊大学的研究人员揭示了,在HIV疗法中扮演重要角色的受体CCR5或许可以驱动前列腺癌向骨头中的转移。 医学博士Rich
GenomeDx-2500万美元开发前列腺癌基因组检测试剂盒
随着医疗水平的提高,人们已经认识到检测方法的更新对疾病治疗的重要意义。因此,许多专注于新型检测手段开发的生物医药公司也越来越受到产业的追捧。最近,GenomeDx Biosciences就宣布公司将募集超过2500万美元的经费用于推广期最新前列腺癌基因组检测方法Decipher Biopsy的推
基因组检测让乳腺癌患者无需化疗-帮助选择治疗方案
美欧多国研究人员日前在新一期《新英格兰医学杂志》上报告说,基因组测试可以识别出部分早期乳腺癌患者复发风险低,术后无需化疗。这一方法可用来预测癌症患者的生存情况,为医生和患者选择治疗方案提供依据。 欧洲9国近6700名乳腺癌早期患者在接受手术治疗后,研究人员采用一种名为MammaPrint的方法
三阴性乳腺癌的治疗新希望
美国转化基因组研究院(TGen)的研究人员通过全基因组测序,在转移性三阴性乳腺癌(TNBC)中发现了之前未曾报道过的突变。这篇文章发表在近期的《Molecular Cancer Therapeutics》上。 三阴性乳腺癌是指雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人表皮生长因子受体(
NEJM:家人患上绝症,你是否需要基因检测?
《新英格兰医学杂志》在上周发表了一篇综述,介绍了基因组和外显子组测序的临床指南。尽管这篇综述的对象是医生,指导他们如何利用这些工具来诊断罕见的遗传病,但杂志同时发表了一系列文章,讨论健康人在担心疾病风险时应该怎么做。 在NEJM描述的一个案例中,一位注重健康的男子在拜访了他的亲戚之后,陷入了深
GWAS荟萃分析发现新的乳腺癌风险位点
由剑桥大学研究人员领导的国际研究小组通过全基因组关联研究(GWAS)的荟萃分析,发现了15个与乳腺癌风险有明显关联的新位点。这项成果于3月9日在线发表于《Nature Genetics》杂志上。 这个团队汇集了超过10万名妇女(包含病例和对照)的数据,其中几万个样本已通过定制的iCOGS芯片进
Science探索癌症的未知世界
由耶鲁大学领导的一个研究小组,通过对人类自然遗传变异和癌肿瘤变异进行海量数据分析,揭示了数十个乳腺癌和前列腺癌形成过程中的突变。研究结果发表在10月4日的《科学》(Science)杂志上。 新发现的这些突变均位于不编码蛋白质但却能影响其他基因活性的DNA区域。科学家们认为,这些区域代表了一
北京基因组所等开发通过外周血检测乳腺癌的新方法
近日,中国科学院北京基因组研究所研究员方向东等在Briefings in Bioinformatics 发表题为Platform-independent approach for cancer detection from gene expression profiles of peripher
构建单细胞癌症基因组时间序列模型,可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型,可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化,环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外,在不断增殖的肿瘤中,具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性(fitness)并不是一成不变的。在化疗药物
GE向瑞典著名研究所提供新一代测序服务
通用电气医疗集团(GE Healthcare)近日宣布,它将向瑞典卡罗林斯卡学院的一个研究小组独家提供新一代测序服务。这是该公司在欧洲的第一份大规模测序协议。它将由GE Healthcare的子公司SeqWright Genomic Services提供。 据介绍,第一个使用GE
精准医疗-如何实现?
在安吉丽娜·朱莉爆出预防性切除乳腺的新闻前,大部分人都不知道乳腺癌可通过基因检测预测,更不知道BRCA1、BRCA2(均为乳腺癌基因)是什么。今年初,美国总统奥巴马提出了“精准医疗”计划之后,医疗界对“精准医疗”乐此不彼,中国也不例外。“精准医疗”是什么?离我们有多远?能给予我们什么帮助? 须
FOX转录因子突变方式诠释前列腺癌治疗新靶点
基因突变是物种不断进化的动力泉源,与此同时基因突变也可能导致癌症。人体中基因变异的方式各有不同,如今密歇根大学罗盖尔癌症中心的研究人员发现了基因突变的三种方式。该研究结果发表在《Nature》杂志上。DOI: 10.1038/s41586-019-1347-4 FOXA1是转录因子FOX家族中