科研人员发现频发与偶发痛风患者的血清代谢组差异
近日，《关节炎与风湿病》（Arthritis & Rheumatology）在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所尹慧勇研究组撰写的题为Metabolomics and Machine Learning Identify Metabolic Differences and Potential Biomarkers for Frequent versus Infrequent Gout Flares的最新研究成果，揭示了频发与偶发型痛风患者的血清代谢图谱，并建立了痛风频繁发作的预警模型。 痛风是常见的炎症性关节疾病，其病因主要是由尿酸代谢异常、尿酸盐晶体沉积在关节或关节周围组织中引起的急性炎症反应。越来越多的证据表明，痛风与高血压、糖尿病、肥胖症、心脑血管疾病和慢性肾脏疾病等密切相关。 痛风的发作通常持续7至14天，并自行消退，然后进入无症状间歇期，直到下一次发作。无症状间歇期的持续时间在患者中个体差异很大，部分......阅读全文
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
综述：代谢组学在疾病中的应用
代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起，实现一次性检测坚定上千种物质，同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点，创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测，为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。 应用代谢组学的定义事件的预测生
代谢组学：一项艰巨的任务
学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢，一系列代谢通路，一大堆代谢产物，简直让人头晕眼花。然而，这又不能跳过。毕竟，DNA编码蛋白质，而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候，科学界对这些分子一无所知。 “如果你测定一滴血中的小分子，大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配，
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
原位代谢组学分析方法与应用进展
2015年10月17日，第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕，在5位院士的精彩报告后，多位学者做了高水平的大会报告。 中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所、中央民族大学再帕尔·阿不力孜教授：原位代谢组学分析方法与应用进展 中国医学科学院/北京协和医学院药物研
岛津非靶向代谢组学解决方案
本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物（一般50-1500 Da）进行高通量定性和定量分析，代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据，方便后续的代谢组学数据分析，揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
J－Proteome－Res:－代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究
微囊藻毒素(MCLR)，作为一种肝毒素，正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内，肝脏是MCLR主要攻击的器官，然而具体代谢变化目前任然未知。近日，中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下，通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究，向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢
告别平均！单细胞代谢组学技术“精准签发”每个细胞的代谢履历
在生命科学研究领域，代谢组学致力于剖析生物体代谢物的奥秘。传统代谢组学研究聚焦群体细胞，忽略了细胞间的代谢异质性，使得单个细胞的独特特征被群体平均属性掩盖，难以满足精准研究需求。单细胞代谢组学应运而生，它能深入细胞亚群精准分析，挖掘被忽视的关键信息。单细胞代谢物浓度极低且代谢物无法扩增，导致对检
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（二）
2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能进一步，作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证（LuxS、PkG等），先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白，随后利用琥珀酰化抗体进行WB，证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后，作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（二）
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现，CrPV
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（一）
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（一）
在疫情逐步可控的情形下，一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学，脂质组学，以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示，新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样，
梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认
梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认识
梁晗：从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少，而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女，你会相信吗？可能大部分人都会摇头：怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明，性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型，在分子水平上认识
【JOAT刘虎威编者按】专题：代谢组学和脂质组学
刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。 近日，刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作，并撰写了题为“专题：代谢组学和脂质组学”的编者按。 代谢
－Cell特辑：从基因组到代谢组学——癌症标记物的进展
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册，主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文，评论性文章以及snapshots，涉及了同一领域的方方面面，更为重要的是这些文章由赞助商赞助，可以免费获取。 癌症生物标记物是
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析，是将代谢组数据作为表型，与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细，因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司
Science：逆转传统认知，代谢组学揭示重要机制
来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物，通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物，干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合，而并未参
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司
当代谢组学技术遇到单细胞测序技术
代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映，因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年，组学研究飞速发展，处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担，而上游的（核酸、蛋白质等）大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面，如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等，所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息。如
代谢组学在疾病诊断中的应用
代谢组学 （metabolomics）的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学，是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分，在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终
大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展
近日，中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作，将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展，相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。 原发性肝癌是全球最
Nature走出重要的一步：研究代谢个体间差异的比较系统
一组线虫生物学家利用来自世界不同地区的四种不相关的秀丽隐杆线虫(C. elegans)，开发了一个模型系统来研究新陈代谢的个体差异。这一进步代表着向“个性化”或“精准”医学迈出了潜在的重要一步。“精准”医学是一门相对较新的学科，根据个人自身的基因组序列定制饮食建议和疾病治疗。这项研究由马里兰大学陈医
科学团队发现肌萎缩侧索硬化症脂质代谢存在差异
肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种神经肌肉疾病，运动神经元退化，也称为渐冻症，其发病原因尚不清楚。美国约翰霍普金斯大学的研究人员发现， ALS患者体内参与脂肪代谢的炎症化学物质水平较高。该项研究的成果近日发表在《Nature Neuroscience》上，题为Multi-omic analysis