AI工具“阿尔法折叠”能否引领药物新发现

2020年,谷歌下属“深度思维”公司开发的人工智能(AI)工具“阿尔法折叠”横空出世,向世人展示了其高精度预测蛋白质三维(3D)结构的超强能力。 此后,又有多款预测蛋白质结构的AI工具面世,鉴于大多数药物通过与蛋白质上的不同位点相结合来发挥作用,而此类工具可预测以前所知甚少的蛋白质结构,因此化学家们对使用AI程序更快、更低成本地发现药物充满期待。 英国《自然》网站在近日的报道中指出,AI预测蛋白质虽然还无法代替实验,但无疑给蛋白质研究领域带来了新的助力。但类似“阿尔法折叠”等预测蛋白质结构的AI工具能否真正撼动制药行业,仍有待时间的检验。 AI工具竞相推出 2020年底,“深度思维”公司首次宣布,他们研发出一种工具——“阿尔法折叠”来精准预测蛋白质的折叠结构。2021年中,“阿尔法折叠”已绘制出人体中98.5%的蛋白质的结构图。2022年,该公司发布了2亿多种蛋白质的结构,全球公认的蛋白质数据库UniProt中收录的......阅读全文

AI工具“阿尔法折叠”能否引领药物新发现

  2020年,谷歌下属“深度思维”公司开发的人工智能(AI)工具“阿尔法折叠”横空出世,向世人展示了其高精度预测蛋白质三维(3D)结构的超强能力。  此后,又有多款预测蛋白质结构的AI工具面世,鉴于大多数药物通过与蛋白质上的不同位点相结合来发挥作用,而此类工具可预测以前所知甚少的蛋白质结构,因此化

破译蛋白质到研制新药,AI帮人类应对科研挑战

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506820.shtm近年来,人工智能(AI)领域发生了巨大变化,ChatGPT横空出世,引发生成式AI创业热潮。英国《新科学家》杂志网站在近日的报道中指出,很多科研团队和公司正在利用AI应对人类目前面临的

从预测进化-AI能“构想”新蛋白质结构

  半个世纪以来,科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战,难倒了几代科学家。但现在,人工智能(AI)解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文,包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种升级的阿尔法折叠系统,该系统由深度思维(

人工智能助力应对科研大挑战

近年来,人工智能(AI)领域发生了巨大变化,ChatGPT横空出世,引发生成式AI创业热潮。英国《新科学家》杂志网站在近日的报道中指出,很多科研团队和公司正在利用AI应对人类目前面临的最大的科学挑战:从破译蛋白质的秘密,到研制出新药,再到应对气候变化以及实现可商用的核聚变发电等。揭示蛋白质结构根据蛋

AI能“构想”新蛋白质结构

科技日报北京12月2日电 (实习记者张佳欣)半个世纪以来,科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战,难倒了几代科学家。但现在,人工智能(AI)解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文,包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种

我国科学家首创蛋白质动态结构AI建模方法

科技日报记者 刘园园 西湖大学12月8日公布,该校人工智能(AI)讲席教授李子青团队与厦门大学、德睿智药合作,首创研发了能够刻画蛋白质构象变化与亲和力预测的AI模型——ProtMD。 这是第一个尝试解析蛋白质动态构象的人工智能方法,可辅助药物化学专家更加精准地筛选出高活性小分子,从而加速临床前药物研

新一代“阿尔法折叠”登场,预测范围从蛋白质扩展到其他生物分子

  英国“深度思维”(DeepMind)公司日前公布了新一代“阿尔法折叠”(AlphaFold-latest),不仅准确性显著提高,预测范围还从蛋白质扩展到其他生物分子,包括配体。该模型已可以预测蛋白质数据库(PDB)中的几乎所有分子,预测精度可以达到原子级。  对抗癌分子的结合(PORCN)、关键

人工智能或在塑造科研新貌

  ChatGPT横空出世后即风靡全球,它以强大的信息整合和对话能力惊艳了整个世界,随着技术的不断更迭,目前最新版的ChatGPT已经拥有撰写论文、代码、软件,以及进行科研辅助分析等多种强大功能。  从更快地合成信息,到数小时内开发出新药,美国趣味科学网在近日的报道中,列出了人工智能(AI)重塑科研

AI“参谋”来了!中关村AI新药研发平台落成

   12月19日,由中关村生命科学园与角井(北京)生物技术有限公司共同发起建设的中关村AI新药研发平台在北京中关村生命科学园举行落成典礼。该平台于2020年12月开始筹建,旨在利用人工智能技术帮助制药企业快速进行药物靶点发现和筛选、药物作用机制探索、特异性抗体优化等工作,成为生物医药企业新药研发的

AI侦探敲碎深度学习黑箱

  研究人员创建了能填补照片空白的神经网络,以鉴别人工智能瑕疵。  Jason Yosinski坐在美国加州旧金山的一个小型玻璃办公室内,陷入了对人工智能的沉思。作为优步公司的研究科学家,Yosinski正为在笔记本电脑上运行的人工智能(AI)进行“脑外科手术”。  很多AI将改变人类现代生活,例如

AI是否会超越人类?丘成桐:AI不会代替人类思维

  近代物“人工智能(AI)是否会超越人类最优秀数学家?”对此,数学家、国际基础科学大会主席丘成桐表示,从目前来看,人工智能无法识别几何背后的定律,更无法识别数学与其他科学之间的关联,人工智能不会代替人类思维。  在7月24日举行的首届基础科学大会青少年专场活动“科学家面对面”中,一批来自高中和大学

新AI“阿尔法扣”胜过近五成“码农”

科技日报讯 (实习记者张佳欣)在全球范围内,程序员短缺。如果人工智能(AI)会写代码——只要人类告诉AI想通过程序做什么,将带来许多便利。根据发表在最新一期《科学》杂志上的研究,一款名为“阿尔法扣”(AlphaCode)的新AI系统正在让人类离这一愿景更近一步。该系统来自“深度思维”研究实验室,整体

Meta公司AI预测6亿蛋白质结构

ESM宏基因组图谱数据库包含6.17亿个蛋白质的结构预测。图片来源:ESM宏基因组图谱 谷歌旗下人工智能(AI)公司Deep Mind今年公布了2.2亿个蛋白质的预测结构,几乎涵盖了DNA数据库中已知生物的所有蛋白质。现在,另一个科技巨头正在填补蛋白质宇宙中的暗物质。 Meta公司(前

华为强势跨界入局-AI药物研发赛道火热

  提到人工智能时,大多数人想到的是科幻小说中有知觉的智能机器人,现代科学虽然尚未破解这种机器人的奥妙,但是却发现了AI技术可以应用于新药研发领域。  近日,华为发布了“华为云盘古”药物分子大模型,这是华为进军AI辅助药物研发领域的最新突破。  华为官方表示,“盘古药物分子大模型”共学习了17亿个药

科学实践中人工智能到底是什么

陈小平人工智能(AI)到底是什么?对当前产业升级有什么作用?与人类的关系将如何发展?这些问题众说纷纭,莫衷一是。通过对AI的科学基础、科学内涵、科学成果和实际应用四方面的梳理发现,科学实践中的AI主要是经典人工智能,它将在15年内推动大面积、颠覆性创新的产业落地。经典人工智能的科学基础和科学内涵通常

​一项疫苗保护力指标提升128倍!

经过人工智能(AI)大模型的设计优化,疫苗序列的两个体现保护力的最重要指标分别比传统基准序列提升了128倍和20倍!5月3日,国际顶级学术期刊《自然》以少有的“预览版快车道”,上线了上海生物医药企业斯微生物与百度美国研究院等机构合作的论文。他们首次将AI用于mRNA疫苗开发,并通过生物实验验证了优化

AI语言模型“提速”药物发现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502762.shtm美国麻省理工学院和塔夫茨大学研究人员设计出一种基于大型语言模型(如ChatGPT)的人工智能算法,这种称为ConPLex的新模型可将目标蛋白与潜在的药物分子相匹配,而无需执行计算分子结

Nature子刊:省时,省钱,又精准!药物研发AI法开创

  中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在 Nature 子刊 Nature Computational Science 上发表了题为:Computing Relative Binding Affinity of Ligands Based on a Pairwise Binding Compari

深度学习“见顶”不等于AI寒冬

   尽管新的算法模型在推动AI向前发展,但并不意味着它们的前景可以预见,也不意味着深度学习“不可救药”。  在当前的第三次人工智能(AI)浪潮之中,深度学习算法被认为是迄今为止“最为重大的AI革命”。此说法或许有所夸大,但深度学习对这一轮AI的大爆发而言的确功不可没。然而,最近以来,关于深度学习算

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,

AI驱动的蛋白质设计

  扩散模型已被证明在图像和文本生成中很有用,而且似乎也适用于蛋白质设计。然而,这类模型目前的成功率并不高;产生的序列基本不能折叠成目标结构。而近期,由《自然》(Nature)发表的一篇论文描述了一种能设计新蛋白质的深度学习方法,名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion

AI再添一成就--AlphaFold蛋白结构预测击败人类

  讲到人工智能(AI),可能在大多数人脑海里首先想到的是谷歌的AlphaGo。2017年围棋人机大战仿佛就在昨天,世界排名第一的天才围棋少年柯洁败北绝望痛哭“我赢不了”。人工智能让人类真真切切的感受到了自己的强大。  而在生命科学领域,AlphaGo的“孪生兄弟”AlphaFold也让世界为之颤抖

C++排序库首次更改:人工智能改进编程语言

英国深度思维公司的人工智能体“阿尔法开发”(AlphaDev),已被证明能发现并改进C++(一种常用的计算机编程语言)库里广泛使用的计算机排序算法。《自然》7日刊登的这些人工智能(AI)生成的算法已被整合到C++排序库,这也是10多年来对这部分库作出的首次更改。       研究团队使用“Alpha

AI设计新蛋白质再现突破,生成在拓扑结构

  《自然》杂志11日发表的论文描述了一项结构生物学新突破:一种能设计新蛋白质的深度学习方法,名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion)。其能生成各种功能性蛋白质,包括在天然蛋白质中从未见过的拓扑结构。  研究示意图(部分)  深度学习推动了蛋白质结构的预测和设计,但仍

《科学》公布2021年度十大科学突破!

北京时间17日,《科学》网站公布了2021年度十大科学突破评选结果。让我们一起来看看今年科学界都有哪些重大成果。 1、人工智能预测蛋白质结构 今年7月,世界知名人工智能团队深度思维宣布,已经利用AI智能软件程序——阿尔法折叠预测了人类表达的几乎所

《科学》公布2021年度十大科学突破!

北京时间17日,《科学》网站公布了2021年度十大科学突破评选结果。让我们一起来看看今年科学界都有哪些重大成果。 1、人工智能预测蛋白质结构 今年7月,世界知名人工智能团队深度思维宣布,已经利用AI智能软件程序——阿尔法折叠预测了人类表达的几乎所

预测材料结构与特性可以预测,AI帮大忙

美国加州大学圣地亚哥分校工程学院的纳米工程师开发了一种人工智能(AI)算法,可几乎即时地预测任何材料(无论是现有材料还是新材料)的结构和动态特性。此项研究成果28日发表在《自然·计算科学》杂志上。 该算法被称为M3GNet,用于开发Matterverse.ai数据库,该数据库包含超过3100万种

百奥几何获千万美元天使轮融资,驱动大分子药物研发

AI大分子制药公司百奥几何已完成千万美元天使轮融资,投资方为高榕资本;另外,团队也发布了首个针对大分子药物研发的开源机器学习平台TorchProtein。据介绍,百奥几何成立于2021年,致力于开发几何深度学习、深度生成模型等下一代人工智能技术,用于大分子药物研发。目前,公司正打造人工智能大分子药物

大难题告破,蛋白质3D结构可用AI解析

  DeepMind关于确定蛋白质3D形状的深度学习技术,可能将在生物学界掀起一场新的变革。图中蓝色为计算机预测的蛋白质结构,绿色为实验验证结果,二者相似度非常高。(图片来源:DeepMind) 生物学界最大的挑战之一——蛋白质三维结构解析如今有望被破解。借由深度学习程序AlphaFold,谷歌

“AI+”时代-|-AI“解码”免疫系统

  人体免疫系统包含了很多有关身体健康的信息,其中的关键部分就包含在血液中。医学界提出了一个大胆设想:通过创建一个万能的血液测试,采集免疫系统与病原体之间的反应信息,绘制“免疫图谱”,从而解码免疫系统中的信息,及时在疾病恶化前筛查确诊。那么,什么样的平台能提供足够的计算力,不断通过机器学习和精准模型