科学家揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的分子机理

RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute(Ago)蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点,达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago,原核生物的Ago展现出多样性,分为三个家族——长A型、长B型和短Ago亚型。原核长A和长B型Ago包括四个结构域,即N端结构域、PAZ结构域、MID结构域和PIWI结构域。这四个结构域在Ago蛋白系统发挥功能的过程中发挥重要的功能,缺一不可。原核短Ago不具备N端和PAZ结构域(图1a),因此原核短Ago在发挥功能时必须招募一些其他蛋白如SIR2和TIR蛋白,补偿N端和PAZ结构域的功能。与真核生物相比,原核生物的Ago不仅可以介导由DNA引导的靶向DNA干扰,而且可以介导由RNA引导的靶向RNA或者DNA干扰。因此,原核生物的Ago展示出更多的功能,如靶向干扰噬菌体入侵和外源质粒DNA扩增、阻碍外源基......阅读全文

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

milRNA调控香蕉枯萎病菌的致病机理获揭示

香蕉枯萎病是制约世界香蕉生产的毁灭性病害,探索其病原真菌致病机理将为发展高效病害防治药剂提供分子靶标。近日,华南农业大学植物保护学院、广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室姜子德/李敏慧团队,首次揭示milRNA调控香蕉枯萎病菌的致病机理。相关研究发表于PLoS Pathogens。据悉,该研究团

北大等在siRNA抗病毒研究方面获进展

  北京大学生命科学学院李毅课题组与美国加州大学河滨分校丁守伟教授合作,近日在美国科学院院刊(PNAS)上发表了题为Virus infection triggers widespread silencing of host genes by a distinct class of endogenou

小干扰RNA转录后基因沉默的介绍

  siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物(RISC)的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程,两条siRNA链中的一条(引导链)将被装载到RISC中,而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后,siR

韩春雨回应“13位学者实名宣布无法重复他的NgAgo实验”

  11日,河北科技大学副教授韩春雨接受科技日报记者采访,回应13位学者实名宣布无法重复他的NgAgo实验。他依然认为,别人重复不了,细胞污染的可能性最大。  韩春雨此前曾表示,有人成功重复了他的实验。至于到底是谁重复成功,他仍说暂不方便透露。“请求大家再有一点耐心。我还是之前的说法,很快将会有新的

西湖大学揭开胚胎早期“启动包”之谜

据西湖大学18日消息,该校研究团队首次揭开生命起始阶段“生命启动包”的核心密码,阐明了小RNA(核糖核酸)和CPL(细胞质晶格)在生命启程中的关键作用,为理解女性不孕、反复胚胎停育等临床问题提供了全新视角。据悉,西湖大学“遗传物质表达与重构全国重点实验室”申恩志团队接连在期刊《生命》(Vita)和《

2013年05月16日《自然》杂志精选

  封面故事:透明的大脑   Structural and molecular interrogation of intact biological systems   本期封面所示为完好的小鼠海马体的一个三维图片,它被做成透明的,显示表达eYFP(绿色)、小清蛋白(红色)和胶质细胞原纤维酸性蛋

科学家解答果蔬为什么会长毛

  西红柿、草莓、葡萄……放上几天就要被灰霉菌侵染长毛,哪怕在冰箱中冷藏也无法避免。灰霉菌为何如此厉害?美国加州大学河滨分校金海翎教授实验室为解答这一问题提供了新线索,他们发现灰霉菌会借助一种特殊手段攻破果蔬的免疫防线。   灰霉菌是空气中大量存在的一种真菌,迄今未发现有植物对其产生抗性。金海翎等

circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(二)

3. hsa_circ_0004872作为分子海绵吸附miR-224作者首先通过FISH实验观测到hsa_circ_0004872主要分布在细胞质。然后通过RIP-qPCR验证到hsa_circ_0004872与AGO2蛋白结合,pull down实验显示hsa_circ_0004872与miR-2

科学家发现灰霉菌可攻破果蔬的免疫防线

  西红柿、草莓、葡萄……放上几天就要被灰霉菌侵染长毛,哪怕在冰箱中冷藏也无法避免。灰霉菌为何如此厉害?美国加州大学河滨分校金海翎教授实验室为解答这一问题提供了新线索,他们发现灰霉菌会借助一种特殊手段攻破果蔬的免疫防线。   灰霉菌是空气中大量存在的一种真菌,迄今未发现有植物对其产生抗性。金海翎等

蛋白A、蛋白G与蛋白L之间的差异

蛋白A (Protein A) 是金黄色葡萄球菌的一个株系的细胞壁蛋白,它通过Fc区与哺乳动物的IgG结合,天然的启维益成提供的Protein A,42kDa,含有四个Ig Fc结合位点,其中2个是有活性的,而用于纯化抗体的,一般是重组的protein A,含有4个Ig Fc区域结合位点。蛋

揭露CG甲基化的遗传性和相互作用

  将表观遗传标记(例如DNA甲基化)靶向特定位点的能力在基础研究和作物植物工程中都很重要。但是,靶向DNA甲基化的遗传性,其如何影响基因表达以及正确建立所需的表观遗传特征尚不清楚。  2021年5月25日,浙江大学刘琬璐及加利福尼亚大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen共同通讯在Nat

特定蛋白包括哪些蛋白

随着越来越多的特定蛋白被应用于临床,其检测方法也发展迅速。在1959年之前,一直采用经典免疫沉淀方法进行检测,这存在测定范围窄、灵敏度低、繁琐费时及不能自动化等缺点。1959年,Schultze等报道了透射比浊法(TransmissionTurbidimetry)。这种方法是常用于生化指标的测定,用

G蛋白的蛋白调控介绍

G蛋白在信号转导过程中起着分子开关的作用。与GDP(紫色)结合后,G蛋白处于非活性状态。GTP取代GDP后,G蛋白活化并传递信号。G蛋白形式多样,大多数用于信号传递,有些则在诸如蛋白质合成中起重要作用。本文主要介绍异三聚体G蛋白,它由三条不同的链组成,分别为α(棕黄色)β(蓝色)γ(绿色)。红色部分

蛋白的常用蛋白鉴定方法

传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术。 “满天星”式的2

RNAi的作用机制及siRNA的合成方法(一)

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA, dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达,用特异性的抗体几乎检测不到靶向基因所表达的蛋白质。因此,RNAi技术又

尿微量蛋白(尿微量白蛋白/蛋白尿)试验

何为尿微量白蛋白(白蛋白)试验?尿微量白蛋白试验是对尿液中的蛋白质进行测定的筛选试验。人体血液中有一种蛋白质称为白蛋白。在正常情况下,几乎无法在尿液中检测到。只有在肾脏受损,尤其是损伤早期,它可以优先于其他肾损伤标志物在尿液中被检测出,因此,尿微量白蛋白在诊断肾脏疾病、早期肾损伤等方面具有重要意义。

关于超氧化氢的化学性质和结构介绍

  一、结构特征  超氧化氢分子中含有未成对电子,因此具有顺磁性。中心氧原子为sp²杂化,用一个电子与端边氢原子形成σ键,用两个电子与端边氧原子成单电子形成三电子π键。 氢元素化合价是+1,氧的平均化合价是-0.5,或说一个氧的化合价是-1,另一个是0价。  二、化学性质  超氧化氢氧化性很强。可将

胞外RNA实现跨物种转移exRNA(二)

02 胞外miRNA进入外泌体的方式对miRNA进行包装并非是随机发生的,而是特定类型的miRNA可能会被优先分配到微泡中。有研究发现,血液细胞和单核淋巴瘤细胞THP1能够主动地、选择性地将miRNA包装到微泡中,响应各种不同的刺激将其分泌到机体循环中。神经酰胺依赖性分泌机制可以诱导核内体转移至胞外

安捷伦科技股票评级由“持有”上调至“买入”

  北京时间12月1日消息,美国股票评级服务公司TheStreet Ratings已将安捷伦的股票评级从“持有”上调至“买入”。   评级报告要点包括:  安捷伦收入增长低于行业平均水平25.6%,去年同期至今,公司收入微增5.1%。数据显示公司EP

蛋白质代谢的降解蛋白

  1、内源蛋白降解速度不同,一般代谢中关键酶半衰期短,如多胺合成的限速酶-鸟氨酸脱羧酶半衰期只有11分钟,而血浆蛋白约为10天,胶原为1000天。体重70千克的成人每天约有400克蛋白更新,进入游离氨基酸库。  2、内源蛋白主要在溶酶体降解,少量随消化液进入消化道降解,某些细胞器也有蛋白酶活性。内

G蛋白的蛋白调控的简介

  G蛋白在信号转导过程中起着分子开关的作用。与GDP(紫色)结合后,G蛋白处于非活性状态。GTP取代GDP后,G蛋白活化并传递信号。G蛋白形式多样,大多数用于信号传递,有些则在诸如蛋白质合成中起重要作用。本文主要介绍异三聚体G蛋白,它由三条不同的链组成,分别为α(棕黄色)β(蓝色)γ(绿色)。红色

转运蛋白是不是就是载体蛋白

转运蛋白:转运蛋白是膜蛋白的一大类,介导生物膜内外的化学物质以及信号交换。脂质双分子层在细胞或细胞器周围形成了一道疏水屏障, 将其与周围环境隔绝起来。尽管有一些小分子可以直接渗透通过膜,但是大部分的亲水性化合物,如糖,氨基酸,离子,药物等等,都需要特异的转运蛋白的帮助来通过疏水屏障。因此,转运蛋白在

球蛋白和清蛋白的区别

球蛋白是一种存在于人体中的血清蛋白,球蛋白是一种常见的蛋白,基本存在于所有的动植物体中。球蛋白具有免疫作用,因此也有人称球蛋白为免疫球蛋白。白蛋白又称为清蛋白,由肝实质细胞合成,是血浆中含量最多的蛋白质,占总蛋白的57%~68%。白蛋白主要生理功能包括:作为内源性氨基酸营养源;其具有相当的酸碱缓冲能

白蛋白球蛋白比值的概述

  白蛋白在肝脏内制造,肝功能受损严重时白蛋白减少,降低程度与肝炎的严重程度相平行。慢性和重型肝炎及肝硬化患者血清白蛋白浓度降低。球蛋白是机体免疫器官制造的,当体内存在病毒等抗原时,球蛋白产生增加。慢性肝炎和肝硬化患者的白蛋白产生减少,而同时球蛋白产生增加,造成白蛋白/球蛋白比值(A/G)比值倒置。

球蛋白和清蛋白的区别

球蛋白是一种存在于人体中的血清蛋白,球蛋白是一种常见的蛋白,基本存在于所有的动植物体中。球蛋白具有免疫作用,因此也有人称球蛋白为免疫球蛋白。白蛋白又称为清蛋白,由肝实质细胞合成,是血浆中含量最多的蛋白质,占总蛋白的57%~68%。白蛋白主要生理功能包括:作为内源性氨基酸营养源;其具有相当的酸碱缓冲能

基于共价连接适合高通量应用的新型高精度CLIP方法

  1月31日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚实验室的研究成果:SpyCLIP: an easy-to-use and high-throughput compatible CLIP platform fo

教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)

从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛

Keynote-Speaker:-Emmanuelle-Claude

Emmanuelle Claude  Miss Emmanuelle Claude (Master in Fine Chemistry and Business and P.Phil in spectroscopy analysis in organic chemistry and biology)

Dicer-Pathway

The degradation of endogenous mRNA in a sequence-specific manner can be induced by dsRNA [RNA interfernce (RNAi)], antisense transcription, or viral i