AI辅助创新蛋白聚类方法开发新型碱基编辑工具

中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组开创性地运用AI辅助结构预测,建立起基于三级结构的蛋白聚类方法,并扩展为全新的脱氨酶挖掘体系,开发了一系列具有中国自主知识产权的新型碱基编辑工具。该工作为蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研发的碱基编辑系统具有我国自主知识产权的精准基因编辑技术(已申请PCT发明专利)。6月27日,相关研究成果发表在《细胞》上。 蛋白质是生命活动的主要承担者。对蛋白质进行功能聚类,是探索其参与的生理过程、设计新型蛋白质等的重要手段。现有的方法主要基于氨基酸一级序列的相似性对蛋白质进行聚类分析,并以此推断其功能和演化关系。然而,蛋白质功能由其三维空间结构决定,开发基于三维结构的高通量蛋白质聚类方法,将为蛋白质功能研究提供更直接、可靠的手段,并推动未知蛋白质的功能挖掘。 碱基编辑系统可以实现单核苷酸精度的DNA或RNA精准编辑,是基因功能研究、疾病治疗、生物育种的变革性技术。然而,现有碱......阅读全文

AI辅助创新蛋白聚类方法开发新型碱基编辑工具

  中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组开创性地运用AI辅助结构预测,建立起基于三级结构的蛋白聚类方法,并扩展为全新的脱氨酶挖掘体系,开发了一系列具有中国自主知识产权的新型碱基编辑工具。该工作为蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研发的碱基编辑系统具有我国自主知识产权的精准基因编辑

生成式AI进军基因编辑领域

OpenCRISPR-1的物理结构,这是一种由Profluent的AI技术创建的基因编辑器。图片来源:singularityhub.com制图、写歌、作诗、编程、生成视频……生成式人工智能(AI)技术与各行业的结合不断为人们带来惊喜,在各领域掀起革新浪潮。现在,AI的应用场景再次拓展:美国AI蛋白质

我科学家开发出具有自主知识产权的基因编辑技术

  基因编辑技术是面向未来的关键技术之一,能否拥有自主知识产权的基因编辑技术,是这一领域国际竞争的核心。我国科学家在这一方向又建新功——中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组研发出一系列新的碱基编辑系统,是具有我国自主知识产权的精准基因编辑技术,有望打破碱基编辑底层专利垄断,将帮助我国在未来的

新研究:精准基因编辑技术

  中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组开创性地运用AI辅助结构预测,建立起基于三级结构的蛋白聚类方法,并扩展为全新的脱氨酶挖掘体系,开发了一系列具有中国自主知识产权的新型碱基编辑工具。该工作为蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研发的碱基编辑系统具有我国自主知识产权的精准基因编辑

AI系统发展出类人脑特征

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512710.shtm

“基因魔剪”携手AI提升DNA编辑精度

来自瑞士苏黎世大学、苏黎世联邦理工学院以及比利时根特大学的科学家合作开发出一种创新的基因编辑方法,将先进的“基因魔剪”技术与人工智能(AI)相结合,显著提升了DNA编辑的精确度。这项技术为更真实地模拟人类疾病机制提供了有力工具,也为未来精准基因疗法的发展奠定了基础。目前,确保“基因魔剪”在切割目标D

设计基因编辑工具的AI大模型问世

  记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞

AI教育风潮席卷中国高校-学生用AI学AI

  “What does this machine do(这台机器是干什么的)?”4日下午,西南交通大学孟加拉国留学生Zahidul Alam拍下身前吊弦疲劳试验仪器的照片。收到他的语音提问后,手机中的24小时在线“AI学伴”瞬间给出如论文般详细的英文回答。  这是西南交大首门人工智能通识课的第一课

科研人员利用人工智能开发出新型碱基编辑工具

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物表观基因组学创新团队运用人工智能(AI)来挖掘新型胞嘧啶脱氨酶,开发了高效、无序列偏好的胞嘧啶碱基编辑工具。相关研究成果发表在《自然—生物医学工程》(Nature Biomedical Engineering)上。挖掘新的功能性蛋白在生物医药和农业应用等领

AI驱动的蛋白质设计

  扩散模型已被证明在图像和文本生成中很有用,而且似乎也适用于蛋白质设计。然而,这类模型目前的成功率并不高;产生的序列基本不能折叠成目标结构。而近期,由《自然》(Nature)发表的一篇论文描述了一种能设计新蛋白质的深度学习方法,名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,

用AI识别AI:西湖大学研究可检测AI生成文本

虚假新闻、恶意产品评论、剽窃……ChatGPT、 GPT-4等AI大语言模型的应用带来便利,但其误用也带来一系列问题。西湖大学工学院张岳教授的“文本智能实验室”日前发布的一项研究提出一种高准确率、高速、低成本、通用的新文本检测方法——Fast-DetectGPT,无需训练即可识别各种AI大语言模型生

AI指导空间结构优化-开发小型基因编辑工具

近日,南方医科大学基础医学院教授荣知立团队通过空间结构优化和AI结构预测,显著提升了小型CRISPR-Cas12f系统的基因编辑效率,为精准高效的基因治疗提供了新的技术手段。相关成果发表于《自然-通讯》(Nature Communications)。CRISPR-Cas系统作为一种基因编辑工具,因其

“AI+”时代-|-AI“解码”免疫系统

  人体免疫系统包含了很多有关身体健康的信息,其中的关键部分就包含在血液中。医学界提出了一个大胆设想:通过创建一个万能的血液测试,采集免疫系统与病原体之间的反应信息,绘制“免疫图谱”,从而解码免疫系统中的信息,及时在疾病恶化前筛查确诊。那么,什么样的平台能提供足够的计算力,不断通过机器学习和精准模型

ChatGPT的拷问:何为AI伦理、AI治理

前不久,AI聊天机器人程序ChatGPT席卷全球,完成了AI第一次大规模的自传播。作为人工智能领域的现象级应用,ChatGPT可能引发的信任、责任、伦理、法律等问题也很快引发各界关注与担忧。近年来,不少关于人工智能(AI),并和人类生产、生活关系紧密的议题被广泛讨论,诸如“如何应对AI可能对社会产生

ChatGPT的拷问:何为AI伦理、AI治理

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494707.shtm   前不久,AI聊天机器人程序ChatGPT席卷全球,完成了AI第一次大规模的自传播。作为人工智能领域的现象级应用,ChatGPT可能引发的信任、责任、伦理、法律等问题也很快引发各

AI生成超越自然界的蛋白?

美国研究人员使用人工智能(AI)来设计超越自然界的新蛋白质。他们开发的机器学习算法,可生成具有特定结构特征的蛋白质,这些蛋白质可用于制造具有特定机械性能(如刚度或弹性)的材料,从而取代作为原料的石油或陶瓷。研究论文发表在最新一期《化学》杂志上。  麻省理工学院、IBM沃森AI实验室和塔夫茨大学研究人

AI能“构想”新蛋白质结构

科技日报北京12月2日电 (实习记者张佳欣)半个世纪以来,科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战,难倒了几代科学家。但现在,人工智能(AI)解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文,包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种

用AI数据训练AI可能最终导致崩溃

  《自然》7月24日发表的一篇论文指出,用人工智能(AI)生成的数据集训练未来几代机器学习模型可能会污染它们的输出,这个概念称为“模型崩溃”(model collapse)。该研究显示,原始内容会在数代内变成不相关的胡言乱语,显示出使用可靠数据训练AI模型的重要性。  生成式AI工具越来越受欢迎,

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《自然》7月24日发表的一篇论文指出,用人工智能(AI)生成的数据集训练未来几代机器学习模型可能会污染它们的输出,这个概念称为“模型崩溃”(model collapse)。该研究显示,原始内容会在数代内变成不相关的胡言乱语,显示出使用可靠数据训练AI模型的重要性。生成式AI工具越来越受欢迎,如大语言

为什么越使用AI,越活得像个AI

生成式人工智能(AIGC)在重塑生产力的同时,也给高等教育领域带来了颠覆性变革。然而,它所具有的“技术双面性”很可能引发“流利但不真实”“道德偏见”“技术依赖”等问题,这将影响高等教育场景。2023年初,全球多所高校陆续出台政策禁止学生使用生成式AI,但越来越多的大学开始意识到生成式AI势不可挡,单

AI“参谋”来了!中关村AI新药研发平台落成

   12月19日,由中关村生命科学园与角井(北京)生物技术有限公司共同发起建设的中关村AI新药研发平台在北京中关村生命科学园举行落成典礼。该平台于2020年12月开始筹建,旨在利用人工智能技术帮助制药企业快速进行药物靶点发现和筛选、药物作用机制探索、特异性抗体优化等工作,成为生物医药企业新药研发的

可用于AI的大型类脑神经网络实现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500296.shtm 科技日报北京5月9日电 (记者张梦然)在《自然·机器智能》杂志上发表的一项新研究中,荷兰国家数学与计算机科学研究所(CWI)科学家展示了类脑神经元如何与新颖的学习方法相结合,能够

糖基化酶碱基编辑器的机器学习研究进展

  碱基编辑技术可实现精确的碱基转换,当前,有三类碱基编辑器被广泛应用,包括胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor,CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor,ABE)、糖基化酶碱基编辑器(glycosylase base editor,GBE)。  20

亚马逊云推出AI代理功能,让AI成为助理

  Amazon Bedrock的Agents(代理)功能将使公司能够构建可以自动执行特定任务的AI应用程序,例如预订餐厅,而不仅仅是得到去哪里吃饭的建议。  “很多人都如此聚焦于这些模型和模型的大小,但我认为真正重要的是如何利用它们构建应用,这也是今天发布代理(Agents)功能的一个重要原因。”

“AI成龙”遇冷,AI数字人在影视业不灵?

影视业成为“粗制滥造”的标签 近日,影视巨星成龙主演、大量使用了人工智能(AI)数字人技术的电影《传说》登陆大荧幕,却遭遇了票房与口碑的双失利。截至7月20日,豆瓣评分5.3,上映10天累计票房不到8000万元。显然,“AI成龙”遭到了冷遇。“AI成龙”本是《传说》这部电影的卖点。据介绍,为了剧情需

“氏无界·AI无疆”医疗AI成果转化行动启动

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516109.shtm

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球ZL许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。   BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球ZL许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。  BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技术领

AI可据蛋白结构快速设计药物分子

一种新的生成式AI可从头开始设计分子,使其与相应蛋白质精确匹配。图片来源:苏黎世联邦理工学院科技日报讯 (记者张梦然)瑞士苏黎世联邦理工学院化学家开发出一种新的人工智能(AI)算法程序,可根据蛋白质的三维表面快速、轻松地设计活性药物成分。最新一期《自然·通讯》杂志刊发的这一成果,可能彻底改变药物研发