我国学者建成全球最大乳酸菌种质库
近日,内蒙古农业大学教授张和平带领团队建成全球最大、种类最全的原创性乳酸菌种质资源库,分离保藏乳酸菌47000余株,相关成果在线发表于《科学通报》(英文版)。 在人类历史中,60%的食物都与乳酸菌发酵有关。乳酸菌是最重要的微生物战略资源之一,被称为乳品工业的“芯片”。 “20世纪90年代前,我国乳酸菌资源缺乏收集保护及自主研发技术与能力,种质资源库建设滞后,国内乳品企业基本采用国外的菌种进行生产,制约着我国乳品行业和乳酸菌产业的健康发展。”张和平介绍。 经过30多年的努力,张和平带领团队建成了全球最大、种类最全的原创性乳酸菌种质资源库,入选2022年首批国家农业微生物种质资源库。 依托于该乳酸菌种质资源库,团队于2018年在国际上率先启动了“乳酸菌万株基因组计划”,基于已完成的11678株乳酸菌基因组数据及公共数据库中51900个乳酸菌基因组信息,团队创建了全球首个集乳酸菌基因组数据与功能研究于一体的共享平台——iL......阅读全文
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!
震惊!Genbank参考基因组序列多处错误! 随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。 近日,约翰霍
白菜甘蓝油菜全基因组序列测定
由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。 研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该
胡萝卜基因组序列草图成功绘出
来自美国的一个研究小组称,他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序,绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称,这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程,对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。 胡萝卜和生菜
新软件按需组装无缝基因组序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 (记者张梦然)美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰
于军研究员:揭秘人参的“生命蓝图”
“我们正在做人参的全基因组测序和基因表达谱的绘制,配合吉林省人参产业的新腾飞。我们首先要解决的关键问题包括种质资源调查、分子育种体系建立、农艺性状与环境的关系等。”11月9日,在赶赴长春的前夕,中科院北京基因组所副所长于军研究员接受了《科学时报》记者的独家专访,讲述了“中国人参基因组计划”的来龙
中国西南野生生物种质资源库接收第一批英国种子
中国西南野生生物种质资源库接收第一批英国种子 根据中国科学院和英国皇家植物园丘园的关于野生植物种质资源保护和研究的合作协议,中科院昆明植物研究所日前正式接收来自英国丘园千年种子库的第一批种子。此举标志着中国西南种质资源库的种子保存设施经过试运行阶段后正式启用。 作为国家重大科学工程项
“广东省热带亚热带植物种质资源库”通过项目验收
项目验收会现场 11月30日,广东省科技厅组织召开由中科院华南植物园任海研究员主持完成的“广东省热带亚热带植物种质资源库(2006-2008)”项目验收会。验收组由广东省农业科学院、华南师范大学、华南农业大学、广东省林业科学研究院等单位的专家组成。验收组认真听取了项目组工作总结报告
种质资源库管理系统软件能帮助用户完善种子管理工作
种质资源库管理系统软件是用于种质信息、中间材料信息、设备、设施管理、储藏管理以及出入库管理的专用软件,能够方便用户查询种子信息、录入种子信息,避免种子信息的混乱,以及流通过程数据的丢失,完善种子管理工作。 种质资源库管理系统软件可以对小麦、玉米、水稻等作物种质及中间材料等育种资源进行信
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群,包括为人类提供天然保健饮料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高级食用植物油的油茶(C. oleifera)以及观赏花卉云南山茶(C. reti
昆明植物所破译稻属植物5个物种全基因组
亚洲栽培稻(一般称为水稻)是世界上最重要的粮食作物之一,是中国第一大粮食作物,养活了80%以上的中国人口。在水稻与其它约23个物种共同组成的稻属植物中,它和7个稻种(普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展颖野生稻、长雄蕊野生稻和南方野生稻)都是AA基因组类型,这些水稻近缘物种间断分
千年基因应邀赴内蒙古农业大学就乳酸菌研究进行学术交流
4月17日,应内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主任张和平教授的邀请,千年基因项目总监于越及技术副总监张伟赴内蒙古农业大学开展乳酸菌研究的学术交流。 会议期间,千年基因技术副总监张伟博士首先向该校的乳酸菌研究人员介绍了千年基因在国内测序市场的绝对优势,其次与在场人员分享了
昆明植物所种质资源库在植物超低温保存机理研究方面获进展
原文地址:http://www.cas.cn/syky/202104/t20210406_4783734.shtml 超低温保存是在液氮(-196℃)中保存细胞、组织和器官的技术,广泛应用于动物、植物和微生物种质资源的长期保存。植物超低温保存通常与离体培养技术相结合,可以实现花粉、愈伤组织、
牡蛎全基因组序列图谱绘制完成
牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物 牡蛎养殖 近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,
中国新型冠状病毒的基因组序列
《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列(论文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示,该病毒与此前在
四篇Science文章公布最新基因组序列
小麦是全球最重要的粮食作物之一,提供了20%人类所需的热量。2010年英国科学家宣布他们绘制出了小麦基因组草图,但这一序列并不完整。在7月17日Science杂志上,两个研究组分别公布了Chinese Spring小麦品种的每个染色体臂的基因组序列,以及小麦染色体3B基因组序列,另外两个研究小组
《Genome-Research》:根据基因组序列预测MRSA毒性
微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型,与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性,破坏宿主细胞膜和粘附的能力,粘附到人体组织的能力,是许多细菌病原体的主要毒力因子,包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌,自从上世纪40
史上最全小麦基因组序列图集问世
据最新一期《自然》杂志报道,加拿大萨斯喀彻温大学领导的国际团队在一项对全球小麦生产具有里程碑意义的研究——10+基因组计划中,对代表全球育种计划的15个小麦品种的基因组进行了测序。这将使科学家和育种人员能够更快地识别出具有影响力的基因,从而提高小麦产量、害虫抗性和其他重要的农作物性状。 小麦
草鱼全基因组序列图谱绘制完成
近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一
昆明植物所解析核心十字花科植物的系统发育关系
十字花科(Brassicaceae或Cruciferae)植物约有351属3977种,是一个全球分布的自然类群,包括常见绿叶类蔬菜、油料作物油菜、园艺观赏植物香雪球等。该科有模式植物拟南芥,也是被子植物全基因组序列数据发表最多的科之一,为研究全基因组加倍、环境适应机制、基因功能进化等重要生物学问
特色香蕉种质的基因组研究取得新进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508028.shtm在国家重点研发计划、国家香蕉产业技术体系及广东省种业振兴等项目的资助下,广东省农业科学院副院长易干军领衔的香蕉遗传改良团队与广西大学教授陈玲玲团队合作,在特色香蕉种质的基因组研究方面取
小粒咖啡种质资源全基因组重测序解析获进展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474824.shtm 随着全球对特色咖啡需求的显著增加,开发市场需求高的咖啡品种是必不可少的。近日,中国科学院武汉植物园的科研人员,通过基因组重测序等方式发现的SNPs,或与咖啡中重要农艺性状的重要基
专家呼吁:用边际性土地资源发展生物质能源
国家发改委等部门制定的《可再生能源发展“十二五”规划》提出,到2015年,生物燃料乙醇利用量将达到400万吨,但2011年我国燃料乙醇产量仅为169万吨。发展生物燃料如何破解不与民争粮、不与粮争地,日前中科院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库副主任高立志博士接受采访时指出,大多数木本油料植
2019新冠病毒资源库发布
1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不
国家基因组科学数据中心发布2019新型冠状病毒资源库
1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不
我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制
4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱
科学家完成辣椒全基因组序列测定
由我国科技人员主导完成的“栽培种和野生种辣椒的全基因组测序揭示辣椒属的驯化与特异性”研究论文,今年3月在国际著名期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)刊发。该论文的正式发表,标志着辣椒基因组序列成功解码,我国辣椒基础性研究取得重大进展,进入分子育种阶段。 美国农艺学会主席、新墨西哥州立大学
蚕“姑娘”终于有了完整的基因组序列
西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列,并揭示鳞翅目昆虫W染色体起源与进化的新机制。日前,相关研究成果在线发表于《科学进展》。雌蚕。课题组供图雄蚕。课题组供图在昆虫中,性染色体组成以XX/XY系统为主,而鳞翅目昆虫性染色体组成与大部分昆虫不同,
科学家破译“纯种马”基因组序列
马有90多种遗传疾病与人类的遗传疾病相似 一个国际科研小组11月5日报告说,他们破译了“纯种马”的基因组序列。这项研究成果将刊登在6日出版的新一期《科学》杂志上。 报告中所指的“纯种马”最早是300多年前英国培育的一种名贵赛马品种,后被一些欧美和亚洲国家引进,主要用于赛马和马
首次测定南极抗冻鱼基因组序列
近,包括美国东北大学H. William Detrich教授在内的一个国际研究小组,首次测定了南极抗冻鱼(Antarctic notothenioid fish)的基因组序列。他说,这一突破性成果,将阐明动物对寒冷水域独特的进化适应性,将有助于揭示鱼类如何应对海水温度上升,由于气候变化,预计接下