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RNA标准转录反应

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇 0.5mol LNa2 HPO4琼脂糖仪器、耗材 DE81 膜液闪仪电泳槽 离心机实验步骤 一材料与设备1) 限制性内切核酸酶2) 模板 DNA 或质粒3)TE4)TE 饱和酚:氯仿5) 氯仿:异丙醇 (24:1)6)3mol/LNaAc(pH5.2)7) 无水乙醇8)5×转录缓冲液:200 mmol/LTris-HCl(PH7.9),300 mmol/LMgCl2,10 mmol/L 亚精胺,50 mmOl/LNaCl9)l00 mmol/LDTT10)RNasin11)rATP......阅读全文

如何寻找转录起始位点

一、引物延伸分析(primer extension analysis) 引物延伸分析用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域,随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,

RNA 标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异

3.1.1 RNA 标准转录反应

利用 DNA 聚合酶 I 的大片段(Klenow 酶)的 3'— 5'外切酶活性将 3'黏性末端转化成平末端。具体方法是在体外转录体系尚未加入核苷酸和 RNA 聚合酶时,加入 Klenoow 片段 (终浓度为 5U/ug),于 22℃ 孵育 15mim, 然后再加入核苷酸混合物和RNA 聚合酶实验材

核酶实验

锤头型核酶实验 发夹型核酶实验 其他类型的核酶             实验方法原理 锤头型核酶是最简

引物延伸实验问题与解答

1)什么是引物延伸实验?引物延伸实验用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域, 随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的

分子杂交

一、杂交通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交可在DNA与DNA、RNA与RNA或RNA与DNA的

分子杂交技术(一)

一、概述  前面已经介绍了核酸分子单链之间有互补的碱基顺序,通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交

分子杂交技术(一)

一、概述  前面已经介绍了核酸分子单链之间有互补的碱基顺序,通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交

核酶实验

实验方法原理 锤头型核酶是最简单的一类核酶,而且其靶序列也比较简单。锤头型核酶发现于几种植物病毒的卫星 RNA、一种类病毒 RNA 和蝾螈核卫星 DNA 的转录产物中。它催化一些类病毒 RNA 和一些与类病毒 RNA 相似的只复制产物的不可逆自我剪切„实验材料 ATPT4多核苷酸激酶RNasinDT

核酶实验——锤头型核酶实验

核酶(ribozyme ) 是一类具有酶特性的 RNA 分子,通过催化靶位点 RNA 链中磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物 RNA 分子,从而阻断基因的表达。核酶广泛存在于从低等到高等的多种生物中,参细胞内 RNA 及其前体的加工和成熟过程。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

3.1.2 RNA 大量转录合成

RNA 标准转录体系的一般回收率为 lugRNA/ug 质粒 DNA, 使用下面的方法,可以提高回收率至 5〜l0ug RNA/ug 质粒 DNA。大量制备 RNA 可以用于体外翻译。实验材料模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒TETE 饱和酚氯仿异内醇3mol LNaAc无水乙醇5X 转录缓冲液lOO

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术

  microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术   摘要:   已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分

核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记RNA探针)

            实验方法原理 核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的

RT-PCR实验方法大全

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单

细菌学诊断新技术

 随着现代科学技术的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学的不断发展,新的细菌诊断技术和方法已广泛用于食品微生物的鉴别。传统的细菌分离、培养及生化反应,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究。近年来国内外学者不断努力,已创建不少快速、简便、特异、敏感、低耗且适用的细菌学诊断方法

细菌学诊断中的新技术

随着现代科学技术的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学的不断发展,新的细菌诊断技术和方法已广泛用于食品微生物的鉴别。传统的细菌分离、培养及生化反应,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究。近年来国内外学者不断努力,已创建不少快速、简便、特异、敏感、低耗且适用的细菌学诊断方法,

分子杂交技术 -1

互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。  杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用的方

无细胞蛋白表达系统的选择

图1.  与细胞内蛋白表达相比,无细胞蛋白表达系统能够显著地节约时间。 与基于细胞的蛋白表达系统相比较,无细胞蛋白表达系统具有独特的优势,包括节约时间、提高具有功能的、可溶的、全长蛋白的总体产量。本文介绍了根据模板类型、期望产率以及下游实验等因素来选择无细胞蛋白表达系统的标

核酸分子杂交法介绍

这是最早用于性病诊断的重组DNA技术。基本原理是具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。待测核酸序列为性病病原体基因组或质粒DNA。探针以放射核素或非放射性核素标记,以利于杂交信号的检测。  所谓

核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针...

核糖核酸酶保护(用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针对RNA作图)实验方法原理 核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。实验材料

RNA 大量转录合成

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE  

3.1.3 合成 5'加帽转录物

一些 RNA 转录物要求其 5'末端有 m7 G(5')Ppp(5')G 帽子,它们在无细胞抽提物或在非洲爪蟾卵母细胞中才具有较高的翻译效率。也有报道表明具有甲基化帽子的转录物在体外剪切时具有较高的效率,并对核抽提物中的核酸酶具有更大的抗性试剂、试剂盒DEPC处理的水转录缓冲液lOOmmo

RT-PCR技术及RNA提取策略-3

成功的RT PCR的要素1、高质量RNA 成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离poly(A)+RNA。不管起始模

细菌学诊断技术(二)

  5.核酸探针杂交技术原理  根据完成杂交反应所处介质的不同,分成固相杂交反应和液相杂交反应。固相杂交反应是在固相支持物上完成的杂交反应,如常见的印迹法和菌落杂交法。事先破碎细胞使之释放DNA/RNA然后把裂解获得的DNA/RNA固定在硝基纤维素薄膜上,再加标记探针杂交,依颜色变化确定结果,该法是

体外转录测序揭示RNA-seq的终极误差

  高通量RNA测序(RNA-seq)是了解转录调控的一种强大技术。利用RNA-seq,我们不仅可以更好地进行传统的基因差异表达分析,而且还可以全面地研究可变剪接、RNA编辑、等位基因特异性表达和确定新的转录本(编码RNA和非编码RNA)。  与更成熟的、以RNA表达分析为基础的微阵列相反,RNA-

体外转录测序揭示RNA-seq的终极误差

  高通量RNA测序(RNA-seq)是了解转录调控的一种强大技术。利用RNA-seq,我们不仅可以更好地进行传统的基因差异表达分析,而且还可以全面地研究可变剪接、RNA编辑、等位基因特异性表达和确定新的转录本(编码RNA和非编码RNA)。  与更成熟的、以RNA表达分析为基础的微阵列相反,RNA-

RNA-蛋白复合物中寡核苷酸靶向的RNaseH切割保护实验

            实验方法原理 寡核苷酸靶向的 RNase Ⅱ 酶解实验是分析 RNA 蛋合复合物(RNP,核糖核蛋白颗粒)的方法,无论是对于粗提物还是提纯后的样品,对分析 RNP 的结构域的结构都非

分子生物学常用实验技术(page 3)

分子杂交技术    互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DN

miRNA克隆实验

            实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起