大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息,结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度,重构了细胞内多种蛋白质,尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质(intrinsically disordered protein,IDP)的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代,AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测,而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来,in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文

活细胞成像系统在实际应用上有哪些功能?

 活细胞成像系统是用于活细胞长时间、高清晰度、高灵敏度成像的设备。当用活细胞染料标记细胞内特定生物大分子,或者使用荧光蛋白标记体内特定蛋白时,使用该荧光染料或者荧光分子特定的激发光线激发,通过探测其特用的发射光线即可探测到该生物大分子。活细胞成像系统一方面控制细胞生存的外部环境,提供合适的温度、适度

活细胞实时动态成像仪-让科研更轻松

目前,大部分的细胞检测方法采用的仍然是传统的终点法——仅仅给出最终结果,而且往往需要标记细胞和破坏细胞。这种方法无法得到细胞在生长时的真正状态,也无法对细胞的生长过程做出动态的监测和分析。美国 Essen 公司开发了第二代长时间实时动态活细胞成像分析仪——IncuCyte ZOOM,用一种

活细胞成像2012最新进展及产品

  目前生物成像领域已经可以采用各种显微技术和共聚焦等技术了,这提高了图像的精确度,但是要观察到深层组织活动并不容易,因此在一些活体成像,组织深部观察等方面还需要更多的技术进步。2012年活体显微技术,荧光显微技术,以及活细胞成像方面都涌现出了不少重要的技术成果。   活体动物成像技术主

基因检测中活细胞检测和血液检测的区别

基因检测中活细胞检测和血液检测的区别基因检测就是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测的技术,是取被检测者脱落的口腔黏膜细胞或其他组织细胞,扩增其基因信息后,通过特定设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,预知身体患疾病的风险,分析它所含有的各种基因情况,从而使人们能了解自己的基因信息,从而通

小鼠胚胎的长时间、6D活细胞观察

哺乳动物细胞胚胎植入发育和时间空间的变化协调是密不可分的,因此,对于这些发育过程的分析也必须是实时,动态而且3D的。我们过去经常使用的荧光蛋白表达技术,mRNA显微注射以及时相荧光显微观察使得活细胞成像成为了可能,但传统的荧光显微镜得到的数据却不能用来构建三维构象,这是由于荧光显微镜不能透过胚胎的厚

PNAS:首次肉眼观测到活细胞离子通道开启

  去年著名实验室MBL研发出了一种新型细胞电活性探针,可以用于神经生物学研究中,时隔一年,这一实验室又在这一荧光探针中加入了一种“有毒成分”:狼蛛毒素(Tarantula Toxin)。  这一研究成果公布在10月20日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。文章的第一作者是加州大学戴维斯分校

超乎想象的新技术:活细胞化学发光检测

  化学发光探针(chemiluminescent probes)是最敏感的DNA序列诊断工具,常用在犯罪现场分析和免疫诊断。  想必大家都见过荧光棒或者萤火虫吧?它们发光的过程就是化学发光(chemiluminescent,CL)。目前,这些原理已经应用于犯罪现场的血液探测和测定不同生物样品组分的

活细胞内的生物正交反应研究获突破

  北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组长期致力于发展活细胞内的外源化学反应,特别是生物正交消除反应的提出,丰富了生物正交反应的内容。最近,他们首次在活细胞的蛋白质上实现了“逆电子需求的狄尔斯—阿尔德反应”(简称“狄—阿”反应),并将其应用于蛋白质酶的激活。基于对“(逆)狄—阿”反应的解析,他们发现

细胞培养中血清的解冻及热灭活

  细胞培养用血清解冻与热灭活常见问题 一、保存血清的方法    建议血清应保存在-5 ℃至-20 ℃。然而,若存放于4℃时,请勿超过一个月。若您一次无法用完一瓶,建议您无菌分装血清至恰当的灭菌容器内,再放回冷冻。 二、如何解冻血清才不会使产品质量受损?    建议您将血清从冷冻箱取出后,先置于2~

活细胞的有机物主要由哪些物质组成?

除了水和无机盐之外,活细胞的有机物主要由碳原子与氢、氧、氮、磷、硫等结合组成,分为大分子和小分子两大类。前者包括蛋白质、核酸、多糖和以结合状态存在的脂质;后者有维生素、激素、各种代谢中间物以及合成生物大分子所需的氨基酸、核苷酸、糖、脂肪酸和甘油等。在不同的生物中,还有各种次生代谢物,如萜类、生物碱、

陈玲玲团队开发活细胞DNA成像新工具——CRISPRdelight

  活细胞追踪DNA、RNA等核酸的空间分布和动态变化对于了解基因表达调控机制具有十分重要的意义。CRISPR-Cas系统是一种来源于细菌和古细菌体内的获得性免疫系统,由于其特异性靶向DNA/RNA的能力,已被广泛开发成多种细胞内DNA/RNA的遗传操作和检测标记的工具。  陈玲玲研究组前期构建了基

活细胞实时动态成像仪-让科研更轻松

目前,大部分的细胞检测方法采用的仍然是传统的终点法——仅仅给出最终结果,而且往往需要标记细胞和破坏细胞。这种方法无法得到细胞在生长时的真正状态,也无法对细胞的生长过程做出动态的监测和分析。美国 Essen 公司开发了第二代长时间实时动态活细胞成像分析仪——IncuCyte ZOOM

超乎想象的新技术:活细胞化学发光检测

  化学发光探针(chemiluminescent probes)是最敏感的DNA序列诊断工具,常用在犯罪现场分析和免疫诊断。  想必大家都见过荧光棒或者萤火虫吧?它们发光的过程就是化学发光(chemiluminescent,CL)。目前,这些原理已经应用于犯罪现场的血液探测和测定不同生物样品组分的

如何使用高内涵进行长时间活细胞成像

活细胞成像技术是最近几年兴起的一项技术,能够在细胞接近生理的状态下观察细胞形态改变和蛋白的表达,该技术能够避免传统采用固定细胞或组织的研究方法中,固定细胞过程中造成的细胞形态的改变和结构改变,能够更加真实的反映出细胞的特性,因而广受推崇。MD ImageXpress Micor高内涵系统具有多种特性

酶标仪利用”无创”技术检测活细胞荧光蛋白

在过去的五年中,荧光蛋白在监测体内生物学研究中,起到越来越重要的作用。源于维多利亚多管发光水母中的绿色荧光蛋白(GFP)是zui早被我们应 用的荧光蛋白,但是随着时间的推移,现在我们可以使用的荧光蛋白种类也越加丰富,包括加强型的变异GFP蛋白、从其他种类水母中发现的荧光蛋白和珊瑚礁蛋 白。它们都可以

化学所在活细胞分子探针研究中取得系列进展

  分子识别是生命过程的基础,揭示生物活性分子间识别作用是透彻理解生命过程的重要途径。发展新型识别分子、构筑分子探针,在分子水平上探索生命过程和疾病发生发展机制是现代生化分析领域前沿研究方向之一。  中国科学院化学研究所活体分析化学院重点实验室上官棣华课题组科研人员长期致力于分子探针的开发和分子识别

基因治疗技术的主要分类

按基因操作基因治疗一类为基因修正(gene correction)和基因置换(gene replacement),即将缺陷基因的异常序列进行矫正,对缺陷基因精确地原位修复,不涉及基因组的其他任何改变。通过同源重组(homologous recombination)即基因打靶(gene targett

细胞周期蛋白质的细胞周期

我们可以把细胞周期人为地划分为几个时期。开始人们按照细胞所处的形态学变化将细胞划分为间期和分裂期两相,霍华德学说划分细胞周期各期则是以细胞核的遗传物质DNA的复制和分裂作为主要标界——即按时间顺序将细胞周期确定为四个期:DNA合成前期(G1期),DNA合成期(S期),DNA合成后期(G2期)和分裂期

如何实现无开孔一体式?-vivo-APEX-2019技术解析

从1983年诞生开始,手机外形设计就经历了天翻复地的变化。形态、交互方式和屏幕等方面都产生了数不清的花样。但在36年的发展史中,有一点是一直不变的。那就是手机会在机身表面进行或多或少、或大或小的开孔。1月14日,vivo发布的概念机APEX 2019终于打破了这一千古束缚,给大家呈现

光学磁扭仪和荧光诱导活细胞细胞核蛋白的分解

实验概要机械力在生物过程中发挥着显著作用。这些机械力可以通过骨架长丝网络传送到细胞,诱导胞浆内不同的生化反应。虽然已经有充足的报告显示,细胞质酶可被细胞表面的局部应力直接激活,但一直没有证据表明,机械力可以直接改变核功能,包括卡哈尔体蛋白质复合物的结构变化。本实验描述了通过利用磁场扭曲力改变,流式细

电流使细胞产生胰岛素-可穿戴活细胞编程设备获进展?

示意图显示了植入小鼠背部的封装DART工程细胞,DART系统可用于治疗Ⅰ型糖尿病小鼠    图片来源:《自然·代谢》    据《自然·代谢》31日发表的一项生物技术突破称,科学家实现了用电流在改造的人类细胞里激活基因表达。这是一项以糖尿病小鼠为模型的概念验证研究,实验系统可激发工程改造的人类细胞产生

无标记活细胞成像系统助力量子点用于细胞死亡表征的...

   细胞死亡机制的研究一直是生命科学领域的研究热点。通常,细胞死亡(细胞凋亡、自噬、坏死)的检测需要间接的荧光标记配合不同检测方法。然而,这些方法无法实时监测细胞死亡过程中的内部状况,也无法同时鉴定毒性物质和细胞死亡过程。因此间接标记越来越难以满足细胞死亡过程实时监测的需求。量子点(quantum

新型高分辨成像技术可观察活细胞中酶和细胞传导活性

  分析测试百科网讯 一种新型的荧光生物传感器可以观察到在活细胞中高度特异性位置发生的酶和细胞信号传导活性。  这些活动的发生通常在100纳米大小,观察它们目前是困难或不可能的。例如,可见光的衍射极限会阻止光学显微镜在小于200至250nm的位置捕获动态事件。  超分辨率技术如SOFI(stocha

酵母菌的形态观察及死、活细胞的鉴别实验——细胞鉴别

实验方法原理美蓝是一种无毒性染料,它的氧化型是蓝色的,而还原型是无色的,用它来对酵母的活细胞进行染色,由于细胞中新陈代谢的作用,使细胞内具有较强的还原能力,能使美蓝从蓝色的氧化型变为无色的还原型,所以酵母的活细胞无色,而对于死细胞或代谢缓慢的老细胞,则因它们无此还原能力或还原能力极弱,而被美蓝染成蓝

单细胞蛋白质的优点

  从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快,原料要求低(包括农林副产物及废料,食品加工后的废物、副产品,石油衍生原料,厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等),营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分),是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物,包括含

单细胞蛋白质的介绍

  从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快,原料要求低(包括农林副产物及废料,食品加工后的废物、副产品,石油衍生原料,厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等),营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分),是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物,包括含

蛋白质的细胞功能介绍

  蛋白质是细胞中的主要功能分子。除了特定类别的RNA,大多数的其他生物分子都需要蛋白质来调控。蛋白质也是细胞中含量最为丰富的分子之一;例如,蛋白质占大肠杆菌细胞干重的一半,而其他大分子如DNA和RNA则只分别占3%和20%。在一个特定细胞或细胞类型中表达的所有蛋白被称为对应细胞的蛋白质组。  蛋白

单细胞蛋白质的用途

  ①用作食品有些单细胞蛋白质,特别是用农产品培养生长的酵母菌菌体可用作食品(必要时要先经过处理)。  ②用作饲料用单细胞蛋白质作为饲料,可以节约粮食,促进畜牧业发展。  ③用作其他从单细胞蛋 白质中可提取许多有用之物,如辅酶A,细胞色素C和辅酶I等医药产品,如酵母浸出汁等生物试剂。

真核细胞蛋白质合成过程

真核细胞中,核糖体进行蛋白质合成时,既可以游离在细胞质中,称为游离核糖体(freeribosome)。也可以附着在内质网的表面,称为膜旁核糖体或附着核糖体。参与构成RER,称为固着核糖体或膜旁核糖体,是以大亚基圆锥形部与膜接着游离核糖体(freeribosome)。分布在线粒体中的核糖体,比一般核糖

布鲁克在美国HUPO-2021大会最新成果发布

——深度无偏向性血浆蛋白质组学、PaSER 1.1软件和新型交联耗材的新成果  牛津大学Roman Fischer教授展示了高通量4D-蛋白质组学技术,只需10~20分钟即可在未去高峰度蛋白的血浆样本中检测出大于350种蛋白质,实现了高通量、高度可靠性的生物标记物发现。  OmicEra诊断集团实现