金黄色葡萄球菌ClpP水解酶的分子机制

上海药物所抗菌交叉团队研究人员针对金黄色葡萄球蛋白水解酶ClpP(SaClpP),开展水解功能的分子机制研究,继2011年在美国生物化学和分子生物学学会专业期刊《Journal of Biological Chemistry》上发表论文(J Biol Chem, 2011, 286, 37590-601)之后,研究论文再次发表于该杂志(J Biol Chem, 2013, 288, 17643–53)。 ClpP是细菌中关键的蛋白水解系统,由上下两个七聚体自组装成一个球形腔体,负责维持细菌体内蛋白质的稳态,对维系细菌的致病力起着关键作用。现有研究表明ClpP已成为一类针对新机制的抗菌新靶标,目前还没有靶向调控剂处于临床研究。 继该研究团队获得的SaClpP的两种功能构象:Extended和Compressed构象的基础上,罗成与杨财广研究员指导博士生叶飞和张婕,以长时间分子动力学模拟为导向,结合生化实验,......阅读全文

金黄色葡萄球菌ClpP水解酶的分子机制

  上海药物所抗菌交叉团队研究人员针对金黄色葡萄球蛋白水解酶ClpP(SaClpP),开展水解功能的分子机制研究,继2011年在美国生物化学和分子生物学学会专业期刊《Journal of Biological Chemistry》上发表论文(J Biol Chem, 2011, 286, 3

胸腺嘧啶水解酶底物特异性的分子基础和催化机制

  10月1日,国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)丁建平研究组的最新研究成果:Molecular basis for the substrate specificity and cata

蛋白水解酶的特性

蛋白水解酶又称肽酶,包括内肽酶、外肽酶、寡肽酶和二肽酶。内肽酶有胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和弹性蛋白酶,对肽链内肽键的特异性不同。胃蛋白酶对底物特异性较低,主要水解Phe、Try C端的肽键;胰蛋白酶水解Lys、Arg C端;胰凝乳蛋白酶作用Phe、Try C端;弹性蛋白酶作用脂肪族氨基酸C端

蛋白水解酶的调控作用

  体内很多重要的生理效应与蛋白酶的生物调控有关,如表中所列,当机体受到外界刺激作出相应的生理反应时就动员体内蛋白酶使原来不具有生理活性的某些多肽或蛋白质,迅速成为功能很强的相应产物,从而达到机体的防御、生存与繁殖的目的。有的动员过程较简单,可通过一次催化反应来完成。如胃肠道中无活性的胰蛋白酶原当其

蛋白水解酶的性质分类

  根据各种蛋白酶活性部位的性质可分之为四大类:  1、丝氨酸蛋白酶  其活性中心除丝氨酸外还包括组氨酸和天冬氨酸残基,如胰脏所分泌的各种内肽酶和与凝血、溶血纤维、补体系统有关的各种蛋白酶。  2、巯基蛋白酶  其活性中心除半胱氨酸外还需有组氨酸残基参与,如植物来源的和细胞溶酶体内的某些组织蛋白酶。

蛋白水解酶的相关介绍

  蛋白水解酶(protease,proteinase)催化多肽或蛋白质水解的酶的统称,简称蛋白酶。广泛分部于动物、植物以及细菌当中,种类繁多,在动物的消化道以及体内各种细胞的溶酶体内含量尤为丰富。蛋白酶对机体的新陈代谢以及生物调控起重要作用。分子量一般在2--3万左右。蛋白酶按水解底物的部位可分为

蛋白水解酶的功能分类介绍

  自从发现蛋白酶在生物调控过程中的重要作用后,又可按其生理功能及其专一性来分类。  非限制性水解蛋白酶  是指酶的专一性很差,能水解蛋白质中的很多肽键,使生成各种小肽甚至游离氨基酸。这类蛋白酶的生理功能主要是参与体内蛋白质的降解作用,例如胃肠道系统所分泌的各种蛋白酶将体外摄入的食物蛋白消化分解;细

吕雪峰团队揭示洛伐他汀水解酶催化机制

  高血脂症是指血液中胆固醇、甘油三酯等脂类物质异常升高,可直接引起一些严重危害人体健康的疾病,通过降胆固醇药物调节血脂是目前预防和治疗高血脂症的有效方法。辛伐他汀(Zocor)是一种重要的降胆固醇药物,其工业生产包括三个步骤:土曲霉发酵生产洛伐他汀,碱水解洛伐他汀制备中间体monacolin J,

稻米蛋白品质形成分子机制获揭示

  近日,《植物细胞》在线发表中国工程院院士、中国农业科学院作物科学研究所研究员万建民团队揭示的稻米蛋白品质形成分子机制。该研究克隆了水稻蛋白品质形成新基因GPA5,并从细胞、遗传和生化层面阐明了GPA5在水稻贮藏蛋白后高尔基体转运中的关键作用,对稻米蛋白品质改良具有重要指导意义。  论文第一作者、

揭秘Piezo蛋白介导机体触觉的分子机制

  我们的身体能够感知多种机械刺激,我们的触觉能够有效区分微风吹过皮肤的感觉和疼痛的按压感,而其它系统则能够检测到肌肉的伸展,甚至血压;我们感知这些东西的能力需要一种外力,其能够在遍布机体不同组织的感觉神经元细胞的微小末梢转化为电信号,其中两个相关蛋白:Piezo1和Piezo2离子通道就能够通过允

关于蛋白水解酶的作用特点的介绍

  1、生物效应是瞬时的  通过对体内活性蛋白前体的激活而迅速表现出活性。因为无需通过基因复制转录及表达等复杂的过程,所以能迅速对外界信号作出反应。此外这种反应又是定向而不可逆的,不同于体内其他一些酶的生物调控机制,例如一些磷酸化激酶,通过对蛋白质的磷酸化及去磷酸化使产生变构效应,从而进行可逆的生物

研究揭示蛋白RhsP靶向猎物细胞的分子机制

中国科学院广州生物医药与健康研究院与澳门大学合作,研究揭示细菌Ⅵ型分泌系统(Type VI secretion system, T6SS)分泌效应蛋白RhsP靶向猎物细胞的分子机制。相关研究在线发表于Cell Reports。 该研究发现,肠炎弧菌效应蛋白RhsP形成一个桶状结构,通过自水解引发

熊志奇小组揭示智障相关蛋白分子机制

  近日,记者从中科院上海生科院神经所获悉,该所研究员熊志奇小组在最新的研究中,揭示了智障相关蛋白CDKL5在兴奋性突触发育中的重要作用,增进了对CDKL5相关疾病机理的理解。相关研究在美国《国家科学院院刊》在线发表。   智障是一类严重危害儿童身心健康的疾患,不仅给患儿带来痛苦,也给家庭和社会带

研究揭示特殊蛋白调节肿瘤生长的分子机制

  免疫检查点是癌细胞表面的特殊蛋白,其能被癌细胞用来躲避宿主机体的免疫反应,这些表面蛋白对于癌细胞的生长非常重要,靶向作用这些蛋白的药物能够彻底改变多种癌症患者的治疗,而阐明降解这些免疫检查点的机制或能帮助宿主机体免疫系统来杀灭癌细胞。  图片来源:CC0 Public Domain  近日,一项

通过膜蛋白受体NMDARs解析小分子与膜蛋白受体作用机制

  近日,中国科学院大连化学物理研究所生物分子结构表征新方法创新特区研究组研究员王方军团队与中科院神经科学研究所研究员竺淑佳团队合作,在N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDARs)-小分子配体相互作用机制分析方面取得新进展,相关结果作为Back Cover在Chemical Communication

研究揭示噬菌体蛋白调控宿主转录的分子机制

  7月11日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组与浙江大学医学院冯钰研究组合作完成的题为Structural basis for transcription anti

揭示特殊的细胞蛋白控制癌症扩散的分子机制

深入揭示控制癌症生长和迁移的细胞信号或能帮助寻找有效的抗癌药物,近日,一项刊登在杂志Journal of Biological Chemistry上的研究报告中,来自麦吉尔大学等机构的科学家们通过研究发现了或能帮助理解结直肠癌发病机制的关键生化过程。文章中,研究人员分析了参与癌细胞扩散的关键酶类的行

相分离调控蛋白翻译与生物节律的分子机制

  清华大学生命科学学院吝易团队与杨雪瑞团队合作揭示了细胞利用相分离对蛋白质翻译进行精细的时空调控,从而维持昼夜节律周期的分子机制。相关成果以“区室化周期性蛋白质翻译精确调控生物节律(Circadian clocks are modulated by compartmentalized oscill

mBio:天然免疫蛋白抑制HIV复制的分子机制

  根据乔治华盛顿大学研究人员发表在《mBio》杂志上的一项新研究,人蛋白质载脂蛋白A-1结合蛋白(AIBP)通过靶向脂质筏并减少病毒细胞融合来抑制HIV复制。这些结果提供了第一个证据,表明AIBP是一种先天免疫因子,该因子可通过修饰HIV靶细胞上的脂质筏来限制HIV复制。  “先前的研究表明,AI

锌调蛋白感知锌离子的分子机制获得进展

  锌是生物体所必需的微量元素,它对很多重要蛋白的结构稳定性和催化活性至关重要。然而,过量的锌会抑制呼吸链NADH氧化酶的活性,毒害细胞。为了生存,细胞必须准确感知并严格调节锌离子在细胞内的浓度。锌调蛋白在维持细菌锌离子稳态和调控致病力过程中发挥极其重要的作用,但其感知锌离子的分子机制却一直未被解析

分子伴侣蛋白作用机制研究获新进展

近日,华东理工大学生物工程学院全舒教授团队联合清华大学薛毅教授团队与国家蛋白质科学研究(上海)设施吴斌博士,在分子伴侣蛋白的作用机制解析方面取得了重要进展。相关成果以“ATP非依赖型分子伴侣Spy的底物释放机制研究”为题发表在《自然-通讯》上,首次从动力学与结构层面对分子伴侣Spy的底物

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蛋白酶和淀粉酶都属于水解酶吗

水解酶是酶6种分类法中的一大类,其包括的范围很广.而淀粉酶就是其中一种,因为淀粉无论是α淀粉酶还是β淀粉酶都是催化糖苷键水解,故其都是水解酶的一种.

水解酶如何分类?

水解酶在EC编号中分类为EC3,并以它分解的键再细分为几个子类:EC3.1:酯键(酯酶)EC3.2:糖(糖基酶)EC3.3:醚键EC3.4:肽键(肽酶)EC3.5:C-N键,但不包括肽键EC3.6:酸酐EC3.7:C-C键EC3.8:卤键EC3.9:P-N键EC3.10:S-N键EC3.11:S-P

水解酶的概念

水解酶是催化水解反应的一类酶的总称(如胰蛋白酶就是水解多肽链的一种水解酶),也可以说它们是一类特殊的转移酶,用水作为被转移基团的受体。

科研人员首次发现G蛋白偶联受体分子识别机制

中科院上海药物研究所蒋华良课题组和王明伟课题组与美国、荷兰、丹麦等国科学家合作,提出了G蛋白偶联受体(GPCR)胞外段与跨膜区的动态变化模式,发现了该受体存在“开放”和“关闭”两种分子构象,从而为其本身以及其他B型G蛋白偶联受体的全长结构解析、功能研究和药物发现奠定了基础。相关研究7

研究抗病毒蛋白质信号分子功能调节机制

  中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所侯法建研究组,揭示了参与抗病毒天然免疫反应的蛋白质分子MAVS发挥功能的分子机制。相关成果日前在线发表于《自然—通讯》杂志。   天然免疫是机体抵御病原体侵染的第一道防线。其中,RIG-I-MAVS介导的信号转导通路在细胞响应RNA病毒侵染的免疫应答过程

Genes-Dev解析致癌组蛋白突变引发癌症的分子机制

  来自清华大学医学院李海涛教授课题组7月31日在《基因与发育》(Genes&Development)杂志上发表了题为《Molecular basis for oncohistone H3 recognition by SETD2 methyltransferase》(甲基转移酶SETD2识别致癌组

人类胆汁酸外排蛋白ABCB11的分子机制揭示

记者从中国科学技术大学获悉,该校生命科学与医学部陈宇星教授和周丛照教授课题组,利用单颗粒冷冻电镜技术解析了一系列人类胆汁酸外排蛋白ABCB11与其生理底物—牛磺胆酸钠的复合物的三维结构,发现该蛋白内部存在两个串联的底物结合口袋,借助一系列生化实验阐明了ABCB11特异性外排胆汁酸的分子机制。该研究成

Nature子刊:神秘蛋白质引发代谢紊乱分子机制

  根据最近来自南卡罗琳娜大学的研究者们发表在《Nature Structural & Molecular Biology》杂志上的一篇文章,细胞对错误折叠的蛋白质的反应或许是引发代谢紊乱的原因,而非结果。在这一研究中,作者们鉴定出了一中此前很少被报道的启动代谢紊乱效应的分子。   蛋白质的错误折