中国科学院生物物理研究所发现古菌C／DRNA识别底物新规则
11月30日，中国科学院生物物理研究所叶克穷课题组在《中国科学：生命科学（英文版）》（Science China Life Sciences）上，在线发表了题为Complicated target recognition by archaeal box C/D guide RNAs的研究论文，揭示了古菌中2'-O-甲基化修饰全局图谱以及C/D RNA识别底物的新模式。 2'-O-甲基化修饰是RNA中频率最高的修饰之一，可影响RNA的结构、功能和稳定性等。C/D RNA在古菌和真核生物中广泛存在，指导底物RNA特定位点的2'-O-甲基化修饰。经典的C/D RNA通过碱基配对结合互补的底物，并挑选距离D/D'序列上游第5个碱基位点进行修饰，这被称为D+5规则。虽然已有关于古菌中C/D RNA的体外生化功能和结构的研究，但它们在体内的靶标和识别机制未有系统研究。 该研究系统测量了Sulfolob......阅读全文
南极古生菌揭示病毒来源
发现pR1SE的南极洲湖泊图片来源：Alyce Hancock 一种罕见的南极微生物或许为破解进化过程中最大的谜题之一 ——病毒的起源提供了线索。相关成果日前发表于《自然—微生物学》杂志。 病毒和其他生命形式不同。可以说，它们根本不算活着。所有其他生命都由细胞构成，而细胞是能独立养活自己和繁
古菌：无所不在－活出极限
22日返回广州的“实验3”号科考船圆满完成中巴首次联合科考任务，两国科学家对莫克兰海沟开展了地质、生物与微生物等综合考察。图为神秘美丽的莫克兰海沟海景“实验3”号科考期间，科学家在莫克兰海沟目标海域首次获得第一手生物样品。 经过12230海里的航行，中国科学院南海海洋研究所“实验3”号科考船圆
古菌揭示潜在抗生素宝库
根据本周发表的两份报告，古菌是生命之树上最不为人所知的微生物分支，是研究新型抗生素的重要线索。古菌以其在极端环境（如热泉和盐碱地）中茁壮成长的能力而闻名，它们也与细菌共存于于多种环境中。现在，两组研究人员认为，这种邻近的关系可能促使数百种古菌进化出独特的化学防御能力，其中一些能够杀灭对传统抗生素
中国科学院生物物理研究所发现古菌C/D－RNA识别底物新规则
11月30日，中国科学院生物物理研究所叶克穷课题组在《中国科学：生命科学（英文版）》（Science China Life Sciences）上，在线发表了题为Complicated target recognition by archaeal box C/D guide RNAs的研究论文，揭
“深部生物圈”古菌揭示生命起源
生活在阳光下，我们看惯了飞禽走兽、树木花草，不会对“万物生长靠太阳”产生怀疑。最近几十年，随着海洋科技不断发展，科学家们发现在海洋底部一些黑暗的极端环境下，也有微生物活动的迹象。 最近，上海交通大学微生物海洋学实验室教授王风平领导的研究团队在《自然—微生物学》（Nature Microbio
酵母菌RNA制备实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 TES酸性酚氯仿乙酸钠乙醇仪器、耗材 离心管离心机摇床实验步骤 1. 酵母细胞在10 ml 培养基中生长至指数中期（OD600=1.0）。 2. 将培养液转移到50 ml，离心管，于4℃，1 500 g 离心3 min。 3. 弃上清，菌体沉淀用1 ml 冰冷的水
老油田有望“复活”？神秘古菌“吃”石油产甲烷
荧光显微镜照片（CARD-FISH)，绿色代表新古菌Ca. Methanoliparum。承磊供图 传统的原油开采技术，难以驱动地下油藏全部原油的运移，仍然有过半原油开采不出来。科学家相信，能在油藏环境中存活的厌氧微生物有可能成为人类的帮手。利用沼气发酵原理，将液态原油降解成气态甲烷，形成油气共采
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队，在《自然》（Nature）上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队，在《自然》（Nature）上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
古菌、细菌和真核生物的形态特征对比
在细胞结构和代谢上，它在很多方面接近其它原核生物。然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上，它们并不明显表现出细菌的特徵，反而非常接近真核生物。比如，它的转译使用真核的启动和延伸因子，且转译过程需要真核生物中的TATA框结合蛋白和TFIIB。它还具有一些其它特徵。与大多数细菌不同，它们只有一层细胞
从革兰氏阳性菌中分离RNA
实验材料 10 ml 细菌培养物 试剂、试剂盒 DEPC 处理的水 裂解缓冲液 酚
从革兰氏阳性菌中分离RNA
实验材料 10 ml 细菌培养物试剂、试剂盒 DEPC 处理的水 裂解缓冲液 酚氯仿异戊醇 5mol LNaCl 冰冷的无水乙醇 70% 乙醇 DNA 酶消化缓冲液 TE 缓冲液仪器、耗材 离心机 带微探头的超声仪实验步骤 一 材料与设备1)10 ml 细菌培养物，2)DEPC 处理的水。3) 裂解
酵母菌RNA制备实验—poly（A）+法
实验材料酵母菌试剂、试剂盒酚氯仿异戊醇仪器、耗材玻璃珠试管摇床培养箱离心机实验步骤一、热酸酚方案（基本方案1）1. TES及酸酚溶液的体积增加到4 ml。2. 操作时使用50 ml 聚丙烯离心管。3. 将得到大约10 mg RNA。 二、玻璃珠方案（备择方案1）1. 将体积增加到15 ml
《自然》：科学家找到“隐藏”的新型产甲烷古菌
近日，农业农村部沼气科学研究所厌氧微生物创新团队联合荷兰瓦赫宁根大学等多家单位，发现并分离培养了一株非广古菌门的新型产甲烷古菌。7月24日，相关研究成果发表在《自然》（Nature）期刊上。 产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。传统观点认为产甲烷古菌隶属古菌域广
《自然》：科学家找到“隐藏”的新型产甲烷古菌
近日，农业农村部沼气科学研究所厌氧微生物创新团队联合荷兰瓦赫宁根大学等多家单位，发现并分离培养了一株非广古菌门的新型产甲烷古菌。7月24日，相关研究成果发表在《自然》（Nature）期刊上。佛斯特拉门古菌 。受访者供图产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。传统观点认为产
RNA病毒通过“挟持”肠道菌逃避寄主免疫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519896.shtm
从革兰氏阴性菌中快速分离RNA
试剂、试剂盒 10 ml 革兰氏阴性菌培养液 原生质体缓冲液 50 mg ml 溶菌酶 革兰氏阴性菌裂解缓冲液 饱和 NaCl 溶液
RNA病毒通过“挟持”肠道菌逃避寄主免疫
该所功能因子利用与生物合成创新团队的研究人员发现，分节段单链正义RNA病毒通过病毒感染，诱导机体产生大量的抗菌肽来抑制有益菌群的丰度与种类，减弱了菌群的抗病毒功能，从而增加了病毒感染程度。该研究从肠道微生物角度为病毒感染治疗提供新思路。相关研究结果3月22日发表在《国际微生物生态学会期刊》（The
从革兰氏阴性菌中快速分离RNA
试剂、试剂盒 10 ml 革兰氏阴性菌培养液 原生质体缓冲液 50 mg ml 溶菌酶 革兰氏阴性菌裂解缓冲液 饱和 NaCl 溶液 DEPC 处理水 乙醇实验步骤 一 材料与设备1)10 ml 革兰氏阴性菌培养液，2) 原生质体缓冲液：15 mmol/LTris-Cl(pH8.0)，0.45mol
2.7.2－从革兰氏阳性菌中分离RNA
实验材料10 ml 细菌培养物试剂、试剂盒DEPC 处理的水裂解缓冲液酚氯仿异戊醇5mol LNaCl冰冷的无水乙醇70% 乙醇DNA 酶消化缓冲液TE 缓冲液仪器、耗材离心机带微探头的超声仪实验步骤一 材料与设备1)10 ml 细菌培养物，2)DEPC 处理的水。3) 裂解缓冲液：30 mmol/
古DNA揭示早期农耕生活为人类带来沙门氏菌
当人类进入农耕时代，并与牲畜一起生活时，这些动物进化出了一种更具毒性的沙门氏菌。图片来源：ANNETTE GüNZEL 猪很可怜，不仅成为食物进人类的肚子，我们还指责它在2012年给人类带来了“猪流感”（研究显示，猪流感病毒也是一种冠状病毒）。此外，猪还是沙门氏菌的宿主，这种细菌可以进入人体并引起
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作，解析了古菌转录终止因子（FttA）依赖型转录终止复合物的三维结构，揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制，为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作，解析了古菌转录终止因子（FttA）依赖型转录终止复合物的三维结构，揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制，为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
新研究证实真菌对全球海洋碳循环贡献远超古菌
上海海洋大学教授费德里科·巴尔塔和博士后伊娃·布雷耶领衔的国际团队，首次精确量化了海洋真菌的碳储存能力，证实真菌对全球海洋碳循环的贡献远超古菌，颠覆了细菌和古菌是海洋碳循环主要推手的传统观点。5月23日，相关研究发表于《细胞》。 研究团队集成生物标志物、细胞壁钙荧光染色、酶联荧光原位杂交CAR
酵母菌RNA制备实验—玻璃珠法
实验材料酵母菌试剂、试剂盒酚氯仿异戊醇仪器、耗材玻璃珠试管摇床培养箱离心机实验步骤1. 培养并收集酵母菌细胞，冷冻细胞沉淀。2. 用300 μl RNA缓冲液中重悬细胞沉淀。 3. 加1体积冷的酸洗玻璃珠（体积与约200 μl 水相等）、300 μl 的用RNA缓冲液平衡的25：24 ：1酚/
2.7.3－从革兰氏阴性菌中快速分离RNA
试剂、试剂盒10 ml 革兰氏阴性菌培养液原生质体缓冲液50 mg ml 溶菌酶革兰氏阴性菌裂解缓冲液饱和 NaCl 溶液DEPC 处理水 乙醇实验步骤一 材料与设备1)10 ml 革兰氏阴性菌培养液，2) 原生质体缓冲液：15 mmol/LTris-Cl(pH8.0)，0.45mol/L 蔗糖，8
中国科学家首次揭示古菌中假尿嘧啶全局图谱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518082.shtm
研究揭示盘古古菌的生态功能和共生生活方式
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495154.shtm
《常见细菌与古菌系统分类鉴定手册》出版发行
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512417.shtm近日，在国家科学技术学术著作出版基金资助下，由中国科学院微生物研究所研究员东秀珠、中国科学院微生物研究所正高级工程师周宇光、广东省科学院微生物研究所研究员朱红惠等编著的《常见细菌与古
昆明植物所在嗜盐古菌质粒研究中取得新进展
古菌是生活在极端自然环境(如高温、低温、强酸、强碱、高压、厌氧或高盐)的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群，主要分布于各种高盐环境，在医药和化工等方面具有应用前景。嗜盐古菌质粒研究为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。 中国科学院昆明植物研究