科学家揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的分子机理
RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点，达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago，原核生物的Ago展现出多样性，分为三个家族——长A型、长B型和短Ago亚型。原核长A和长B型Ago包括四个结构域，即N端结构域、PAZ结构域、MID结构域和PIWI结构域。这四个结构域在Ago蛋白系统发挥功能的过程中发挥重要的功能，缺一不可。原核短Ago不具备N端和PAZ结构域（图1a），因此原核短Ago在发挥功能时必须招募一些其他蛋白如SIR2和TIR蛋白，补偿N端和PAZ结构域的功能。与真核生物相比，原核生物的Ago不仅可以介导由DNA引导的靶向DNA干扰，而且可以介导由RNA引导的靶向RNA或者DNA干扰。因此，原核生物的Ago展示出更多的功能，如靶向干扰噬菌体入侵和外源质粒DNA扩增、阻碍外源基......阅读全文
北大学者发表Cell论文：首次发现外源植物蛋白可抗肿瘤
癌症作为一种细胞异常增殖的疾病，是全球主要的公共卫生问题。癌症的诱因非常复杂，是胞内多种调控通路的突变和微环境共同作用的结果，其中微小RNA（miRNA）是近年来被认为与癌症发生息息相关的重要RNA分子。在哺乳动物中，具有2-nt 3' 末端悬垂的成熟miRNA双链可以被Argonaute（
Core－RISC的概念
Core RISC：是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。
RNA干扰相关知识Core－RISC
Core RISC：是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。
Core－RISC的概念
Core RISC：是介导目标mRNA切割过程或者翻译抑制的最小的RNA-蛋白质复合物。在人和果蝇身上发现的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白质和Core RISC密切相关。
可在微量细胞中鉴定RBP作用靶点的新技术LACEseq被开发
人类基因组编码了约1500个RNA结合蛋白（RNA-binding protein, RBP），它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。RBP在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。R
LACEseq方法在微量细胞中准确鉴定PTBP1的结合靶标
6月10日凌晨，中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超课题组及其合作者在Nature Cell Biology上，在线发表了题为Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq的论文。 人类基因组编码了约1500个R
科学家发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502734.shtm近日，中国农业科学院郑州果树研究所瓜果质量安全监测与控制技术创新团队发现西瓜抗黄瓜绿斑驳花叶病毒的基因。相关研究成果发表于《分子植物病理》（Molecular Plant Pathol
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...（一）
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复文章导读血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增
RNAinduced－silencing－complex（RISC）的功能和用途
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。
我国科学家解析小RNA的生物合成机制
小RNA是真核生物中重要的基因调控分子，在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中，Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体，切割RNA至特定长度，并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和
我国科学家解析小RNA的生物合成机制
小RNA是真核生物中重要的基因调控分子，在生长发育、基因沉默、抵御病毒等动植物的各类生理过程中起着至关重要的作用。小RNA的生物合成中，Dicer家族核酸内切酶选择性识别小RNA前体，切割RNA至特定长度，并选择性地将一条链递呈给下游AGO蛋白从而介导下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNAinduced－initiation－of－transcriptional－gene－silencing（RITS）的用途
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
6月21日《自然》杂志精选
肿瘤对芳香酶抑制剂的反应 Elaine Mardis及其同事利用全基因组测序方法来了解来自用“芳香酶抑制剂新辅助疗法”治疗过的“雌激素受体阳性”（ER+）乳腺癌患者的组织样本的突变情况。他们识别出几个与疾病相关的突变，这些突变与肿瘤细胞组织学、增殖速度和对治疗的反应有特定
韩春雨发表的NgAgo又有新功能！
CRISPR/Cas 系统具有编辑 DNA 和 RNA 靶标的强大能力。然而，CRISPR/Cas 系统对特定识别位点、PAM 的需求限制了其在基因编辑中的应用。一些 Argonaute (Ago) 蛋白在 5' 磷酸化或羟基化引导 DNA (gDNA) 的引导下具有核酸内切酶功能。Ng
环状RNA研究深度剖析（二）
目标circRNA的机制研究 a RIP-qPCR：挑选功能最为明显的1个circRNA做RIP-qPCR实验，检测circRNA是否与AGO2蛋白结合。（AGO2是circRNA发挥海绵作用的指示蛋白） b RNA pull down：对上述circRNA进行RNA pull down实验，拉
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
PVDF膜上蛋白的可逆染色
实验材料 蛋白试剂、试剂盒 AmidoBlackisopropanolaceticacid考马斯亮蓝methanolPonceau S in TCAEtOHHACNa2S2O3AgO3Na2CO3MeOHAgNO3甲醛仪器、耗材 PVDF膜实验步骤 Western 杂交时，为确认蛋白是否转至 PVD
南京大学曾科教授JBC解析microRNA的核转运
南京大学生命科学学院的研究团队对microRNA进行了深入研究，揭示了成熟microRNA转运进入细胞核的具体机制。这项研究于三月四日提前发表在The Journal of Biological Chemistry杂志的网站上。 成熟的microRNA是长约22nt的非编码RNA，它们
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
RNA转染试剂的对比
近期，上海公卫临床研究中心的一位研究生应用两种转染试剂Turbofect transfection reagent（Thermo）和EntransterTM-R4000（Engreen）进行了一次RNA转染比较。比较情况如下：实验方法转染试剂：Turbofect transfection reage
MCMV和SCMV复合侵染玉米引起玉米组织中siRNAs的积累
RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制，它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后，其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别，加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA（vsiRNA）。初级vsiR
MCMV和SCMV复合侵染玉米引起玉米组织中siRNAs的积累
背景介绍RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制，它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后，其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别，加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA（vsiRNA）。初级vs
PVDF膜上蛋白的可逆染色
PVDF膜上蛋白的可逆染色可以用于：Western杂交时，确认蛋白是否转至PVDF膜上。实验方法原理丽春红带负电荷，可以与带正电荷的氨基酸残基结合，同时也可以与蛋白质的非极性区相结合，从而形成红色的条带。实验材料蛋白试剂、试剂盒AmidoBlackisopropanolaceticacid考马斯亮蓝
MCMV和SCMV复合侵染玉米引起玉米组织中siRNAs的积累
背景介绍 RNA沉默是真核生物中调控基因表达的一种保守机制，它在植物生长发育和抗病毒中发挥着重要的作用。RNA病毒进入寄主植物细胞后，其复制中间复合体和单链基因组RNA的高级结构形成的双链RNA可以被寄主植物DCL蛋白识别，加工产生21-24-nt的初级来源于病毒的siRNA（vsiRNA
环状RNA研究的方法及功能作用（二）
RNA是怎样变成环状的呢？a. 在可变剪切过程中，外显子迁移，剪切形成套索结构，拉近剪切位点，促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对，拉近剪切位点，使其相互攻击，促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能，敲降看看据文献报道，环状RNA可以被小干扰R
PVDF膜上蛋白的可逆染色
实验方法原理 丽春红带负电荷，可以与带正电荷的氨基酸残基结合，同时也可以与蛋白质的非极性区相结合，从而形成红色的条带。 实验材料 蛋白
植物DNA损伤修复调控，这个位点尤为重要
华南师范大学生命科学学院阳成伟/赖建彬教授团队揭示了DNA损伤诱发产生的diRNA介导SMC5/6染色体结构维持复合物在DNA断裂位点富集的分子机制。相关研究7月1日在线发表于《植物细胞》（The Plant Cell）。华南师范大学为该论文唯一单位，生命科学学院青年英才（博士后）江洁明为第一作者，
环状RNA研究深度剖析
1.环状RNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2013年两篇Nature[1][2]文章的出世，彻底颠覆了我们对RNA的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界！经过严格统计汇总后，2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项，其中有两项杰出青年基金，一项优秀