一种植物会为其基因组主动“减肥”

据趣味科学网报道,美国布法罗大学的研究人员经过对一种食肉植物研究后发现,其基因组中不必要的成分被剥离了,这表明,对于正常健康的机体而言,垃圾DNA似乎真的不需要。相关论文发表在近期出版的《自然》杂志上。 科学家早就发现,组成基因组的绝大多数DNA并不编码蛋白质,也不发挥开关基因的功能。这些巨大的灰色地带大多是寄生虫DNA遗传片段反复复制并粘贴到基因组中的;此外就是一些古老的基因,但现已关闭。研究人员将这些区域称为垃圾DNA,至今尚无人知晓这些区域会不会发挥作用。在人类基因组中,功能基因只占2%的比例。 近年来,研究人员一直在质疑“垃圾DNA”这一用语,认为这有可能是一种误称,但他们也表示这些神秘的 DNA有可能扮演着一定的角色,发挥着一定的功能。目前正在开展的一个名为ENCODE的大型科研项目,就是希望揭示人类基因组中不编码蛋白质的33亿个碱基对的功能。研究表明,大约80%的DNA似乎有一些生物活性,如影响基......阅读全文

能源植物小桐子基因组中发现3个开花抑制基因

  开花是高等植物由营养生长进入生殖生长的重要标志,受促进或抑制开花基因的双重调控。FT/TFL1基因家族在植物的成花过程中起着重要的作用,其中TFL1(TERMINAL FLOWER 1)类基因发挥着抑制开花的功能。  中国科学院西双版纳热带植物园能源植物分子育种研究组的博士研究生李超琼与科研人员

研究发现植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制

  叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器,对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队,历时五年,通过对三种高等植物(水稻、玉米和拟南芥

武汉植物园在淫羊藿叶绿体基因组研究中获进展

  淫羊藿为小檗科淫羊藿属植物,是我国常用大宗中药材,具有较多的药用价值和广阔的开发前景。当前淫羊藿药材主要依靠野生资源,存在基原植物混乱、质量参差不齐等问题。叶绿体基因组信息可以用于植物的系统分类、品种鉴定,但目前还没有对我国淫羊藿属植物开展过叶绿体基因组的研究。  中国科学院武汉植物园副研究员张

昆明植物所建立叶绿体基因组遗传信息获取技术体系

  在分子生物学和基因组时代,叶绿体基因组为植物分类、系统发育和物种鉴定等提供了不可或缺的遗传信息。随着新一代测序技术的快速发展,叶绿体基因组学已经成为植物系统基因组学和超级条形码研究的热点,也是中国科学院昆明植物研究所三个重大突破目标——iFlora 研究的重要内容。  昆明植物所种质资源库多年来

高彩霞研究组等合作建立优化植物基因组引导编辑系统

  近日,中科院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组与美国哈佛大学刘汝谦研究组合作,建立并优化了适用于植物的引导编辑系统(PPE),并在重要农作物水稻和小麦基因组中实现精确的碱基替换、增添或删除。相关成果近日在线发表于《自然—生物技术》。  基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组,从而大大加速植物育种进

武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展

  葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种

“千种动植物基因组计划”一期启动100多种测序

  由深圳华大基因研究院发起的“千种动植物基因组计划”,一期已启动100多种动植物基因组测序分析项目,其中近一半的项目已经完成或接近尾声。  华大基因5月13日召开发布会称,该“千种计划”在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展,该计划将加速全球基因组学研

两篇Nature遗传:迄今为止最古老的植物基因组

  最近,一个国际研究小组首次成功地对铜器时代的大麦基因组进行了测序。这是迄今重建的最古老的植物基因组。这些6000年前的种子是从以色列Judean沙漠Masada要塞南崖靠近死海的Yaram洞穴获得的。从遗传学来说,史前大麦非常类似于目前种植在Levant南部的大麦,从而支持目前“大麦驯化发生在U

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA

  基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀

遗传发育所等联合研究建立植物基因组引导编辑技术体系

  基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组,从而大大加速植物育种的进程,是实现作物精准育种的重要技术突破。然而,作物的许多重要农艺性状是由基因组中的单个或少数核苷酸的改变或突变造成的。基于CRISPR/Cas系统的基因组编辑,可利用外源修复模板通过同源重组介导的修复方式(HDR)实现目标基因特定核苷酸

植物所解析高粱驯化改良过程中的基因组印记

  作物驯化和遗传改良,在人类从游牧狩猎到定居的生活方式过渡过程中起到关键作用。高粱是谷类作物,具有多种用途,如食物、饲料、酿酒、制糖和生产生物燃料等。面对可持续发展的需求和应对气候环境的挑战,揭示高粱驯化和改良过程的基因组选择,探索种间杂交以及平行/趋同进化的遗传机制至关重要。  中国科学院植物研

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA

  概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则

濒危植物报春苣苔交配系统转变基因组效应获揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488438.shtm 近日,中国科学院华南植物园植物科学研究中心研究员康明团队以苦苣苔科报春苣苔(Primulina tabacum)为对象,研究揭示了濒危植物报春苣苔交配系统由异交向自交转变的基因

植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做

植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样?植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子。 二、设备 移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50ml离心管(有盖)及5ml和1.5ml离心管,弯成钩状的小玻棒。(这时选择设备的时候注意选择那种通用性强的,可以一机配多种

植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做

植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样?植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子。 二、设备 移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50ml离心管(有盖)及5ml和1.5ml离心管,弯成钩状的小玻棒。(这时选择设备的时候注意选择那种通用性强的,可以一机配多种

版纳植物园完成蓖麻基因组bZIP家族鉴定与表达分析

  蓖麻是双子叶胚乳型植物的典型代表,是大戟科中重要的油料作物,其种子油被广泛地应用在工业上。bZIP(basic leucine zipper)转录因子广泛分布于真核生物中,在植物中涉及多种生物进程,其中ABF亚族更是ABA信号途径中重要的调控因子。   中国科学院西双版纳热带植物园分子遗传

石菖蒲及单子叶植物祖先基因组演化研究获进展

2022年7月14日,Nature Plants在线发表了来自中国科学院武汉植物园王青锋、陈进明团队与法国合作者的重要成果,公布了单子叶植物最早期分支菖蒲目中的重要水生药用植物石菖蒲(Acorus tatarinowii)的基因组,相关研究初步揭示了单子叶植物祖先早期基因组演化过程和规律,为理解包括

植物所揭示丁香属全基因组、演化历史及花香形成机制

  丁香属为温带起源的木本芳香植物,是木犀科(Oleaceae)中较为古老的类群,全属30余种(变种),除3种在巴尔干半岛和北海道分布以外,其余在中国均有野生分布。作为观赏植物,丁香拥有约1400年的栽培历史和约200年的育种历史,其药用功能的开发和芳香精油的利用由来已久。然而,丁香属全基因组信息的

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...(二)

3.2 染色体制备无论是荧光染色还是 FISH,分裂期和分裂间期的染色体制备均于载物片上进行。建议使用蛋白水解酶对材料进行预处理,以去除细胞壁和细胞质,再将样品置于载玻片上,滴上乙酸,然后盖上玻片压片。所有操作均于室温下进行,除非是特殊说明。在洗涤和材料准备时使用小培养皿,方法见 2. 2 节。(

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...(三)

3.5 杂交混合变性和杂交( 1 ) 离心管中准备杂交液,见表14. 1,充分混合。 ( 2 ) 在离心管中加入 34 μl 杂交液、2 μl 转基因探针、1 μl 指示探针或对照探针,蒸馏水补齐至 40 μl,作为探针混合液。( 3 ) 探针变性,放入 70°C 水浴锅 10 min , 然后置冰

遗传发育所利用CRISPRCas系统对植物进行定点基因组编辑

  CRISPR-Cas系统是继锌指核酸酶(ZFNs)和TALEN核酸酶之后的另一个可精确定点编辑基因组DNA的新技术,具有设计构建简单快速等优点。目前已在人类细胞系、斑马鱼、小鼠、果蝇和酵母等多个物种中利用,但CRISPR-Cas系统能否在植物中使用尚无报道。   中国科学院遗传与发育生物学研究

-Pacbio单分子实时测序技术于药用植物基因组研究应用

  药源短缺成为限制临床治疗和新药研发的最大瓶颈,因此,开发新的药物来源途径是迫切需要解决的问题。利用现代生物技术和次生代谢工程手段是未来生产药物最有潜力的发展方向。我国药用植物有1 万多种,大多数药用植物遗传背景不清楚,基因组信息缺乏,遗传信息和功能基因的研究亦极为薄弱。例如人参属(Panax)

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合转基因片段实验

实验材料核苷酸试剂、试剂盒冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤原位杂交的基本操作方法(图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交:标底是玻片上的染色体和细胞核,探针是带标记的待测 DNA 序列 [ 本书中即是转基因和对照,图 14.3(a)

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA(二)

5. 仔细移取上清液至另一50ml离心管,加入1倍体积异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。 6. 在1.5ml eppendorf中加入1ml TE。用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。 7. 如DNA不形成絮状沉淀,则可用500

遗传发育所在植物基因组编辑突变体筛选方法研究取进展

  如何快速高效进行突变体检测和鉴定是植物基因组编辑技术迅速发展面临的重要问题之一。目前植物基因组编辑突变检测方法主要包括PCR/RE、T7EI错配切割、临界退火温度PCR (ACT-PCR)、Sanger测序和二代测序(NGS)等。以上所有的检测方法都基于PCR反应,且都有各自的不足之处。PCR/

华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展

  报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物,具有非常丰富的物种多样性和特有性,是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图  中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下,以报春苣苔属植物为材料,率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...(一)

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基因片段实验实验材料 核苷酸试剂、试剂盒 冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材 载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤 原位杂交的基本操作方法(图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交:标底是玻片上的染色体和细胞核,探针是带标记的待测

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基因片段...

实验材料核苷酸                                                          试剂、试剂盒冰水                                                                  8-羟基喹啉    

我国成功研究出世界首个药用植物基因组框架图

  广药集团与中国医学科学院药用植物研究所6月20日在京举行丹参基因组框架图成果发布会。这是世界上首个药用植物基因组框架图,标志着中药研究全面进入基因组学时代。该项工作将推动丹参成为第一个“模式药用植物”,为药用植物生命科学研究提供系统工具,为深入开展相关学科研究奠定基础。  中国医学科学

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA(一)

基因组DNA的提取概 述基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DN