《自然评论》：最佳密码子打破生物钟节奏
Microbial physiology: Optimal codons break the clock's rhythm 生物钟通过协调发生在24个小时周期内的具有昼夜循环的基因表达从而在生理学过程中控制每日的振荡。两项研究如今显示，在真菌粗糙脉孢菌和蓝藻聚球藻中，基因编码的生理节奏机制的核心组件表现出了一种不是最佳的密码子偏倚，并且这是对于保持一种适当的生理节奏的适应。 MACMILLAN 被丰富的tRNA(所谓最优密码子)解码的密码子在高度表达的基因中被过度表达，这被预测可以确保mRNA的快速和准确的转化，以实现高水平的蛋白质生。研究小组开始在生物钟基因中评估密码子的使用偏倚，进而发现粗糙脉孢菌frq和聚球藻kaiB及kaiC(这对于各自生物体中的生物钟功能而言是必不可少的)展示出了非最佳的密码子使用。 为了评估密码子最佳化对粗糙脉孢菌生物钟功能的影响，周等人构建了两个frq变异型：在第一个中，最佳密......阅读全文
细胞化学词汇反密码子环
中文名称：反密码子环外文名称：anticodon loop定 义：在氨基酸臂对面的单链环称反密码子环（anticodon loop）,该环含有由三个核苷酸残基组成的反密码子。
关于起始密码子的基本介绍
起始密码子，信使RNA（mRNA）的开放阅读框架区中，每3个相邻的核苷酸为一组，代表一种氨基酸，这种存在于mRNA开放阅读框架区的三联体形式的核苷酸序列称为密码子（codon）。由A、U、C、G四种核苷酸可组成64个密码子，其中有61个密码子可编码氨基酸。AUG既编码甲硫氨酸，又作为多肽链合成的
概述终止密码子的关键破译
直到1965年Weigert,M.和Ggaren,A由碱性磷酸酶基因中色氨酸位点的氨基酸的置换证明E.coli中无义密码子的碱基组成揭示了琥珀和赭石（ochre）突变基因分别是终止密码子UAG和UAA。当时64个密码中的61个已破译，只留下了UAA、UAG 和UGA有待确定。Garen等为了鉴定
关于终止密码子的基本介绍
终止密码: UAG,UAA,UGA是终止密码子。相应的DNA上的终止密码子序列是TAG,TAA,TGA。 终止密码子又称“无意义密码子”。不编码任何氨基酸的密码子，如UAA，UAG和UGA。当肽链延长到这3个密码子的任何一个时，即行停止，从而使已合成的多肽链释放出来，因此终止密码子相当于1个停
诺奖加持的生物钟可调节生物钟蛋白并将癌细胞饿死
前两天有个新研究，说值夜班的女性易得乳腺癌，奇点糕一下子就想到了 2017 年诺贝尔生理医学奖生物钟。生物钟可老重要了，人体宏观上的生物钟管着我们啥时候睡觉啥时候起床，细胞自己也有个小生物钟，管它啥时候吃饭啥时候消化呢！ 当然了，吃饭消化只是奇点糕的一个比喻，实际上，生物钟参与的是细胞的增
PNAS：炎症让生物钟暂停
刊登在国际杂志PNAS上的一篇研究论文中，来自宾夕法尼亚大学等处的研究人员通过研究揭开了机体生物钟和免疫细胞的关联，或为开发治疗机体炎症及感染性疾病的新型疗法提供一定的帮助。 文章中，研究人员阐明了当白细胞暴露于细菌中时其内部的生物钟被阻断的分子机制，而更重要的是，阻断白细胞的生物钟可以促进细
生物钟研究获重要进展
人类早已知道，某些生物的活动是按照时间的变化（昼夜交替、四季变更或潮汐涨落等）来进行的，具有周期性的节律，这种规律被称为生物钟（Circadian Clock）。由于生物钟在生物学的基础理论研究，以及治疗学等方面占据了独特的位置，因此一直以来都是科学家们研究的一个重点，本期《科学》（12月14日）和
PNAS：炎症让生物钟暂停
刊登在国际杂志PNAS上的一篇研究论文中，来自宾夕法尼亚大学等处的研究人员通过研究揭开了机体生物钟和免疫细胞的关联，或为开发治疗机体炎症及感染性疾病的新型疗法提供一定的帮助。 文章中，研究人员阐明了当白细胞暴露于细菌中时其内部的生物钟被阻断的分子机制，而更重要的是，阻断白细胞的生物钟可以促进细
延迟用餐有助调整生物钟
人体机能的运行会参照一个24小时生物钟，该时钟由人脑和外部环境所控制。近日，研究人员在《当代生物学》期刊上报告称，他们找到一种调节生物钟的简单方法。研究人员表示，倒时差其实很简单，只需改变吃饭时间就可以，这样做能够改变体内血糖水平波动周期，从而调整生物钟。该研究结果也显示，有规律的用餐时间或许能
蜘蛛倒时差－重置生物钟
有些蜘蛛种类拥有很短的生物钟，比如每天早上它们都产生超过5个小时的时差。但不知何故，它们似乎并未因此产生不良影响。 小圆蛛是最常见的一种制作圆网的蜘蛛。它们在夜间活动捕食猎物，并在黎明前的几个小时内重建一张整洁的网。 为了研究这些蜘蛛的昼夜节律，美国东田纳西州大学生物学家Darrell M
生物钟紊乱如何导致疾病
如今，随着生活节奏越来越快，我们的作息已然构筑在人为划分的白天和黑夜上，以适应夜班、通宵、或因各种原因成了“空中飞人”。众所周知，这样一定会影响我们体内的生物钟（昼夜节律），对健康造成威胁。如果我们篡改自己的昼夜节律，我们的健康也会被篡改。 昼夜节律控制着我们的新陈代谢，甚至可以说体内所有器官
颜色帮助调节人体生物钟
落日的漂亮的颜色可能并不仅仅是一副美景，可能是身体的一个信号“到了该重置我们生物钟的时候了”。生物的钟声支配着身体的一切，从睡眠模式到消化模式。一项在老鼠上新的研究显示，这些小的龋齿动物利用光线颜色的变化去设置他们自己的生物钟。科学家们期望这个结果也可以适用于人类。 虽然来自加州大学圣克鲁斯分
PNAS：炎症可叫停生物钟
最近，宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院和都柏林三一学院的研究人员发现，人体生物钟和免疫系统之间的重要联系，对于我们理解炎症和感染性疾病有很大帮助。他们将相关研究结果发表在本周的《PNAS》，报道了一种关键的白血细胞（称为巨噬细胞），当接触细菌时，如何使巨噬细胞内的生物钟停止，从而让它发炎。 他们解
古代生物的生物钟揭秘
室温下的蓝藻生物钟，三个蛋白滴答滴答转个不停，我们很难理解它的发条机制。将它们冻住后，我们就可以仔细观察它们的外观和装配细节。 10年之前，蓝藻体内的生物钟仅由三种蛋白组成：KaiA,，KaiB和KaiC。2015年，日本科学家在Science杂志上报道：只要加一点能量（ATP），这三种蛋白在
英发现生物钟“第二驱动齿轮”－红细胞中也存在生物钟
生物钟控制着生命活动的内在节律，过去人们一直认为它的“驱动齿轮”是基因。而英国研究人员在新一期《自然》杂志上报告说，他们发现了独立于基因的生物钟机制，这种与新陈代谢有关的机制构成了生物钟的“第二驱动齿轮”。 英国剑桥大学研究人员报告说，他们首次发现人类血液红细胞中也
关于密码子的基本信息介绍
密码子（codon）是指信使RNA分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，代表某一种氨基酸的规律。 信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。信使RNA分子中的四种核苷酸（碱基）的序列能决定蛋白质分子中的20种氨基酸的序列。而在信使RNA分子上的三个碱基能决定一个氨
关于密码子的试管选择理论介绍
艾根等在研究遗传密码起源时进行试验：在试管里没有任何酶和模板的参与下，仅仅依靠锌离子的催化，将核苷酸单体聚合成寡核苷酸，并通过彼此互为模板的复制、扩增，最终在不同条件的继代培养下，优选出不同的tRNA克隆，然后形成RNA分子的准种群。这个实验被称为“试管选择性理论”，证明在无生命力作用的情况下，
关于琥珀密码子的基本介绍
琥珀密码子（amber codon）指mRNA的多核苷酸链中的终止密码子（UAG），它引起蛋白质翻译的中止。这个名字的由来是因为这个密码子是在大肠杆菌噬菌体T4的“琥珀型”突变种中发现的，T4突变种的发现者是德国人H.Bernstein，而Bernstein这个姓在德语中意为“琥珀”。当mRNA
关于密码子翻译起始效应的介绍
mRNA浓度是翻译起始速率的主要影响因素之一，密码子直接影响转录效率，决定mRNA浓度。如单子叶植物在“翻译起始区”的密码子偏性大于“翻译终止区”，暗示“翻译起始区”的密码子使用对提高蛋白质翻译的效率和精确性更为重要，因此，通过修饰编码区5′端的DNA序列，来提高蛋白质的表达水平将有望成为可能。
反密码子的位置和功能特点
反密码子是在tRNA的三叶草形二级结构反密码臂的中部，可与mRNA中的三联体密码子形成碱基配对的三个相邻碱基。在蛋白质的合成中，起解读密码、将相应的氨基酸引入核糖体A和P位点的作用。
终止密码子的实验方法介绍
他们的实验方法不是对各种突变型的产物测序，而是先将野生型的头部蛋白用胰蛋白酶和糜蛋白酶来处理，消化后所产生的极复杂的混合物中，通过电泳能分离、鉴定出8个各有特征的头部蛋白蛋白片段，分别是Cys, T7C(His), C12b(Tyr), T6(Trp), T2a(Pro), T2(Trp), C
反密码子的基本信息介绍
anticodon中除有常见的4种碱基外还出现次黄嘌呤（I） 其可最大限度阅读mRNA上的信息，降低突变引起的误差。所以实际上反密码子少于61种。 在转移RNA反密码子环中的三个核苷酸的序列，在蛋白质合成中通过互补的碱基配对，这部分结合到信使RNA的特殊密码上。 已知一种tRNA只能携带一种
反密码子的结构和功能特点
反密码子（anticodon）：RNA链经过折叠，看上去像三叶草的叶形，其一端是携带氨基酸的部位，另一端有3个碱基。每个tRNA(transfer RNA）的这3个碱基可以与mRNA上的密码子互补配对，因而叫反密码子。 tRNA分子二级结构的反密码环中部的三个相邻核苷酸组成反密码子。它们与结合在核糖
关于终止密码子的发现过程介绍
1964年Yanofsky在研究E.coli色氨酸合成酶A蛋白时推测无义密码子的存在。他的推测/是从两个不同的角度：一是为trp A编码的mRNA还编码了trpB，trpC，trpD和trpE。即一个mRNA 分子中可以作为不同多肽的模板，那么有可能在翻译时中途在某个位点（两个肽的连接处〕停止，
生物钟调控代谢新方式揭示
人体内有一个很酷的时钟——生物钟。然而，生物钟调控生理、代谢和行为等生命活动的机制十分复杂，仍需要进一步深入探究。记者15日从南京农业大学获悉，该校王恬教授团队与芝加哥大学合作在《细胞通讯》上刊发研究成果，揭示了生物钟调控代谢的新方式。 生物钟由基因和蛋白质打造，是生物进化的礼物。生物钟掌控
血检可测人体生物钟
据英国《每日邮报》9月10日报道，美国芝加哥西北大学研究员发现昼夜节律失调和糖尿病、抑郁等多种疾病的联系，并研究出名为“时间记号”的血液检测，用于检测人体生物钟，以此调整病人作息时间并预防多种潜在致命疾病的威胁。 人体生物钟可指明昼夜节律，比如人体睡眠觉醒周期。研究团队发现，有些人的生物钟和实
生物钟调控代谢新方式揭示
人体内有一个很酷的时钟——生物钟。然而，生物钟调控生理、代谢和行为等生命活动的机制十分复杂，仍需要进一步深入探究。记者15日从南京农业大学获悉，该校王恬教授团队与芝加哥大学合作在《细胞通讯》上刊发研究成果，揭示了生物钟调控代谢的新方式。 生物钟由基因和蛋白质打造，是生物进化的礼物。生物钟掌控
Nature－：免疫系统的生物钟
在植物中和在很多其他真核生物中，生物钟不仅通过影响基因转录、而且通过改变生物的氧化还原状态来确保生物过程每天的有节奏波动。氧化还原节奏与生物钟相联系的分子机制以及氧化还原-生物节律相互作用的生物学意义仍不清楚。Xinnian Dong及同事识别出了拟南芥的这种氧化还原节奏的一个出乎意料的调控因
Science专题：生物钟生理学
无论是植物，动物，还是细菌真菌，在生理或者分子机理作用方面都存在昼夜节律（circadian rhythms），但是要进行这一领域的研究并不容易，首先需要跨越模型系统，昼夜节律研究包含了核心生物钟蛋白和其调控因子之间的详细分子相互作用，维持多变环境中，一段持续时间内稳定的系统整体水平分析，还有对于不
生物钟：大自然馈赠的神奇
“日出而作，日落而息”，地球上大部分生物从几十万年前开始就遵从着大自然的规律繁衍生息。对于这种自然的状态，人们并没有过多的留意。直到现代医学逐步发达，人们才知道，这种顺应自然的规律叫作“生物钟”。随之而来的，也是科学家们对生物钟的各种研究。 最近，美国哈佛大学的一项研究显示，人体的生物钟和道