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生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制

7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增强子(enhancer)作为调控基因转录的重要元件,往往需要通过远距离染色质环化与目标启动子(promoter)相互作用,从而决定基因的时空表达特异性。这一过程参与细胞命运的决定,并在多种疾病的发生发展中扮演着重要角色。增强子能够精确地选择需要激活的目标启动子,以准确调节特定基因的转录时间和转录水平。然而,增强子和启动子配对选择的特异性是如何实现的依然是未解之谜。 为了解决这一关键科学问题,薛愿超团队利用实验室此前开发的RNA原位构象测序技术RIC-seq,系统捕获了增强子RNA(eRNA)和启动子来源的非编码RNA(uaRNA或P......阅读全文

增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示

广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40

研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性

  CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰,而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能,在疾病、发育过程中所扮演的具体角色,以及控制基因表达的详细机理,直到今天并没有全面详细的认知。  2019年8月15日,美国Whitehead研究所Rudolf Jae

分子遗传学词汇--转录增强子

中文名称:转录增强子英文名称:transcriptional enhancer定  义:能提高基因转录效率的顺式调节序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

转录水平的调控

该模型认为在整合基因的5’端连接着一段具有高度专一性的DNA序列,称之为传感基因。在传感基因上有该基因编码的传感蛋白。外来信号分子和传感蛋白结合相互作用形成复合物。该复合物作用于和它相邻的综合基因组,亦称受体基因,而转录产生mRNA,后者翻译成激活蛋白。这些激活蛋白能识别位于结构基因(SG) 前面的

转录因子的转录调控区的介绍

  同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。  转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10

转录后水平的调控

真核生物基因转录在细胞核内进行,而翻译则在细胞质中进行。在转录过程中真核基因有插入序列,结构基因被分割成不同的片段,因此转录后的基因调控是真核生物基因表达调控的一个重要方面,首要的是RNA的加工、成熟。各种基因转录产物RNA,无论rRNA、tRNA还是mRNA,必须经过转录后的加工才能成为有活性的分

基因转录后调控方式

真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在特异性保

基因转录调控的途径

可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

信使RNA转录的调控

  一、遗传信息的表达有时序调控和适应调控,转录水平的调控是关键环节,因为这是表达的第一步。转录调控主要发生在起始和终止阶段。  二、操纵子是细菌基因表达和调控的单位,有正调节和负调节因子。阻遏蛋白的作用属于负调控。环腺苷酸通过其受体蛋白(CRP)促进转录,可促进许多诱导酶的合成。操纵子可构成综合性

如何证明基因需要转录调控元件调控表达

如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3)

基因表达转录调控的主要途径

基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

基因表达的转录调控的介绍

  可分为三种主要途径:  1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);  2)调控转录因子与转录机制相互作用;  3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合

“超级增强子”调控关键基因 科学家为其编目录

  据物理学家组织网10月10日报道,最近,美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器,能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出,超级增强子富集在基因组的变异区,而这些变异区与多种疾病谱系密切相关,所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发

中国科大基因转录调控研究取得进展

  近日,中国科学技术大学生命科学学院教授单革实验室研究发现,秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55,共调控包括cAMP通路、微小RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)等在内的数以千计的靶基因的表达,从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《

基因表达的转录后调控的介绍

  真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。  携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在

真核基因转录水平的调控-1

一、真核生物的RNA聚合酶有三种RNA聚合酶:RNA聚合酶Ⅰ;RNA聚合酶Ⅱ;RNA聚合酶Ⅲ。二、真核基因顺式作用元件(一)、顺式作用元件概念指DNA上对基因表达在调节活性的某些特定的调控序列,其活性仅影响其自身处于同一DNA分子上的基因。(二)、种类启动子、增强子、静止子1、启动子的结构和功能启动

真核基因转录水平的调控-2

(3)增强子的位置可在基因5′上游、基因内或其3′下游的序列中,而其作用与所在基因旁侧部位的方向似无关系,因为无论正向还是反向,它都具有增强效应;(4)增强子所含核苷酸序列大多为重复序列,其内部含有的核心序列,对于它进入到另一宿主之后重新产生增强子效应至关重要;(5)增强子一般都具有组织和细胞特异性

​转录水平调控的概念和方式

转录水平调控是真核基因表达调控的重要环节。根据真核基因表达是否受环境影响可分为:发育调控和瞬时调控。其中发育调控是指真核生物为确保自身生长、发育、分化等对基因表达按“预定”和“有序”的程序进行的调控,是不可逆的过程;瞬时调控是指真核生物在内、外环境的刺激下所做出的适应性转录调控,是可逆过程。

增强子的增强子的特点作用

① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 有的增强子可以对外部信号产生反应。增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动;[2]它能在两个方向产生相互作用。一个增强

eRNA与Super Enhancer RNA在转录调控中扮演的角色

增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件,能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录,产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具

遗传发育所等发现增强子调控茉莉酸信号途径的机理

  增强子是真核细胞调控基因转录的重要元件。在模式动物中,增强子与相应的基因启动子通过形成染色质环在物理上相互靠近,从而精确调控基因的时空特异性表达。然而目前在植物中,如何界定特定基因的启动子和增强子元件尚未明确,特定生理途径中增强子的系统鉴定未见报道,增强子与启动子之间染色质环的形成及其作用机理也

植物转录起始调控机制研究获进展

在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录

Cell免费论文:转录调控的新思路

  来自奥地利维也纳分子生物技术研究所的研究人员发现了转座子和piRNA对染色质模式,以及基因表达的广泛影响,对于未来深入探索这一沉默途径,以及染色质状态基因表达具有重要的意义。相关成果公布在Cell杂志上,目前可免费获取。   领导这一研究的是分子生物技术研究所的Julius Brennecke

植物转录起始调控机制研究获进展

  在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录

Cell新突破:CRISPR技术助力转录调控研究

  CRISPRs 技术成为了最近的新宠儿,这种基因组编辑技术更易于操作,也具有更强的扩展性,近期来自加州大学旧金山分校,伯克利分校等处的研究人员发表了题为 “CRISPR-Mediated Modular RNA-Guided Regulation of Transcription in

Nature:T细胞功能调控的关键转录因子

  T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。  来自清华大学医学院,陆军军医大学全军临床病理学研究所的研究人员发表了题为“

染色质结构对转录调控的影响

真核细胞中染色质分为两部分,一部分为固缩状态,如间期细胞着丝粒区、端粒、次溢痕,染色体臂的某些节段部分的重复序列和巴氏小体均不能表达,通常把该部分称为异染色质。与异染色质相反的是活化的常染色质。真核基因的活跃转录是在常染色质进行的。转录发生之前,常染色质往往在特定区域被解旋或松弛,形成自由DNA,这

染色质结构对转录调控的影响

真核细胞中染色质分为两部分,一部分为固缩状态,如间期细胞着丝粒区、端粒、次溢痕,染色体臂的某些节段部分的重复序列和巴氏小体均不能表达,通常把该部分称为异染色质。与异染色质相反的是活化的常染色质。真核基因的活跃转录是在常染色质进行的。转录发生之前,常染色质往往在特定区域被解旋或松弛,形成自由DNA,这

拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展

  近日,东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学(Michigan State University)Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心(John Innes Centre)Anne Osbourn团队合作,在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF

武汉大学发现一个新的结直肠癌的致癌转录因子

  结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近日,武汉大学生命科学学院的一项最新研究成果,揭示了一个新的结直肠癌的致癌转录因子,为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组数据和新的关键调控因子,相关论文近日在线发表于《自然—通讯》。  据介绍,目前关于结直肠癌的多组学研究广泛集中在基因组学和转