我国科学家首创蛋白质动态结构AI建模方法

科技日报记者 刘园园 西湖大学12月8日公布,该校人工智能(AI)讲席教授李子青团队与厦门大学、德睿智药合作,首创研发了能够刻画蛋白质构象变化与亲和力预测的AI模型——ProtMD。 这是第一个尝试解析蛋白质动态构象的人工智能方法,可辅助药物化学专家更加精准地筛选出高活性小分子,从而加速临床前药物研发。相关研究成果发表在《尖端科学》期刊。 李子青介绍,此前谷歌旗下公司研发的“阿尔法折叠2”能够利用人工智能准确预测蛋白质的三维结构,对结构生物学、药物设计乃至整个科学界都产生了巨大影响。但“阿尔法折叠2”只能预测蛋白质在一个瞬间的静态结构,尚未能解决蛋白质结构动态变化的预测。 李子青团队此次开发的AI模型,给定药物分子和靶点蛋白,可预测药物分子与生物体内靶点蛋白质结合(柔性对接)后蛋白质结构的变化过程,推断药物与靶标蛋白结合的稳定性,预测药物功能,从而提升AI药物设计的精度和效率。 研究团队首先从57651个人类蛋白结构中选取具有代......阅读全文

我国科学家首创蛋白质动态结构AI建模方法

科技日报记者 刘园园 西湖大学12月8日公布,该校人工智能(AI)讲席教授李子青团队与厦门大学、德睿智药合作,首创研发了能够刻画蛋白质构象变化与亲和力预测的AI模型——ProtMD。 这是第一个尝试解析蛋白质动态构象的人工智能方法,可辅助药物化学专家更加精准地筛选出高活性小分子,从而加速临床前药物研

“博依特杯”中新大学生工艺AI建模大赛启动

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488445.shtm 大赛发布现场。主办方 供图 俄罗斯工程院外籍院士刘焕彬为大赛启动作分享。主办方 供图 参会嘉宾合影。主办方 供图 大赛智库专家组成员。主办方 供图

癌症治疗新曙光:癌症建模

  现在科学家们将患者的肿瘤细胞接种到小鼠体内,进而建立肿瘤模型,以用于分析和开展药物测试。目前研究人员已鉴定了一系列小儿实体肿瘤模型,同时相关数据的允许免费获取。  罕见癌症的研究面临着两方面的挑战:可用的肿瘤样本少;缺乏相应的小鼠模型。最近科学家们非常成功地开发了将人类肿瘤细胞高效移植到免疫缺陷

大脑发育的神经网络建模

  本周《自然》发表的两篇研究Assembly of functionally integrated human forebrain spheroids和Cell diversity and network dynamics in photosensitive human brain organoi

Nature:新的建模预测GDP提高

  据英国《自然·物理学》杂志30日在线发表的一项最新研究,欧洲科学家团队详细介绍了一种预测国内生产总值(GDP)的新方法,将经济增长视为一套物理系统,通过复杂系统物理建模对产品出口数据进行分析,并预测该系统的动态。新方法可以补充国际货币基金组织(IMF)的预测,准确度甚至更优。  GDP是指一个国

全球开展人脑建模大型研究合作

  仿照物理学家组建大型项目搜寻新粒子的方式,神经科学家也在国际合作道路上迈出了重要一步。据《自然》杂志官网19日报道,国际脑实验室(IBL)当日宣布成立,来自美国和欧洲的21家国际一流脑科学实验室加入,在建立大脑作用“标准模型”方面开展大型合作。英国维尔康信托基金会和美国西蒙斯基金会将在未来5年出

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,

AI驱动的蛋白质设计

  扩散模型已被证明在图像和文本生成中很有用,而且似乎也适用于蛋白质设计。然而,这类模型目前的成功率并不高;产生的序列基本不能折叠成目标结构。而近期,由《自然》(Nature)发表的一篇论文描述了一种能设计新蛋白质的深度学习方法,名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion

武大两学子获美国数学建模大奖

  昨日(4月24日)获悉,2013年美国大学生数学建模竞赛成绩日前揭晓,武汉大学计算机学院2010级弘毅班学生童文竹获得特等奖提名奖,2011级仿真科学与技术专业本科生郭庆荣获得一等奖。   作为数学建模领域内的国际性权威赛事,该赛事每年吸引了包括哈佛大学、麻省理工学院、北京大学、清华大学等著名

PNAS:基因调控网络建模研究获进展

  近日,国际学术期刊《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果,提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型,将基因调控网络的建模研究从编码基因推进

空间天气建模973项目启动

  6月8日,国家重点基础研究发展计划(973计划)项目——“基于子午工程和双星计划的地球空间天气数值预报建模研究”启动会在中国科学院国家空间科学中心召开。科学技术部基础研究司司长张先恩、中国科学院高技术研究与发展局副局长于英杰、国家自然科学基金委员会地球科学部处长于晟、国家空间科学

AI能“构想”新蛋白质结构

科技日报北京12月2日电 (实习记者张佳欣)半个世纪以来,科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战,难倒了几代科学家。但现在,人工智能(AI)解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文,包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种

AI教育风潮席卷中国高校-学生用AI学AI

  “What does this machine do(这台机器是干什么的)?”4日下午,西南交通大学孟加拉国留学生Zahidul Alam拍下身前吊弦疲劳试验仪器的照片。收到他的语音提问后,手机中的24小时在线“AI学伴”瞬间给出如论文般详细的英文回答。  这是西南交大首门人工智能通识课的第一课

如何利用CAD对摇床三维建模

  摇床主要由床在、机架和传动机构三大部分组成,以下分别对各组成设备进行建模设计。打开并运行AutoCAD2000软件,进入AutoCAD2000操作界面。    首先进行的摇床床面的建模设计,移动ucs坐标到界面中间合适位置,在命令行输入Line命令,输入相应坐标数字以建立一个梯形图形,然后在命令

动物基因“建模”-微米乾坤里的“中国创造”

  那是个带“发卡”的姑娘,“酶少爷”回忆:“她的发卡摄人心魄,我忍不住追过去,拥她入怀。”  彼时,发卡姑娘正被“双螺旋”纠缠。“别怕!”“酶少爷”利落挥剑,DNA双螺旋就此解体、断裂,咔咔声不断。  这个桥段,是用来形象地比喻上古时代细菌基因组的免疫记忆。“瓦解噬菌体、病毒的入侵”,百科资料显示

Maxwell如何对磁滞材料进行建模(二)

3.激活磁滞模型解决方案二1.按常规方法输入材料的平均磁化曲线,并设置X,Y,Z为02.Core Loss Model> Hysteresis Model3.自动打开B-H曲线,输入Hci参数至此两种磁滞材料建模方法介绍完毕。

Maxwell如何对磁滞材料进行建模(一)

问题描述磁滞现象是铁磁材料的固有属性,电机、变压器使用的硅钢片属于软磁材料,剩磁与矫顽力都比较小,所以在电机设计过程中一般使用其平均磁化曲线,磁滞损耗包含在铁耗中,根据斯坦梅茨方程拟合计算其铁耗,这对电机、变压器稳态运行影响较小,但是在特殊工况下,磁滞现象会产生不良影响或者利用其特性开发新的产品。针

如何利用CAD对摇床三维建模

    摇床主要由床在、机架和传动机构三大部分组成,以下分别对各组成设备进行建模设计。打开并运行AutoCAD2000软件,进入AutoCAD2000操作界面。    首先进行的摇床床面的建模设计,移动ucs坐标到界面中间合适位置,在命令行输入Line命令,输入相应坐标数字以建立一个梯形图形,然后在

AI设计出具非凡结合强度蛋白质

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514540.shtm 一种使用深度学习方法设计出来的新蛋白质。图片来源:华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所美国科学家借助机器学习软件,创建出一批具有非凡结合强度的蛋白质分子。这些分子与包括人类激素

用AI识别AI:西湖大学研究可检测AI生成文本

虚假新闻、恶意产品评论、剽窃……ChatGPT、 GPT-4等AI大语言模型的应用带来便利,但其误用也带来一系列问题。西湖大学工学院张岳教授的“文本智能实验室”日前发布的一项研究提出一种高准确率、高速、低成本、通用的新文本检测方法——Fast-DetectGPT,无需训练即可识别各种AI大语言模型生

ChatGPT的拷问:何为AI伦理、AI治理

前不久,AI聊天机器人程序ChatGPT席卷全球,完成了AI第一次大规模的自传播。作为人工智能领域的现象级应用,ChatGPT可能引发的信任、责任、伦理、法律等问题也很快引发各界关注与担忧。近年来,不少关于人工智能(AI),并和人类生产、生活关系紧密的议题被广泛讨论,诸如“如何应对AI可能对社会产生

ChatGPT的拷问:何为AI伦理、AI治理

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494707.shtm   前不久,AI聊天机器人程序ChatGPT席卷全球,完成了AI第一次大规模的自传播。作为人工智能领域的现象级应用,ChatGPT可能引发的信任、责任、伦理、法律等问题也很快引发各

“AI+”时代-|-AI“解码”免疫系统

  人体免疫系统包含了很多有关身体健康的信息,其中的关键部分就包含在血液中。医学界提出了一个大胆设想:通过创建一个万能的血液测试,采集免疫系统与病原体之间的反应信息,绘制“免疫图谱”,从而解码免疫系统中的信息,及时在疾病恶化前筛查确诊。那么,什么样的平台能提供足够的计算力,不断通过机器学习和精准模型

首次在大脑中看到记忆构建模块

  终于,人们在小鼠大脑中看到了构成记忆的潜在主要构建模块。  人脑中有细胞,啮齿类动物也是如此,这些细胞能够跟踪人们的位置以及记录人们旅行了多远。当小鼠休息时,这些神经元据了解会依次发光,就像是这种动物在意识上回顾其路径,这一过程或有助于记忆形成,法国马赛市地中海神经生物学研究所的Rosa Cos

近红外光谱仪怎样创建模型

不管是定性还是定量模型,都要收集大量样品的近红外图谱,然后给他们能赋予一个属性,再用化学计量软件去建模

首届中国青年汽车研发仿真建模大赛启动

5月14日,以“慧聚青年新工匠、新质数字逐梦行”为主题的首届中国青年汽车研发仿真建模大赛(以下简称大赛)启动仪式在北京经开区举办。活动由中国青年创业就业基金会、国家新能源汽车技术创新中心(以下简称国创中心)共同主办,中国汽车研发软件产业创新联盟承办。中国青年汽车研发仿真建模大赛启动仪式据介绍,本届大

加在北极建模拟温室为太空种菜积累经验

  在火星、月球上建立科学研究基地,是人类长期以来的梦想。这既需要投入大量的资金,也需要各种技术的突破。宇航员在其他星球上要长期生活,吃上可口的饭菜可能是第一需要。加拿大科学家正在为此做着不懈的努力。     2002年,加拿大宇航局研究人员就开始在位于北极极地的加拿大迪温岛上建立

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百奥几何获千万美元天使轮融资,驱动大分子药物研发

AI大分子制药公司百奥几何已完成千万美元天使轮融资,投资方为高榕资本;另外,团队也发布了首个针对大分子药物研发的开源机器学习平台TorchProtein。据介绍,百奥几何成立于2021年,致力于开发几何深度学习、深度生成模型等下一代人工智能技术,用于大分子药物研发。目前,公司正打造人工智能大分子药物

生成式AI设计出非天然蛋白质

  加拿大多伦多大学研究人员开发了一种人工智能系统,可以使用生成扩散来创建自然界中不存在的蛋白质。该系统有望使治疗蛋白的设计和测试更加高效和灵活,从而加速人类药物开发。研究发表在最新一期《自然·计算科学》杂志上。  蛋白质由氨基酸链组成,氨基酸链折叠成的三维形状反过来又决定了蛋白质的功能。这些折叠的