中枢神经系统肿瘤快速分类新技术

荷兰科学家研究报道了一种给中枢神经系统肿瘤快速分类的技术,结合快速测序和深度学习AI模型,或能在不到90分钟内完成分子诊断。相关研究近日在线发表于《自然》。研究结果显示术中进行肿瘤分子诊断以辅助手术决策的潜在可行性。 中枢神经系统肿瘤的主要治疗方式包括通过手术摘除肿瘤,这要求在经过谨慎考虑后,在清除肿瘤组织的同时最大程度降低神经系统损伤等并发症的风险。目前的标准流程依赖术前成像和术中组织学分析,但这些方法有时无法给出最终结论,偶尔也不准确。通过DNA测序获得甲基化图谱或揭示关于肿瘤起源和预后的信息,但一般要好几天才能出结果。 为了快速获得DNA甲基化图谱,从而实现术中诊断,Jeroen de Ridder和同事使用了纳米孔测序技术。该技术速度更快,但产生数据覆盖的遗传位点不如传统测序技术多。为了在这么少的数据下实现中枢神经系统肿瘤的分子分类,研究团队开发了名为“Sturgeon”的神经网络工具。 在用模拟数据对该工具进......阅读全文

DNA测序仪:454测序仪

454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了

DNA测序仪pcr测序反应

  pcr测序反应  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  bigdye mix 1μl 1μl  待测的质粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl  待测dna的正向引物 1μl -  

DNA测序技术的测序原理

化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物

DNA测序的测序原理介绍

  化学修饰法测序原理  化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。  Sanger法测序的原理  就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定

DNA测序——自动测序法

DNA测序可用于:(1)测定未知序列;(2)确定重组DNA的方向与结构;(3)对突变进行定位和鉴定比较研究。实验方法原理ABI  PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单

用AI生成数据训练AI或导致模型崩溃

  《自然》24日正式发表的一篇研究论文指出了一个人工智能(AI)严重问题:用AI生成的数据集训练未来几代机器学习模型,可能会严重“污染”它们的输出,这被称为“模型崩溃”。研究显示,原始内容会在9次迭代以后,变成不相关的“胡言乱语”(演示中一个建筑文本最终变成了野兔的名字),这凸显出使用可靠数据训练

用AI生成数据训练AI或导致模型崩溃

科技日报北京7月25日电 (记者张梦然)《自然》24日正式发表的一篇研究论文指出了一个人工智能(AI)严重问题:用AI生成的数据集训练未来几代机器学习模型,可能会严重“污染”它们的输出,这被称为“模型崩溃”。研究显示,原始内容会在9次迭代以后,变成不相关的“胡言乱语”(演示中一个建筑文本最终变成了野

全球最大结直肠癌多组学研究:如何让疾病分类更准确

·“在AI多组学模型建立的过程中通过深度学习可以判断出一个符合预期的结果,但这个结果具体是由什么机制推导出来的AI并不能给出特别具体的答案,也就是所谓的‘黑箱’,如果没有科学性的预测依据,可能结果不能完全令人信服。”准确的疾病分类能够帮助医生对病人的病情、治疗手段以及预后(即预估治疗结果)进行快速和

再登Nature-GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...1

再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现,许多扩增的原ai基因,并不只是位于染色体,而且还能变成游离的染色体外DNA(ecDNA),并出现大量拷贝,而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在,即eccDNA(染色体外环状DNA

肿瘤动物模型建立实验——诱发性肿瘤动物模型

肿瘤动物模型的建立可应用于:(1)评价抗肿瘤免疫治疗的疗效;(2)作为抗肿瘤药物筛选模型;(3)为肿瘤转移研究提供更好的研究平台;(4)为研发抗肿瘤转移性药物提供良好的实验工具。实验方法原理诱发性肿瘤动物模型是指研究者用化学致癌剂、放射线、致癌病毒诱发动物的肿瘤等。实验材料肿瘤细胞小鼠试剂、试剂盒无

肿瘤动物模型建立实验——自发型肿瘤动物模型

实验方法原理自发性肿瘤动物模型是指未经人为处理;自然发生的肿瘤动物模型,主要有自发性乳腺癌模型和自发性白血病模型。实验材料C3H小鼠A系小鼠CBA小鼠试剂、试剂盒受试药仪器、耗材记号笔脚规实验步骤一、自发性乳腺癌小鼠模型类型 1.  C3H小鼠:繁殖用雌鼠自发性乳腺癌发生率为85%~100%。 2.

释放AI大模型促消费潜力

  今年的《政府工作报告》提出持续推进“人工智能+”行动,旨在抓住人工智能技术突破机遇,使我国数字技术与制造优势、市场规模优势充分结合,推动人工智能大模型广泛应用,真正赋能千行百业、走进千家万户。在构建新发展格局战略背景下,AI大模型在激活内需市场、促进消费升级等方面充满“模”力。  随着人工智能技

AI视频生成模型Sora来了

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517625.shtm

AI模型助力精准诊断冠心病

近日,由上海市第一人民医院与联影智能的一项研究开发并验证一款可自动量化心肌血流状况的CT心肌灌注成像深度学习模型,辅助医生准确诊断患者心肌缺血程度,其衍生的缺血心肌体积百分比指数可作为预测不良心血管事件(以下简称MACE)发生概率的重要参考,能帮助医生预判患者发病几率,进而制定个性化治疗方案。相关论

欧盟廉价快速DNA基因组测序与解码技术获得突破

  欧盟第七研发框架计划(FP7)提供220万欧元资助,总研发投入290万欧元,由欧盟6个成员国及联系国塞尔维亚(总协调)、德国、英国、爱尔兰、瑞士和以色列跨学科科研人员组成的欧洲NANODNASEQUANCING研发团队。历时3年多的研发创新活动终于修成正果,即廉价快速的DNA基因组测序与解码技术

测序-100-万肿瘤-DNA!液体活检新锐获投-3.6-亿美元

  5月12日,世界领先的综合性液体活检公司之一 Guardant Health 宣布了一项雄心勃勃的目标,即在五年内对一百多万名癌症患者的肿瘤 DNA 进行测序。Guardant Health 预计这些来自“Guardant 1 Million”项目的数据可以推动癌症持续护理的根本性进步,并加速基

《自然》封面:以AI生成数据训练AI,模型变傻?

  大模型有许多“崩”的时候,但有一种崩溃叫做“自毁前程”——  近日,《自然》发表在封面的一篇论文指出,用AI生成的数据集训练未来几代机器学习模型,可能会“污染”它们的输出。这项由英国牛津大学、剑桥大学、帝国理工学院、加拿大多伦多大学等多所高校联合开展的研究显示,原始内容会在数代内变成不相关的“胡

《自然》封面:以AI生成数据训练AI,模型变傻?

大模型有许多“崩”的时候,但有一种崩溃叫做“自毁前程”——近日,《自然》发表在封面的一篇论文指出,用AI生成的数据集训练未来几代机器学习模型,可能会“污染”它们的输出。这项由英国牛津大学、剑桥大学、帝国理工学院、加拿大多伦多大学等多所高校联合开展的研究显示,原始内容会在数代内变成不相关的“胡言乱语”

DNA测序自动测序法简介

  基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一

DNA测序技术的测序的规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

DNA测序454-焦磷酸测序简介

  该方法在油溶液包裹的水滴中扩增DNA(即emulsion PCR),每一个水滴中开始时仅包含一个包被大量引物的磁珠和一个链接到微珠上的DNA模板分子(控制DNA浓度出现的大概率事件)。将emlusion PCR产物加载到特制的PTP板上,板上有上百万个孔,每个微孔只能容纳一个磁珠。DNA Pol

中枢神经兴奋剂的分类

  在常规用量时,本类药物对中枢神经系统不同部位具有一定的选择性作用。根据其主要用部位可分为三类:  ①主要兴奋大脑皮层的药物,能提高大脑皮层神经细胞的兴奋性,促进脑细胞代谢,改善大脑机能,代表药物是咖啡因等;  ②主要兴奋延脑呼吸中枢的药物,能兴奋延髓呼吸中枢。直接或间接作用于该中枢,增加呼吸频率

基因测序肿瘤检测

临床医生在肿瘤治疗中发现,人体肿瘤千差万别,即使是同一个部位的肿瘤,治疗效果和方法也应因人而异,这种因人、因病而采取的不同疾病治疗方法称为“个体化治疗”。因此在癌症治疗过程中,只有同病异治,因人而异,实施个体化治疗,才能针对不同类型的病人选择合适他们的药物。下图中给出的是在乳腺癌中HER2基因的表达

DNA测序仪原理

abi prism 310型基因分析仪(即dna测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法),因此通过单引物pcr测序反应,生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单

DNA测序仪相关

  分析或打印出彩色测序图谱  上机操作按仪器操作说明书安装毛细管,进行毛细管位置的校正,人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管,1.2kv预电泳5min,按编程次序自动进样,再预电泳(1.2kv,20min),在7.5kv下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗,灌胶,进下一样品

DNA测序仪定义

  DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多

DNA测序的规律

  生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。  由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。  在可以区分长度仅

计算/DNA测序仪

测序反应精确度计算公式:100%-差异碱基数(不包括n数)/650×100%差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基,n为仪器不能辨读的碱基。

什么是DNA测序?

DNA测序(DNA sequencing,或译DNA定序)是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤(G)的排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。在基础生物学研究中,和在众多的应用领域,如诊断,生物技术,法医生物学,

DNA测序的原理

  化学修饰法测序原理  化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。  Sanger法测序的原理  就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定