中枢神经系统肿瘤快速分类新技术

荷兰科学家研究报道了一种给中枢神经系统肿瘤快速分类的技术,结合快速测序和深度学习AI模型,或能在不到90分钟内完成分子诊断。相关研究近日在线发表于《自然》。研究结果显示术中进行肿瘤分子诊断以辅助手术决策的潜在可行性。 中枢神经系统肿瘤的主要治疗方式包括通过手术摘除肿瘤,这要求在经过谨慎考虑后,在清除肿瘤组织的同时最大程度降低神经系统损伤等并发症的风险。目前的标准流程依赖术前成像和术中组织学分析,但这些方法有时无法给出最终结论,偶尔也不准确。通过DNA测序获得甲基化图谱或揭示关于肿瘤起源和预后的信息,但一般要好几天才能出结果。 为了快速获得DNA甲基化图谱,从而实现术中诊断,Jeroen de Ridder和同事使用了纳米孔测序技术。该技术速度更快,但产生数据覆盖的遗传位点不如传统测序技术多。为了在这么少的数据下实现中枢神经系统肿瘤的分子分类,研究团队开发了名为“Sturgeon”的神经网络工具。 在用模拟数据对该工具进......阅读全文

中枢神经系统肿瘤快速分类新技术

  荷兰科学家研究报道了一种给中枢神经系统肿瘤快速分类的技术,结合快速测序和深度学习AI模型,或能在不到90分钟内完成分子诊断。相关研究近日在线发表于《自然》。研究结果显示术中进行肿瘤分子诊断以辅助手术决策的潜在可行性。  中枢神经系统肿瘤的主要治疗方式包括通过手术摘除肿瘤,这要求在经过谨慎考虑后,

DNA测序技术的分类介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。  根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同

再创纪录!AI系统可诊断近100种脑癌

今日,《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作,联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章,他们开发了一个超级AI系统,该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据,可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是,这个AI系统还能自学成才,发现

Illumina牵头制定DNA测序肿瘤临床检测规范

  Illumina联合娜法伯癌症中心、弗雷德哈钦森癌症研究中心、MD安德森癌症中心、纪念斯隆凯特林癌症中心,宣布成立AGC(规范基因组联盟)联合机构,指导下一代测序技术在肿瘤临床诊断中的应用。  他们的目标是定义什么是“癌症专属基因组”,即到底那些变异是癌症真正特有的,由此肿瘤学家和病理学家可以确

AI语言模型“提速”药物发现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502762.shtm美国麻省理工学院和塔夫茨大学研究人员设计出一种基于大型语言模型(如ChatGPT)的人工智能算法,这种称为ConPLex的新模型可将目标蛋白与潜在的药物分子相匹配,而无需执行计算分子结

PNAS:新技术实现纳米孔内快速测序DNA

  据《每日科学》近日报道,由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术,可在纳米孔内对DNA进行快速测序,而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图,提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)。  论文主要作者

DNA测序

                自动测序法 双脱氧链末端终止法 非同位素银染 鸟枪法 Maxam-Gilbert化学修饰法             实验方法

DNA测序

DNA测序(主要内容如下)·         Sequencing Gel Preparation·         Preparation of Templates ·         DNA Sequencing by the Dideoxy Method·         DNA Sequen

DNA测序

实验方法原理 ABI  PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DN

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

DNA测序PCR测序反应

  1. 取0.2 ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  BigDye Mix 1 μl 1 μl  待测的质粒DNA 1 μl -  pGEM-3Zf (+) 双链DNA - 1 μl  待测DNA的正向引物 1 μl -  M13(

DNA测序的测序原理

DNA测序的测序原理是:利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸

再登Nature-GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...1

再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现,许多扩增的原ai基因,并不只是位于染色体,而且还能变成游离的染色体外DNA(ecDNA),并出现大量拷贝,而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在,即eccDNA(染色体外环状DNA

肿瘤动物模型建立实验——诱发性肿瘤动物模型

肿瘤动物模型的建立可应用于:(1)评价抗肿瘤免疫治疗的疗效;(2)作为抗肿瘤药物筛选模型;(3)为肿瘤转移研究提供更好的研究平台;(4)为研发抗肿瘤转移性药物提供良好的实验工具。实验方法原理诱发性肿瘤动物模型是指研究者用化学致癌剂、放射线、致癌病毒诱发动物的肿瘤等。实验材料肿瘤细胞小鼠试剂、试剂盒无

肿瘤动物模型建立实验——自发型肿瘤动物模型

实验方法原理自发性肿瘤动物模型是指未经人为处理;自然发生的肿瘤动物模型,主要有自发性乳腺癌模型和自发性白血病模型。实验材料C3H小鼠A系小鼠CBA小鼠试剂、试剂盒受试药仪器、耗材记号笔脚规实验步骤一、自发性乳腺癌小鼠模型类型 1.  C3H小鼠:繁殖用雌鼠自发性乳腺癌发生率为85%~100%。 2.

DNA测序仪

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今dna序列分析的主流。美国peabi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型

DNA测序仪

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一

DNA测序技术

目前还有一种基于半导体芯片的新一代革命性测序技术——Ion Torrent。该技术使用了一种布满小孔的高密度半导体芯片, 一个小孔就是一个测序反应池。当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸中的DNA链上时,会释放出一个氢离子,反应池中的PH发生改变,位于池下的离子感受器感受到H+离子信号,H+离子信号再直

DNA测序市场

DNA测序市场:快照  DNA 测序预计将在 2021-2031 年的预测期内显示出有希望的增长,因为它在微阵列和其他分析方法等各种应用中的执行。DNA测序具有成本效益,具有很高的准确性和速度,甚至可以从低样本中得出输出。DNA测序技术已经从第一代升级到第三代。DNA 测序系统因其功能而受到关注,可

ChatGPT之父:巨型AI模型时代已结束

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498735.shtm ·山姆·奥特曼表示,新的进步不会来自于让模型变得更大,“我认为我们正处于巨型模型时代的末尾”。他的说法表明,GPT-4可能是OpenAI“使模型更大并为其提供更多数据”战略中的最

华为发布大模型时代AI存储新品

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504751.shtm

模拟芯片大幅削减AI模型运行能耗

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507457.shtm

模拟芯片大幅削减AI模型运行能耗

  模拟计算机芯片运行人工智能(AI)语音识别模型的效率是传统芯片的14倍,有可能为AI研究中巨大且不断增长的能源消耗以及全球范围内通用数字芯片短缺问题提供解决方案。  这一新产品由IBM Research开发,概述这项工作的论文发表于《自然》。研究人员声称,模拟芯片可以减少人工智能发展的障碍。  

Science:谷歌AI新模型预测天气快又准

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512459.shtm编译 | 辛雨 图片来源:Carlos Munoz Yague 人工智能(AI)公司Google DeepMind开发的机器学习模型GraphCast,在“3至

AI大模型“源”炼造客服大脑

  2018年至今,NLP领域经历了非常大的变化,Transformer、ELMO、BERT、GPT-3,再到最近的ChatGPT(GPT 3.5的微调)的突破,NLP在预训练大模型的暴力拆解路上越走越远,这也让各行业开始相信:很多之前无法做到的场景、效果,现在可以有新的解法和落地。  智能客服,是

快速的DNA测序仪正带来简单的癌症血液检测

  中国(相关)的一切都很大,包括它的癌症问题。在一些富裕的城市,如北京,癌症被认为是最常见的杀手。空气污染,吸烟率高,以及因工业污染而造成的“癌症村”,正在增加这个国家的死亡率。它的肝癌发生率是西方国家的四倍,部分原因在于每14个中国人中就有一个携带乙肝病毒,全世界每年死于癌症的人中,大约有27%

Nature故事:他用DNA测序技术,让百年肿瘤“变废为宝”

  在伦敦大奥蒙德街儿童医院地下室的档案库里,存放着一些“宝贵”病历。癌症研究人员Sam Behjati希望能够利用这些资源开启未来的研究。5月2日,他和他的同事发表了一些成果,这些成果来自前个世纪3份儿童肿瘤样本的基因组序列。这则故事也于5月11日被Nature网站报道。  这些有历史意义的细胞有

DNA测序技术的测序规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

简述DNA测序的测序规律

  生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。  由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。  在可以区分长度仅

DNA测序仪pcr测序反应

  pcr测序反应  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  bigdye mix 1μl 1μl  待测的质粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl  待测dna的正向引物 1μl -