天津工生所等解析出糖苷水解酶第120家族首个晶体结构

近日,中科院天津工业生物技术研究所与江苏大学、佐治亚大学合作,成功解析出糖苷水解酶第120家族的新型木糖苷酶和底物(木二糖)、产物(木糖)复合体的结构,该结构为糖苷水解酶第120家族首个解析的晶体结构。 此次解析的新型木糖苷酶是CAZy资料库中第120个水解酶家族的木糖苷酶(www.CAZy.org),以四聚体的型式存在。此次解析结果发现此木糖苷酶具有开放式的底物结合区,可水解较长链的底物。我所还进一步将相关的活性胺基酸依序进行了点突变并测试其活性,并推测出此木糖苷酶是利用D382和E405为催化胺基酸执行底物的催化,利用W113、Q289、K358、H360、W383和R450来辨认底物。 该研究为糖苷酶水解酶第120家族的研究和改造提供了坚实的基础,晶体结构的获得填补了GH120糖苷水解酶家族结构的空白;可以为分析催化活性区提供结构基础,以利于进一步阐明XylC的催化机理;同时可以为通过定点突变等方......阅读全文

无嘌呤嘧啶位点的定义

所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。

纤维素酶的组成与分类

纤维素酶是指能降解纤维素的一类酶的总称,是一个由多种水解酶组成的复杂酶系,主要来自于真菌和细菌。根据各酶功能的不同主要分为三类:1、葡聚糖内切酶(1,4-β-D-glucan  glucanohydrolase或endo-1,4-β-D-glucanase,E.C3.2.1.4,来自于真菌简称为EG

β半乳糖苷酶试验

β-半乳糖苷酶试验 原理:有的细菌可产生β-半乳糖苷酶,能分解邻硝基酚β-D-半乳糖苷(ONPG),而生成黄色的-硝基酚(O-nitrophenol),在很低浓度下也可检出。试剂:0.75MONPG溶液:取80mg溶于15ml蒸馏水中,在加入缓冲液(6.9gNaH2PO4,溶于45ml蒸馏水中,用3

烷基糖苷的性能特点介绍

  配伍性能好,能与各种离子型、非离子型表面活性剂复配产生增效作用  起泡性好,泡沫丰富细腻  溶解性好,耐强碱和电解质,有良好的增稠能力  与皮肤相溶性好,显著改善配方的温和性,无毒、无刺激、易生物降解

糖苷酶的作用机制

  N-糖基化是在内质网上由糖基转移酶催化,在内分泌蛋白和膜结合蛋白的天冬酰氨残基的氨基上结合寡糖的过程,即在粗面内质网的核糖体上合成蛋白肽链的同时,一旦形成天冬氨酸-Xaa-色氨酸-/丝氨酸(Asn-Xaa-Ser/Thr, Xaa为除脯氨酸外的所有氨基酸残基)三联序列子密码,即糖基化位点,才有可

氨基糖苷的不良反应

  氨基糖苷类抗生素主要不良反应是肾毒性和耳毒性。  1.耳毒性  耳毒性包括前庭功能障碍和耳蜗听神经损伤。前庭功能障碍表现为头昏、视力减退、眼球震颤、眩晕、恶心、呕吐和共济失调,其发生率依次为neomycin> kanamycin> streptomycin> gentamicin、amikaci

氨基糖苷的药理作用

  氨基糖苷类抗生素可起到杀菌作用,属静止期杀菌药。其杀菌作用具有如下特点:  1.杀菌作用呈浓度依赖性。  2.仅对需氧菌有效,尤其对需氧革兰阴性杆菌的抗菌作用强。  3.具有明显的抗生素后效应。  4.具有初次接触效应。  5.在碱性环境中抗菌活性增强。

关于烷基糖苷的基本介绍

  烷基糖苷是指用葡萄糖和脂肪醇合成的烷基糖苷(Alkyl Polyglucoside.简称APG),是指复杂糖苷化合物中糖单元大于等于2的糖苷,统称为烷基多糖苷(或烷基多苷)。一般情况下,烷基多苷的聚合度n在1.1~3的范围,R为C8~C16的烷基。APG常温下呈白色固体粉末或淡黄色油状液体,在水

氨基糖苷类的临床应用

  氨基糖苷类抗生素主要用于敏感需氧革兰阴性杆菌所致的全身感染。虽然近年来有多种cephalosporins和quinolones药物在临床广泛应用,但由于氨基糖苷类抗生素对铜绿假单胞菌、肺炎杆菌、大肠杆菌等常见革兰阴性杆菌的PAE较长,所以,仍然被用于治疗需氧革兰阴性杆菌所致的严重感染,如脑膜炎、

β果糖苷酶

实验方法原理β-D-呋喃果糖苷果糖水解酶,β-呋喃糖苷酶,转化酶,蔗糖酶。此酶水解 β-D-呋喃果糖苷中 β-D-呋喃果糖苷残基的非还原端,特别是蔗糖。这是早期生化研究中最热领域之一,Michaelis-Menten 等式就是来自于转化酶的反应。实验利用当蔗糖被切成葡萄糖和果糖的等克分子混合物时,平

β果糖苷酶

基本方案             实验方法原理 β-D-呋喃果糖苷果糖水解酶,β-呋喃糖苷酶,转化酶,蔗糖酶。此酶水解 β-D-呋喃果糖苷中 β-D-呋喃果糖苷残基的非还原端,特

其他类糖苷的相关介绍

  (1)环烯醚萜甙类(Iridoid g1ycosides)和裂环烯醚萜甙类(Secoiridoid glycosides)是由环烯醚单萜(Iridoids)衍生物与糖所成的甙类。广泛分布于植物界,尤以茜草科、玄参科、龙胆科、鹿蹄草科等为多,如地黄、栀子、玄参、龙胆、鹿蹄草等。目前已发现的在80种

β半乳糖苷酶试验

  β-半乳糖苷酶试验是检验主管技师考试辅导的部分内容,以下是医学教育网对这块内容的整理,希望对考生有所帮助:  β-半乳糖苷酶试验(ONPG试验)  (1)试剂:0.75M ONPG溶液。  (2)方法:从克氏双糖铁培养基上取菌,于0.25ml无菌生理盐水中制成菌悬液,加入一滴甲苯并充分振摇,使酶

简述氨基糖苷抗药性

  由于庆大霉素的大量生产、链霉素本身的毒性以及肠球菌逐渐对链霉素产生抗药性,使得庆大霉素全面的取代链霉素,成为青霉素合并疗法的首选药物。随著庆大霉素的广泛使用,肠球菌对庆大霉素的高度抗药性(MIC≧2000 μg/ml)也逐渐产生。如此一来,如果引起心内膜炎的肠球菌,对于链霉素及庆大霉素都有抗药性

关于龙葵碱糖苷的简介

  龙葵碱是一种胆甾烷类生物碱,是由葡萄糖残基和茄啶(solanidine)组成的一种弱碱性生物碱,又名茄碱、龙葵毒素、马铃薯毒素,分子式C45H73NO10。龙葵碱不溶于水、乙醚、氯仿,能溶解于乙醇,与烯酸共热生成茄碱(C27H43NO)及一些糖类。茄碱能溶解于苯和氯仿。龙葵碱存在于马铃薯、番茄及

碱基切除修复的用途

碱基切除修复(base-excision repair, BER)研究发现,所有细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能够特异性切除受损核苷酸上的N-β-糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。

金黄色葡萄球菌ClpP水解酶的分子机制

  上海药物所抗菌交叉团队研究人员针对金黄色葡萄球蛋白水解酶ClpP(SaClpP),开展水解功能的分子机制研究,继2011年在美国生物化学和分子生物学学会专业期刊《Journal of Biological Chemistry》上发表论文(J Biol Chem, 2011, 286, 3

细菌鉴定中的精氨酸双水解酶应如何测

答: 细菌的精氨酸双水解作用是将精氨酸经过两步水解,生成有机胺和无机氨。鉴定细菌的精氨酸试验,无论发酵菌还是非发酵菌,革兰阳性菌还是革兰阴性菌,测的都是精氨酸双水解酶,使用脱羧酶试验培养基。所以,赖氨酸脱羧酶,鸟氨酸脱羧酶和精氨酸双水解酶用同一种基础培养基,为Moeller配方或Falkow配方,均

β半乳糖苷酶的测定实验

实验方法原理 β-D-半乳糖苷半乳糖水解酶。乳糖+H2O → β-D-半乳糖+D-葡萄糖实验材料 β-半乳糖苷酶试剂、试剂盒 磷酸钾邻硝基苯基 β-D-半乳糖苷仪器、耗材 分光光度计实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」实验混合物:以 0.02 ml 酶溶液起始,然后 25℃ 下,在 405 nm

β半乳糖苷酶的测定实验

实验方法原理β-D-半乳糖苷半乳糖水解酶。乳糖+H2O → β-D-半乳糖+D-葡萄糖实验材料β-半乳糖苷酶试剂、试剂盒磷酸钾邻硝基苯基 β-D-半乳糖苷仪器、耗材分光光度计实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」实验混合物:以 0.02 ml 酶溶液起始,然后 25℃ 下,在 405 nm处吸收值升

β半乳糖苷酶的测定实验

基本方案             实验方法原理 β-D-半乳糖苷半乳糖水解酶。乳糖+H2O → β-D-半乳糖+D-葡萄糖 实验

天津工生所纤维素酶的晶体结构研究取得新成果

  中科院天津工业生物技术研究所郭瑞庭课题组在耐热纤维素酶的晶体结构及基因改造研究上获得阶段性重要进展。  纤维素酶已经广泛应用于处理不同含有碳水化合物的物质。海栖热孢菌中纤维素酶12A属于糖苷水解酶的第十二个家族。它是一个内切葡聚糖酶可以藉由切割b-1,4糖苷键而达到降解纤维素分子

生物分子学中GUS什么意思

应该是指的GUS基因,在植物样品中很常用的一个报告基因。GUS基因就是β-葡萄糖苷酸酶基因 。该基因产物为β-葡萄糖苷酸酶,为一水解酶。可使用市售的底物 (substrate) 在原位 (in situ) 显现出酶的活性,以肉眼即可检测其产物,非常方便。

β半乳糖苷酶的临床意义

  1、简介  β半乳糖苷酶介绍:  尿中β半乳糖苷酶活性可反映肾实质,特别是肾小管的早期损伤,与尿中N-乙酰β-D-氨基葡糖苷酶一同测定作尿酶谱分析,有助于病程观察和预后评价。  2、临床意义  β半乳糖苷酶临床意义:  尿中β半乳糖苷酶和N-乙酰β-D-氨基葡糖苷酶同属细胞溶酶体内的水解酶,主要

αL岩藻糖苷酶的简介

  α-L-岩藻糖苷酶是一种溶酶体酸性水解酶,广泛存在于人体组织细胞、血液和体液中,参与糖蛋白、糖脂和寡糖的代谢。在原发性肝癌患者血清中增高,是原发性肝癌的标志物之一。  参考值  ELISA法和分光光度连续监测法为234~414μmol/L。  α-L-岩藻糖苷酶正常值: (6.80±1.49)u

几丁质酶的结构特点及主要作用

几丁质酶催化几丁质水解,几丁质是一种存在于昆虫外骨骼和真菌细胞壁中的丰富的糖类聚合物几丁质酶的糖苷水解酶18家族包括8个人类家族成员。该基因编码糖基水解酶18家族的糖蛋白成员。该蛋白缺乏几丁质酶活性,由活化的巨噬细胞、软骨细胞、中性粒细胞和滑膜细胞分泌这种蛋白质被认为在炎症和组织重塑过程中起作用。

分解纤维素实验原理

纤维素酶是由多种水解酶组成的一个复杂酶系,自然界中很多真菌都能分泌纤维素酶。习惯上,将纤维素酶分成三类:C1酶、Cx酶和β葡糖苷酶。C1酶是对纤维素最初起作用的酶,破坏纤维素链的结晶结构。Cx酶是作用于经C1酶活化的纤维素、分解β-1,4-糖苷键的纤维素酶。β葡糖苷酶可以将纤维二糖、纤维三糖及其他低

溶菌酶的定义

溶菌酶(Lysozyme)又称胞壁质酶或糖苷水解酶或N-乙酰胞壁质聚糖水解酶,是一种专门作用于微生物细胞壁的水解酶。由129个安基酶组成碱性球蛋白,为白色或微黄色的结晶性或无定形粉末;无毒、无臭、味甜、极易溶于水,不溶于丙酮、乙醚、乙醇。是一种碱性球蛋白,对PH变化较稳定,酸性条件下对热稳定的蛋白质

溶菌酶作用和来源

溶菌酶(Lysozyme)又称胞壁质酶或糖苷水解酶或N-乙酰胞壁质聚糖水解酶,是一种专门作用于微生物细胞壁的水解酶。由129个安基酶组成碱性球蛋白,为白色或微黄色的结晶性或无定形粉末;无毒、无臭、味甜、极易溶于水,不溶于丙酮、乙醚、乙醇。是一种碱性球蛋白,对PH变化较稳定,酸性条件下对热稳定的蛋白质

关于β半乳糖苷酶的简介

  GAL是细胞溶酶体中的水解酶,在肾近曲小管上皮细胞中含量较高。尿中GAL活性可反映肾实质,特别是肾小管的早期损伤,与尿中N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAG)一同测定作尿酶谱分析,有助于病程观察和预后评价。在遗传学领域中对人类β-半乳糖苷酶缺陷病的诊断(包括产前诊断)和基础研究也是重要的指征