人工智能新模型实现精准RNA靶向和基因调控
据发表在最新一期《自然·生物技术》杂志上的新研究,美国研究人员开发了一种人工智能模型,可预测RNA靶向CRISPR工具的脱靶活性。该模型可精确地设计向导RNA并调节基因表达,这些精确的基因控制可用于开发基于CRISPR的新疗法。 美国纽约大学、哥伦比亚大学工程学院和纽约基因组中心研究人员进行的这项研究,将深度学习模型与CRISPR筛选相结合,以不同的方式控制人类基因的表达,类似于轻按电灯开关将其完全关闭,或通过调光旋钮调低电灯亮度。 CRISPR基因编辑技术通常使用Cas9酶来靶向DNA。近年来,科学家发明了另一种类型的CRISPR,它使用Cas13酶来靶向RNA。研究人员此次创建了一个使用Cas13进行RNA靶向CRISPR筛选的平台,以更好地了解RNA调控并识别非编码RNA的功能。 该研究的一个关键目标是最大限度地提高RNA靶向CRISPR对预期靶标RNA的活性,并最大限度地减少可能对细胞产生有害副作用的其他RNA......阅读全文
微流控芯片检测基因重排
基因重排主要是指高等动物、低等动物基因从远离启动子的地方且转移到距离启动子比较近的地方,从而促使各类动物基因重新启动转录的调控方式,其结合了传统诱变技术、细胞融合技术、基因突变技术等。研究显示,基因重排利于消化道淋巴瘤和非小细胞肺癌的诊断。国外研究显示,通常高等动物、低等动物T、B恶性淋巴瘤多表现T
基因敲除,rna干扰,基因沉默有什么关系
基因敲除一般指永久的、不可逆转的敲除/失活靶基因,目前其中一种热门的,常见的基因敲除方法是CRISPR/Cas9,利用gRNA靶向靶基因并指导cas9切割基因双链,形成移码突变或片段敲除来完成基因敲除。基因沉默与基因敲除不同的地方在于,沉默可以是暂时性的、可逆转的失活基因/抑制基因表达,基因可以是存
基因表达RNA加工的机制介绍
原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中
“RNA桥”新基因编辑技术问世
RNA桥。图片来源:Visual Science本报讯 《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术,这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势,比如有望进行比
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰 实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR
新基因编辑技术“RNA桥”来了!
科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术,能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势,例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑,以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近
新基因编辑技术“RNA桥”来了!
科学家在两项独立研究中描述了一种新的基因组编辑技术,能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,实现这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法或比现有技术更有优势,例如有望比现有技术进行更精准、有效的大规模基因组编辑,以及能介导重组而非造成需要修复的断裂。相关研究近
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使
基因敲除与RNA干扰的关系
20世纪80年代初,胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因,传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用,但是,这个方法在当年来说,存
-制定规则-精心策划-技术把控-深圳推动环境检测社会化
环境检测市场的开放是大势所趋。作为广东省环境检测社会化试点城市,深圳市转变政府职能,改变“保姆式”的监管方式,强化行业自律,环境检测正日益走向社会化、产业化。 严格准入:实验室面积不低于500平方米 深圳市人居环境委员会认为检测市场的开放应遵循健康、有序的原则,积极稳妥推进。为此,广东省环保
利用水质检测仪精准把控水质四大指标
在养鱼管水的过程中,水体溶解氧、浊度、pH值、水温是特别需要关注的四大指标。传统的水质检测,需要检测人员经常出入池塘、水塘等进行现场取样,然后再进行检测,十分不方便,实时性也不高,而现在利用水质检测仪,不仅水质四大指标的检测变得轻松准确,而且让水质监测变成了一项常规工作,可帮助管理者精准把控水质四大
K通道的失活把控生物钟于白天的兴奋性
BK channel inactivation gates daytime excitability in the circadian clockJoshua P. Whitt, Jenna R. Montgomery& Andrea L. MeredithNature Communications
“从源头到终端食品企业如何实现关键环节把控”分论坛
2012年3月28日“第五届中国北京国际食品安全高峰论坛(CBIFS)”各专题研讨会在北京国家会议中心隆重召开。其中有关全供应链质量管理、卫生环境控制、生肉制品关键环节把控、水产品保鲜及安全最新研究、供应链风险分析及控制等方面内容在“从源头到终端--食品企业如何实现关键环节把控”专
破解涂料色彩难题:色差仪在颜色质量把控中的关键作用
涂料,或者我们习惯称之为“油漆”,在中国扮演着重要的角色,无论是汽车、建筑物、交通工具,乃至船舶防腐,它们都离不开涂料的装点和保护。那一层层光滑的颜色,不仅提升了产品的外观装饰性,延长了使用寿命,还赋予了产品特殊的功能。可想而知,涂料的颜色和质量直接影响着产品的最终表现。然而,在实际的生产过程中
温湿度自记仪对大棚冬瓜种植的温湿度把控
冬瓜作为一种食疗保健蔬菜受到人们的广泛喜爱,但是,也因为季节性的影响因素,冬瓜一 般需要到每年的7、8月份才能供应上市。如果对于冬瓜的栽培乐意采用大棚栽培的话,那么就可以提早冬瓜上市的时间,而且产量高,亩收益将会得到进一步的提 升。大棚种植冬瓜时,选用耐低温、耐弱光、耐湿,第一雌花节位低、易坐果、节
华弈生物:把基因检测的成本降下来
■创业故事 抽一管血,就能判断肿瘤的类型,确定个体化的治疗方案,让医生知道什么药对这一患者是最有效的,对癌症病患来说是这是基因检测技术带来的重大利好。 最近,华弈生物科技公司的创始人吴一雷处在他事业发展的关键期,他获得了来自不同的几家投资公司的资金,这些钱让他有更多机会拓展他的“梦想地图
CRISPRRNAseq:把混乱的基因编辑结果屡清楚
对复杂基因网络的分析可以简单概括为三步:1.向大量细胞引入CRISPR基因编辑系统。2.应用单细胞RNA测序分析这些基因编辑的影响。3.分析基因型和表型之间相互作用的遗传途径。通过遵循这些步骤,研究人员可以比以前更有效地探索基因组遗传风险因子的功能影响,观察和研究癌细胞中发生突变的具体基因。
吴一龙:莫把基因检测当“算命先生”
精准医疗是医学界当下最热门的话题,可是何为精准医疗,精准医疗是否存在泡沫,作为精准医疗入口的基因检测又该如何发展?12月10日,一场由中国健康促进教育协会主办的“健康中国2030·精准医疗互动研讨会”在江苏南京举行。广东省人民医院吴一龙教授,江苏省肿瘤医院冯继锋教授,四川大学步宏教授,北京大学肿
吴一龙:莫把基因检测当“算命先生”
精准医疗是医学界当下最热门的话题,可是何为精准医疗,精准医疗是否存在泡沫,作为精准医疗入口的基因检测又该如何发展?12月10日,一场由中国健康促进教育协会主办的“健康中国2030·精准医疗互动研讨会”在江苏南京举行。广东省人民医院吴一龙教授,江苏省肿瘤医院冯继锋教授,四川大学步宏教授,北京大学肿
对话Illumina:基因测序是一把双刃剑?
Illumina公司从事着比谷歌和微软更“神秘”的行业:制造基因测序仪。记者就"基因测序,会不会是一把双刃剑?"等一连串基因测序的话题,提问这家全球“最聪明”的创新企业 人类基因组测序的成本真的已经降到了约1000美元了吗?完成一次测序只需要一天时间?这些听起来很神奇的事情,究竟是如何发生的?基因
是谁把两套基因组拉开的?
当细胞开始分裂(有丝分裂)它的染色体需要被分离并均匀地分布在新产生的子细胞中。这个过程极其复杂,而且因细胞组分而特异,它的许多细节我们并不清楚,这阻碍了开发治疗有丝分裂出错的方法。 发表在Nature Cell Biology杂志上的新研究揭示了蛋白质复合物在染色体中心聚集的细节,该染色体中心
袁隆平:转基因是发展方向正研究把玉米基因转入水稻
袁隆平(资料图)。 有“杂交水稻之父”之称的著名农学家袁隆平近日在接受媒体采访时谈到对转基因的看法,他认为转基因也是今后的发展方向,同时透露他也正在进行转基因水稻的相关研究。 袁隆平用浓重的湖南口音一字一顿地说,“转基因不能一概而论”。他认为,转基因是今后的发展方向。 袁隆平认
研究揭示RNA生物农药防控马铃薯害虫机遇与挑战
近日,中国农业科学院植物保护研究所经济作物虫害监测与防控创新团队联合国内外相关单位,系统阐述了全球首款喷洒式RNA生物农药商业化用于马铃薯害虫防控面临的机遇与挑战。相关成果发表在《中国科学:生命科学》(Science China Life Sciences)上。RNA干扰技术在害虫防控中的应用。受访
微流控芯片与基因的关系
基因测序主要是指采用先进的方法对高等动物、低等动物核酸序列进行系统化、规范化、快速化分析,此过程需要的工程量尤为巨大。目前,对微流控芯片实验室主要采用96根阵列毛细管电泳对基因序列进行系统化测定,虽在一定程度上加快了人类基因组项目,但是还不能实现高效、灵敏、快速、价廉、自动、准确等基本特点,而微
关于基因污染的防控原则介绍
应当坚持谨慎原则 不能再重蹈滴滴涕(DDT) 的覆辙。滴滴涕杀虫剂曾获诺贝尔奖,但50年后才发现其对人类及生态环境产生了无法挽回的巨大伤害。因此要把基因工程的发展速度降下来,而着重提高其质量,将基础工作和研究做扎实,在确实弄清不会对自然环境和人类造成不利影响后再稳步推广。例如欧盟国家曾在卢森堡
震撼!光控基因编辑器有望关闭致癌基因
人为什么会得癌症?人体均携带有原癌基因,当原癌基因受到外界物理或化学致癌因子的刺激,发生癌变,人就得了癌症。基因治疗(gene therapy)是指将外源正常基因导入靶细胞,以纠正或补偿因基因缺陷和异常引起的疾病,以达到治疗目的。 将原癌基因剪切掉,是不是人就不会得癌症了呢? 理论上,这的确
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
分子遗传学词汇转移RNA基因
中文名称:转移RNA基因英文名称:transfer RNA gene;tRNA gene定 义:转录后可产生tRNA的基因。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
赛尔基因口服RNA药物显示疗效
今天赛尔基因宣布其口服RNA药物mongersen(GED0301)在一个克罗恩症临床1b试验中显示疗效。这个临床试验中有63名中重度克罗恩患者参与,三组病人使用每日160毫克mongersen(12周mongersen,8周mongersen+4周安慰剂,4周mongersen+8周安慰剂)。
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的