浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络

近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding region–host protein interactome reveals the potential regulatory role of negative-sense viral RNA”的研究论文。该研究系统性地揭示了新冠病毒(SARS-CoV-2)RNA的非编码区域(noncoding regions of viral RNA,ncrRNA)与宿主蛋白质间的互作网络。 新冠病毒与宿主蛋白间的相互作用在病毒复制与翻译等关键过程中起着至关重要的作用。然而此前未有研究系统性地探索新冠病毒ncrRNA与宿主蛋白之间的相互作用。 ......阅读全文

RNA-标准转录反应

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN

RNA-标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc

3.1.1-RNA-标准转录反应

利用 DNA 聚合酶 I 的大片段(Klenow 酶)的 3'— 5'外切酶活性将 3'黏性末端转化成平末端。具体方法是在体外转录体系尚未加入核苷酸和 RNA 聚合酶时,加入 Klenoow 片段 (终浓度为 5U/ug),于 22℃ 孵育 15mim, 然后再加入核苷酸混合物和RNA 聚合酶实验材

分子卓越中心发现真菌利用小RNA抑制蚊虫免疫反应新机制

  9月20日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所王四宝研究组在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上在线发表了题为A fungal pathogen deploys a small silencing RNA that attenuates

释放先天免疫,RNA是关键!

很长时间以来,作为生物分子中间产物,RNA一直是被忽视的。最近,越来越多研究人员意识到,RNA是一种多功能分子,功能可能跟蛋白质一样多。《Journal of Biological Chemistry》最新文章显示,一种RNA分子可能是人类细胞对抗病毒的“前哨兵”。负责这项研究的生物化学教授Grae

《自然—结构与分子生物学》:发现RNA调控基因新标靶

美国和加拿大科学家近日研究发现,RNA可以与DNA上称为启动子区(promoter region,位于实际基因前的一小段DNA片段)的非基因区相互作用。在基因被开启前,启动子必须先被激活。相关论文7月6日在线发表于《自然—结构与分子生物学》(Nature Structural and Molecul

RNA蛋白免疫沉淀技术简介

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

细胞的免疫反应

展望未来,研究人员计划在多次给药后检查肺部运输的动力学,并研究基于细胞的免疫反应。Pasqualini说:“重要的是要注意,所有这些工作都是在临床前模型中进行的,因此我们期待将我们的方法应用于临床应用,例如针对肺部给药或基于肺部的疫苗接种。” 研究人员在概念验证研究中证明,用于疫苗的基于噬菌体的吸入

RNA的免疫共沉淀分离及检测

RNA的免疫共沉淀分离及检测非编码RNA的发现使得RNA领域再次成为了生命科学研究关注的焦点。因为RNA是一种不稳定的生物大分子,绝大多数的RNA都需要与特定的RNA结合蛋白质结合形成RNA/蛋白复合物才能稳定存在于细胞中;不仅如此,RNA与RNA结合蛋白之间的动态关联贯穿和伴随了RNA的转录合成、

RNA的免疫共沉淀分离及检测

RNA的免疫共沉淀分离及检测非编码RNA的发现使得RNA领域再次成为了生命科学研究关注的焦点。因为RNA是一种不稳定的生物大分子,绝大多数的RNA都需要与特定的RNA结合蛋白质结合形成RNA/蛋白复合物才能稳定存在于细胞中;不仅如此,RNA与RNA结合蛋白之间的动态关联贯穿和伴随了RNA的转录合成、

RIP技术(RNA结合蛋白免疫沉淀)

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合

RNA的免疫共沉淀分离及检测

RNA的免疫共沉淀分离及检测 非编码RNA的发现使得RNA领域再次成为了生命科学研究关注的焦点。因为RNA是一种不稳定的生物大分子,绝大多数的RNA都需要与特定的RNA结合蛋白质结合形成RNA/蛋白复合物才能稳定存在于细胞中;不仅如此,RNA与RNA结合蛋白之间的动态关联贯穿和伴随了RNA的转录合

RNA的提取与核酸的颜色反应

一. 目的学习用浓盐法从酵母中提取RNA掌握用等电点法沉淀RNA观察核酸的颜色反应,了解核酸定性与定量测定的原理熟练掌握普通离心机的使用方法二. 原理酵母繁殖快,生长周期短;其细胞质中的核酸大部分是RNA,而DNA很少;RNA提取液与菌体分离比较容易。因此,酵母是提取RNA的好材料。将RNA从细胞中

细胞介导免疫的免疫反应过程介绍

病原体被抗原呈递细胞(APC)吞噬后,APC利用细胞膜上的MHCII蛋白呈现抗原,抗原活化T细胞,T细胞释放信号分子,激活吞噬细胞或B细胞来消灭病原体。

疟疾免疫反应利弊共存

  经常感染疟疾的孩子出现继发感染时往往没有临床症状。美国加州大学旧金山分校的研究人员对这一现象进行了研究,发现这可能部分由于特定免疫细胞的损耗:一种叫做γδT细胞(免疫细胞)的损耗减轻了受感染儿童的炎症反应。这项研究2014年8月27日在线发表于 Science Translational Med

免疫记忆的反应来源

  用同一抗原再次免疫时,可引起比初次更强的抗体产生,称之为再次免疫应答或免疫记忆,无论在体液免疫或细胞免疫均可发生免疫记忆现象。在体液免疫时,对TD抗原的再次应答可表现为抗体滴度明显上升,免疫球蛋白类别可由IgM转换为IgG,而且抗体亲和力增强。提示再次应答不仅发生抗体量的变化,而且也发生了质的变

免疫反应有哪些阶段?

  识别阶段:免疫系统通过感知病原体的特定分子结构,如抗原,来识别病原体。  激活阶段:当免疫系统识别到病原体后,会激活免疫细胞,如T细胞和B细胞,来产生免疫应答。  增殖阶段:被激活的免疫细胞开始快速增殖,以增加对病原体的攻击力。  效应阶段:增殖后的免疫细胞会分泌各种免疫分子,如抗体和细胞因子,

免疫反应的操作步骤

1、将膜用TBS从下向上浸湿后,移至含有封闭液的平皿中,室温下脱色摇床上摇动封闭1h。2、将一抗用TBST稀释至适当浓度(在1.5ml离心管中);撕下适当大小的一块儿保鲜膜铺于实验台面上,四角用水浸湿以使保鲜膜保持平整;将抗体溶液加到保鲜膜上;从封闭液中取出膜,用滤纸吸去残留液后,将膜蛋白面朝下放于

免疫反应的操作步骤

1、将膜用TBS从下向上浸湿后,移至含有封闭液的平皿中,室温下脱色摇床上摇动封闭1h。2、将一抗用TBST稀释至适当浓度(在1.5ml离心管中);撕下适当大小的一块儿保鲜膜铺于实验台面上,四角用水浸湿以使保鲜膜保持平整;将抗体溶液加到保鲜膜上;从封闭液中取出膜,用滤纸吸去残留液后,将膜蛋白面朝下放于

免疫反应的操作步骤

1、将膜用TBS从下向上浸湿后,移至含有封闭液的平皿中,室温下脱色摇床上摇动封闭1h。2、将一抗用TBST稀释至适当浓度(在1.5ml离心管中);撕下适当大小的一块儿保鲜膜铺于实验台面上,四角用水浸湿以使保鲜膜保持平整;将抗体溶液加到保鲜膜上;从封闭液中取出膜,用滤纸吸去残留液后,将膜蛋白面朝下放于

免疫记忆的反应来源

用同一抗原再次免疫时,可引起比初次更强的抗体产生,称之为再次免疫应答或免疫记忆,无论在体液免疫或细胞免疫均可发生免疫记忆现象。在体液免疫时,对TD抗原的再次应答可表现为抗体滴度明显上升,免疫球蛋白类别可由IgM转换为IgG,而且抗体亲和力增强。提示再次应答不仅发生抗体量的变化,而且也发生了质的变化。

RNA药物迎来春天?强生联手Isis重金开发自身免疫疾病RNA药物

  2015年伊始,位于加州卡尔斯巴德市的生物技术公司Isis医药公司再迎来一个开门红。Isis生物技术公司与强生公司签订了一项价值高达8亿3千5百万美元的合作协议,共同开发用于治疗肠道自身免疫疾病的RNA药物。  这份协议中包括了3500万美元的预付款和高达8亿美元的里程碑奖金,同时Isis公司还

PLOS:先天免疫系统如何区分病毒RNA和内源性RNA

  目前,慕尼黑大学的研究人员已经确定了可使活细胞内先天免疫系统区别病毒RNA和内源性RNA的结构特点。   当病毒感染细胞的时候,它们控制细胞代谢和劫持用于产生病毒蛋白的细胞资源。这个过程依赖于病毒RNA分子,在宿主细胞内它们被直接传送给新合成的RNA病毒,并通过细胞的翻译设备提供病毒蛋白的制造

外源性RNA的转录反应预测RNA病毒的广谱抗病毒药

  所有RNA病毒都通过与正常运输细胞RNA转录本不同的过程将其基因组传递到目标宿主细胞中。来自正常的细胞RNA转录的运输。病毒RNA的传递最多。进入大多数细胞的病毒DNA的运输因此触发了先天的抗病毒防御机制,将病毒RNA识别为异物。反过来,病毒已经进化出了破坏这些防御的机制,让它们在其中茁壮成长。

分子生物学技术在免疫检测中的应用

目前已有许多新生物学技术应用于免疫学研究,促进了免疫学的发展,丰富了免疫学检测的内容,使免疫学研究与相关疾病的诊断建立在基因水平,提高了检测的敏感性和可靠性。 一、分子杂交技术 分子杂交的基本原理是根据双链DNA经高温解链成两条互补的单链,降温后又可恢复原来的双链。两条不同的单链分子可根据碱基配

RNA病毒通过“挟持”肠道菌逃避寄主免疫

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519896.shtm

单细胞RNA测序发现新的免疫细胞

  最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究,详细检测了一组新发现的免疫细胞(被称为ILC)。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析,瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们,发现了三个以前未知的ILC子群,并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。  先天淋巴细胞(ILC)是

RNA表观修饰能够影响天然免疫研究

前言       DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员,对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文,揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞

RNA表观修饰居然能够影响天然免疫

   DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员,对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文,揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞核内RNA修饰的新方

RNA病毒通过“挟持”肠道菌逃避寄主免疫

该所功能因子利用与生物合成创新团队的研究人员发现,分节段单链正义RNA病毒通过病毒感染,诱导机体产生大量的抗菌肽来抑制有益菌群的丰度与种类,减弱了菌群的抗病毒功能,从而增加了病毒感染程度。该研究从肠道微生物角度为病毒感染治疗提供新思路。相关研究结果3月22日发表在《国际微生物生态学会期刊》(The