昆明植物所在唇形科铃子香属研究中取得新进展
铃子香属(Chelonopsis Miq.)隶属于唇形科,最新的研究结果将其和毛药花属(Bostrychanthera Benth.)、锥花属(Gomphostemma Wall. ex Benth.)一起置于野芝麻亚科锥花族。该属为东亚特有属,其两个亚属分别为中国-日本和中国-喜马拉雅分布类型。铃子香属共有14种2变种,除3种特产于日本外,其余种类几全为我国特有种,且为狭域分布。 中国科学院昆明植物研究所彭华研究员与国内外同行合作,从形态解剖、分子系统和分类修订等方面对该属进行了深入研究。基于5个叶绿体序列和2个核基因序列的分子系统学研究结果表明(Xiang et al. 2013a),锥花族是一个单系类群,且毛药花属应并入铃子香属,花药具髯毛是二者的共源性状。铃子香属可分为铃子香亚属和等齿铃子香亚属两个分枝,且分别与中国-日本和中国-喜马拉雅分布区类型相对应。各分枝间及分枝内的系统发育关系进一步得到了毛被形态结构(Xi......阅读全文
蚜虫核基因EF1-alpha基因序列测定及系统发育分析
实验概要核基因含有更加丰富的遗传信息,生物的性状基本上是由核基因决定的,用适当的核基因研究昆虫的系统发育,结果更有可能真实地反映昆虫的进化历史。本研究采用DNA序列分析法,对三种蚜虫的核基因EF-1 alpha进行比较,通过系统发育树分析了它们的系统进化。这一结果结合三种蚜虫的mtDNA的C
分子遗传学词汇核心序列
中文名称:核心序列英文名称:core sequence定 义:重复序列共有的核苷酸序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇回文序列
中文名:回文序列外文名:Palindromic sequence定义:遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中
重叠基因的调控序列
①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRN
蚜虫mtDNACOI/COII基因序列测定及系统发育分析
实验概要本研究通过分析三种蚜虫mtDNA COI/COII基因序列的进化,揭示了三种蚜虫与已知其它蚜虫的该段序列的进化关系。实验材料本研究中的蚜虫为桃蚜、豆蚜、棉蚜。桃蚜、豆蚜、棉蚜在实验室内分别用萝卜、菜豆、黄瓜进行饲养;各种群分别置于50X50X50的正方体铁架外罩100目双层沙网内,饲养条件为
分子遗传学词汇间插序列
中文名称:间插序列英文名称:intervening sequence;IVS定 义:基因间或基因内的非编码序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇共有序列
中文名称:共有序列外文名称:consensus sequence定义:共有序列是在一套相似序列中的每个位置上都由最常出现的残基所组成的DNA或氨基酸序列。
分子遗传学词汇旁侧序列
中文名称:旁侧序列英文名称:flanking sequence定 义:结构基因两侧的核苷酸序列,对基因的表达及表达水平具有调控作用。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇上游激活序列
中文名称:上游激活序列英文名称:upstream activating sequence,定义:是真核基因中一类顺式调控序列,通常被认为与增强子相关,临近TATA box的上游,可以结合转录激活子
分子遗传学词汇上游阻抑序列
中文名称:上游阻抑序列英文名称:upstream repressing sequence;URS定 义:酵母基因转录的负调控元件,位于结构基因5'端上游。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇上游表达序列
中文名称:上游表达序列英文名称:upstream expressing sequence;UES定 义:酵母基因转录的调控元件之一,位于结构基因5'端上游。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
什么是基因的核心序列?
中文名称核心序列英文名称core sequence定 义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
功能基因cDNA序列的分析
(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'
基因序列仪的分类介绍
根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类:1. 平板型电泳:平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中,聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄,因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术,具有样品判读序列长(600-900bp)、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。2. 毛细管电泳:将凝胶高分子聚合物
分子遗传学词汇着丝粒序列
中文名称:着丝粒序列英文名称:centromeric sequence;CEN sequence定 义:构成染色体着丝粒的DNA序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
什么是基因的间插序列?
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
割裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。 TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,
解析现代月季基因组序列
科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然
基因组序列草图的概念
中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定 义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
蚜虫mtDNA12S/16SrRNA基因序列测定及系统发育分析
实验概要线粒体DNA在分子进化中具有许多独特的优越性,mtDNA己成为研究生物(主要是动物)进化的重要材料。本研究所利用的mtDNA基因序列包括12SrRNA,16SrRNA以及12SrRNA和16SrRNA之间的序列,通过分析三种蚜虫mtDNA 12S/16SrRNA基因序列的进化,不仅揭示了
rhpPC基因协同调节III型分泌系统基因表达的分子机制
III型分泌系统是大多数革兰氏阴性病原细菌(包括植物病原菌和动物病原菌)感染宿主的重要“武器”,是由蛋白复合体构成的跨膜分子装置。病原菌通过III型分泌系统将一系列效应蛋白注入宿主细胞内,从而逃避宿主细胞的免疫防御并建立感染。III型分泌系统基因的表达受各种环境因素和宿主因素的影响,在丰富培养基
DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列
Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列,以不同器官中的mRNA为探针,检测其基因表达水平,结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列,用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红,绿荧光标记进行杂交检测,结果表明9
多重序列比对及系统发生树的构建
【实验目的】1、熟悉构建分子系统发生树的基本过程,获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识;2、掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法;3、掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。【实验原理】在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的
液相序列捕获系统与高通量测序
Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷伦寡核苷酸序列合成技术的液相序列捕获系统 – 高通量平行靶向测序的最佳解决方案来自美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员,利用安捷伦(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技术,合成
基因序列揭示非洲人早期历史
人类在非洲的早期历史正日益成为人们关注的焦点。一项新的研究对源自这片大陆的十几个族群的180个基因组进行了研究,其中一些基因组之前从未被分析过。 初步研究结果表明,在4万多年前,其中两个族群(桑人和巴卡人)的规模相当于当时其他族群的两倍,并且这两个族群生活在中东部非洲或南部非洲。 研究人员在
结构基因的侧翼序列的介绍
1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成,但不被翻译,前者位于转录起始点和第一外显子之间,相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT);后者位于最末外显子和终止子之间,相当于mRNA3’端非翻译区(3'UT)。前导区和尾部区转录后的相应序列在mRNA中起维持mRNA稳定性的
首次测定玉米蛇基因组序列
在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动
如何设计基因cds序列的pcr引物
提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA,用cDNA作为模板扩增基因的CDS区,然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部复制下来,在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始(比如18bp),反向引物从CDS最后一
3000株水稻基因序列公开发表
近日,3000株水稻基因组测序文章在GigaScience正式发表,且整套水稻基因序列以可引用形式在该杂志的附属开放获取数据库GigaDB中公开。 该项目产生的数据是目前已公开水稻序列数据量的四倍。该成果标志着3000株水稻基因组项目第一阶段的完成,主要由中国农业科学院、国际水稻研究
概述酿酒酵母的基因组序列
1996年6月,在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序,它被称为遗传学上的里程碑。因为首先,这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列;其次,这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10] 在酿酒酵母测序计划开始之前,人们通过传统的遗传学方法已确定