大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等,与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作,提出了利用原位化学交联-质谱技术(in vivo XL-MS),解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息,结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度,重构了细胞内多种蛋白质,尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质(intrinsically disordered protein,IDP)的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代,AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测,而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来,in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文

石墨烯电极捕捉活细胞疾病受体获进展

   利用细胞表面特异性受体及蛋白标志物,识别并捕捉特定组织及特定生理病理状态下的细胞,对于疾病诊断、靶向治疗都有非常重要的意义。糖蛋白及糖结合蛋白作为细胞--细胞、细胞细胞、细胞--微环境相互作用的重要媒介,随着糖组学的发展,其重要性也日益受到重视。   针对现有化学糖生物学检测手段技术繁复、耗时

活细胞培养法体外试验应注意哪些?

  ①有的药物在体外试验时无致癌性,进入体内在某些酶的激活下可产生致癌作用,另外还存在着癌细胞耐药性问题。  ②一般说,细胞培养比较适用于单质药物测试,在用复方药或中药进行试验时,由于药物成分多,加上每批药物之间可能存在着质和量上的差异,评价时应考虑这些因素,持客观而谨慎态度。  ③非水溶性药物测试

离心机分离脂肪活细胞种植技术简介

活细胞种植技术是从人体抽取活体脂肪细胞,通过高速离心机分离提取zui活跃的脂肪颗粒细胞,然后将这些细胞用营养液培养,zui后移植到受体体内。这就是活细胞种植技术。这项技术过程并不复杂,在国内外很多科研实验室和生物工程研究所在研究细胞或者生物技术的时候经常用到这项技术,但是在人体上实施情况尚待考究。从

zenCELL-owl活细胞动态成像及分析系统介绍

研究背景诸多科研院所的医学院、药学院,药企研发部门、CRO企业每天进行大量的药化实验、细胞增殖抑制实验等,筛选匹配细胞株、检测或验证药化效果、各种药化浓度组、细胞实验组、对比组等造成工作量巨大。现有的实验方法多为终点法,包含有LDH乳酸脱氢酶释放、Caspase酶法、代谢活性检测、胞内ATP浓度检测

量子点活细胞成像应用的实验方案

量子点(Quantum dot, QD)是一种新型荧光纳米材料,又称半导体纳米晶,呈近似球形,三维尺寸在2-10nm,具有明显的量子效应,其物理、光学、电学特性优于传统有机荧光染料,是新一代荧光标记探针的优质选择。Chan等将量子点与传统有机荧光染料进行了光学特性的比较,发现量子点的荧光亮度是传统荧

显微镜对于活细胞成像有什么作用

使用现在已开发的各种荧光蛋白和多色探针几乎可以标记任何分子。 对囊泡、细胞器、细胞和组织中的蛋白质动力学成像的能力为了解细胞在健康和疾病状态下如何工作提供了新的洞察力。 这些包括有丝分裂、胚胎发育和细胞骨架变化等过程的时空动态。研究活细胞时,常见的障碍包括光毒性和光损伤。 要捕捉快速的生物过程,关键

活细胞的脂类染色的操作与应用

脂类是脂肪和类脂(磷脂、糖脂、固醇脂等)的统称。它是构成人体组织的正常成分,不溶于水而易溶于酒精、乙醚、氯仿等脂溶剂中。在化学组成上,脂类属于脂肪酸的酯或与这些酯有关的物质,脂类的主要功能是氧化供能。脂肪主要存积于脂肪组织中,并以油滴状的微粒存在脂肪细胞浆内。在病理检验中,脂类染色法最常用于证明脂肪

简述造血干细胞移植的植活鉴定

  植活标准:回输造血干细胞后,血细胞持续下降然后再回升,当中性粒细胞连续3天超过0.5×109/L,为白细胞植活;在不进行血小板输注的情况下,血小板计数连续7天大于20×109/L为血小板植活。  植活鉴定:可根据供、受者之间性别、红细胞血型和HLA的不同,分别通过细胞学和分子遗传学(FISH技术

如何实现无开孔一体式?-vivo-APEX-2019技术解析

从1983年诞生开始,手机外形设计就经历了天翻复地的变化。形态、交互方式和屏幕等方面都产生了数不清的花样。但在36年的发展史中,有一点是一直不变的。那就是手机会在机身表面进行或多或少、或大或小的开孔。1月14日,vivo发布的概念机APEX 2019终于打破了这一千古束缚,给大家呈现

活细胞免疫荧光技术-流式细胞仪标本的制备

实验方法原理活细胞表面保留有较完整的抗原或受体,先用特异性鼠源性单克隆抗体与细胞表面相应抗原结合,再用荧光标记的第二抗体结合,根据所测定的荧光强度和阳性百分率即可知相应抗原的密度和分布。实验材料细胞样品试剂、试剂盒兔血清第二抗体单克隆抗体FCS-RPMI1640DPBS仪器、耗材玻璃管塑料管离心机荧

活细胞免疫荧光技术-流式细胞仪标本的制备

实验方法原理活细胞表面保留有较完整的抗原或受体,先用特异性鼠源性单克隆抗体与细胞表面相应抗原结合,再用荧光标记的第二抗体结合,根据所测定的荧光强度和阳性百分率即可知相应抗原的密度和分布。实验材料抗体血清试剂、试剂盒RPMI1640DPBS洗涤液固定液仪器、耗材玻璃管塑料管离心机显微镜实验步骤1.  

活细胞成像是直接把培养的细胞放到工作站吗

一、活细胞成像系统原理目前主流的活细胞成像系统从原理上可以分为两大类:基于宽场反卷积技术基于共聚焦技术两种技术作为目前最流行的活细胞成像技术,均可以实现在维持细胞存活的情况下,快速获取单一焦平面的信号,在具体性能上则各有擅长。宽场反卷积技术对光线进行反卷积运算是光学成像领域的成熟技术,最早由美国国家

为什么研究人员要对细胞分析和对活细胞动态测量

活细胞是生命体基本结构单位和功能单位,因此对单个活细胞的实时观测对生命科学有重要意义,而深入量化分析实验数据有助于揭示生命科学中的信息。在这个过程中,研究人员会设计搭建活细胞培养室,改进显微成像系统,使系统在实现实时观测、成像、双通道同时成像基础上更适合活细胞长时间实时观测和数据分析,研究人员通过细

活细胞成像是直接把培养的细胞放到工作站吗

一、活细胞成像系统原理目前主流的活细胞成像系统从原理上可以分为两大类:基于宽场反卷积技术基于共聚焦技术两种技术作为目前最流行的活细胞成像技术,均可以实现在维持细胞存活的情况下,快速获取单一焦平面的信号,在具体性能上则各有擅长。宽场反卷积技术对光线进行反卷积运算是光学成像领域的成熟技术,最早由美国国家

使用Incyte活细胞密度测量技术实时在线监控CHO细胞的培...

使用Incyte活细胞密度测量技术实时在线监控CHO细胞的培养过程——Incyte技术与离线细胞密度测量技术的比较在R&D阶段比较不同的细胞密度测量技术应用: CHO细胞生产单抗Hamilton 产品: Incyte, PC Box在治疗和诊断用单抗的生产中,中国仓鼠卵细胞(CHO)是最常用的细胞。

基因治疗的主要分类

按基因操作一类为基因修正(gene correction)和基因置换(gene replacement),即将缺陷基因的异常序列进行矫正,对缺陷基因精确地原位修复,不涉及基因组的其他任何改变。通过同源重组(homologous recombination)即基因打靶(gene targetting)

细胞内定位的相关介绍

   in vivo的蛋白质研究常常专注于蛋白质在细胞中的合成和定位。虽然已经知道许多细胞内蛋白质是在细胞质中合成,而膜结合蛋白质或分泌性蛋白质是在内质网中合成,但蛋白质定位到特定细胞器或细胞结构的特异性是如何达到的,目前还不清楚。一些有助于获得特定蛋白质在细胞中定位的方法得到了发展,特别是用基因工

活细胞内进行DNA计算获得成功

  据物理学家组织网7月11日(北京时间)报道,美国北卡罗莱纳州立大学的化学家成功演示了如何在人体细胞内进行基于DNA的逻辑门操作。这一研究为将来在活细胞内运行更复杂的计算铺平了道路,并有助于开发新的疾病诊断和治疗方法。   计算机是通过逻辑门进行运算的,多个逻辑门以不同的方式组合,使计算机

PNAS:首次肉眼观测到活细胞离子通道开启

  去年著名实验室MBL研发出了一种新型细胞电活性探针,可以用于神经生物学研究中,时隔一年,这一实验室又在这一荧光探针中加入了一种“有毒成分”:狼蛛毒素(Tarantula Toxin)。  这一研究成果公布在10月20日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。文章的第一作者是加州大学戴维斯分校

活细胞内的生物正交反应研究获突破

  北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组长期致力于发展活细胞内的外源化学反应,特别是生物正交消除反应的提出,丰富了生物正交反应的内容。最近,他们首次在活细胞的蛋白质上实现了“逆电子需求的狄尔斯—阿尔德反应”(简称“狄—阿”反应),并将其应用于蛋白质酶的激活。基于对“(逆)狄—阿”反应的解析,他们发现

安捷伦推出实时活细胞-ATP-速率测定试剂盒

  新测定方法扩大了 Agilent Seahorse XF 技术的应用范围  2018年5月8日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前宣布推出一款新产品— Agilent Seahorse XF 实时 ATP 速率测定试剂盒,这款试剂盒将帮助生物学家增进对活细胞实时功能的了解。  Seah

超乎想象的新技术:活细胞化学发光检测

  化学发光探针(chemiluminescent probes)是最敏感的DNA序列诊断工具,常用在犯罪现场分析和免疫诊断。  想必大家都见过荧光棒或者萤火虫吧?它们发光的过程就是化学发光(chemiluminescent,CL)。目前,这些原理已经应用于犯罪现场的血液探测和测定不同生物样品组分的

如何使用高内涵进行长时间活细胞成像

活细胞成像技术是最近几年兴起的一项技术,能够在细胞接近生理的状态下观察细胞形态改变和蛋白的表达,该技术能够避免传统采用固定细胞或组织的研究方法中,固定细胞过程中造成的细胞形态的改变和结构改变,能够更加真实的反映出细胞的特性,因而广受推崇。MD ImageXpress Micor高内涵系统具有多种特性

超乎想象的新技术:活细胞化学发光检测

  化学发光探针(chemiluminescent probes)是最敏感的DNA序列诊断工具,常用在犯罪现场分析和免疫诊断。  想必大家都见过荧光棒或者萤火虫吧?它们发光的过程就是化学发光(chemiluminescent,CL)。目前,这些原理已经应用于犯罪现场的血液探测和测定不同生物样品组分的

活细胞成像2012最新进展及产品

  目前生物成像领域已经可以采用各种显微技术和共聚焦等技术了,这提高了图像的精确度,但是要观察到深层组织活动并不容易,因此在一些活体成像,组织深部观察等方面还需要更多的技术进步。2012年活体显微技术,荧光显微技术,以及活细胞成像方面都涌现出了不少重要的技术成果。   活体动物成像技术主

活细胞实时动态成像仪-让科研更轻松

目前,大部分的细胞检测方法采用的仍然是传统的终点法——仅仅给出最终结果,而且往往需要标记细胞和破坏细胞。这种方法无法得到细胞在生长时的真正状态,也无法对细胞的生长过程做出动态的监测和分析。美国 Essen 公司开发了第二代长时间实时动态活细胞成像分析仪——IncuCyte ZOOM

小鼠胚胎的长时间、6D活细胞观察

哺乳动物细胞胚胎植入发育和时间空间的变化协调是密不可分的,因此,对于这些发育过程的分析也必须是实时,动态而且3D的。我们过去经常使用的荧光蛋白表达技术,mRNA显微注射以及时相荧光显微观察使得活细胞成像成为了可能,但传统的荧光显微镜得到的数据却不能用来构建三维构象,这是由于荧光显微镜不能透过胚胎的厚

量子点活细胞成像应用的实验方案建议

   量子点(Quantum dot, QD)是一种新型荧光纳米材料,又称半导体纳米晶,呈近似球形,三维尺寸在2-10nm,具有明显的量子效应,其物理、光学、电学特性优于传统有机荧光染料,是新一代荧光标记探针的优质选择。    Chan等将量子点与传统有机荧光染料进行了光学特性的比较,发现量子点的

超乎想象的新技术:活细胞化学发光检测

  化学发光探针(chemiluminescent probes)是最敏感的DNA序列诊断工具,常用在犯罪现场分析和免疫诊断。  想必大家都见过荧光棒或者萤火虫吧?它们发光的过程就是化学发光(chemiluminescent,CL)。目前,这些原理已经应用于犯罪现场的血液探测和测定不同生物样品组分的

化学所在活细胞分子探针研究中取得系列进展

  分子识别是生命过程的基础,揭示生物活性分子间识别作用是透彻理解生命过程的重要途径。发展新型识别分子、构筑分子探针,在分子水平上探索生命过程和疾病发生发展机制是现代生化分析领域前沿研究方向之一。  中国科学院化学研究所活体分析化学院重点实验室上官棣华课题组科研人员长期致力于分子探针的开发和分子识别